New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | DH1 | = 2991630 | 269 (0.540) | 333 (0.670) | 144/298 | 3.4 | 55.3% | coding (331/1686 nt) | ybjL | transporter |
? | DH1 | = 3577068 | NA (NA) | noncoding (1198/1201 nt) | repeat_region | repeat region | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
Only 100 of 305 total aligned reads displayed.
GCGCTTAATCTTGGCTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGAAAGCAGGCAGCTCTCACTGGCACTGGATAATCTGAGCC > DH1/2991480‑2991780 | cgcTTAATCTTGGCTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAgg > 5:717004/1‑151 (MQ=255) gcTTAATCTTGGCTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAggg > 3:688980/1‑150 (MQ=255) gcTTAATCTTGGCTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGt < 8:1521292/151‑1 (MQ=255) gcTTAATCTTGGCTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTATGGGTTAggg > 1:197844/1‑150 (MQ=255) gcTTAATCTTGGCTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAAGGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGt < 5:1715744/151‑1 (MQ=255) cTTAATCTTGGCTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGt > 3:280953/1‑150 (MQ=255) tAATCTTGGCTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTaa < 3:1434076/150‑1 (MQ=255) tAATCTTGGCTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGGaa < 3:856040/150‑1 (MQ=255) aTCTTGGCTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGGAAggt > 2:921904/1‑149 (MQ=255) aTCTTGGCTTTATCCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATCTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGGAAggt > 3:1361138/1‑149 (MQ=255) ttttGGCTTTTTGCTGTTTATTTGCTGGTGGGGGGGCGACGCCGTACCTAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGTAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGGAAggt < 1:536820/148‑3 (MQ=255) tGGCTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGt < 5:650748/149‑1 (MQ=255) tGGCTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGGAAGGTgc < 5:525353/149‑2 (MQ=255) ggCTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGttt < 2:139713/150‑1 (MQ=255) ggCTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTg > 8:205205/1‑151 (MQ=255) cTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTggg > 1:346383/1‑150 (MQ=255) cTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGGAAGGTgcgaat > 4:379071/1‑145 (MQ=255) tttATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCt > 3:230496/1‑151 (MQ=255) 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tGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGatat > 2:195922/1‑151 (MQ=255) gTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGGAAGGTgcgaataagcgggga < 5:1229828/150‑15 (MQ=255) aTTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTCTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTCATCGCCGAAGGGTTAGGTAAGCGGTTGGGCTGGGATAGTGGcc > 5:1515736/1‑151 (MQ=255) tttCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCt < 3:1930373/150‑1 (MQ=255) ttCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTg > 6:1676193/1‑150 (MQ=255) 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gCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACgg < 6:1134642/150‑1 (MQ=255) gCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGc < 1:881190/151‑1 (MQ=255) gggTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTAt < 7:691738/151‑1 (MQ=255) ggTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATg < 3:578566/151‑1 (MQ=255) gAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGTTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTTTTTGGGTGGGATATTGGCGTGACGGCCGGTATGtt > 1:637403/1‑149 (MQ=255) 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ttGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACCTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGCAAgc > 6:1765200/1‑149 (MQ=255) tGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGAAAGCAGGCAGctc > 4:1784029/1‑151 (MQ=255) gcgcTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCCGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGAAAGCAGGCAGctc < 5:20949/150‑1 (MQ=255) gTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGAAAGCAGGCAGCTCTcactgg < 8:1425366/151‑1 (MQ=255) gttcgcaccttccttAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGAAAGCAGGCAGCTCTcactggc > 6:614403/14‑150 (MQ=255) gcaccttccttAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGAAAGCAGGCAGCTCTcactggcactgg < 7:1517328/142‑1 (MQ=255) gCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGAAAGCAGGCAGCTCTcactggcactgg < 7:542037/151‑1 (MQ=255) accttccttAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGAAAGCAGGCAGCTCTCACTGGCACTGGAt > 8:583039/8‑151 (MQ=255) accttccttAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGAAAGCAGGCAGCTCTCACTGGCACTGGAt < 3:1756813/144‑1 (MQ=255) ccttccttAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGAAAGCAGGCAGCTCTCACTGGCACTGGAt > 7:1722997/7‑150 (MQ=255) ccttccttAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGAAAGCAGGCAGCTCTCACTGGCACTGGATa < 8:660261/145‑1 (MQ=255) ttccttAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGAAAGCAGGCAGCTCTCACTGGCACTGGATAAt > 4:136715/5‑151 (MQ=255) aGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGAAAGCAGGCAGCTCTCACTGGCACTGGATaa < 5:1768944/150‑1 (MQ=255) ccttAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGAAAGCAGGCAGCTCTCACTGGCACTGGATAATCt > 6:451217/3‑151 (MQ=255) ccttAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGAAAGCAGGCAGCTCTCACTGGCACTGGATAATCt < 8:278786/149‑1 (MQ=255) cttAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGAAAGCAGGCAGCTCTCCCTGGCACTGGATAATCTg > 8:1236106/2‑151 (MQ=255) ttAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGGGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGAAAGCAGGCAGCTCTCACTGGCACTGGATAATCTg > 3:375817/1‑150 (MQ=255) ttAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGAAAGCAGGCAGCTCTCACTGGCACTGGATAATCTg > 6:692360/1‑150 (MQ=255) aGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGAAAGCAGGCAGCTCTCACTGGCACTGGATAATCTGAg < 7:993548/150‑1 (MQ=255) aGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTACGGCATGGAAAGCAGGCAGCTCTCACTGGCACTGGATAATCTGAGc > 4:1189563/1‑151 (MQ=255) aGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATGCCGGCATGGAAAGCAGGCAGCTCTCACTGGCACTGGATAATCTGAGc < 7:1662955/151‑1 (MQ=255) aGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGGCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGAAAGCAGGCAGCTCTCACTGGCACTGGATAATCTGAg < 8:1796862/150‑1 (MQ=255) | GCGCTTAATCTTGGCTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGAAAGCAGGCAGCTCTCACTGGCACTGGATAATCTGAGCC > DH1/2991480‑2991780 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |