Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | DH1 | 298,246 | 0 | T | C | 55.2% | 186.8 / inf | 543 | V436A (GTC→GCC) | ggt | gamma‑glutamyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (125/118); new base C (145/154); total (270/273) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.46e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.53e-01 |
Only 100 of 544 total aligned reads displayed.
GAGAGTAATCAAACTACCCATTACTCAGTGGTGGATAAAGATGGTAACGCGGTGGCGGTGACCTATACGCTGAACACCACCTTCGGTACGGGCATTGTCGCGGGCGAGAGCGGTATTCTGCTTAATAACCAGATGGATGATTTCTCCGTCAAACCGGGCGTACCGAACGTTTACGGGCTGGTGGGCGGTGATGCCAACGCCGTCGGGCCGAACAAACGCCCGCTGTCGTCGATGTCGCCGACCATTGTGGTGAAAGACGGTAAAACCTGGCTGGTTACCGGTAGCCCAGGCGGTAGCCG > DH1/298098‑298396 | gagaGTAATCAAACTACCCATTACTCAGTGGTGGATAAAGATGGTAACGCGGTGGCGGTGACCTATACGCTGAACACCACCTTCGGTACGGGCATTGTCGCGGGCGAGAGCGGTATTCTGCTTAATAACCAGATGGATGATTTCTCCGCCa < 8:143090/151‑1 (MQ=255) agagTAATCAAACTACCCATTACTCAGTGGGGGATAAAGATGGTAACGCGGTGGCGGTGACCTATACGCTGAACACCACCTTCGGTACGGGCATTGTCGCGGGCGAGAGCGGTATTCTGCTTAATAACCAGATGGATGATTTCTCCGTCaa < 4:1917956/151‑1 (MQ=255) gagTAATCAAACTACCCATTACTCAGTGGTGGATAAAGATGGTAACGCGGTGGCGGTGACCTATACGCTGAACACCACCTTCGGTACGGGCATTGTCGCGGGCGAGAGCGGTATTCTGCTTAATAACCAGATGGATGATTTCTCCGTCaaa < 5:511961/151‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |