Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | DH1 | 1,883,418 | 0 | C | T | 54.1% | 162.0 / inf | 505 | H24Y (CAC→TAC) | uvrC | excinuclease ABC subunit C |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (106/125); new base T (138/134); total (245/260) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.84e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.44e-01 |
Only 100 of 508 total aligned reads displayed.
ACTAAACATTCATGGCGATGTTGAGCTGACTCACCTGGCAATTCGCCATGGTCTGTGTAATGCGGAGACATTATCAAGTCAGTGAGTGATCAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGCACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTATTTCCGTAGCAACCTCGCTTCGCGCAAAACCGAAGCGCTGGTCGCCCAGATCCAGCAAATTGATGTAACGGTTACTCACACA > DH1/1883268‑1883567 | taaacATTCATGGCGATGTTGAGCTGACTCACCTGGCAATTCGCCATGGTCTGTGTAATGCGGAGACATTATCAAGTCAGTGAGTGATCAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGCAc > 6:1697190/1‑151 (MQ=255) aaacATTGATGGCTATGTTGAGCTGACTCTCCTGGCAATTCGACATGGTCTGTGTAATGCGGAGACATTATCAAGTCAGTGAGTGATCAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGTAc < 7:183438/150‑1 (MQ=255) aaacATTCATGGCGATGTTGAGCTGACTCACCTGGCAATTCGCCATGGTCTGTGTAATGCGGAGACATTATCAAGTCAGTGAGTGATCAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGCAc < 4:1204149/150‑1 (MQ=255) aTTCATGGCGATGTTGAGCTGACTCACCTGGCAATTCGCCATGGTCTGTGTAATGCGGAGACATTATCAAGTCAGTGAGTGATCAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGTACGATGc > 6:202086/1‑151 (MQ=255) tGGCGATGTTGAGCTGACTCACCTGGCAATTCGCCATGGTCTGTGTAATGCGGAGACATTATCAAGTCAGTGAGTGATCAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGTACGATGCtggtg > 1:98074/1‑151 (MQ=255) tGGCGATGTTGAGCTGACTCACCTGGCAATTCGCCATGGTCTGTGTAATGCGGAGACATTATCAAGTCAGTGAGTGATCAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGCACGATGCtggtg > 5:120471/1‑151 (MQ=255) ggCGATGTTGAGCTGACTCACCTGGCAATTCGCCATGGTCTGTGTAATGCGGAGACATTATCAAGTCAGTGAGTGATCAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGTACGATGCtggtgg > 4:530428/1‑151 (MQ=255) cGATGTTGAGCTGACTCACCTGGCAATTCGCCATGGTCTGTGTAATGCGGAGACATTATCAAGTCAGTGAGTGATCAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGCACGATGCTggtggt > 6:1412030/1‑150 (MQ=255) aTGTTGAGCTGACTCACCTGGCAATTCGCCATGGTCTGTGTAATGCGGAGACATTATCAAGTCAGTGAGTGATCAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGCACGATGCTGGTGGTACg > 1:1300877/1‑151 (MQ=255) gAGCTGACTCACCTGGCAATTCGCCATGGTCTGTGTAATGCGGAGACATTATCAAGTCAGTGAGTGATCAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGCACGATGCTGGTGGTACGGTTAt > 8:432163/1‑151 (MQ=255) gCTGACTCACCTGGCAATTCGCCATGGTCTGTGTAATGCGGAGACATTATCAAGTCAGTGAGTGATCAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGCACGATGCTGGTGGTACGGTTATCt < 3:301679/151‑1 (MQ=255) tGACTGATCTTGTAATTCGTCATTGTCTGTGTAATGCGGAGACATTATCAAGTCAGTGAGTGATCAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACGAGCCTGCCAGGCGTTTATCGCATGTACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTa < 6:286771/150‑1 (MQ=255) tGACTCACCTGGCAATTCGCCATGGTCTGTGTAATGCGGAGACATTATCAAGTCAGTGAGTGATCAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGCACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTAt > 3:1166381/1‑151 (MQ=255) gACTCACCTGGCAATTCGCCATGGTCTGTGTAATTCGGAGACATTATCAAGTCAGTGAGTGATCAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGCACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTa < 2:905912/149‑1 (MQ=255) gACTCACCTGGCAATTCGCCATGGTCTGTGTAATGCGGAGACATTATCAAGTCAGTGAGTGATCAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGCACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATg < 8:761151/151‑1 (MQ=255) aCTCACCTGGCAATTCGCCATGGTCTGTGTAATGAGGAGACATTATCAAGTCAGTGAGTGATCAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGCACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGt > 6:813381/1‑151 (MQ=255) tCACCTGGCAATTCGCCATGGTCTGTGTAATGCGGAGACATTATCAAGTCAGTGAGTGATCAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGTACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCg > 2:302853/1‑151 (MQ=255) cACCTGGCAATTCGCCATGGTCTGTGTAATGCGGAGACATTATCAAGTCAGTGAGTGATCAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGTACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTc < 3:99053/149‑1 (MQ=255) cACCTGGCAATTCGCCATGGTCTGTGTAATGCGGAGACATTATCAAGTCAGTGAGTGATCAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGTACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCgg < 7:355587/151‑1 (MQ=255) ccTGGCAATTCGCCATGGTCTGTGTAATGCGGAGACATTATCAAGTCAGTGAGTGATCAGTTTGACGGAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGTACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCa < 1:1010920/151‑1 (MQ=255) gCAATTCGCCATGGTCTGTGTAATGCGGAGACATTATCAAGTCAGTGAGTGATCAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGCACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGc < 3:781214/151‑1 (MQ=255) aTTCGCCATGGTCTGTGTAATGCGGAGACATTATCAAGTCAGTGAGTGATCAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGCACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGaa < 6:954235/151‑1 (MQ=255) tCGCCATGGTCTGTGTAATGCGGAGACATTATCAAGTCAGTGAGTGATCAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGCACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGaa > 3:1933109/1‑149 (MQ=255) tCGCCATGGTCTGTGTAATGCGGAGACATTATCAAGTCAGTGAGTGATCAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGCACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGaa > 1:4860/1‑149 (MQ=255) gCCATGGTCTGTGTAATGCGGAGACATTATCAAGTCAGTGAGTGATCAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGCACGATGCTGGTTGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGAc < 5:1388039/151‑1 (MQ=255) ccATGGTCTGTGTAATGCGGAGACATTATCAAGTCAGTGAGTGATCAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGTACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGAcc > 6:1337142/1‑151 (MQ=255) ccATGGTCTGTGTAATGCGGAGACATTATCAAGTCAGTGAGTGATCAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGCACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGAcc > 5:1529844/1‑151 (MQ=255) cATGGTCTGTGTTATGCGGAGACATTATCAAGTCAGGGAGTGATCAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTATAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGTACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCTAAGCGAAAGACCt < 4:1436715/151‑1 (MQ=255) aTGGTCTGTGTAATGCGGAGACATTATCAAGTCAGTGAGTGATCAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGTACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTg > 2:412838/1‑151 (MQ=255) aTGGTCTGTGTAATGCGGAGACATTATCAAGTCAGTGAGTGATCAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGCACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTg > 3:1849429/1‑151 (MQ=255) tGGGCTGTGTAATGCGGAGACATTATAAAGGCAGTGAGTGATCAGTTTGACGAAAAAGCGTTGTTAAAAACCGTAACAAGCCAGCCCGGCGTTTATCGAATGCAAGATGCTGGTGGTACGTGTATCTATGTAGGAAAATCGAAAGACATg > 5:655622/1‑150 (MQ=255) ggTCTGTGTAATGCGGAGACATTATCAAGTCAGTGAGTGATCAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGTACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGa > 5:353953/1‑150 (MQ=255) gTCTGTGTAATGCGGAGACATTATCAAGTCAGTGAGTGATCAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGCACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGaaa < 1:1591309/151‑1 (MQ=255) tCTGTGTAATGCGGAGACATTATCAAGTCAGTGAGTGATCAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGTACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGaaa > 7:1506671/1‑150 (MQ=255) tCTGTGTAATGCGGAGACATTATCAAGTCAGTGAGTGATCAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGCACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGaaa > 7:1031095/1‑150 (MQ=255) gtgtAATGCGGAGACATTATCAAGTCAGTGAGTGATCAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGTACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAAc < 6:1606336/151‑1 (MQ=255) gtgtAATGCGGAGACATTATCAAGTCAGTGAGTGATCAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGCACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGaaaaa < 1:1829781/149‑1 (MQ=255) gtgtAATGCGGAGACATTATCAAGTCAGTGAGTGATCAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGCACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGaaaa < 4:955566/148‑1 (MQ=255) 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aTTATCAAGTCAGTGAGTGATCAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGCACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTAtt < 8:1186715/151‑1 (MQ=255) tATCAAGTCAGTGAGTGATCAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGCACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTAttt < 2:669224/150‑1 (MQ=255) tATCAAGTCAGTGAGTGATCAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGCACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTAttt < 7:1701317/150‑1 (MQ=255) tATCAAGTCAGTGAGTGATCAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGCACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTAttt < 2:1569109/150‑1 (MQ=255) tATCAAGTCAGTGAGTGATCAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGCACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTATTTc > 5:253113/1‑151 (MQ=255) aTCAAGTCAGTGAGTGATCAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGCACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGAGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTATTTcc > 8:1572947/1‑151 (MQ=255) cAAGTCAGTGAGTGATCAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGTACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTATTTCCGt > 5:445365/1‑151 (MQ=255) cAAGTCAGTGAGTGATCAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGCACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTATTTCCg < 1:1771260/150‑1 (MQ=255) aGTCAGTGAGTGATCAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGTACGATGCTGGTCGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTATTTCCGt > 6:1914435/1‑149 (MQ=255) gTCAGTGAGTGATCAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGTACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTATTTCCGTAGc < 8:1821413/151‑1 (MQ=255) tCAGTGAGTGATCAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGTACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTATTTCCGTAGc > 2:1810565/1‑150 (MQ=255) cAGTGAGTGATCAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGCACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTATTTCCGTAGCaa < 7:1298520/151‑1 (MQ=255) cAGTGAGTGATCAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGCACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTATTTCCGTAGCa > 3:142525/1‑150 (MQ=255) gagtgaTCAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGTACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTATTTCCGTAGCAACCTc > 1:1961403/1‑151 (MQ=255) gagtgaTCAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGTACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTATTTCCGTAGCAACCTc > 7:606846/1‑151 (MQ=255) gagtgaTCAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGCACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTATTTCCGTAGCAACCTc < 5:955087/151‑1 (MQ=255) agtgaTCAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGTACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTATTTCCGTAGCAACCTCg > 8:195733/1‑151 (MQ=255) aTCAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGCACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTATTTCCGTAGCAACCTCGCTTc < 2:112484/151‑1 (MQ=255) cAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGTACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTATTTCCGTAGCAACCTCGCTTcg < 8:1262920/150‑1 (MQ=255) aGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGTACGATGCTGGTTGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTATTTCCGTAGCAACCTCGCTTcgcg < 3:1037254/151‑1 (MQ=255) tttGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGTACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTATTTCCGTAGCAACCTCGCTTCgcgc > 5:1688820/1‑150 (MQ=255) aCGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGTACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTATTTCCGTAGCAACCTCGCTTCGCGCAAAAc < 3:1468704/151‑1 (MQ=255) cGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGTACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTATTTCCGTAGCAACCTCGCTTCGCGCAAAAcc > 3:383818/1‑151 (MQ=255) gCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGTACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTATTTCCGAAGCAACCTCGCTTCGCGCAAAAccc > 6:433262/1‑150 (MQ=255) aaaGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGCACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTATTTCCGTAGCAACCTCGCTTCGCGCAAAACCGa > 1:1908038/1‑149 (MQ=255) aaGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGCACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTATTTCCGTAGCAACCTCGCTTCGCGCAAAACCGAAgc < 4:1848351/151‑1 (MQ=255) gTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGTACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTATTTCCGTAGCAACCTCGCTTCGCGCAAAACCGAAGCGCTg < 1:398114/151‑1 (MQ=255) tAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGTACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTATTTCCGTAGCAACCTCGCTTCGCGCAAAACCGAAGCGCTGGTCGc > 4:1602585/1‑151 (MQ=255) tAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGTACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTATTTCCGTAGCAACCTCGCTTCGCGCAAAACCGAAGCGCTGGTCGc > 6:1103205/1‑151 (MQ=255) aaaaCCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGTACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCAGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTATTTCCGTAGCAACCTCGCTTCGCGCAAAACCGAAGCGCTGGTCGccc < 2:781662/151‑1 (MQ=255) aaCCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGTAGGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTATTTCCGTAGCAACCTCTCTTCGCGCAAAACCTAAGCGCTGGTCGccc > 2:534164/1‑149 (MQ=255) aaCCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGTACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTATTTCCGTAGCAACCTCGCTTCGCGCAAAACCGAAGCGCTGGTCGccc > 1:630286/1‑149 (MQ=255) cGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGTACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTATTTCCGTAGCAACCTCGCTTCGCGCAAAACCGAAGCGCTGGTCGccc > 4:1062778/1‑146 (MQ=255) tAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGTACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTATTTCCGTAGCAACCTCGCTTCGCGCAAAACCGAAGCGCTGGTCGCCCAGATccc > 5:752921/1‑150 (MQ=255) aaCCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGTACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTATTTCCGTAGCAACCTCGCTTCGCGCAAAACCGAAGCGCTGGTCGCGCAGATcc > 6:616909/1‑149 (MQ=255) aaCCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGCACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTATTTCCGTAGCAACCTCGCTTCGCGCAAAACCGAAGCGCTGGTCGCCCAGATCCAg < 1:742238/151‑1 (MQ=255) aCCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGTACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTATTTCCGTAGCAACCTCGCTTCGCGCAAAACCGAAGCGCTGGTCGCCCAGATCCAGc < 8:1423934/151‑1 (MQ=255) ccagccagccagGCGTTTATCGCATGTACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTATTTCCGTAGCAACCTCGCTTCGCGCAAAACCGAAGCGCTGGTCGCCCAGATCCAGc > 4:671194/1‑150 (MQ=255) ccagccagccagGCGTTTATCGCATGTACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTATTTCCGTAGCAACCTCGCTTCGCGCAAAACCGAAGCGCTGGTCGCCCAGATCCAGCa < 8:642698/151‑1 (MQ=255) cagccagccagGCGTTTATCGCATGCACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTATTTCCGTAGCAACCTCGCTTCGCGCAAAACCGAAGCGCTGGTCGCCCAGATCCAGCa > 1:1137052/1‑150 (MQ=255) ccagccagGCGTTTATCGCATGCACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTATTTCCGTAGCAACCTCGCTTCGCGCAAAACCGAAGCGCTGGTCGCCCAGATCCAGCAAAtt > 6:1253670/1‑151 (MQ=255) ccagGCGTTTATCGCATGTACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTATTTCCGTAGCAACCTCGCTTCGCGCAAAACCGAAGCGCTGGTCGCCCAGATCCAGCAAATTGATg > 3:167317/1‑151 (MQ=255) cagGCGTTTATCGCATGTACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTATTTCCGTAGCAACCTCGCTTCGCGCAAAACCGAAGCGCTGGTCGCCCAGATCCAGCAAATTGATGt > 1:840064/1‑151 (MQ=255) agGCGTTTATCGCATGTACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTATTTCCGTAGCAACCTCGCTTCGCGCAAAACCGAAGCGCTGGTCGCCCAGATCCAGCAAATTGATGt > 2:1893930/1‑150 (MQ=255) agGCGTTTATCGCATGCACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTATTTCCGTAGCAACCTCGCTTCGCGCAAAACCGAAGCGCTGGTCGCCCAGATCCAGCAAATTGATGt > 8:54556/1‑150 (MQ=255) ggCGTTTATCGCATGTACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTATTTCCGTAGCAACCTCGCTTCGCGCAAAACCGAAGCGCTGGTCGCCCAGATCCAGCAAATTGATGTa > 3:855726/1‑150 (MQ=255) cGTTTATCGCATGTACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTATTTCCGTAGCAACCTCGCTTCGCGCAAAACCGAAGCGCTGGTCGCCCAGATCCAGCAAATTGATGTAACg < 5:399849/151‑1 (MQ=255) cGTTTATCGCATGCATGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTATTTCCGTAGCAACCTCGCTTCGCGCCAAACCGAAGCGCTGGTCGCCCAGATCCAGCAAATTGATGTAACg > 1:1351214/1‑151 (MQ=255) cGTTTATCGCATGCACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTATTTCCGTAGCAACCTCGCTTCGCGCAAAACCGAAGCGCTGGTCGCCCAGATCCAGCAAATTGATGTAACg > 7:111815/1‑151 (MQ=255) gTTTATCGCATGTACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTATTTCCGTAGCAACCTCGCTTCGCGCAAAACCGAAGCGCTGGTCGCCCAGATCCAGCAAATTGATGTAACgg < 5:1944546/151‑1 (MQ=255) cGCATGTACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTATTTCCGTAGCAACCTCGCTTCGCGCAAAACCGAAGCGCTGGTCGCCCAGATCCAGCAAATTGATGTAACGGTTACt < 1:295727/150‑1 (MQ=255) cGCATGCACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTATTTCCGTAGCAACCTCGCTTCGCGCAAAACCGAAGCGCTGGTCGCCCAGATCCAGCAAATTGATGTAACGGTTACt < 1:1539353/150‑1 (MQ=255) cGCATGCACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTATTTCCGTAGCAACCTCGCTTCGCGCAAAACCGAAGCGCTGGTCGCCCAGATCCAGCAAATTGATGTAACGGTTACTc < 5:110792/151‑1 (MQ=255) cGCATGCACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTATTTCCGTAGCAACCTCGCTTCGCGCAAAACCGAAGCGCTGGTCGCCCAGATCCAGCAAATTGATGTAACGGTTACTc < 2:1346703/151‑1 (MQ=255) gCATGTACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGTCAAAGCGAAAGACCAGAAAAAACGGCTTTCCAGCTATTTCCGTAGCAACCTCGCTTCGCGCAAAACCGAACCGCTGGTCGCCAAGATCCAGCAAAAACATGTAACGGTTACTcc > 7:927496/1‑150 (MQ=255) gCATGTACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTATTTCCGTAGCAACCTCGCTTCGCGCAAAACCGAAGCGCTGGTCGCCCAGATCCAGCAAATTGATGTAACGGTTACTca < 8:323675/151‑1 (MQ=255) gCATGTACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTATTTCCGTAGCAACCTCGCTTCGCGCAAAACCGAAGCGCTGGTCGCCCAGATCCAGCAAATTGATGTAACGGTTACTc > 7:466645/1‑150 (MQ=255) | ACTAAACATTCATGGCGATGTTGAGCTGACTCACCTGGCAATTCGCCATGGTCTGTGTAATGCGGAGACATTATCAAGTCAGTGAGTGATCAGTTTGACGCAAAAGCGTTTTTAAAAACCGTAACCAGCCAGCCAGGCGTTTATCGCATGCACGATGCTGGTGGTACGGTTATCTATGTCGGCAAAGCGAAAGACCTGAAAAAACGGCTTTCCAGCTATTTCCGTAGCAACCTCGCTTCGCGCAAAACCGAAGCGCTGGTCGCCCAGATCCAGCAAATTGATGTAACGGTTACTCACACA > DH1/1883268‑1883567 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |