New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | DH1 | 2991627 = | 259 (0.500) | 362 (0.700) | 148/300 | 3.1 | 58.3% | coding (328/1686 nt) | ybjL | transporter |
? | DH1 | 3575874 = | NA (NA) | noncoding (4/1201 nt) | repeat_region | repeat region | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
Only 100 of 530 total aligned reads displayed.
GATGCGCTTAATCTTGGCTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGAAAGCAGGCAGCTCTCACTGGCACTGGATAATCTGA > DH1/2991477‑2991777 | gATGCGCTTAATCTTGGCTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTNCNTTTNNTTTNGCGATGGGAAAAATTACNTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGt < 4:1992036/151‑1 (MQ=255) gATGCGCTTAATCTTGGCTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGt < 6:1542706/151‑1 (MQ=255) aTGCGCTTAATCTTGGCTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGtt > 7:1191749/1‑151 (MQ=255) gcgcTTAATCTTGGCTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGtt > 3:1000395/1‑149 (MQ=255) gcTTAATCTTGGCTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGgg > 1:1170695‑M1/1‑149 (MQ=255) gcTTAATCTTGGCTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGt < 2:1652145/151‑1 (MQ=255) tactCTTGTCTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCTGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTaa < 6:1935755/147‑1 (MQ=255) aaTCTTGGCTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAg < 1:961335/150‑1 (MQ=255) tCTTGGCTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGggaaggtg > 8:1920490‑M1/1‑143 (MQ=255) cTTGGCTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGggaaggtgc > 8:1000491‑M1/1‑142 (MQ=255) tGGCTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGtt < 6:1094533/150‑1 (MQ=255) tGGCTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTCCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGtt < 3:598586/150‑1 (MQ=255) gCTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGggaaggtgcgaat > 1:1111228‑M1/1‑138 (MQ=255) gCTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGGGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTgg > 4:342099/1‑151 (MQ=255) cTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGggaaggtgcgaat > 5:790726‑M1/1‑137 (MQ=255) ttATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGggaaggtgcgaata > 6:1745565‑M1/1‑135 (MQ=255) ttATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGc < 5:64491/149‑1 (MQ=255) ttATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTg > 7:1405667/1‑151 (MQ=255) tATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGGTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTg < 7:1817351/150‑1 (MQ=255) aTGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGTGCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCTCTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTggg < 2:250690/151‑1 (MQ=255) aTGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGggaaggtgcgaataagcg > 5:1201383‑M1/1‑133 (MQ=255) gCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGggaaggtgcgaataagcgg < 5:1960848‑M1/150‑20 (MQ=255) tGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGatat > 1:1298900/1‑151 (MQ=255) gTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATAtt < 3:329727/151‑1 (MQ=255) ttATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaat > 1:1027590‑M1/1‑126 (MQ=255) tATTTTCTGCGTCTTGTTCGTAGCTGGACCGAACTTTTTTTCCTTTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGACGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTgg < 8:349315/150‑1 (MQ=255) tATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaat < 6:391186‑M1/150‑26 (MQ=255) ttcttcGTAGGGGTCGAAGGCGGATCGATCTTTTTTTCCATTTTTTTTCGAGATGGGAAAAATTTCCTAATGTTAGCACTGGTGATTGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCGTTAGGTTTAGGTAAGCTTTTTGGCTGGGATATTGGCGTg < 8:1714694/150‑1 (MQ=255) tCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttct > 2:1209836‑M1/1‑120 (MQ=255) tCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGAc > 2:1437257/1‑151 (MQ=255) gCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcg < 6:55250‑M1/150‑34 (MQ=255) gCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttct < 7:84050‑M1/148‑32 (MQ=255) gCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGcgaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcgg > 2:17923‑M1/1‑117 (MQ=255) gTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCg > 5:186001/1‑151 (MQ=255) cGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCgg < 5:982060/150‑1 (MQ=255) ggggTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgac > 6:88433‑M1/1‑112 (MQ=255) gggTCGAAGCCGGACCGAAC‑TTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATg > 7:1032952/1‑151 (MQ=255) ggTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactc > 7:1677080‑M1/1‑110 (MQ=255) cGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagt > 6:797059‑M1/1‑107 (MQ=255) cGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGtt < 3:985460/150‑1 (MQ=255) gAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtc < 6:1860330‑M1/151‑46 (MQ=255) aGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAga > 4:1596510/1‑149 (MQ=255) cccgGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatt < 2:600201‑M1/150‑49 (MQ=255) ccGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcattt > 3:764584‑M1/1‑102 (MQ=255) gAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttct > 3:1183747‑M1/1‑95 (MQ=255) gAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCGGGCTCTATg > 8:542918/1‑151 (MQ=255) gAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATg > 1:451138/1‑151 (MQ=255) aaCTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttctt > 1:635072‑M1/1‑94 (MQ=255) aaCTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATg > 8:1150244/1‑150 (MQ=255) tttttCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTc < 7:557009/150‑1 (MQ=255) tttttttCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGtt > 7:1997013/1‑151 (MQ=255) tttttCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgagt > 2:1123263‑M1/1‑78 (MQ=255) tttCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTgg > 4:1844993/1‑151 (MQ=255) tttCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTgg > 3:549372/1‑151 (MQ=255) gcgATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCgg < 1:796276/151‑1 (MQ=255) aaaaaTTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCg < 7:463252/151‑1 (MQ=255) aaaTTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatg > 5:241786‑M1/1‑62 (MQ=255) aaaTTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatg < 8:905138‑M1/151‑90 (MQ=255) aaTTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgc < 5:1530093‑M1/151‑91 (MQ=255) aTTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgcc > 8:81677‑M1/1‑60 (MQ=255) tACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATaca < 3:1638325/150‑1 (MQ=255) aCCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGggaaggggcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgcctt < 4:832258‑M1/150‑94 (MQ=255) cTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGc > 7:778537/1‑151 (MQ=255) tAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgcctcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaat > 5:1372440‑M1/1‑54 (MQ=255) tGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatc > 6:1446980‑M1/1‑51 (MQ=255) gTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCAt < 6:1239854/151‑1 (MQ=255) tAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcct > 6:161793‑M1/1‑48 (MQ=255) tAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGCCACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACCCTGCGTCATTc > 2:423399/1‑151 (MQ=255) tAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTc > 5:423583/1‑151 (MQ=255) aGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcct > 3:919669‑M1/1‑47 (MQ=255) gATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccg < 2:691162‑M1/151‑114 (MQ=255) aTGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGAAGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGaa > 4:1497462/1‑150 (MQ=255) tGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtt > 8:276214‑M1/1‑36 (MQ=255) gTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGAAAgc > 1:1470385/1‑150 (MQ=255) ggCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGAAAgcaggc < 3:1846272/151‑1 (MQ=255) gCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGAAAgcaggca < 3:706448/151‑1 (MQ=255) aGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgcc < 4:521188‑M1/151‑124 (MQ=255) aGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGAAAGCAGGCAGc > 7:280073/1‑151 (MQ=255) gTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgcca < 2:1518351‑M1/151‑125 (MQ=255) ggTGATCGCCTTAGGGTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaa < 5:1048322‑M1/149‑130 (MQ=255) ggTGATCGCCTTAGGGTTAGGTTAGGTGTTTGGCTGGGATTTTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCTAGACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGAAAGCAGGGAGCTCTcactg < 6:2034462/151‑1 (MQ=255) tgttcgcaccttccttAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGAAAGCAGGCAGCTCTcactgg < 3:1464449/136‑1 (MQ=255) tgttcgcaccttccttAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGGTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGAAAGCAGGCAGCTCTcactggc > 2:1346801/15‑151 (MQ=255) tGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGAAAGCAGGCAGCTCTcactggc > 7:1547428/1‑151 (MQ=255) gttcgcaccttccttAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGAAAGCAGGCAGCTCTcactggc < 4:1652765/137‑1 (MQ=255) cGCCTTAGGGTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcagttcttcatgtttgcgccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagccgatttagcccgtttcttcgccattttaggcgtt > 2:1719159‑M1/1‑14 (MQ=255) gCCTTAGGGTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgttatc > 8:1369699‑M1/1‑13 (MQ=255) ccTTAGGGTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgttatcc > 8:1623913‑M1/1‑12 (MQ=255) cTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCAGGCATGGAAAGCAGGCAGCTCTCACTGGCACTGGAt > 5:542522/1‑151 (MQ=255) accttccttAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGAAAGCAGGCAGCTCTCACTGGCACTGGAt < 3:1981539/144‑1 (MQ=255) tagggttagggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagacgtttcttcgccatttaaggcgttatcccc < 5:1650356‑M1/149‑141 (MQ=255) tccttAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGAAAGCAGGCAGCTCTCACTGGCACTGGATAATc > 1:388835/4‑151 (MQ=255) gggttagggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgttatccccagt < 1:1623964‑M1/151‑145 (MQ=255) ccttAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGAAAGCAGGCAGCTCTCACTGGCACTGGATAATc < 3:177184/148‑1 (MQ=255) gttagggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgttatccccagttt > 6:731091‑M1/1‑5 (MQ=255) gttagggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgttatccccagttt > 4:1213007‑M1/1‑5 (MQ=255) gttagggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgttatccccagttt > 1:221715‑M1/1‑5 (MQ=255) ttagggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgttatccccagtttt > 7:1949168‑M1/1‑4 (MQ=255) ttagggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgttatccccagtttt > 4:1300153‑M1/1‑4 (MQ=255) ttagggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgttatccccagttt < 4:937421‑M1/150‑147 (MQ=255) | GATGCGCTTAATCTTGGCTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGAAAGCAGGCAGCTCTCACTGGCACTGGATAATCTGA > DH1/2991477‑2991777 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |