| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | DH1 | 3970034 = | 2 (0.010) | 159 (1.030) | 118/274 | 0.1 | 97.6% | intergenic (‑120/‑94) | fimA/ECDH1_RS19620 | type‑1 fimbrial protein, A chain/hypothetical protein |
| ? | DH1 | 3970348 = | 6 (0.040) | intergenic (+32/+48) | ECDH1_RS19620/fimE | hypothetical protein/tyrosine recombinase | |||||
Only 100 of 355 total aligned reads displayed.
GAACAACGATTGCCAGAGTTTTAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCATTTTGACTCATAGAGGAAAGCATCGCGGACAAACTTTTTCAGTTTATTTGTTGGCTTAATATTCTATTGTTATCTTTATTTATAGATGTTTATATTGCATGAGGTGGTTTTTGGAGAGAAGAATGAGGAAGATGCGTCGAGC > DH1/3969884‑3970184 | gAACAACGATTGCCAGAGTTTTAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATT < 2:2289891‑M1/151‑1 (MQ=255)cgccatactgtgcgttataccgccagtaatgctgctcgttttgccggattatgggaaagaaataatctcataaacgaaaaattaaaaagagaagaggtttgatttaacttattgataataaagttaaaaaaacaaataaatacaagacaat > 2:1179619‑M1/151‑151 (MQ=255)cgccatactgtgcgttataccgccagtaatgctgctcgttttgccggattatgggaaagaaataatctcataaacgaaaaattaaaaagagaagaggtttgatttaacttattgataataaagttaaaaaaacaaataaatacaagacaat < 1:1687755‑M1/1‑1 (MQ=255) ccatactgtgcgttataccgccagtaatgctgctcgttttgccggattatgggaaagaaataatctcataaacgaaaaattaaaaagagaagaggtttgatttaacttattgataataaagttaaaaaaacaaataaatacaagacaaTTg < 2:1606422‑M1/3‑1 (MQ=255) ccatactgtgcgttataccgccagtaatgctgctcgttttgccggattatgggaaagaaataatctcataaacgaaaaattaaaaagagaagaggtttgatttaacttattgataataaagttaaaaaaacaaataaatacaagacaaTTg < 2:2410396‑M1/3‑1 (MQ=255) ctgtgcgttataccgccagtaatgctgctcgttttgccggattatgggaaagaaataatctcataaacgaaaaattaaaaagagaagaggtttgatttaacttattgataataaagttaaaaaaacaaataaatacaagacaaTTGGGGcc < 1:2058872‑M1/8‑1 (MQ=255) gtgcgttataccgccagtaatgctgctcgttttgccggattatgggaaagaaataatctcataaacgaaaaattaaaaagagaagaggtttgatttaacttattgataataaagttaaaaaaacaaataaatacaagacaaTTGGGGCCAt < 1:1968371‑M1/10‑1 (MQ=255) gtgcgttataccgccagtaatgctgctcgttttgccggattatgggaaagaaataatctcataaacgaaaaattaaaaagagaagaggtttgatttaacttattgataataaagttaaaaaaacaaataaatacaagacaaTTGGGGCCAt < 1:1867595‑M1/10‑1 (MQ=255) gCCGGAGTTTTAATTTTCACGCTGCTTTCCTTTCACAAAACTATTTCTAAATCGCCATGGGCAGTGGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAaac > 1:2147183‑M1/1‑148 (MQ=255) ccAGAGTTTTAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAaact < 2:1735148‑M1/151‑5 (MQ=255) gttataccgccagtaatgctgctcgttttgccggattatgggaaagaaataatctcataaacgaaaaattaaaaagagaagaggtttgatttaacttattgataataaagttaaaaaaacaaataaatacaagacaaTTGGGGCCATTTTg < 1:2250605‑M1/14‑1 (MQ=255) cAGAGTTTTAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGG > 2:34863‑M1/1‑143 (MQ=255) tataccgccagtaatgctgctcgttttgccggattatgggaaagaaataatctcataaacgaaaaattaaaaagagaagaggtttgatttaacttattgataataaagttaaaaaaacaaataaatacaagacaaTTGGGGCCATTTTGa > 2:2372939‑M1/136‑150 (MQ=255) gagTTTTAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAaact < 1:2296985‑M1/148‑5 (MQ=255) agTTTTAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAaactgtcc > 2:69528‑M1/1‑143 (MQ=255) ttAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAa > 1:2353625‑M1/1‑139 (MQ=255) tAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAaactgtccatat < 1:69528‑M1/150‑13 (MQ=255) aaTTTTCATGCTGCTTTCCTTTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGTAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAaactgtccatatca < 1:1782787‑M1/151‑15 (MQ=255) cagtaatgctgctcgttttgccggattatgggaaagaaataatctcataaacgaaaaattaaaaagagaagaggtttgatttaacttattgataataaagttaaaaaaacaaataaatacaagacaaTTGGGGCCATTTTGACTCa > 2:1314541‑M1/128‑146 (MQ=255) tCATGCTGCTTTCCTTTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAaactgtccatatcataaa < 2:673910‑M1/150‑19 (MQ=255) tCATGCTGCTTTCCTTTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAaactgtccatatc < 2:1817508‑M1/145‑14 (MQ=255) tCATGCTGCTTTCCTTTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAaactgtccatatc > 1:1817503‑M1/1‑132 (MQ=255) atgctgctcgttttgccggattatgggaaagaaataatctcataaacgaaaaattaaaaagagaagaggtttgatttaacttattgataataaagttaaaaaaacaaataaatacaagacaaTTGGGGCCATTTTGACTCATAGAGGaa < 2:2256540‑M1/27‑1 (MQ=255) atgctgctcgttttgccggattatgggaaagaaataatctcataaacgaaaaattaaaaagagaagaggtttgatttaacttattgataataaagttaaaaaaacaaataaatacaagacaaTTGGGGCCATTTTGACTCATAGAGGaa < 1:83155‑M1/27‑1 (MQ=255) aTGCTGCTTTCCTTTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAaactgtccatatcataaataa < 2:301356‑M1/151‑22 (MQ=255) aTGCTGCTTTCCTTTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAaactgtccatatcataaataa < 1:1117126‑M1/151‑22 (MQ=255) aTGCTGCTTTCCTTTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAaactgtccatatcataaataa < 2:1959097‑M1/151‑22 (MQ=255) gctgctcgttttgccggattatgggaaagaaataatctcataaacgaaaaattaaaaagagaagaggtttgatttaacttattgataataaagttaaaaaaacaaataaatacaagacaaTTGGGGCCATTTTGACTCATAGAGGAAAGc < 1:1547173‑M1/30‑1 (MQ=255) gctgctTTCCTTTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAaactgtccatatcataaat > 1:2173030‑M1/1‑128 (MQ=255) tgctcgttttgccggattatgggaaagaaataatctcataaacgaaaaattaaaaagagaagaggtttgatttaacttattgataataaagttaaaaaaacaaataaatacaagacaaTTGGGGCCATTTTGACTCATAGAGGAAAGCATc < 1:565584‑M1/33‑1 (MQ=255) gctcgttttgccggattatgggaaagaaataatctcataaacgaaaaattaaaaagagaagaggtttgatttaacttattgataataaagttaaaaaaacaaataaatacaagacaaTTGGGGCCATTTTGACTCATAGAGGAAAGCATc > 1:2256531‑M1/118‑150 (MQ=255) gctTTCCTTTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAaactgtccatatcataaataagttac > 1:2614285‑M1/1‑125 (MQ=255) tcgttttgccggattatgggaaagaaataatctcataaacgaaaaattaaaaagagaagaggtttgatttaacttattgataataaagttaaaaaaacaaataaatacaagacaaTTGGGGCCATTTTGACTCATAGAGGAAAGCATcgcg < 1:983662‑M1/36‑1 (MQ=255) cgttttgccggattatgggaaagaaataatctcataaacgaaaaattaaaaagagaagaggtttgatttaacttattgataataaagttaaaaaaacaaataaatacaagacaaTTGGGGCCATTTTGACTCATAGAGGAAAGCATcgcg > 2:1924921‑M1/115‑150 (MQ=255) cgttttgccggattatgggaaagaaataatctcataaacgaaaaattaaaaagagaagaggtttgatttaacttattgataataaagttaaaaaaacaaataaatacaagacaaTTGGGGCCATTTTGACTCATAGAGGAAAGCATcgc > 1:1006648‑M1/115‑149 (MQ=255) gttttgccggattatgggaaagaaataatctcataaacgaaaaattaaaaagagaagaggtttgatttaacttattgataataaagttaaaaaaacaaataaatacaagacaaTTGGGGCCATTTTGACTCATAGAGGAAAGCATCGCgg < 1:2098670‑M1/37‑1 (MQ=255) ttcAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAaactgtccatatcataaataagttacgtattttt > 1:1526582‑M1/1‑117 (MQ=255) gccggattatgggaaagaaataatctcataaacgaaaaattaaaaagagaagaggtttgatttaacttattgataataaagttaaaaaaacaaataaatacaagacaaTTGGGGCCATTTTGACTCATAGAGGAAAGCATCGCGGACAAAc < 2:2353613‑M1/43‑1 (MQ=255) 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2:596752‑M1/102‑1 (MQ=255) gAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAaactgtccatatcataaataagttacgtattttttctcaagcataaaaatattaaaaaacgacaaaaagcatctaactgtttgatatgtaaatt < 2:1079880‑M1/151‑95 (MQ=255) tttGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAaactgtccatatcataaataagttacgtattttttctcaagcataaaaatattaaaaaacgacaaaaagcatctaact > 1:24016‑M1/1‑54 (MQ=255) ataataaagttaaaaaaacaaataaatacaagacaaTTGGGGCCATTTTGACTCATAGAGGAAAGCATCGCGGACAAACTTTTTCAGTTTATTTGTTGGCTTAATATTCTATTGTTATCTTTATTTATAGATGTTTATATTGCATGAggt > 1:944456‑M1/37‑150 (MQ=255) ataataaagttaaaaaaacaaataaatacaagacaaTTGGGGCCATTTTGACTCATAGAGGAAAGCATCGCGGACAAACTTTTTCAGTTTATTTGTTGGCTTAATATTCTATTGTTATCTTTATTTATAGATGTTTATATTGCATGAggt < 2:944457‑M1/114‑1 (MQ=255) ataaagttaaaaaaacaaataaatacaagacaaTTGGGGCCATTTTGACTCATAGAGGAAAGCATCGCGGACAAACTTTTTCAGTTTATTTGTTGGCTTAATATTCTATTGTTATCTTTATTTATAGATGTTTATATTGCATGAGGTGGtt > 2:1436662‑M1/34‑151 (MQ=255) 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ttGGGGCCAaactgtccatatcataaataagttacgtattttttctcaagcataaaaatattaaaaaacgacaaaaagcatctaactgtttgatatgtaaattatttctattgtaaattaatttcacatcacctccgctatatgtaaagct > 2:1154659‑M1/1‑9 (MQ=255) | GAACAACGATTGCCAGAGTTTTAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCATTTTGACTCATAGAGGAAAGCATCGCGGACAAACTTTTTCAGTTTATTTGTTGGCTTAATATTCTATTGTTATCTTTATTTATAGATGTTTATATTGCATGAGGTGGTTTTTGGAGAGAAGAATGAGGAAGATGCGTCGAGC > DH1/3969884‑3970184 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |