| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | DH1 | 1,365,203 | 0 | T | G | 36.6% | 372.6 / 20.5 | 165 | V313G (GTG→GGG) | mntH | divalent metal cation transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (19/85); new base G (60/0); total (80/85) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.30e-28 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 172 total aligned reads displayed.
TTCCGGTCATACTGGTGTTGCCGATCTTGATGAGGCTTATCTGACGCTGCAACCGCTGTTAAGCCACGCTGCGGCAACGGTCTTTGGATTAAGCCTGGTTGCTGCGGGGCTGTCTTCAACGGTGGTGGGGACACTGGC‑GGGGCAGGTGGTGATGCAGGGCTTCATTCGCTTTCATATCCCGCTGTGGGTGCGTCGTACAGTCACCATGTTGCCGTCATTTATTGTCATTCTGATGGGATTAGATCCGACACGGATTCTGGTTATGAGTCAGGTACTGTTAAGTTTTGGTATCGCTCTGGC > DH1/1365054‑1365353 | tCCGGTCATACTGGTGTTGCCGATCTTGATGAGGCTTATCTGACGCTGCAACCGCTGTTAAGCCACGCTGCGGCAACGGTCTTTGGATTAAGCCTGGTTGCTGCGGGGCTGTCTTCAACGGTGGTGGGGACACTGGC‑GGGGCAGgtggtg < 2:1093615/150‑1 (MQ=255) cATACTGGTGTTGCCGATCTTGATGAGGCTTATCTGACGCTGCAACCGCTGTTAAGCCACGCTGCGGCAACGGTCTTTGGATTAAGCCTGGTTGCTGCGGGGCTGTCTTCAACGGTGGTGGGGACACTGGC‑GGGGCCGGGGGTGATGTAgg > 2:1710133/1‑151 (MQ=255) aTACTGGTGTTGCCGATCTTGATGAGGCTTATCTGACGCTGCAACCGCTGTTAAGCCACGCTGCGGCAACGGTCTTTGGATTAAGCCTGGTTGCTGCGGGGCTGTCTTCAACGGTGGTGGGGACACTGGC‑GGGGGAGGGGGGGATGTAggg > 1:1266203/1‑151 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |