| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | DH1 | 3,571,995 | 0 | T | G | 39.1% | 240.7 / 43.2 | 128 | Y659D (TAT→GAT) | paoC | PaoABC aldehyde oxidoreductase Moco‑containing subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (13/65); new base G (50/0); total (63/65) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.35e-24 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
TGTGTGTGCTGCAGGACGCATCCTGAATCCGAAAACTGCGCGCAGCCAGGTCATTGGCGCAATGACTATGGGCATGGGCGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGCGGATATCCCAAAACAGGAGGTG‑ATTTTCCTGGATGATACCGACCCCATATCCTCCCCGATGAAGGCCAAAGGTGTCGGTGAGCTGGGCCTGTGCGGCGTGAGCGCGGCTATCGCCAACGCGGTGTATAAC > DH1/3571847‑3572144 | tgtgtgtgCTGCAGGACGCATCCTGAATCCGAAAACTGCGCGCAGCCAGGTCATTGGCGCAATGACTATGGGCATGGGCGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGGAt > 2:1993016/1‑151 (MQ=255) tgtgCTGCAGGACGCATCCTGAATCCGAAAACTGCGCGCAGCCAGGTCATTGGCGCAATGACTATGGGCATGGGCGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGGATGAgg > 2:2200733/1‑151 (MQ=255) tgctgcAGGACGCATCCTGAATCCGAAAACTGCGCGCAGCCACGTCATTGGCGCAATGACTATGGGCATGGGCGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATGACGATATGGCGGGGTCGGAgg > 2:577062/1‑149 (MQ=255) gctgcAGGACGCATCCTGAATCCGAAAACTGCGCGCAGCCAGGTCATTGGCGCAATGACTATGGGCATGGGCGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGTg < 1:647878/150‑1 (MQ=255) gctgcAGGACGCATCCTGAATCCGAAAACTGCGCGCAGCCAGGTCATTGGCGCAATGACTATGGGCATGGGCGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGGATGAGGTGc > 2:426321/1‑151 (MQ=255) tgcAGGACGCATCCTGAATCCGAAAACTGCGCGCAGCCAGGTCATTGGCGCAATGACTATGGGCATGGGCGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGGTTTAGGGGCCg > 1:2423668/1‑151 (MQ=255) cAGGACGCATCCTGAATCCGAAAACTGCGCGCAGCCAGGTCATTGGCGCAATGACTATGGGCATGGGCGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGGATGAGGGGCCggg > 1:1176929/1‑150 (MQ=255) aGGACGCATCCTGAATCCGAAAACTGCGCGCAGCCAGGTCATTGGCGCAATGACTATGGGCATGGGCGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGTGCCGGtt < 1:1454736/151‑1 (MQ=255) gACGCATCCTGAATCCGAAAACTGCGCGCAGCCAGGTCATTGGCGCAATGACTATGGGCATGGGCGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCTTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATTAGGGGGCGGttt > 2:894614/1‑149 (MQ=255) gACGCATCCTGAATCCGAAAACTGCGCGCAGCCAGGTCATTGGCGCAATGACTATGGGCATGGGCGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCa < 1:1094901/151‑1 (MQ=255) cGCATCCTGAATCCGAAAACTGCGCGCAGCCAGGTCATTGGCGCAATGACTATGGGCATGGGCGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGt < 2:1469706/133‑1 (MQ=255) gCATCCTGAATCCGAAAACTGCGCGCAGCCAGGTCATTGGCGCAATGACTATGGGCATGGGCGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGc < 1:1647405/151‑1 (MQ=255) cATCCTGAATCCGAAAACTGCGCGCAGCCAGGTCATTGGCGCAATGACTATGGGCATGGGAGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGCg < 2:1209573/151‑1 (MQ=255) gtCCTGAATCCGAAAACTGCGCGCAGCCAGGTCATTGGCGCAATGACTATGGGCATGGGCGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCa < 1:2410339/145‑1 (MQ=255) gtCCTGAATCCGAAAACTGCGCGCAGCCAGGTCATTGGCGCAATGACTATGGGCATGGGCGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGGATGAGGGGCCGGGTCa > 2:2410350/2‑146 (MQ=255) aTCCTGAATCCGAAAACTGCGCGCAGCCAGGTCATTGGCGCAATGACTATGGGCATGGGCGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGGATGAGGGGGCGGGTTACGCgg > 1:50165/1‑151 (MQ=255) ccTGAATCCGAAAACTGCGCGCAGCCAGGTCATTGGCGCAATGACTATGGGCATGGGCGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGCGGat < 1:1733939/151‑1 (MQ=255) ccTGAATCCGAAAACTGCGCGCAGCCAGGTCATTGGCGCAATGACTATGGGCATGGGCGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGCGGa < 2:2619249/150‑1 (MQ=255) tGAATCCGAAAACTGCGCGCAGCCAGGTCATTGGCGCAATGACTATGGGCATGGGCGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGGATTAGGTGGCGGGTTATggggcgat > 2:16792/1‑147 (MQ=255) gAATCCGAAAACTGCGCGCAGCCAGGTCATTGGCGCAATGACTATGGGCATGGGCGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGCGGatat < 2:809677/150‑1 (MQ=255) gAATCCGAAAACTGCGCGCAGCCAGGTCATTGGCGCAATGACTATGGGCATGGGCGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGCGGatat < 1:1756480/150‑1 (MQ=255) aTCCGAAAACTGCGCGCAGCCAGGTCATTGGCGCAATGACTATGGGCATGGGCGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGCGGATATccc < 1:985496/151‑1 (MQ=255) ccGAAAACTGCGCGCAGCCAGGTCATTGGCGCAATGACTATGGGCATGGGCGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGGATGGGGGGGCGGGTCATGCgggttttccc > 1:1471211/1‑142 (MQ=255) cGAAAACTGCGCGCAGCCAGGTCATTGGCGCAATGACTATGGGCATGGGCGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGGCTGAGGTGGCCGGTCATTCggtaatcgcca > 2:1218071/1‑141 (MQ=255) aaaaCTGCGCGCAGCCAGGTCATTGGCGCAATGACTATGGGCATGGGCGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGCGGATATCCCAAAAc < 1:426322/151‑1 (MQ=255) aaaCTGCGCGCAGCCAGGTCATTGGCGCAATGACTATGGGCATGGGCGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGCGGATATCCCAAAACa < 1:505566/151‑1 (MQ=255) aaCTGCGCGCAGCCAGGTCATTGGCGCAATGACTATGGGCATGGGCGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGCGGATATCCCAAAACag < 2:1635668/151‑1 (MQ=255) aCTGCGCGCAGCCAGGTCATTGGCGCAATGACTATGGGCATGGGCGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGCGGATATCCCAAAACagg < 2:1999504/151‑1 (MQ=255) tGCGCGCAGCCAGGTCATTGGCGCAATGACTATGGGCATGGGCGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGCGGATATCCCAAAACag < 2:1028631/148‑1 (MQ=255) gcgcgcAGCCAGGTCATTGGCGCAATGACTATGGGCATGGGCGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGCGGATATCCCAAAACaggagg < 2:399315/151‑1 (MQ=255) gcgcAGCCAGGTCATTGGCGCAATGACTATGGGCATGGGCGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTAt < 2:486806/112‑1 (MQ=255) gcAGCCAGGTCATTGGCGCAATGACTATGGGCATGGGCGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGGATGAGGGGGCGGTTCATGCGGATATCCCAAAAAAGGAGGGG‑At > 2:2360975/1‑151 (MQ=255) cAGCCAGGTCATTGGCGCAATGACTATGGGCATGGGCGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGGGCCGGGTTATTCGGGTATCCCCAAACaggggggggtt > 2:48398/1‑146 (MQ=255) cAGCCAGGTCATTGGCGCAATGACTATGGGCATGGGCGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGGATGAGGGGCCGGGTCATGCGGGTATTCCCAAACaagggggggtt > 2:2449542/1‑141 (MQ=255) aGCCAGGTCATTGGCGCAATGACTATGGGCATGGGCGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGCGGATATCCCAAAACAGGAGGTG‑Attt < 1:1993008/151‑1 (MQ=255) aGCCAGGTCATTGGCGCAATGACTATGGGCATGGGCGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGCGGATATCCCAAAACAGGAGGTG‑Attt < 1:2262788/151‑1 (MQ=255) cAGGTCATTGGCGCAATGACTATGGGCATGGGCGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGCGGATATc < 2:194282/129‑1 (MQ=255) cAGGTCATTGGCGCAATGACTATGGGCATGGGCGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGGATGAGGGGGCGGGTCATGCGGgtatt > 1:194283/1‑128 (MQ=255) aGGTCATTGGCGCAATGACTATGGGCATGGGCGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGCGGATATCCCAAAACAGGAGGTG‑ATTTTCCt < 1:52716/151‑1 (MQ=255) aGGTCATTGGCGCAATGACTATGGGCATGGGCGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGGATGAGGGGCCGGTTTATGCGGGTATCCCCAAACAGGAGGGG‑ATTTTTCt > 2:52716/1‑151 (MQ=255) aGGTCATTGGCGCAATGACTATGGGCATGGGCGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGGATGAGGGGCCGGTTCATGCGGATATCCCCAAACAGGAGGGG‑ATTTTTCt > 2:1505/1‑151 (MQ=255) ggTCATTGGCGCAATGACTATGGGCATGGGCGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGCGGATATCCCAAAACAGGAGGTG‑ATTTTCCTg < 2:1176930/151‑1 (MQ=255) cATTGGCGCAATGACTATGGGCATGGGCGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGCGGATATCCCAAAACAGGAGGTG‑ATTTTCCTGgat < 2:1728135/151‑1 (MQ=255) cATTGGCGCAATGACTATGGGCATGGGCGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGGATTAGGGGCCGGGTCATTCGGATATCCCCAAAAAGGAGGGG‑Attagaaccgg > 1:913983/1‑142 (MQ=255) aTTGGCGCAATGACTATGGGCATGGGAGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGCGGATATCCCAAAACAGGAGGTG‑ATTTTCCTGgatg < 2:1191845/151‑1 (MQ=255) tGGCGCAATGACTATGGGCATGGGCGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGCGGat < 1:2319410/118‑1 (MQ=255) tGGCGCAATGACTATGGGCATGGGCGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGGATTAGGGGGCGGGTCCTGCGGAAAATCCCAAACAAGAGGGG‑AGTTTTCTTggtgat > 2:2278666/1‑151 (MQ=255) cgcAATGACTATGGGCATGGGCGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGCGGATATCCCAAAACAGGAGGTG‑ATTTTCCTGGATGATAcc < 1:16792/151‑1 (MQ=255) atgggcatgggcGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGCGGATATCCCAAAACAGGAGGTG‑ATTTTCCTGGATGATAcc < 1:2403771/141‑1 (MQ=255) atgggcatgggcGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGGATGAGGTGGCGGGTCATGCGGGTATCCCAAAAAAAGGGGGG‑GGTTTTCTGGGTGATACCCACCCCacat > 1:367125/1‑151 (MQ=255) atgggcatgggcGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGGATGAGGGGCCGGGTCATTCGGGTATCCCCAAAAAGGAGGGG‑ATTTTTCTGGGTGATaaccgatcggaa > 2:2403782/1‑139 (MQ=255) gggcatgggcGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGCGGATATCCCAAAACAGGAGGTG‑ATTTTCCTGGATGATACCGACCCCATAtcc < 2:2423679/151‑1 (MQ=255) gggcatgggcGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGCGGATATCCCAAAACAGGAGGTG‑ATTTTCCTGGATGATACCGACCCCATAtcc < 1:48398/151‑1 (MQ=255) gcatgggcGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGGGCCGGTTCCTGCGGATATCCCAAAACAGGAGGGG‑ATTTTCCTGGATGAAACCCACCCCCTAtcctc > 2:474497/1‑151 (MQ=255) gcatgggcGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGGATGAGGGGCCGGTTCATGCGGGTATCCCAAAACAGGGGGGG‑GTTTTTCTGGATGATACCGACCCCCTAtcctc > 2:676841/1‑151 (MQ=255) tgggcGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGCGGATATCCCAAAACAGGAGGTG‑ATTTTCCTGgat < 2:780292/128‑1 (MQ=255) gggcGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGCGGATATCCCAAAACAGGAGGTG‑ATTTTCCTGGATGATACCGACCCCATATCCTcccc < 2:1471216/150‑1 (MQ=255) cgGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGCGGATATCCCAAAACAGGAGGTG‑ATTTTCCTGGATGATACCGACCCCat < 2:2453795/136‑1 (MQ=255) cgGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGCGGATATCCCAAAACAGGAGGTG‑ATTTTCCTGGATGATACCGACCCCATATCCTCCCCGATGaa < 1:1189824/151‑1 (MQ=255) gCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGCGGATATCCCAAAACAGGAGGTG‑ATTTTCCTGGATGATACCGACCCCATATCCTCCCCGATGAAgg < 1:652043/151‑1 (MQ=255) gCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGCGGATATCCCAAAACAGGAGGTG‑ATTTTCCTGGATGATACCGACCCCATATCCTCCCCGATGAAgg < 1:2278657/151‑1 (MQ=255) tGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGGATGAGGGGCCGGGTCATTCGGATATCCCAAAAAAGGAGGGG‑ATTTTTCTGGGTGATACCGACCCCATATCCTCCCCGATGAAGGGCa > 2:2086890/1‑150 (MQ=255) gATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGCGGATATCCCAAAACAGGAGGTG‑ATTTTCCTGGATGATACCGACCCCATATCCTCCCCGATGAAGGCCaa < 1:1505/150‑1 (MQ=255) aTGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGGGTGAGGGGCCGGGTCCTGGGGGTATCCCCAAAAAGGGGGGGAATTTTCTTGGGGGTAACAGA‑CCCATATCCTCCCCCATGAAGGGCaaa > 1:2569446/1‑150 (MQ=255) gagCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGCGGATATCCCAAAACAGGAGGTG‑ATTTTCCTGGATGATACCGACCCCATATCCTCCCCGATGAAGGCCAAAGGTGTCg < 1:2415497/151‑1 (MQ=255) agCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGCGGATATCCCAAAACAGGAGGTG‑ATTTTCCTGGATGATACCGACCCCatat < 2:371795/123‑1 (MQ=255) cTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGGATGAGGGGCCGGTTCATTCGGATATTCCAAAACAGGAGGGG‑GTTTTCCTGGGTGATACCGACCCCATATCCTCCCCGATGAAGGCCAAAGGTGTCgggg > 2:2188887/1‑149 (MQ=255) tGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGCGGATATCCCAAAACAGGAGGTG‑ATTTTCCTGGATGATACCGACCCCatat < 1:333170/120‑1 (MQ=255) tGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGGATTAAGGGCCGGCTTATGCGGGTATCCCCCAACAGGAGGGG‑ATTTTTCCGGCTGATACCGACCCCCTTACCTCCCCCATGGAAGCCAAAGgtgttcgggg > 2:864865/1‑145 (MQ=255) ggCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGCGGATATCCCAAAACAGGAGGTG‑ATTTTCCTGGATGATACCGACCCCATATCCTCCCCGATGAAGGCCAAAGGTGTCGGTGa < 1:464130/150‑1 (MQ=255) ggCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGCGGATATCCCAAAACAGGAGGTG‑ATTTTCCTGGATGATACCGACCCCATATCCTCCCCGATGAAGGCCAAAGGTGTCGGTGa < 2:1759589/150‑1 (MQ=255) ggCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGCGGATATCCCAAAACAGGAGGTG‑ATTTTCCTGGATGATACCGACCCCATATCCTCCCCGATGAAGGCCAAAGGTGTCGGTGa < 2:283018/150‑1 (MQ=255) ggCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGGATGAGGGGCCGGTTTATGCGGATATCCCCAAAAAGGGGGGG‑ATTTTTCTGGATGATACCGACCCCCTATCCTCCCCGCTGAAGGGCAAAGGTGTCGGTg > 2:2605301/1‑149 (MQ=255) cGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGCGGATATCCCCAAACAGGAGGGG‑GTTTTCCTGGGTGATATCGACCCCATATCCTCCCCGATGAAAGCCAAAGGTGTCGGTGAGCt > 1:2142995/1‑151 (MQ=255) cGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGGATGAGGTGCCGGGTCCTTCGGATATCCCAAAAAAGGAGGGG‑GTTTTCCTGGATGATACCGACCCCATATCCTCCCCGATGAAAGGCAAAGGTGTCGGGGAGCt > 2:552776/1‑151 (MQ=255) gATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGGATGAGGTGCCGGTTCATTCGGATGTCCCAAAAAAGGGGGGG‑ATTTTCCTCGGGGGTACCGACCCCATATTCCCCCCCAATAAGGCCAAAGGTGTCGGTGAGCTGGGcc > 2:2537504/1‑151 (MQ=255) aTGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGCGGATATCCCAAAACAGGAGGTG‑ATTTTCCTGGATGATACCGACCCCATATCCTCCCCGATGAAGGCCAAAGGTGTCGGTGAGCTGGGCCt < 2:2081081/151‑1 (MQ=255) tGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGCGGATATCCCAAAACAGGAGGTG‑ATTTTCCTGGATGATACCGACCCCATATCCTCCCCGATGAAGGCCAAAGGTGTCGGTGAGCTggg < 1:2478953/147‑1 (MQ=255) aCCTTTTGTGCTACTTCGTTAATCACGATATAGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGCGGATATCCCAAAACAGGAGGTG‑ATTTTCCTTGATGATACCGTCCACATATCCTCCCCGATGAAGGCCAAAGGTTTCGGTGAGCGGGGCCtgtg < 1:474497/151‑1 (MQ=255) aCCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGTGGCGGGTCATGCGGGTATCCCCAAAAAGGAGGGG‑GTTTTTCTGGGTGATACCGAcccc > 1:1155914/1‑104 (MQ=255) aCCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGCGGATATCCCAAAACAGGAGGTG‑ATTTTCCTGGATGATACCGAcccc < 2:1155915/104‑1 (MQ=255) aCCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGCGGATATCCCAAAACAGGAGGTG‑ATTTTCCTGGATGATACCGACCCCATATCCTCCCCGATGAAGGCCAAAGGTGTCGGTGAGCTGGGCCtgtg < 2:2487035/151‑1 (MQ=255) gTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGCGGATATCCCAAAACAGGAGGTG‑ATTTTCCTGGATGATACCGACCCCATATCCTCCCCGATGAAGGCCAAAGGTGTCGGTGAGCTGGGc < 1:318413/143‑1 (MQ=255) gTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGGATGAGGGGCCGGTTCATGCGGATATCCCAAAACAGGAGGGG‑ATTTTTCTGGATGATACCGACCCCATATCCTCCCCCATGAAGGCCAAAGGTGTCGGTGAGCTGGGc > 2:318412/1‑143 (MQ=255) tGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGCGGATATCCCAAAACAGGAGGTG‑ATTTTCCTGGATGATACCGACCCCATATCCTCCCCGATGAAGGCCAAAGGTGTCGGTGAGCTGGGCCTGTgcggcg < 1:676840/150‑1 (MQ=255) gggCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGCGGATATCCCAAAACAGGAGGTG‑ATTTTCCTGGATGATACCGACCCCATATCCTCCCCGATGAAGGCCAAAGGTGTCGGTGAGCTGGGCCTGTGCGGCGTg < 1:2188878/151‑1 (MQ=255) ggCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGGATGAGGGGCCGGGTCATGCGGATATCCCAAAACAGGAGGGG‑ATTTTCCTGGGTGATACCGACCCCATATCCTCCCCGATGAAGGCCAAAGGTGTCGGGGAGCTGGGCCTGTGCGGCGTg > 2:1162367/1‑150 (MQ=255) cTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGGATGAGGGGGCGGGTCATGCGGATCTCCCAAAACAGGGGGTG‑ATTTTCCTGGATGATAACGACCCCATATCCCCCCCCCTGCAGGCCAAAGGGGTCGGGGAGCTGGGCCTgcgtggcgtgggg > 2:559175/1‑148 (MQ=255) tACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGCGGATATCCCAAAACAGGAGGTG‑ATTTTCCTGGATGATACCGACCCCATATCCTCCCCGATGAAgg < 1:2186752/112‑1 (MQ=255) tACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGGATGAGGTGCCGGTTCATGCGGATATCCCAAAACAGGAGGGG‑ATTTTCCTGGGTGATACCGACCCCATATCCTCCCCGATGAAGGCCAAAGGGGTCGGGGAGCTGGGCCTGTGCGGCGTGAgcg > 2:2190240/1‑151 (MQ=255) tCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGCGGATATCCCAAAACAGGAGGTG‑ATTTTCCTGGATGATACCGACCCCATATCCTCCCCGATGAAGGCCAAAGGTGTCGGTGAGCTGGGCCTGTGCGGCGTGAGCGCgg < 1:2190231/150‑1 (MQ=255) cGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGCGGATATCCCAAAACAGGAGGTG‑ATTTTCCTGGATGATACCGACCCCATATCCTCCCCGATGAAGGCCAAAGGTGTCGGTGAGCTGGGCCTGTGCGGCGTGAGCGCGGCt < 2:367124/151‑1 (MQ=255) tAATCACGATATGGCGGGGGATGAGGTGCCGGTTCATGCGGATATCCCAAAACAGGAGGGG‑ATTTTCCTGGATGATACCGACCCCATATCCTCCCCGATGAAGGCCAAAGGTGTCGGTGAGCTGGGCCTGTGCGGCGTGAGCGCGGCTATc > 2:114837/1‑151 (MQ=255) cGATATGGCGGGGGATGAGGTGCCGGTTCATGCGGATATCCCCAAACAGGAGGTG‑ATTTTTCTGGGTGATACCGACCCCATATCCTCCCCGATGAAGGCCAAAGGTGTCGGTGAGCTGGGCCTGTGCGGCGTGAGCGCGGCTATCGCCAAc > 2:1819168/1‑151 (MQ=255) atatGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGCGGATATCCCAAAACAGGCGGTG‑ATTTTCCTGGATGATACCGACCCCATATCCTCCCCGATGAAGGCCAAAGGTGTCGGTGAGCTGGGCCTGTGCGGCGTGAGCGCGGCTATCGCCAAcgc > 1:1794194/1‑151 (MQ=255) atGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGCGGATATCCCAAAACAGGAGGTG‑ATTTTCCTGGATGATATCGACCCCATATCCTCCCCGATGAAGGCCAAAGGTGTCGGTGAGCTGGGCCTGTGCGGCGTGAGCGCGGCTATCGCCAAcgcg < 2:2143003/150‑1 (MQ=255) tGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGCGGATATCCCAAAACAGGAGGTG‑ATTTTCCTGGATGATACCGACCCCATATCCTCCCCGATGAAGGCCAAAGGTGTCGGTGAGCTGGGCCTGTGCGGCGTGAGCGCGGCTATCGCCAAc > 1:2543523/1‑146 (MQ=255) tGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGCGGATATCCCAAAACAGGAGGTG‑ATTTTCCTGGATGATACCGACCCCATATCCTCCCCGATGAAGGCCAAAGGTGTCGGTGAGCTGGGCCTGTGCGGCGTGAGCGCGGCTATCGCCAAc < 2:2543538/146‑1 (MQ=255) tGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGCGGATATCCCAAAACAGGAGGTG‑ATTTTCCTGGATGATACCGACCCCATATCCTCCCCGATGAAGGCCAAAGGTGTCGGTGAGCTGGGCCTGTGCGGCGTGAGCGCGGCTATCGCCAACGCGgt > 2:695728/1‑151 (MQ=255) gTATGAGGTGCCGGTTCATGCGGATATCCCAAAACAGGAGGTG‑ATTTTCCTGGATGATACCGACCCCATATCCTCCCCGATGAAGGCCAAAGGTGTCGGTGAGCTGGGCCTGTGCGGCGTGAGCGCGGCTATCGCCAACGCGGTGTATAAc > 1:624085/1‑151 (MQ=255) | TGTGTGTGCTGCAGGACGCATCCTGAATCCGAAAACTGCGCGCAGCCAGGTCATTGGCGCAATGACTATGGGCATGGGCGCGGCACTGATGGAGGAGCTGGCGGTGGATGACCGTTTGGGCTACTTCGTTAATCACGATATGGCGGGGTATGAGGTGCCGGTTCATGCGGATATCCCAAAACAGGAGGTG‑ATTTTCCTGGATGATACCGACCCCATATCCTCCCCGATGAAGGCCAAAGGTGTCGGTGAGCTGGGCCTGTGCGGCGTGAGCGCGGCTATCGCCAACGCGGTGTATAAC > DH1/3571847‑3572144 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |