| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
TCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACG‑A‑CC‑C‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/781516‑781369‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAATTTCTTGCTACACGGCGGAGACTACATAAAGTAGTTGGTGG < NC_000913/2521128‑2521001 ||| TCGTCTCGCCCTGCGGGCCGTTGCTCCCGAAAGGTTATCCTTCACGTTCTCTTCTTTTAACCACGTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACG‑A‑CC‑C‑G < 1:94013/149‑1 GTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACG‑A‑CC‑C‑G‑AGgg > 1:577764/1‑149 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5:1489764/1‑93 CGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACG‑A‑CC‑C‑GAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAATTTCTTGCTACAC < 7:933418/151‑1 GACCAATTGACTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTTAGCTAAGG‑A‑CA‑C‑GAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAATTTCTTGCTACACG < 4:157635/151‑1 GACCAATCTATTCAACTTCAACTGCTCAACCCACAGAGCTAACG‑A‑CC‑C‑GAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAATTTCTTGCTACACG < 3:796517/151‑1 ACCCATTTAGTAAACGTCAACTTCTCAACCCACTTATCTAAGG‑AGCC‑C‑A‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAATTTCTTGCTACACG < 4:1164897/150‑1 CAATTTATTCAAATTCAACTGCTCTAAACACTTAGCTAACG‑C‑CC‑G‑GAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAATTTCTTGCTACACGGCG < 6:992915/151‑1 atggtTTAAACGTCAACTTCTCTCCACAATGAGCGCACGCC‑CC‑C‑A‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAATTTCTTGCTACACGGCGGA < 3:969049/146‑1 ggtcttcagatcttgTACCAACTGATATAACG‑A‑GA‑G‑GAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAATTTCTTGCTACACGGCGGAGACTACA < 8:433345/136‑1 AAAAGTCACATGCTATACCCACTGAGCGAACG‑A‑CA‑G‑GAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAATTTCTTGCTACACGGCGGAGACTAC < 4:705303/150‑1 TCTACCAACTGAGCTAACG‑A‑CC‑C‑GAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAATTTCTTGCTAAAAGCCGCAGAATACAagagccgaagctc > 5:433010/1‑138 TACCAACTGAGCTAACG‑A‑CC‑C‑GAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAATTTCTTGCTACACGGCGGAGACTAGATAAAGTAGTTGGTGG > 5:374913/1‑151 cACTGATCTAACG‑C‑CC‑CTA‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAATTTCTTGCTACACGGCGG < 8:104220/123‑1 AACTGCGCTAACG‑A‑CC‑C‑G‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTC < 3:186626/77‑1 AACTGAGCTAACG‑A‑CC‑C‑G‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTC > 2:186576/1‑77 AACTGAGCTAACG‑A‑CC‑C‑G‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAG > 4:820665/1‑69 ACTGAGCTAACG‑C‑CC‑C‑G‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTT < 6:717516/59‑1 ACTGAGCTAACG‑A‑CC‑C‑G‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTT > 4:718436/1‑59 GAGCTAACG‑ACCC‑C‑A‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAATTTCTTGCTAC < 5:931718/113‑1 GAGCTAACG‑A‑CC‑C‑GAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAATTTCTTGCTAa > 8:931339/1‑112 ACG‑A‑CC‑C‑G‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGT > 7:67642/1‑61 ACG‑A‑CC‑C‑G‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGT < 1:67763/61‑1 G‑A‑CC‑C‑G‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCC < 2:260692/43‑1 G‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCAC > 2:220767/1‑77 G‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCAC < 3:220895/77‑1 G‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAG > 6:131130/1‑48 G‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAG < 4:131392/48‑1 G‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTG > 6:1159231/1‑44 G‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTG < 4:1160761/44‑1 ||| TCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACG‑A‑CC‑C‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/781516‑781369‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAATTTCTTGCTACACGGCGGAGACTACATAAAGTAGTTGGTGG < NC_000913/2521128‑2521001 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |