| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 781446 | 264 (0.620) | 54 (0.150) | 33/260 | 32.6 | 15.8% | intergenic (+2/‑131) | lysZ/lysQ | tRNA‑Lys/tRNA‑Lys |
| ? | NC_000913 | 2521487 = | 349 (0.950) | intergenic (+159/+106) | lysV/xapR | tRNA‑Lys/transcriptional activator of xapAB | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
CCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCA‑GGTAACACCC‑GTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/781279‑781446‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑atcctgcacgacccaccaatGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATCTGCGATTTGCGAAATTGCCTGATGCGCTTCACTTAGCAGACTACTATTTCCGGCAATTCCTGTCTCCTCACCTACTGTGTCAATGCAGCCAACAGCTTAACCATCGCGGGCGTC > NC_000913/2521487‑2521635 CCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCA‑GGTAACACCC‑GTATGGGTCGTGAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGGTCGACTC > 3:1267955/1‑151 CCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCGAGAGTAAAAATCTTTCA‑GGTACCACCC‑GTATGGGTGCTTAGCTCAGTTGGTAGATCAGTTGAGTTTTAATCAATTGTTAGCAGGTTGGCATCC > 5:1157498/1‑151 CCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCA‑GGTAACACCC‑GTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCC < 1:359877/151‑1 TAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGACTAAAAATCGTTCA‑GGTAACACCC‑GTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGCCTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGACTCCTGC > 7:1048668/1‑151 AGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCA‑GGTAACACCC‑GTATGGGTCGTAAGCTCAGTTGGTAGAGAAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGC > 1:1641259/1‑150 AGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCGTTCA‑GGTAACACCC‑GTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGATCAGAAGACGATTAATCAATAGGTCGCACGTTGGAATCCTGC > 5:383802/1‑150 GGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCA‑CGTAACACCC‑GTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCAC < 5:1344337/151‑1 GGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCA‑CGTAACACCC‑GTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCAC < 4:535755/151‑1 GGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCGCGAGTAAAAATCTTTCA‑GGTACAACCC‑GGAGGGGTCGTTAGATGAGTTGGTTGAGCAGTTGAGTTTTAATCAATTCGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACG > 5:437166/1‑151 GAGCGGAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCA‑GGTAACACCC‑GTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACC < 6:101154/151‑1 AGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCGCGAGTAAAAATGTTTCA‑GGTAACACCC‑GTATGGGTCGGTAGATCAGGTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCC > 4:1405133/1‑151 AGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCA‑GGTAACACCC‑GTATGGGTCGTTAGCTCAGGTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGCATCCTGCACGACCC > 4:214080/1‑151 CGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCA‑GGTAACACCC‑GTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCATGAACGACCCAC > 1:1213746/1‑151 CGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCA‑GGTAACACCC‑GTATGGGTAGTTAGCTGAGTGGGTAGAGCAGTTGAGTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCAC > 7:1542215/1‑151 GAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATGTTTCA‑GGTAACACCC‑GTATGGGTGGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTTAACCACCCACC > 7:879738/1‑151 AAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCA‑GGTAACACGC‑GTATGTGTCGTTAGCTAAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTATTCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCAAGAaacaca > 2:1150342/1‑144 AAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCA‑GGTAACAAGC‑GTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGCCGTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACACAac > 4:12299/1‑148 AGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCA‑GGTAACACGC‑GTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGAGTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCCCCA > 7:740744/1‑150 AGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCACGAGTAAAAATCTTTCA‑GGTAACACCC‑GTATGGGTAGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATAAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGT > 1:754158/1‑150 TCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCA‑GGTAACACCC‑GTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTTATCAGTAGATCGAAGTGTCGGATAATGCACGACCCAAAAATGTAA > 8:1801/1‑150 accgatctaaCCACCAATCTAACACATTGGAGCCTAGTAAAAATCTTCCA‑CCTAACCCCC‑GTAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAA < 3:1083599/140‑1 CTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCA‑GGTAACACCC‑GTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAt > 2:1523177/1‑147 TGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCA‑GGTAACACCC‑GTATGGGTCGATAGCTAAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAGATGCG > 5:1295601/1‑151 ACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCA‑GGTAACACCC‑GTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAAAAGCGaac > 6:1541524/1‑148 CCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCA‑GGTAACACCC‑GTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGGCCTcc > 7:750113/1‑148 AATGTTATAGATTGGAACCTATTTAATATCTTTAA‑GTTAACACCG‑GTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCTAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGC < 1:1340925/150‑1 AATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCA‑GGTAACACCC‑GTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGAGCT > 7:1050600/1‑151 ATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCA‑GGTAACACCC‑GTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCTCACTAAAagagatt > 1:698201/1‑144 TTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCA‑GGTAACACCC‑GTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCTAACTAAAAGAGCATTTT > 1:162106/1‑151 tcaacATTCGCCCCGA‑TAAAAATTCTTCACGGTAACCCCC‑CTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTT < 7:697908/143‑1 TAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCA‑GGTAACACCC‑GTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCacatcg > 1:667217/1‑145 TAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCA‑GGTAACACCC‑GTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTGTTTT > 5:1170155/1‑151 ATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCA‑GGTAACACCC‑GTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCACTAAAAGCGCAGTTTTtgtat > 4:756838/1‑146 ATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCA‑GGTAACACCC‑GTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAAT < 7:1030351/99‑1 CCCGAGTAAAAATCTTTCA‑GGTAACACCC‑GTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGAACTAAATGAGAAGTTTTGCTATaaccg > 2:820671/1‑145 CCGAGTAAAAATCTTTCA‑GGTAACACCC‑GTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCG > 5:91316/1‑121 CGAGTAAAAATCTTTCA‑GGTAACACCC‑GTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCTACCTAAAAGCGATTTTTTGCTATatcctat > 2:574392/1‑143 GAGTAAAAATCTTTCA‑GGTAACACCC‑GTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGATGTTTTGCTATCTcggatcc > 4:887041/1‑144 tgatcatataTTCA‑CGTTAAACCCGGTAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATCTGCGATa < 1:921887/139‑2 GTAAAAATCTTTCA‑GGTAACACCC‑GTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGAGCTTTTTAGCTATCACCGATact > 2:287630/1‑147 TAAAATTCTTTCA‑GTTAACACCC‑GTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGC < 6:536052/126‑1 TAAAAATCTTTCA‑GGTAACACCG‑GTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATCTGCGATactc < 8:1170626/150‑5 TAAAAATCTTTCA‑GGTAACACCC‑GTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAATAAGCGAACTAGAGGAGCTGTTGTGCTATCacgttgactg > 3:527394/1‑140 TAAAAATCTTTCA‑GGTAACACCC‑GTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGC > 4:536653/1‑126 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TCA‑GGTAACACCC‑GTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGAACTAAA > 2:972031/1‑113 CA‑GGTAACACCC‑GTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGC > 4:1139780/1‑115 TAACACCC‑GTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAAAAGCGACCTAAAGGAGCTTTTTTGCTATatcctatactaa > 8:1217267/1‑124 GTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTT < 6:1416896/109‑1 GTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAG < 3:1079757/101‑1 GTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCT < 7:1012813/100‑1 GTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCT > 1:1013383/1‑100 TAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCA < 2:580250/69‑1 TAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCA > 3:580811/1‑69 AGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCC < 6:985564/54‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCC < 1:1142913/51‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCC > 7:1142619/1‑51 AGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCAC > 1:455857/1‑61 AGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCAC < 7:454936/61‑1 AGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCT > 8:845698/1‑50 AGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCT < 5:845800/50‑1 TGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCA > 8:658980/1‑60 TGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCA < 5:658973/60‑1 TAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTG < 7:229666/45‑1 AGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCA < 8:1480242/51‑1 AGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCA > 5:1479549/1‑51 GCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAAT < 8:1469940/37‑1 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2:795968/151‑1 GCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATCTGCGATTTGCGAAATTGCCTGATGCGCTTCACTTAGCAGACTACTATTTCCGGCAATTCCTGTCTCCTCACCTACTGTGTCAATGCAGCCAACAGCTTAA < 8:165292/150‑1 CACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATCTGCGATTTGCGAAATTGCCTGATGCGCTTCACTTAGCAGACTACTATTTCCGGCAATTCCTGTCTCCTCACCTACTGTGTCAATGCAGCCAACAGCTTAACC > 3:1423294/1‑151 aaGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATCTGCGATTTGCGAAATTGCCTGATGCGCATCACTTAGAACCCTACTATTTCCGGCAATTCCTGTCTCCTAACCTACTGTGTAAATGCAGCCAACAGCTTAACC > 6:304012/3‑150 CGACCCACCAATGTAAAAAATCTCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATCTGCGATTTGCGAAATTGCCTGATGCGCTTCACTTAGCAGACTACTATTTCCGGCAATTCCTGTCTCCTCACCTACTGTGTCAATGCAGCCAACAGCTTAACCAT < 4:244378/151‑1 CGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATCTGCGATTTGCGAAATTGCCTGATGCGCTTCACTTAGCAGACTACTATTTCCGGCAATTCCTGTCTCCTCACCTACTGTGTCAATGCAGCCAACAGCTTAACCAT > 8:268135/1‑151 CGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATCTGCGATTTGCGAAATTGCCTGATGCGCTTCACTTAGCAGACTACTATTTCCGGCAATTCCTGTCTCCTCACCTACTGTGTCAATGCAGCCAACAGCTTAACCAT < 5:1568780/151‑1 GACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATCTGCGATTTGCGAAATTGCCTGATGCGCTTCACTTAGCAGACTACTATTTCCGGCAATTCCTGTCTCCTCACCTACTGTGTCAATGCAGCCAACAGCTTAACCATC > 1:994735/1‑151 CCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATCTGCGATTTGCGAAATTGCCTGATGCGCTTCACTTAGCAGACTACTATTTCCGGCAATTCCTGTCTCCTCACCTACTGTGTCAATGCAGCCAACAGCTTAACCATCGCG > 3:1277002/1‑151 ACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATCTGCGATTTGCGAAATTGCCTGATGCGCTTCACTTAGCAGACTACTATTTCCGGCAATTCCTGTCTCCTCACCTACTGTGTCAATGCAGCCAACAGCTTAACCATCGCGGG < 5:507230/151‑1 CCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATCTGCGATTTGCGAAATTGCCTGATGCGCTTCACTTAGCAGACTACTATTTCCGGCAATTCCTGTCTCCTCACCTACTGTGTCAATGCAGCCAACAGCTTAACCATCGCGGGC < 6:44239/151‑1 CCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCGTTTTTGCTATCTGCGATTTGCGAAATTGCCTGATGCGCTTCACTTAGCAGACTACTATTTCCGGCAATTCCTGTCTCCTCACCTACTGTGTCAATGCAGCCACCAGCTTAACCATCGCGGGC > 7:1478390/1‑151 CAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATCTGCGATTTGCGAAATTGCCTGATGCGCTTCACTTAGCAGACTACTATTTCCGGCAATTCCTGTCTCCTCACCTACTGTGTCAATGCAGCCAACAGCTTAACCATCGCGGGCG > 1:1043371/1‑151 AATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATCTGCGATTTGCGAAATTGCCTGATGCGCTTCACTTAGCAGACTACTATTTCCGGCAATTCCTGTCTCCTCACCTACTGTGTCAATGCAGCCAACAGCTTAACCATCGCGGGCGT < 6:344732/151‑1 ATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATCTGCGATTTGCGAAATTGCCTGATGCGCTTCACTTAGCAGACTACTATTTCCGGCAATTCCTGTCTCCTCACCTACTGTGTCAATGCAGCCAACAGCTTAACCATCGCGGGCGTC > 4:1362320/1‑151 CCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCA‑GGTAACACCC‑GTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/781279‑781446‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑atcctgcacgacccaccaatGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATCTGCGATTTGCGAAATTGCCTGATGCGCTTCACTTAGCAGACTACTATTTCCGGCAATTCCTGTCTCCTCACCTACTGTGTCAATGCAGCCAACAGCTTAACCATCGCGGGCGTC > NC_000913/2521487‑2521635 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |