| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 288 total aligned reads displayed.
CCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGC > NC_000913/2817792‑2818092 | ccgggatcagtctcaCCTACGACCTCTCGGTGCGTCTGCGCGTAGTGTATGCCGCTGAGATAAGGATGCAGCTGCATTAGTTATTCTACTGTTGATATTGATACCGCTACTAACGCAATATCAATTACCAGATGGTGCATCCGGGAGGAtt < 8:713587/137‑1 (MQ=2) ggaggaTTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGG‑AAAGTTATTTTACTGCTGATATTGATAGCGCTAGTATAGCCATATAAAGAATGAGATGGTGGCTAGCGGAGGATTaga > 3:200692/1‑148 (MQ=11) ggagcaTTCGAACCTCCGACCTCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGATCTACGCATGCATCGGGAACCGTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTAGTAAAGCAATATCAATTACTAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACt < 4:1051208/151‑1 (MQ=14) aggaTTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCg > 6:96837/1‑151 (MQ=255) gaTTCGAACCTCCGACCGCTCTTTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAAGTTATTCTACTGCTGATATTGATAACGCTACTAAAGCCATATCAATTATTAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGcc < 1:257480/151‑1 (MQ=14) cccaCCTCCTACCGCTCGGTGCGTAGCCGAGGACTCTATCCCGCTGAGCTACCCATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAACGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTg < 7:1599636/147‑1 (MQ=17) cGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACCGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTCCTGATATTGCTACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTg < 4:270577/150‑1 (MQ=255) ttaccctcGACCGTTCGGTTCGTAGACGCGCAGTCTATCTCGCTGAGATAATCATTCATCTTCATTAGTTATTCTTCTGTTTCTATTGATACATTTACTAACGAAATTTTAATTACCAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGc < 1:215053/143‑1 (MQ=255) cgccGACCGCTCGGTTCGTATCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAACAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTc < 3:290914/149‑1 (MQ=255) gACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATTCAGCTGAGATACGGATGCATCGGG‑AAATTTATTTTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAAGTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACACGcgccgacccacgccat > 7:1130844/1‑136 (MQ=11) ccGCTCGTGGCGTAGGCGAGTACTGTATCCCGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAACACTTATTCTACTGCTTATATTGATACCGGTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCtt < 7:984034/151‑1 (MQ=17) cGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTc < 1:1133170/151‑1 (MQ=255) gtCGGTTGGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCAGAGCTACGCATGCAGCGGCAACCCTTCATCTACTGCTCATATTGATACCTCTACTAACGCCATTTGAATTACAAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCgg < 7:140344/150‑1 (MQ=17) 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aattcATCGGGAATCGTTATTGTACTTCTTTTATTGATACATCTTCTTAAGCCATATCTATTACGAGATTGTGCATCCGGGAGGCTTTCTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCg < 5:776652/147‑1 (MQ=14) aattcATCGGAAAAACTTATTCTACTGCTGAAAATGATACCTCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCg < 3:448547/147‑1 (MQ=255) atccATCCGCAAAACTTCTTCAACTGCTGTTTTTTCTTCTGTTTCTACAGCCATATCATTTAGCAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCg < 2:324207/147‑1 (MQ=14) gCATCGGG‑AAATTTATTTTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAAGTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCCCGATGAGGCTAGCCATGGGTGCCGTTTAAAATAAAAAGTTATCCTCCCTattaaaacgga > 6:1620001/1‑138 (MQ=2) aTCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGAttc < 8:471227/83‑2 (MQ=255) aTCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTa > 5:470672/1‑83 (MQ=255) 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gCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGAAACGTTATCCTACCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGgaga > 2:1599288/1‑150 (MQ=255) cATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCATAGCGGCTAGCCATTCTGGCCGTTTATAAAGAAACGTTAACATACCTATTGAAAGCGGTTAATTCAGCTACCTCTTAGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAat > 2:1447441/1‑150 (MQ=18) actCAATTAAGAGCTCGGGCACCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGTCTCTACCTTCGGGCCGTTCCTAAAGCAACGTTATCATCCATACTGCCTTCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATg < 2:712339/149‑1 (MQ=18) cAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTg > 2:882379/1‑151 (MQ=255) ttAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCATTGCGCCTCGCCCTTCTGGCCGTTTCTAAAACAACGATAACATACCTAGTGCAAGCGATTAATTCAGAAAACTCTTCGATACCTTCAATGCTAAAGATTTCGGATAATATGGTGAAt > 1:1039382/1‑151 (MQ=17) tAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTAGCGGGGCGGCTCGCCATGCGGGCCGTTGCTAAAGGAAAGGTAACCTACCTAGTGCCTGCGGTTTATTCGGCTACCTCTGCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGAGCAt > 5:979619/1‑150 (MQ=17) aaGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATcc < 7:1169996/151‑1 (MQ=255) aaGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCAGAGCCGCTAGCCATTCTGGCCGTTGATAAAGCAACGTTATCATAACTAGTGACTGCGGTTAATTCCTCTACCTCTTCGATACCTTCATTGATGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATcc > 6:1028652/1‑151 (MQ=18) agagATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCGTTGCGGCTCCCCCTTCGGGCCGTTGCGAAAGCAACGTTATGCTCCCTAGTGCCTGCGGTTAATACCGCTACCGCGTCGATACCTTCATTGCTGAAGAGTTCGGAGAATATGGTGCTTCCg > 5:231724/1‑151 (MQ=14) agagATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCg > 3:325633/1‑151 (MQ=255) gaTGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCggg > 7:258664/1‑150 (MQ=255) gCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTc > 2:679976/1‑151 (MQ=255) gCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTc > 5:1480835/1‑151 (MQ=255) aTCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCg > 3:669341/1‑150 (MQ=255) aTCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCg > 1:1172750/1‑150 (MQ=255) ccGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAAc > 3:860538/1‑151 (MQ=255) ccGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATAACTTCATTGCTGAAGATTTATGAGAATATGCTGCATACGGGAGGATTCGAAc > 8:1161814/1‑151 (MQ=255) gggAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCt > 3:822449/1‑151 (MQ=255) ggaggaTTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACATc > 2:1049234/1‑151 (MQ=255) gaggaTTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTcc < 3:572698/151‑1 (MQ=255) | CCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGC > NC_000913/2817792‑2818092 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |