| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1287084 | 206 (0.480) | 99 (0.270) | 56/260 | 21.9 | 29.8% | intergenic (+558/+3) | narI/tpr | nitrate reductase 1, gamma (cytochrome b(NR)) subunit/protamine‑like protein |
| ? | NC_000913 | 1287557 = | 287 (0.780) | noncoding (66/85 nt) | tyrT | tRNA‑Tyr | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 217 total aligned reads displayed.
GTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTT > NC_000913/1286935‑1287233 | cGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGCCGCTCGAGGCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACt < 5:733017/151‑1 (MQ=255) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGTCGCTCTAGTCGAACCTTTGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGATTTCAGGGTCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTa < 6:502898/148‑1 (MQ=11) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGCCGCTCCAGGCGAACCTTCGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCTCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGATTTCAGGGTCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGTAAGGATTACTc < 2:562996/151‑1 (MQ=11) tGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTAGTccc > 5:997662/1‑149 (MQ=255) tGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTccg > 3:1346342/1‑149 (MQ=255) gCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGCCGCTCCAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCTTTTCATTGTCAGAATATTTGATTTCTTATTCGCTTTAGAGTTCAGTGTCTTTTTAAAGTTATGTTTTTGGTTGAAGGATTACTCAgc < 8:1110706/151‑1 (MQ=9) ccTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAttccaccggg > 4:780044/1‑143 (MQ=255) ccTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTAGTccg > 4:1140839/1‑147 (MQ=255) cTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGATTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTaataatca > 8:591320/1‑143 (MQ=255) cTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGATTGAAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTagaaacatc > 6:1050578/1‑143 (MQ=255) tGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGGTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAttcgaaccctcg > 5:138447/1‑141 (MQ=255) tGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTAcaaacatc > 8:89242/1‑143 (MQ=255) gCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAttcgaaccttc > 1:1570979/1‑140 (MQ=255) ggCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTATCATCCTTCCCCGCATGGGGAGAATATTTGATTGGTGCTGCGGTTGAGAGTTCGGGGACTGGTGAAAGTGATTGTGGTGGGGGTGGGCTTCCTCCGCgcggcg > 7:135313/1‑151 (MQ=255) cGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCCTCCACCCATGGGCAGAAAAGTGCATTGAGAATTCTCTTTAGAGTTAAGGGACTTGTGAAAGAAAAATTCGTGGGGGACGGCTTCCTCCGCGCGGCGCGGTTGGccggggggggcg > 4:1068890/1‑141 (MQ=255) gcaaggcGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGCCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTg < 3:985579/145‑1 (MQ=2) gAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCACGGATGGGCAGAAGAGTTCATAGCGGATTGCAGAGATATATCAGGGAAATTGGAAAGTGATCGTGGTGGGGGAAGGATTCGTCCGCGCGGCGGGGGTCGccgggggggtcgtggcg > 4:949252/1‑136 (MQ=255) caaCCTTCCTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGCGCAGAATATTTTATTTATTTTTAGGTTGAGAATTCAGTGCATTTTTAAAGTGAAGTTTGTTTCGGAACTATTAGTTATTGCGTTGTGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCgg < 2:1495547/150‑1 (MQ=2) 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aTCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCt < 3:1504869/151‑1 (MQ=255) tcccgtcttgttctgAATATTTGATTGCGGATTCGTTTTATATTTCAGGGACTTTTGAAATTGATGGTGGTGTTGGTAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAg < 2:894167/136‑1 (MQ=11) gcccGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGCCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTc < 5:267590/150‑1 (MQ=255) cccGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGATTTCAGGGTCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCg < 6:1126562/151‑1 (MQ=9) cccGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGACTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCg < 1:857576/146‑1 (MQ=9) cccGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTc < 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cggttGAGAATTCCGGGTCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCg < 3:1419757/148‑1 (MQ=9) tgtgagTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCTGCGCTGCGCGCTTCTCCCTTCGGGGCGTTGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCgat < 6:1476737/146‑3 (MQ=11) gagaGTTCCGGGCCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATg < 7:711254/150‑1 (MQ=25) taagTTCATGTAGTTTTGAATGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCACCCTTCGGGCCGTTGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCgatgag < 2:1245589/148‑6 (MQ=18) agagTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGTGGCAACGGTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCgaagagt > 7:1399788/1‑145 (MQ=11) 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2:1064712/1‑151 (MQ=255) tggtggGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGAGGCAACGATCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCAACCTACAACGCAAGAGCATAATATATaaaaaaacattagtata > 8:319624/1‑135 (MQ=11) ggtggGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGAtt < 7:1466057/143‑1 (MQ=35) ggggggggAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGGCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGa < 3:802782/148‑1 (MQ=255) ggggggggAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTggg < 5:1261817/147‑1 (MQ=255) tggGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGGGGCAAAGCACTCTCGCTGGCGCGCGAGTAGAACCTTTGTAGAAGCGTCTCAACCTTCCACCCCGGGGGGGAATATTAAATTgggggatagtttgttat > 8:552949/1‑138 (MQ=2) tggGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGa > 5:695276/1‑149 (MQ=39) ggggAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGtt < 7:830750/151‑1 (MQ=255) gggAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGttg > 7:1261723/1‑150 (MQ=255) ggAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGGAGAATATTTAATTTCGGATTCGTTGGGAAGTTc > 7:1036427/1‑150 (MQ=255) ggAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCGTGGTCGAAGCGTCTCATCCGTCCCCGCATGGGCCGAATATTTAATTGCGGATTCGGTGGGAAGTTc > 5:941229/1‑150 (MQ=255) gAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCa < 7:577975/150‑1 (MQ=255) aaGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTGGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGCATATTTAATTTCGGATTCGTTGGGAAGTTCAgg > 5:1546866/1‑151 (MQ=255) aaGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAgg < 3:606061/151‑1 (MQ=255) aaGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGGCGAACCTTCGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTc < 1:1216891/148‑1 (MQ=255) aaGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTTATTGCGGATTCGTTGGGTAGTTCAgg > 7:1216034/1‑151 (MQ=255) aGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCAAGCGCGCGCTCCAGACCAACCAAGGTCGAAGCTTCACAAGATTAACAACATGTGGACAATATTTAATTGCGGATACTTATGGAACTTCAcgg > 4:18388/1‑151 (MQ=2) ggATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGTCGCTCGAGTCGAACCTTCGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGa < 8:789425/151‑1 (MQ=255) ttACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGAcgt > 5:182734/1‑149 (MQ=255) tACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACtt < 2:183258/150‑1 (MQ=255) | GTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTT > NC_000913/1286935‑1287233 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |