| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,304,842 | 0 | C | A | 23.3% | 254.4 / 18.7 | 223 | intergenic (+449/+266) | eco/mqo | ecotin, a serine protease inhibitor/malate dehydrogenase, FAD/NAD(P)‑binding domain |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (89/69); new base A (46/2); total (150/73) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.93e-08 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 229 total aligned reads displayed.
CGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTT > NC_000913/2304692‑2304947 | ggTTGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATGATTCCTACACAGGTGTGTATTGCTCCACCCCGTAGGTTCGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCt < 2:1662808/151‑1 (MQ=14) tGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTGGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCGAACGGCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGAGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTacc > 7:1457097/1‑150 (MQ=9) cccccaccgccGCTGGCGCGACCTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACAcc < 3:1534455/141‑1 (MQ=255) cTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAGCAGGGCTACAccc > 7:154393/1‑150 (MQ=255) tGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCCACGTGCAGCGGCGC‑AGCCGGATGCCTGATCCTCAGCTTCCGCGTCTTAGCAGGCCTACAcctg > 5:328859/1‑149 (MQ=11) gattctaCGCTGGCGCGTCGTTTCTGGGCTACACCGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCt < 6:365154/145‑1 (MQ=11) gacgCGACGCGGGCGCGTCTTATCATGCCTACACCGCTGGCACGCGCGCCACCCCGTCGCTTGGCTAAGGAGGTTACGCCGCATCCGACACCCAACGCCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCt < 4:186743/148‑1 (MQ=11) gATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCATACACCCCTGGGAAGTGCGCCGCCCCGTAGGGTGGATAAGGCGGTGACGCCGCGTCCGCCATCCAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTCATGCGACGCTGGCGCGTCGTATCAGGCGAacacacct > 5:735856/1‑147 (MQ=11) caCGCTTGCGCTTCTTATCAGTCCTACAACGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTTGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGaa < 2:1166733/150‑1 (MQ=255) aCGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATTCGACGTTGTCGCGTCTTATCAGGCCTTCACCGGTGTGa > 7:22868/1‑149 (MQ=255) cGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTAGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCGAACGACCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACACTGGCGATTCTGATCAGGCATacaaagattttaagt > 8:152273/1‑139 (MQ=11) gccggCGCGTCGTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCTGTAGTTGCGATTAGGGGTTTACCGCGCCTGCGACATCAAACGTGGT‑ACCCGGTTTGCTCTTGCGAGCCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTg < 7:818326/148‑1 (MQ=2) cTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGGCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGGCTGAGCAGCCCTACCCCCCGGTGAAGTGc > 3:222153/1‑151 (MQ=11) gcgTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGGCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCCGTACCCCCATGAGAACtcctcccc > 4:380089/1‑149 (MQ=11) gcgTCTTATCAGGCATACACCGCTGTGAAGTGCTAAACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCTCATCAGACATAAAACGTCCG‑AGCCGTTTGACTGATGAGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCATACCCCGCTGGGAGGTGcgcgac > 6:622951/1‑146 (MQ=11) gcgTCTGATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCC‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAc < 4:1573444/151‑1 (MQ=25) cgTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCGAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCAGCCGCGTATGATACGTCCTACCGCGCTTCGAAGTGCTCCAcc > 3:525083/1‑151 (MQ=11) cgTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGATCCAGCCCGTAGCTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCTACATCAAAAGACCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACGCCGCGGTGACGTgggccccc > 4:1155817/1‑144 (MQ=11) cgTCTTATCAGGCATACACAGCTGTGAAGTGCTCAACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCCAACGGCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGAGCGTCTTATCAGGATAACACAGATCAGAAGTGCTCGAcc > 1:362878/1‑151 (MQ=11) tctgttCATGCCTACACCGCGGTGATGTGCTCTCCGCCGTAGGTGCGATAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGGCCG‑AGCCGGGTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAcc < 6:889572/144‑1 (MQ=11) ttATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCAAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTAGATCGTCTTATCATCCATAAACCGATGTGAATTGcgcaaacacgt > 8:625216/1‑141 (MQ=11) tATCAGTCCTAGACGGTTTTGATGTGTTCCACCCCGTAGGTCTGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGGCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGt < 2:119827/150‑1 (MQ=11) tATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCAAACGACCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGATATCGCATCATATAAGTCATACAAAACAGTGAAGTGCtaaaacaagt > 8:195727/1‑141 (MQ=11) tCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCCCTCAGAACTCCTCCCCCCCGTAgg > 7:63559/1‑151 (MQ=14) gacTACACTTCTGTGAAGTGTTTCACCACTTTTGTTGGATAAGTTGTTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCg < 6:1235257/148‑1 (MQ=14) gCCTACTCCGCTGTGAAGTGCGCCACCCCGTAGGTTGGATAACGCGGTGTCGCCGCATCCGAGATCCAACGGCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCgg < 3:61319/151‑1 (MQ=11) acacCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGATATATAAAGCGCTTACTCATCATCAAAAATCAAACGTAAA‑ATCATGTTGACTGATGAGACGCTGTCCATTAATAAAAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCggcggc > 1:1299035/1‑147 (MQ=2) cacCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCAAACGACCG‑AGCAGCTTGCCTGATGCGACTCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCCCCCCGTAGGTAGGATa > 6:323992/1‑149 (MQ=11) gggCTGTGATTTGCTCTACACGTTTGGCTTGATATGTCGGTTTCGCCGCATCCGAGATCCAACGGCGG‑AGGCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCGGTAGGTCGGATAAGGc < 8:1106664/149‑1 (MQ=11) ccGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTCGGCCGCATGCTACATCAAACGTCGG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGc < 7:525089/151‑1 (MQ=14) cGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCAAACGACCG‑AGCCGGTTCCCATAAGCGACGATTTCGCTTATTATCATGCCTAAACAGGTGTTAAGTGATCAACCCCTTAgcttttataaatcg > 2:1357504/1‑138 (MQ=2) cGCTGTGAAGGGCGCCACCGCGGAGGTGGGATAAGGCGGGTACGCCGCATCCGACATCCAACGGCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCg < 3:1225403/151‑1 (MQ=11) gCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCAAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCAATCCACACATCTGAAGTGCGCACCCCCGTATGTCGTATaattacg > 6:273178/1‑146 (MQ=11) gCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCAAACGACCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCAAAACACACATCAGAACTGCTCCACCCCATATGTCGGATaattac > 6:972945/1‑146 (MQ=11) cTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCTTAGCCAGCTGTGAAGTGCACCACCCCTTAGGTCGGATAAGGCGGt > 4:735210/1‑151 (MQ=14) tttgAAGCGCTCCACCCCCTAGGTTGGATACGGCTGTTACGCCTCTTCAGACATCTCACGTCCG‑TATCTGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGt < 7:1309109/148‑1 (MQ=11) tgtgAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAGGTCGGATGCGCCCAATCCTCCAGCCAACTACCA‑ATACTCTTGCCTGATGCGACGCTTGAGCTTGTTATAAGGCCTACTCCGCTGTGGAGTGGTGCGGCGCGTAGGTggggtggggggggt > 4:72469/1‑140 (MQ=2) gtgAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGGGTGTGCGCCGCAGCCGACATCAATCGACGC‑AGCGTGTTGCCTGATGCGACGCTGGGGCGTCTTGTAAGGACTACACCGCTGTGCAGTGCTCCCCCCCGTCGGTGGGATACGggggggg > 3:718847/1‑148 (MQ=2) gtgAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCAAACCACCCCTCAGAAGTGCACAACCCCGTAGGTCGGATaatgacgaa > 2:822367/1‑143 (MQ=14) gtgAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGGGTTATGAGGCGTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGtt > 3:1453430/1‑150 (MQ=255) tgAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCAATACACACCTGAGAAGTGCTAAACCCCGTAGGTCGTATAAGTAGGTTAc > 1:749875/1‑151 (MQ=14) aaGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCATACACCGCTGAGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTActc > 2:49411/1‑149 (MQ=255) aGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCAAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGAATACACACATCAGAACTGAACACCCCCCTAGGTCGGATCAGGCGCTTAcgac > 6:65631/1‑149 (MQ=14) gTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGGATGAGGAATAC‑ACCTCGGCAGCCGCTTCCCATATGAGACGCTCGGGAGGCGTATGAGGCATCAAAAGATGTGAAGTGCTCCCCCGCGTAGGGGGGCTCAGGCGGTGAcgcgg > 5:77040/1‑149 (MQ=2) gCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCAAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCCATACACCGCTCTGAAGAGCTCCACCCAGTAGGTAGGATAAGGCGGTTaagaagc > 2:137253/1‑144 (MQ=11) gCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCAAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCACATCTTAACAGCCAAACACAGCTAAAAAGTGATCCACAAAGTAGGTAGCATAATGCGCTTActaaga > 8:1308558/1‑145 (MQ=2) cTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCATACACCGATCTGAAATACACAACCCCGTATGTCGTATAAGTCGCTTAccacgaa > 1:445130/1‑144 (MQ=14) tCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCGAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGACTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGGGGGTAcggcgccgg > 4:124042/1‑148 (MQ=14) tCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCAGCCTc > 2:805213/1‑151 (MQ=255) aaaagcagTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGACTAAACTTAAATCCAACCTACG‑AGCAGGTTGACTGATGCTACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATcc < 1:22840/144‑1 (MQ=14) aCCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGATGTGAAGTGCTCCACCCCGTATGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCg > 5:492666/1‑150 (MQ=255) cccgggacgatGGAAAAGCCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCG‑AGCCTGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCTCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGGCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGAc < 5:537559/141‑1 (MQ=11) ccccGGAGGTCGGATAAGGCGGTTACTCCGCATCCGACATCACACGGCCG‑AGCCGGTGGACTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGAc < 5:1249958/151‑1 (MQ=11) ccggTAGGTCGGAGAAGGCGGGTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGAcn < 7:1103298/148‑2 (MQ=255) cccGTAGGTTGTATAAGCCCGTTACGCCGCATCCGACATCCACCCTCCG‑CCCCGGATGCCTGACGCGTGGCGGTCCCTTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACa < 4:1599714/151‑1 (MQ=14) cccGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCCCCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGAc > 3:173487/1‑150 (MQ=255) cccGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGAc > 5:281974/1‑150 (MQ=40) ccGTAGGTTGGATCAGGCGGTTACGGAGCATGCGACATGGACCGCCGC‑CGGCGGGTGCCGGTAGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACAt < 4:668307/151‑1 (MQ=11) cGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATc > 7:1584264/1‑151 (MQ=40) cGTAGGTAGTATAAGTCTTTTACGTCGAATCTTACATAAAACGTCGG‑TGTTGGTTTCTTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATc < 6:77849/151‑1 (MQ=11) aGGTTGGATAATGCGTTTACTCCTCATCCGACATCCAACGTGCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTaa < 1:155038/151‑1 (MQ=255) aGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGACTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGAGGTTACGCCGCATCCGACATCTa > 2:717364/1‑150 (MQ=255) ggTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAAc > 8:1650131/1‑151 (MQ=39) tGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCCCCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGcc > 4:562994/1‑151 (MQ=37) gATACGGCGGGTACGCCGCATCCGACAGCGCACGGCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCa < 7:1359773/151‑1 (MQ=11) gATAAGGCGGTTACGCCGCATCGGACATCCAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGccc > 2:60169/1‑150 (MQ=25) gATAAGGAGTTTACGCCGCATGCTAGATCTAACGGACG‑AGCTTGTTTTCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGccc < 6:17965/150‑1 (MQ=11) aTAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCGTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCa > 3:1282893/1‑150 (MQ=25) aTAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCa > 1:1092375/1‑150 (MQ=35) tAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCATACACCGCTGTGAAGTGCTCCCCCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTCCTCCGCATCCGACATCTAACGCCCaac > 3:1109006/1‑150 (MQ=255) aaGGCGGTTACGCCTCATCTTATATCGAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTTATCCTACGCTGTCGCGTCTTATCATGCATTCAGCGCTGTGAAGCTCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGc < 6:1171186/151‑1 (MQ=11) aaGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCATACACCCCTGTGAAGTGCTCGACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTCCGCCGCATCCGACATCTAACGCCCCAGc > 4:1005992/1‑151 (MQ=255) aaGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCCAAACACACATCAGAAGTGCTCCACCCCCTAGGTCGGATAAGTAGGTTACGCCGAATCCGACATCTAAAGCCCaacc > 8:426244/1‑149 (MQ=11) aGGCTGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCAATACACCCCTGAGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGAGGTTACGCCGCAGCCCACATCTAACGCCCCAgac > 5:921207/1‑149 (MQ=11) aGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCGAACGTCCG‑AGCCGGTGGCCTGATGCGACGCGGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGcc < 4:229254/151‑1 (MQ=16) aGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGcc < 3:88200/151‑1 (MQ=33) aGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCATACACCGATATGAAGTGATCCACCCCTTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGACGCATCCTACATCTAACGCCCCAGcc > 2:196580/1‑151 (MQ=11) tttACGCCTCATCCGACATCCTACTTCAT‑ATCTTTTTGCCTGATGCTACGCTTGCTCGTCTTATTTGGGATATACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGtt < 8:457806/149‑1 (MQ=11) ttACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCATACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGACCAAGCCGGTTGc > 6:551610/1‑151 (MQ=18) aCGCCGCATCCGACATCCAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCt > 1:1372955/1‑151 (MQ=31) aCGCCGCATCCGACATCCAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCATACACCCCTCTGAAGTGCACCACCCCCTATGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAAATCCCAAGCCGCTTGCCt > 1:1465754/1‑151 (MQ=11) cgccgcATCCGACATCCAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTg < 7:276142/151‑1 (MQ=31) gccgcATCCGACATCCAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGAGAATCTAATCAGGCATACAAAGATTTGAAGTGATCCACCCCGTAGGAAGGATAAAAAGATTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCATg > 1:921398/1‑150 (MQ=11) ccgcATCCGACATCCAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACAACGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCACAAGACGGTTGCCTGAt > 2:178668/1‑151 (MQ=9) ccgcATCCGACATCCAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGACTACACCCCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTAGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCGAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGAt > 7:455318/1‑151 (MQ=9) gcATCCGACATCCAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCAGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGc > 2:1186420/1‑151 (MQ=14) cATCCGACATCCAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCATACACCGCTCTGAAGTGCTACACCCCGTATGTCGTATAAGGACGATACGCCGCATCCCACATCTAAAGCCCAAGCCGATTGCCTGATGCg > 6:1185355/1‑151 (MQ=11) aTCCGACATCCAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATACGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCg > 4:1498010/1‑150 (MQ=14) aaggtgatggcaggTCAG‑AGCAGGTGTCCTGATTCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCTAc < 5:152091/138‑1 (MQ=11) aCATCCAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCGTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTg < 3:639291/151‑1 (MQ=14) aCATCCAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTg > 2:1448184/1‑151 (MQ=31) aCATCCAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCAATACACCCCTCAGAAGTCCTCCACCCCGTAGGTCGGATAATGCGGTAACGCAGCATCCCACATCTAACGCACAAGCAGGTTGCCTGATGCGACGCTg > 1:662349/1‑151 (MQ=11) aTCCAAAGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCCATACAACGCTCTGAAGTGCTCAACCCCGTAGGTCGGATAAGTAGGTTACGACGCATCCGACATCTAAAGCCCAAGCAGGTTGCCTGATGCGACGCTGgc > 2:1282179/1‑151 (MQ=11) ccAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGCAGTGCTCCCCCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCCTCCGACATCTAACGCCCACGCCGGTTGCCTGATGCGCCGCTGgcgc > 3:295568/1‑151 (MQ=255) ccAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGAATACACCGATCTGAAGTGCTCAACCCCCTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGAAACCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGgcgc > 6:1485603/1‑151 (MQ=11) aaCGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTAGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGt > 2:383138/1‑151 (MQ=14) aaCGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCATACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCTGTTGCCTGATGAGACGCTGGCGCGt > 6:1359418/1‑151 (MQ=9) aCGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCATACACCGCTCTGAAGTGCTCAACCCCGTAGGTCGTATAAGGAGGTTACGCCGCATCCCACATCTAACGCCCAAGCCTGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTc > 8:1188737/1‑151 (MQ=11) gTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTGTTATCCGGCCTCGCCCCCTGGGAAGTGCTGCACACCGTAGGTGGGATAAGGAGGTTACGCAGAATACGACATCTCACGCCCGCGCCGGTTGCCTGCTGCGGCGGGGGcgcggggt > 4:913080/1‑147 (MQ=2) gTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCGTCCCCAGCTGGGCCGTGCTCCCCCCCGTAGGTCGGATCAGGCGGTTGCGCCGCATCCGACATCTAACGCCCCCGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTcgt > 4:1377057/1‑149 (MQ=11) | CGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCG‑AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTT > NC_000913/2304692‑2304947 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |