| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,165,968 | C→T | intergenic (+283/‑117) | ycfP → / → ndh | putative UPF0227 family esterase/respiratory NADH dehydrogenase 2/cupric reductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,165,968 | 0 | C | T | 99.4% | 1803.7 / ‑2.9 | 473 | intergenic (+283/‑117) | ycfP/ndh | putative UPF0227 family esterase/respiratory NADH dehydrogenase 2/cupric reductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/1); new base T (213/257); total (215/258) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.93e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 479 total aligned reads displayed.
CCCTGCATACACCCCTCACTCTATATCACTCTCACAAATTCGCTCAAATAATAAACAATAAACTCTGTTTTTTGATCTCACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCACCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAACAATTGGTTAATAAATTTAAGGGGGTCACGTTGACTACGCCATTGAAAAAGATTGTGATTG > NC_000913/1165820‑1166115 | ccTGCATACACCCCTCACTCTATATCACTCTCACAAATTCGCTCAAATAATAAACAATAAACTCTGTTTTTTGATCTCACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCACCAt > 5:1132959/1‑151 (MQ=255) cTGCATACACCCCTCACTCTATATCACTCTCACAAATTCGCTCAAATAATAAACAATAAACTCTGTTTTTTGATCTCACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCAtt > 1:1476741/1‑151 (MQ=255) cATACACCCCTCACTCTATATCACTCTCACAAATTCGCTCAAATAATAAACAATAAACTCTGTTTTTTGATCTCACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGAAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATCACCAATGCAtcattcat > 4:146707/1‑151 (MQ=255) tACACCCCTCACTCTATATCACTCTCACAAATTCGCTCAAATAATAAACAATAAACTCTGTTTTTTGATCTCACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGt > 5:84088/1‑151 (MQ=255) cacCCCTCACTCTATATCACTCTCACAAATTCGCTCAAATAATAAACAATAAACTCTGTTTTTTGATCTCACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGtt > 7:706957/1‑150 (MQ=255) acCCCTCACTCTATATCACTCTCACAAATTCGCTCAAATAATAAACAATAAACTCTGTTTTTTGATCTCACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTAt < 8:613696/151‑1 (MQ=255) cACTCTATATCACTCTCACAAATTCGCTCAAATAATAAACAATAAACTCTGTTTTTTGATCTCACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATtctc < 4:1678382/149‑1 (MQ=255) cACTCTATATCACTCTCACAAATTCGCTCAAATAATAAACAATAAACTCTGTTTTTTGATCTCACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCaa < 6:1071427/151‑1 (MQ=255) cACTCTATATCACTCTCACAAATTCGCTCAAATAATAAACAATAAACTCTGTTTTTTGATCTCACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCaa < 4:130426/151‑1 (MQ=255) cACTCTATATCACTCTCACAAATTCGCTCAAATAATAAACAATAAACTCTGTTTTTTGATCTCACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCa < 7:401485/150‑1 (MQ=255) tctATATCACTCTCACAAATTCGCTCAAATAATAAACAATAAACTCTGTTTTTTGATCTCACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAAt > 5:1028379/1‑149 (MQ=255) atatCACTCTCACAAATTCGCTCAAATAATAAACAATAAACTCTGTTTTTTGATCTCACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAg < 8:128680/148‑1 (MQ=255) atatCACTCTCACAAATTCGCTCAAATAATAAACAATAAACTCTGTTTTTTGATCTCACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAg < 7:1466329/148‑1 (MQ=255) atCACTCTCACAAATTCGCTCAAATAATAAACAATAAACTCTGTTTTTTGATCTCACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAAATTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATACATGTTATTCTCAATAGCgaat > 8:84044/1‑150 (MQ=255) tCACTCTCACAAATTCGCTCAAATAATAAACAATAAACTCTGTTTTTTGATCTCACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCga > 5:18022/1‑148 (MQ=255) cACTCTCACAAATTCGCTCAAATAATAAACAATAAACTCTGTTTTTTGATCTCACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCgaagaa < 4:783097/151‑1 (MQ=255) aCTCTCACAAATTCGCTCAAATAATAAACAATAAACTCTGTTTTTTGATCTCACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAAc < 2:953984/151‑1 (MQ=255) ctcACAAATTCGCTCAAATAATAAACAATAAACTCTGTTTTTTGATCTCACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACAtt > 2:599246/1‑151 (MQ=255) cacaAATTCGCTCAAATAATAAACAATAAACTCTGTTTTTTGATCTCACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACAtttt < 6:955960/151‑1 (MQ=255) aaaaTTCGCTCAAATAATAAACAATAAACTCTGTTTTTTGATCTCACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCa < 1:133710/150‑1 (MQ=255) aaaTTCGCTCAAATAATAAACAATAAACTCTGTTTTTTGATCTCACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCAt > 1:1551371/1‑151 (MQ=255) aaTTCGCTCAAATAATAAACAATAAACTCTGTTTTTTGATCTCACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCAtt < 1:25138/151‑1 (MQ=255) aTTCGCTCAAATAATAAACAATAAACTCTGTTTTTTGATCTCACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTg < 1:314165/151‑1 (MQ=255) cGCTCAAATAATAAACAATAAACTCTGTTTTTTGATCTCACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTg > 3:388169/1‑151 (MQ=255) gCTCAAATAATAAACAATAAACTCTGTTTTTTGATCTCACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGt > 3:1216308/1‑151 (MQ=255) gCTCAAATAATAAACAATAAACTCTGTTTTTTGATCTCACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGt > 6:523763/1‑151 (MQ=255) cAAATAATAAACAATAAACTCTGTTTTTTGATCTCACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTaa < 5:237379/150‑1 (MQ=255) cAAATAATAAACAATAAACTCTGTTTTTTGATCTCACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTaa < 5:864125/150‑1 (MQ=255) aaaTAATAAACAATAAACTCTGTTTTTTGATCTCACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAAcc > 3:1346779/1‑151 (MQ=255) aaaTAATAAACAATAAACTCTGTTTTTTGATCTCACCCGGTAAAGTCGCCTATCGTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAAcc > 3:721605/1‑151 (MQ=255) ataataAACAATAAACTCTGTTTTTTGATCTCACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCtg > 4:192360/1‑151 (MQ=255) ataataAACAATAAACTCTGTTTTTTGATCTCACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCtg > 5:1326509/1‑151 (MQ=255) aataaacaataaacTCTGTTTTTTGATCTCACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCtgtt > 4:368658/1‑151 (MQ=255) ataaacaataaacTCTGTTTTTTGATCTCACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCtgttg < 6:1258030/151‑1 (MQ=255) ataaacaataaacTCTGTTTTTTGATCTCACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCtgttg > 2:535875/1‑151 (MQ=255) ataaacaataaacTCTGTTTTTTGATCTCACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCtgttg < 1:1589632/151‑1 (MQ=255) taaacaataaacTCTGTTTTTTGATCTCACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCtgttgt > 2:726467/1‑151 (MQ=255) acaataaacTCTGTTTTTTGATCTCACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGttaa < 7:1275110/151‑1 (MQ=255) aataaacTCTGTTTTTTGATCTCACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGATGTAACCTGTTGttaatt > 2:869215/1‑151 (MQ=255) aaacTCTGTTTTTTGATCTCACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCATCAAAAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGttaattaa < 3:251601/150‑1 (MQ=255) aaacTCTGTTTTTTGATCTCACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGttaatta > 3:813495/1‑149 (MQ=255) tctGTTTTTTGATCTCACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCt > 3:459339/1‑151 (MQ=255) ctGTTTTTTGATCTCACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGc < 6:441084/149‑1 (MQ=255) gTTTTTTGATCTCACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTAt < 4:1265311/150‑1 (MQ=255) gTTTTTTGATCTCACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATg < 4:1192725/151‑1 (MQ=255) gTTTTTTGATCTCACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATg > 5:60856/1‑151 (MQ=255) tttttGATCTCACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGtt > 6:189277/1‑151 (MQ=255) tttttGATCTCACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGt < 8:1456135/150‑1 (MQ=255) tttttGATCTCACCCGGTAAAGTCGCCAATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGGATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGt < 4:1021493/150‑1 (MQ=255) tttGATCTCACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTta < 5:1187074/150‑1 (MQ=255) ttGATCTCACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCATTTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGGTATGTtaat > 2:1696465/1‑151 (MQ=255) tGATCTCACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTtaat > 7:828384/1‑150 (MQ=255) tGATCTCACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTtaat > 5:284420/1‑150 (MQ=255) ctcACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAAcc > 3:1646484/1‑150 (MQ=255) ctcACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTCTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAAcc > 6:38386/1‑150 (MQ=255) cACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTtaataa < 8:1594565/146‑1 (MQ=255) cACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCatt < 4:608874/151‑1 (MQ=255) cACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCatt < 3:199272/151‑1 (MQ=255) cACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCatt > 1:1401122/1‑151 (MQ=255) aCCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCatta < 7:355695/151‑1 (MQ=255) aCCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCatt > 4:1547015/1‑150 (MQ=255) ccGGTAAAGTCTCCTTTCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGAGAAATGATTCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAATAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCattaat < 1:1127152/151‑1 (MQ=255) ggTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCattaatt > 2:284275/1‑150 (MQ=255) ggTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCattaatt > 8:240737/1‑150 (MQ=255) tAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCAttaattaa > 3:576026/1‑150 (MQ=255) aaaGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAACa < 8:1201827/151‑1 (MQ=255) aaGTCGCCTATCTTTTCATCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAACaa < 6:1509372/151‑1 (MQ=255) aaGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAACaa < 1:642157/151‑1 (MQ=255) aaGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAACaa < 8:824606/151‑1 (MQ=255) gTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAACAAtt < 3:874450/151‑1 (MQ=255) cGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAACAATTgg < 4:499659/151‑1 (MQ=255) cGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAACAATTg < 5:1493379/150‑1 (MQ=255) cTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTACCCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAACAATTGGTtaata > 8:46653/1‑150 (MQ=255) ttttCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAACAATTGGTtaataa > 7:1350644/1‑150 (MQ=255) tttCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAACAATTGGTtaata < 2:1359468/148‑1 (MQ=255) tttCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAACAATTGGTtaata < 7:607104/148‑1 (MQ=255) tttCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAACAATTGGTtaat < 7:1065338/147‑1 (MQ=255) tCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAACAATTGGTTAATAAAtt < 5:924149/150‑1 (MQ=255) cAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAACAATTGGTTAATAAAttt > 2:1200008/1‑150 (MQ=255) cAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACAATTAATTAACAATTGGTTAATAAAttt > 5:541133/1‑150 (MQ=255) caacaaAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAACAATTGGTTAATAAATTTAAgg < 3:1532639/151‑1 (MQ=255) aacaaAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAGCCATTAATTAACAATTGGTTAATAAATTTAAggg < 7:211122/151‑1 (MQ=255) caaAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAACAATTGGTTAATAAATTTAAggggg > 5:444342/1‑151 (MQ=255) aaaaCTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAACAATTGGTTAATAAATTTAAGGGGGt > 5:679633/1‑151 (MQ=255) aaaaCTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAACAATTGGTTAATAAATTTAAGGGGGt < 1:547155/151‑1 (MQ=255) aaaCTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAACAATTGGTTAATAAATTTAAGGGGGTc < 2:1575523/151‑1 (MQ=255) ttGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAACAATTGGTTAATAAATTTAAGGGGGTCACGt > 4:1576129/1‑151 (MQ=255) tGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAACAATTGGTTAATAAATTTAAGGGGGTCACGt < 4:937133/150‑1 (MQ=255) taTTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAACAATTGGTTAATAAATTTAAGGGGGTCACGtt < 1:1004530/149‑1 (MQ=255) aCATCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAACAATTGGTTAATAAATTTAAGGGGGTCACGTTGACTAc < 5:1612050/151‑1 (MQ=255) aTCAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAACAATTGGTTAATAAATTTAAGGGGGTCACGTTGACTACGc > 8:708817/1‑151 (MQ=255) cAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAACAATTGGTTAATAAATTTAAGGGGGTCACGTTGACTACGcc < 7:663376/150‑1 (MQ=255) cAATTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAACAATTGGTTAATAAATTTAAGGGGGTCACGTTGACTACGCCa < 7:927629/151‑1 (MQ=255) aTTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAACAATTGGTTAATAAATTTAAGGGGGTCACGTTGACTACGCCAtt < 2:1022124/151‑1 (MQ=255) aTTTTGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAACAATTCGTTAATAAATTTAAGGGGGTCACGTTGACTACGCCAtt > 6:791896/1‑151 (MQ=255) ttttGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAACAATTGGTTAATAAATTTAAGGGGGTCACGTTGACTACGCCATTg > 4:270546/1‑151 (MQ=255) ttGGTATGACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAACAATTGGTTAATAAATTTAAGGGGGTCACGTTGACTACGCCATTGa < 1:167862/150‑1 (MQ=255) gACCAATGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAACAATTGGTTAATAAATTTAAGGGGGTCACGTTGACTACGCCATTGAAAAAgatt > 2:815590/1‑151 (MQ=255) aaTGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAACAATTGGTTAATAAATTTAAGGGGGTCACGTTGACTACGCCATTGAAAAAgattgtg < 1:799864/150‑1 (MQ=255) tGCATCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAACAATTGGTTAATAAATTTAAGGGGGTCACGTTGACTACGCCATTGAAAAAgattgtgatt > 6:231506/1‑151 (MQ=255) | CCCTGCATACACCCCTCACTCTATATCACTCTCACAAATTCGCTCAAATAATAAACAATAAACTCTGTTTTTTGATCTCACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCACCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAACAATTGGTTAATAAATTTAAGGGGGTCACGTTGACTACGCCATTGAAAAAGATTGTGATTG > NC_000913/1165820‑1166115 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |