New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 696863 = | 144 (0.320) | 83 (0.200) +GAAGAAACAATC |
30/276 | 32.4 | 24.0% | intergenic (‑33/+2) | glnW/glnU | tRNA‑Gln/tRNA‑Gln |
? | NC_000913 | = 697134 | 429 (0.950) | intergenic (‑1/+379) | metT/asnB | tRNA‑Met/asparagine synthetase B | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
Only 100 of 159 total aligned reads displayed.
CTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAAC‑CGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTGCGGCGCCAGAACCTA > NC_000913/696718‑697013 | aaCTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTCCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGt < 1:1250810/151‑1 (MQ=255) cTACGTAGCCAGAGTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGAATCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCCGAGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGCCCGGTTACGCGTGAACTCGAAGAACCTCGCTAGGTGACCTgg > 5:612803/1‑150 (MQ=17) aCGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGAtt > 5:1341063/1‑151 (MQ=255) gTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATACCCGCGCGCTGAAACGGGTAGGCGGAGAAGCTGGCTGGGGTAACtcgctacc > 5:799568/1‑144 (MQ=17) acctcttgaataaattGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCATAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAg < 6:1164911/136‑1 (MQ=17) aGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAAAAAACCGGCGGTGAAACGATAACTCGAAGAAGATCGATGCGGTACCTCGAATAGaaac > 8:1817403/1‑147 (MQ=17) cgtcttgaataaattGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATACGGTGACTTACCGCTTGGCGATACCCCAAAAAACTGGAGGTGAAAAGCTAAATCAAAGAAGATGGCTTCGGTAGATGGATTCGAACCAgc > 4:1171345/15‑150 (MQ=9) atttttttataaattGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCAGGTAATGCCGGAATCAAAACCCGGTGCCTTACGGCTTGTCGATACCCCAATAACCGGGCTGTGAAGCGCGTACTCGAATAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAgg < 7:1533370/137‑1 (MQ=18) ttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATACGCGGGCGGTGACCCGCTTACTCGCAGCGGCTGGCTGGGGTACCTGGCTGCGAAGCAGGGAAGGc > 5:184003/1‑151 (MQ=18) ccgcggccctACCAGGATGCGCACCACCGAAGGCCGGAATCAAAATCCGGGGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGAGGGGAAGCCCTTACTAGAAGAAGATGGCGGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCa < 6:1271347/142‑1 (MQ=21) ggCTGGTGTACGAGGATGCGAACCACGGAATGCCGGAATCACCCGCCGGAGCCTTACCGCTTGGCGATCGCCCACTAACCGGGGTCAGCAGACCGTTCTCGAATAACATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCaa < 5:623413/151‑1 (MQ=12) tGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAAAAGGGCGGTGAACATCGTACTCGAAGAAgatggatg > 6:1809434/1‑111 (MQ=11) ggggTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCTCTTACTCGAAGAAGATGGCTggg > 2:1491551/1‑112 (MQ=17) cgtccccccggAGTCGCACCACGGACTGCCGGTATCATAACCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATCCCCCAATAACCGTGCGGGGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAAc < 5:1423153/142‑1 (MQ=25) gtacgaggATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCATAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGaagaag < 8:960580/94‑1 (MQ=14) gtacgaggATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGaagaag > 7:957570/7‑100 (MQ=14) acgaggATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCTCTGACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTAGCTGGAt > 8:1206932/5‑117 (MQ=17) cTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGCTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATCGATGGGGTACCTGGAATCGCAACAGGCAAGGCCGCGATCATAAAC‑AGCTGc > 2:96612/1‑150 (MQ=21) ggatggggtcgaGGGACTGACGCGATCATAAGCCGGGGCCTTACCGCGTGGCGATACCCCACTAACCGCGCGTCGAACCGATTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAAC‑CGGTGCCtt < 1:869598/140‑1 (MQ=18) ggagtggAACCAGGTAATGACTGGATCAACAGCCGGTGGCTTACCGCGTGGCGATAGCCCAATAACCGCGCTGGGAACCGCTAACGCGTAGACGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAAC‑CGGTGCCt < 5:689540/144‑1 (MQ=18) ggATTCGATCGAGGGAATGCCGGTATCAAAACCCCGGCGCTTACCGCGTGGGGATAGCCCAAAAACCGGGCGCCGAACCGATTTCTCGTATAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAAC‑CGGTGCCtt < 5:691924/151‑1 (MQ=18) ggATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATACACGGGCGGTGAACCGCTAACTCTAAGAAGATGGCGGGGGTACCTGGATACGAACCAGGGAATGCCGGTTTCAAAAAC‑CGGTGCCtt > 1:531088/1‑151 (MQ=25) gacgcgccccACGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAAC‑CGGTGCCTTa < 1:521030/143‑1 (MQ=255) aacctcggAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAAAAAACGGGCTGTGAAGCTCATAATCGAAGAAGATCGATGGGGTagat > 6:1684030/7‑99 (MQ=2) gggAATGCATCTATCAAATCCCGGGGCCTTAACGCTTGGCGATACCGCAAAAACCGGGCGGCGAACCGCGAACTGGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAAC‑CGGTGCCTTACCGCTTGGCGa < 1:835458/151‑1 (MQ=18) ggAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCGTACTCGCAGAAGATGGATGGGGTACCTCGATTCGAACCCGGGAATGCCGGTATCAAAAAC‑CGGTGCCTTACCGCTGGGCgct > 5:1048510/1‑149 (MQ=37) ggAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACAGGGCGGTGAAGGGCTAAGTGGGAGAAGGTGGCTGGTGTACCTCGCTAAGAACGAGGGAATGCCGGATACAAAACC‑CGGGTCCTTAACGATTGGCGAt > 6:1365340/1‑151 (MQ=16) ggAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACAGCTTGGCGATACCCCAATAAAAGCACGCTGAACCGAGTAGTCGAAGAAGATCGCTACGGTACCTGGAAACGATACAGGGCATCGCCGTAACAAAAAC‑ATGTGCATTAACTCTTgccca > 1:1023626/1‑146 (MQ=12) aTGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACAGGGGGGTGAAGAGCGGACTCGAAGAAGATg > 1:1393747/1‑81 (MQ=14) cGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAAGACCCGGGCGGTGACCCGCGTAGGCTAAGAAGATGGCTCGGGTACCTCGATTCGCAACAGGCGATGGCGGGTAAAAAACC‑CGGTTCCTTAAATCTTGGCCCTACCCCa > 5:1487981/1‑150 (MQ=12) ggTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATTCCGCCGGCGGTGACCCGCTAAGTCTAAGAAGATGGCTGGTGTACCTCGCAGCCCAGCAGGCGAGGCCGCCATAAAAACC‑CGGTGCCTTCCCGCTAGGCGCTCCCGCAt > 1:325140/1‑150 (MQ=9) tATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAAC‑CGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCg > 2:1032389/1‑151 (MQ=255) cagaatccGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGc < 4:990786/67‑1 (MQ=255) cagaatccGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAAGAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGc > 6:987510/7‑73 (MQ=25) cAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAGCACGGCGCTGACCCGGTTAGGCTCAGAACATGGCTGGGGTACCTCGCTACGCTGCAGGGGAGGGCGGGATAATAAGC‑CGGTTCGTGACAGATGGCCGATCCCCCATcctaac > 4:1339300/1‑147 (MQ=255) gTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATACCCGGGCGGTGACGCGGGTAGGCTCAGCAGCTGGCTGGGGTACCTGGATGCGCTCCAGGGGAGGCCGGGATCAAAACC‑CGGGGCCTGACCGCTTGGCGCTACCCCATCCGTAGAACGGttgg > 1:773023/1‑149 (MQ=255) tGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTAGTCGAAGAACATGGCTCCGGTACCTCGCATCGCAGCAGGCCATGCCGGTATCAAAAGC‑AGCTGCAATACCGCTAGGCCATACCCCATACCAACAACgggtta > 4:1529523/1‑145 (MQ=255) cTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAAC‑CGGTGCCTTACAGCTAGGCGATACCCCATCAGAACAACGCTTTCTGGt > 2:1630533/1‑151 (MQ=255) ccGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAAC‑CGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAAt > 1:394763/1‑151 (MQ=255) cTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAAC‑CGGTGCCTTACAGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGt > 1:1485034/1‑151 (MQ=255) ttGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAAC‑CGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTg > 6:769161/1‑151 (MQ=255) ttGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAAC‑CGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTg > 1:1779863/1‑151 (MQ=255) tGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAAC‑CGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGc > 4:565900/1‑151 (MQ=255) cGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAAC‑CGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCggg > 1:1597490/1‑151 (MQ=255) cGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAAC‑CGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCggg > 6:874337/1‑151 (MQ=255) gATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAAC‑CGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCgggc > 5:178307/1‑150 (MQ=255) aTACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAAC‑CGGTGCCTTACCGCTTGGCGCTACCCCATCCGTACAACGCTGTCGGGTGAATGGTGCgggcg > 2:297776/1‑149 (MQ=255) tACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAAC‑CGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAgg > 7:1528390/1‑151 (MQ=255) agcgcAATAACCGCGCGGTGAAGCGCTTTCTCTTATAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGATTGCCGTTATCAAAAAC‑CGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAgg < 5:1242411/146‑1 (MQ=21) aCCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAAC‑CGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGc > 5:335229/1‑151 (MQ=255) ccccAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGCACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAAC‑CGGAGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCg > 1:420919/1‑151 (MQ=255) ccccAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAAC‑CGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCg > 8:1323450/1‑151 (MQ=255) cccAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAAC‑CGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCg > 1:1632153/1‑150 (MQ=255) cAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAAC‑CGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACCACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCg > 5:373121/1‑148 (MQ=255) aaTAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAAC‑CGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGAc > 8:769825/1‑151 (MQ=255) aTAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAAC‑CGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACt > 1:1722637/1‑151 (MQ=255) aTAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAAC‑CGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACt > 4:1762869/1‑151 (MQ=255) aaCCGCGCTGCGAACCGCTTACGAGACTTAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAAC‑CGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTg < 5:378651/151‑1 (MQ=21) 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agaTGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAAC‑CGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTGCGGCGCCAGAACCt > 5:27089/1‑151 (MQ=255) gaTGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAAC‑CGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTGCGGCGCCAGAACCTa < 6:1511289/151‑1 (MQ=255) | CTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAAC‑CGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTGCGGCGCCAGAACCTA > NC_000913/696718‑697013 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |