New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 781369 = | 313 (0.690) | 139 (0.310) +GAG |
31/294 | 33.6 | 37.0% | noncoding (1/76 nt) | lysZ | tRNA‑Lys |
? | NC_000913 | = 2521006 | 170 (0.380) | noncoding (76/76 nt) | valU | tRNA‑Val | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
Only 100 of 324 total aligned reads displayed.
ACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAAT‑CTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGT > NC_000913/781219‑781519 | accaGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAAT‑CTTTCAGGTAACACCCGTATg < 8:695810/151‑1 (MQ=255) ccaGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAAT‑CTTTCAGGTAACACCCGTATgg < 7:17874/151‑1 (MQ=255) caGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCTAGTCATCCAGCACGACCCCCCAAAAAGAAAGATTTTACCCCAGAAAAAAG‑ATATCAGCAAACACGCGTATggg > 3:934500/1‑151 (MQ=14) attttAACTTCTAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAAT‑CTTTCAGGTAACACCCGTATGGGt < 2:508189/149‑1 (MQ=18) ttttAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAAT‑CTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTc < 4:155051/150‑1 (MQ=255) ttttAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAAT‑CTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCg > 5:720535/1‑151 (MQ=255) tAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAAT‑CTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGtt < 2:298679/150‑1 (MQ=255) aaCTTCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAAGCTTAAAGATTGTCCCCGAGTAAAAAC‑CCTACAGGTAACAACCGGATGGGTCGtt > 7:13311/1‑149 (MQ=21) aaCATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAAT‑CTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGtt > 5:257619/1‑149 (MQ=255) aaCATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAAT‑CTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTa < 7:426583/150‑1 (MQ=255) aCATCAAACTCAGATGTTAAGCGTTAAGGATAACGTTGCGACAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAAT‑CTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGc < 3:1776631/151‑1 (MQ=255) aCATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAAT‑CTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGt < 4:1151753/147‑1 (MQ=255) catcgaagacAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATATTAAAGCTTGGCCCCGAGGAAAAAT‑CTTTCAGGTTACACCCGAATCGGTGGTTAggg > 2:1222790/10‑149 (MQ=14) aTCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCCCCAAACTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAAT‑CATACAGGTAACAACCGAATGTGTCGTTAGCTc > 5:1510236/1‑151 (MQ=21) aTCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGAATGTCCCCGACTAAAAAT‑CGTTCACTTAACACCCGAATGCGTCGTTAGCTc > 7:731096/1‑151 (MQ=21) cAAACTCAGATGTTAAGCGTGACGGATAACGTGGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAAT‑CTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAg < 3:111532/151‑1 (MQ=255) aaCTCAGATGTTAAGCGTGAAGTATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAAT‑CTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGtt < 8:594426/151‑1 (MQ=255) aaCTCAGATCTTATGTTTGAATCATCTCGTTGCTTCAGATAGGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAAT‑CTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGtt < 3:664852/151‑1 (MQ=25) agacAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAAT‑CTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTg < 2:1716667/148‑1 (MQ=255) aCTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAAT‑CTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTg > 7:605777/1‑151 (MQ=255) aCTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAAT‑CTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTg < 8:1075380/151‑1 (MQ=255) tCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGACTAAAAAT‑CGTTAAGGTAACACCCGAATGGGACGTTAGCTCAGTTGGt > 6:496994/1‑151 (MQ=255) acAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAAT‑CTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCa < 2:884859/144‑1 (MQ=255) 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tGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTTGCCCCGAGTAAAAAT‑CTTTCAGGTAACAAACGTATGGTTCGTTAGCTAAGTTGGTagat > 3:513096/1‑149 (MQ=25) tAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAAT‑CGTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCGCAGTGGGGTGAGCAgg > 5:877365/1‑150 (MQ=255) aaaGCGTCAAGCATAAATTTCCGACAGCATCGGCCATGAGGTCGAGCTTAGCTTGTCATCCTGCAGTTCACATCAATCTTAAAGAGTGGGTCGGAGTAAAAAT‑CTATGACTCAACAACCCCACGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGt < 2:830070/150‑1 (MQ=255) aaGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAAT‑CATTCAGGTAACAACCGTATGGGTCGTTAGCTAAGTTGGTAGAGCAGtt > 8:184707/1‑151 (MQ=255) gCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAAT‑CTTTAAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTag > 2:773706/1‑142 (MQ=255) gTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAAACTGAAAGATTTTACCCGAGTAAAAAT‑CTGTCAAGAGACACGAGTATGGGAAGTTAGGTCAGTTTTTAGAGCatgtgggt > 4:1479645/1‑144 (MQ=17) tatgtaTAACTTTGCGCCAGCAACGGGCCGTAGGCCTAGCCAAGCTAGTTATCCTGCAAGAACGACCAATCTAAAAGATTGGGCCCGAGTTTCAAT‑CTTTCCCTCACCACCCCCAAGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACtt < 8:1497941/145‑1 (MQ=255) gAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAAT‑CTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACtt < 4:368729/150‑1 (MQ=255) aaGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTTGCCCCGAGGAAAACT‑CTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTGAGCTGAGTTGGTAGAGCTGTTGACtttt > 1:918194/1‑151 (MQ=37) aaCGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAAT‑CTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCGCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCa > 5:333267/1‑150 (MQ=255) 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(MQ=18) acacCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGGCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGc < 5:927173/151‑1 (MQ=255) cccGTATGGGTCGTTAGCTCAGTGGGTAGAGCACTGGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGGTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCgag < 6:673066/151‑1 (MQ=255) acagTATTGGTCGTTATCTCAGTTGTTAGATCATTTGACTTTTATTCAATTGGTCGCAGCTTTTAATAGTTCAGTACCCACATATTTAAATGTTCTTACTGCTATATAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCgag < 2:1815578/148‑1 (MQ=12) cgctgggggCGTTAGCGCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGGCGCAGGGTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGAc < 7:1013265/146‑1 (MQ=18) cGTAGGGGGCGTTAGCGCAGTTGGTAGACCCGTGCACTTCTAATCAATGGGGCGCCGGTCCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAACCGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGAc < 6:1812378/151‑1 (MQ=18) gTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGc < 1:705090/69‑1 (MQ=34) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |