| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_000913 | 1,287,217 | 0 | G | T | 24.6% | 736.4 / 134.5 | 384 | intergenic (‑41/+27) | tpr/tyrV | protamine‑like protein/tRNA‑Tyr |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (145/140); new base T (53/40); total (202/182) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.40e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 395 total aligned reads displayed.
GTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCA‑GGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTG > NC_000913/1287068‑1287367 | ggtggGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGa < 1:1324054/151‑1 (MQ=39) gcgcaGGACTCCTCCGCGCGGCGCGCTTCGCTTTTTTTTTATTTGCCTGCGGCAACGGTCTCTCCCTGTATCTCGTCCCGTATTTTCGTCGAAGACGCTCTTCCTTTCTCGCTTGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTc < 4:613215/147‑1 (MQ=255) tgtaGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGTCGCTCGAGGCGAACCTTTGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTc < 8:1470732/147‑1 (MQ=255) ggAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCTGCAACGCTCTCTCGCTGTCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATTGGCATAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCa < 4:175989/151‑1 (MQ=255) gAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGCACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGCATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTc > 7:1151415/1‑149 (MQ=255) gAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGGAGAATATTTAATTGCGGCTTCGTTGGGAAGTTc > 7:1637569/1‑149 (MQ=255) gAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTc > 1:1182411/1‑149 (MQ=255) aaGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAgg < 7:790483/151‑1 (MQ=255) aTTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACt > 6:5631/1‑151 (MQ=255) aCTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGCACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGCATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGCCtttt > 6:1328673/1‑151 (MQ=255) cAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCTAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGa < 2:1045901/150‑1 (MQ=255) gcgcTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAg < 5:1134796/151‑1 (MQ=255) cgcTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGt < 1:1813081/151‑1 (MQ=255) cTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCAACATAACCCCCAAGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAATTTAAGTGACTTTTGAAAGtt > 8:1339251/1‑149 (MQ=17) tGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACCCTCTCTCGGTGGCGGTCGAGTGGAACCTTTGTGGAACCTTCTCCTACTTCCCCGGCTGGGGAGAATATTTAATTGCGGTGTCGGTGGGGTGTTCATGGGCTTTTGATAGTGAt > 7:887800/1‑151 (MQ=9) gcgcgcTTCGCCCTTCGGGTCTTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGTCGCTCGAGTCGAACCTTTGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGTAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGAt < 8:32541/150‑1 (MQ=255) gcgcgcTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTAAt < 6:658290/150‑1 (MQ=255) gcgcTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCGCGCGTCGCACCGTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGCATATTTAATTGCGGATTCGGTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGAtggg > 7:514471/1‑150 (MQ=14) 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ccgatcgcTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGCCGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCg < 7:58194/144‑1 (MQ=255) cGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGCCGCTCGAGTCGAACCTTTGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCg < 5:693284/150‑1 (MQ=255) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGa > 4:773915/1‑150 (MQ=255) gCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGGCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCt < 2:1631635/151‑1 (MQ=255) tGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATGCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAATTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCtt > 7:191630/1‑149 (MQ=255) 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6:419150/1‑146 (MQ=17) ttAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCA‑GGGGTAATTCAAATTTTGAg < 7:287481/150‑1 (MQ=255) tAATTGCGTATTCGTTGTGAAGTTCATTGACTTTTGATATTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAcc < 4:928093/123‑1 (MQ=17) ttGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGTCCCGTCGCAGCCCATCGCCGGACCTTTACATTCTGCTCCCAATGCCCTCTCGGGACCCCCACCC‑GCGGTAATTGAAAtacacgggaac > 7:676272/1‑140 (MQ=2) tGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCA‑GGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAAt < 2:859393/150‑1 (MQ=255) gCGGATTCGGTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCA‑GGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGc < 8:1638037/151‑1 (MQ=255) 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2:420214/151‑1 (MQ=255) gTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACATTCGTAGAGCATCACGCGACATTAACAGTCTGCTCGCATAGTACTCTCGGGAACGCAACCA‑GCGCTAATTCAAAGAATGAGGTAAAGCttcac > 3:881083/1‑145 (MQ=12) tGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACATTCGAAGTCGATGACGGAAGATTTACAGTCTTCTCCCATTGGCCGCTCGGGAACCCCACCA‑TGGCAAATTAAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGCtggt > 4:1483806/1‑151 (MQ=21) | GTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCA‑GGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTG > NC_000913/1287068‑1287367 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |