| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 781369 = | 339 (0.740) | 128 (0.280) +G |
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| ? | NC_000913 | = 2521129 | 106 (0.230) | intergenic (+3/‑44) | valX/valY | tRNA‑Val/tRNA‑Val | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
TCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTT‑ATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCT‑ACCAACTGAGCTAACGACCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/781513‑781369‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAATTTCTTGCTACACGGCGGAGACTACATAAAGTAGTTGGTGGGTGATGA < NC_000913/2521129‑2520994 | GCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTT‑ATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCT‑ACCAACTGAGCTAACGACCCGAAtgggggg > 4:286145/1‑144 GCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTT‑ATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCT‑ACCAACTGAGCTAACGACCCCAA‑TGGTGGt > 4:1227824/1‑150 CCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTT‑ATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCT‑ACCAACTGAGCTAACGACCC‑CAGAGGTGGGT > 1:1748698/1‑151 ttgGGGCGGTTGCTAACGAAAGGTT‑ATCCTTCAGGTTATCTACTTTTAATGATGTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCT‑ACCAACTGAGCTAACGACCCG‑AGTGGTGGGTGA < 5:390872/147‑1 cgGTTGCTAACG‑AATGTTAATCTTTCCGGTTCTCTACTTTTATCCAGCTTAAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCT‑ACCAACTGAGCTAACGACCCG‑‑GTGGTGGGTGATGACGGGA < 2:522560/149‑1 ttcggatctAACGTT‑ATCCTTCACGTTCTCTTCTATTAATCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCT‑ACCAACTGAGCTAACGACCCG‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATC < 7:937417/141‑1 GCTAACGCAACGTT‑ATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCT‑ACCAACTGAGCTAACGACCCGAAAGGGTGGtaaagacaagatat > 2:259209/1‑136 cttaggaaagGTT‑ATCTTTCACGTTCTCTTCTATTAAACACGTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCT‑ACCAACTGAGCTAACGACCCG‑AGTGGTGGGTGATG < 5:81310/130‑1 aagGCAAGGTA‑ACCCTGCAGGTTATCTACCACTTAGCACGTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCT‑ACCAACTGAGCTAACGACCCG‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACC < 1:614733/148‑1 AACGTT‑ATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCT‑ACCAACTGAGCTAACGACCC‑CAGTGGTGGGTGAAGCCGCGATa > 3:937655/1‑140 ATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCT‑ACCAACTGAGCTAACGACCCTACG‑GGGGGGTGAAGCCATGATCTAACCGCCGCCCCCCT > 1:995276/1‑151 ttaACGTTCTCTACCAGTTATCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCT‑ACCAACTGAGCTAACGACCCG‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCT < 2:1662793/147‑1 CACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCT‑ACCAACTGAGCTAACGACCC‑AAAAGGTTGTTGATGAAGAGATAGATACTCCGACCCaatcattt > 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> 2:1243123/1‑151 GGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCT‑ACCAACTGAGCTAACGACCCGAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATC < 7:866340/151‑1 GGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCT‑ACCAACTGAGCTAACGACCCGAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATC < 6:257932/151‑1 GGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCT‑ACCAACTGAGCTAACGACCCGAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAAT < 3:1409816/150‑1 GTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCT‑ACCAACTGAGCTAACGACCCGAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCA < 4:1233254/151‑1 ggcggcgttctGGATGCTAACCTTCGACCAATTTATTTAAAGTCAACTTCTCT‑ACCAAATGATATAACGACCGCAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCAC < 5:1046317/140‑1 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< 3:1516374/151‑1 AGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCT‑ACCAACTGAGCTAACGACCCGAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCCCTaagtt > 2:844700/1‑146 AGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCT‑ACCAACTGAGCTAACGACCCGAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACgaagtg > 5:1350392/1‑145 GGATTCGAACCTTAGACCAATTGATTATAAGTCAACTTGTGTCACCAA‑TTTGCTAACGAGCGGAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCA < 4:1639103/150‑1 GGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCT‑ACCAACTGAGCTAACGACCCGAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTaagaa > 4:571381/1‑145 GGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCT‑ACCAACTGAGCTAACGACCCGAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCAACCACggagga > 8:562600/1‑144 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aCAATTTTTTAAAATTCAAATTTTAT‑ACCAAATGATCTAACGACAGTAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAATTTCTTGCTACACGGC < 4:1449673/150‑1 CAATTTATTAAAATTCAACTTATCT‑ACAAAATTATATAACGACACTAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAATTTCTTGCTACACGGCG < 2:1769399/151‑1 CAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCT‑ACCAACTGAGCTAACGACCCGAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAATTTCTTagtaatagg > 2:1758054/1‑140 CAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCT‑ACCAACTGAGCTAACGACCCG < 8:1453406/46‑1 atttctatactTCAACTGATCT‑CACAAATTATCTCACGACACGAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAATTTCTTGCTACACGGCGGAG < 1:1760194/140‑1 aTGAGTAAACGTCACCTTCTAA‑CCCAACATAGCTCACGCCACGAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAATTTCTTGCTACACGGCGGAG < 6:817545/150‑1 TTGATTAAAAGTCAACTGCTCT‑ACCAACTGAGCTAACGACCCGAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAATTTCTagatataaggagaac > 8:251334/1‑136 TGATTAAAAGTCAACTGCTCT‑ACCAACTGAGCTAACGACCCGAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTGAAATTCTaaatagaacgagtac > 2:474851/1‑135 TTAAAAGTCAACTGCTCT‑ACCAACTGAGCTAACGACCCGAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCTATTTCTTTCTAGTCGGCGtaaaat > 8:1414890/1‑144 TTAAAAGTCAACTGCTCT‑ACCAACTGAGCTAACGACCCGAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCAACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAATTTCTTGCTAATCGGCGGAGACT > 5:1570534/1‑150 AAAGTCAACTTGTAT‑AACAACTTATCTATCGAGAGTAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAATTTCTTGCTACACGGCGGAGACTACAT < 6:1709389/151‑1 GTCAACTGCTCT‑ACCAACTGAGCTAACGACCCGAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAAATTCTTGCTAAAAGGAGGAGAATACATAA > 3:106484/1‑150 TCAACTGCTAT‑CCCAACTTATCTAACGACCCCAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAATTTCTTGCTACACGGCGGAG < 1:1773625/140‑1 CTCT‑ACCAACTGAGCTAACGACCCGAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTG > 6:1218074/1‑80 CAACTGAGCTAACGAGCCGAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAATTTCTTGCTACACGGCGGAGACTACATAAAGTAGTTGGTGGGTG < 6:1564342/151‑1 agtgcgaaggagagGAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAATTTCTTGCTACACGGCGGAGACTACATAAAGTAGTTGGTGGGTGATGA < 6:706649/137‑1 AACGACCCGAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCccgctgtg > 3:243282/1‑88 AACGACCCGAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAAATTCTTGATACACGGCGGAaaat > 7:1015296/1‑116 GACCCGAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCT > 6:1319191/1‑77 CCCGAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGT < 1:1527649/49‑1 CCGAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATC > 1:485112/1‑78 | TCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTT‑ATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCT‑ACCAACTGAGCTAACGACCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/781513‑781369‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAATTTCTTGCTACACGGCGGAGACTACATAAAGTAGTTGGTGGGTGATGA < NC_000913/2521129‑2520994 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |