| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 781446 | 344 (0.750) | 48 (0.120) | 34/260 | 31.3 | 12.7% | intergenic (+2/‑131) | lysZ/lysQ | tRNA‑Lys/tRNA‑Lys |
| ? | NC_000913 | 2521487 = | 361 (0.910) | intergenic (+159/+106) | lysV/xapR | tRNA‑Lys/transcriptional activator of xapAB | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 359 total aligned reads displayed.
GAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGG > NC_000913/781298‑781595 | tCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCCCGACCCACCAATTTaa > 8:163140/1‑150 (MQ=255) tCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTaa > 2:828952/1‑150 (MQ=255) tCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACAACCGTATGGGTCGTTAGCTCAGATGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGATCGAATCCTGCACGACCCAACAAATTaaaac > 7:1300527/1‑148 (MQ=25) tGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAggtggt > 4:1048576/1‑151 (MQ=255) tGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGATGAGTTTTAATCAATTGCTAGAAGGGTATAATCATGAACGACCCACCAAATTAAAgtttct > 2:1008656/1‑146 (MQ=25) tGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGAAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAggtggt > 4:1578804/1‑151 (MQ=255) gCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGTTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGtt < 6:968973/151‑1 (MQ=255) gCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGtt > 4:1403126/1‑151 (MQ=255) cACGACCCACCACTCCTACACCTCGCCCCCGAGTAAAATTCTTTCAGGCACCACCCGTCTTCCTCGTTAGTTCTCTTGGTCTCGACTTCCCCCTTTACTCATTCGGTCCCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTa < 6:538874/151‑1 (MQ=255) cACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGtt > 8:69026/1‑150 (MQ=255) cGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTaaaaaagctccct > 4:845838/1‑141 (MQ=255) gACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTg > 2:1147601/1‑151 (MQ=255) accaATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTaga < 5:11993/151‑1 (MQ=255) aaTCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGaa < 1:776289/151‑1 (MQ=255) aaTCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGaa < 5:1494234/151‑1 (MQ=255) aTCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAAc > 4:1784196/1‑151 (MQ=255) aTCATAAAGATTGGACCCGATTAAAAATCTTTCCCGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAAtgt < 6:1668712/128‑3 (MQ=18) ttAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGCATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGCACGTg > 1:890603/1‑151 (MQ=255) aGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGG‑AGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAgg > 2:182053/1‑150 (MQ=255) gAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCg > 8:1235439/1‑151 (MQ=255) aaaaTCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGc < 7:873269/151‑1 (MQ=255) attCTTTCAGTTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTCGATCAGTTGACTTTTAATCCATTGGTCGCAGGTTCTAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCaa < 4:243816/149‑1 (MQ=25) aTCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCa < 7:164412/149‑1 (MQ=255) cTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACgg > 6:207000/1‑151 (MQ=255) tttCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGc > 2:1233917/1‑151 (MQ=255) tAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAgg > 8:1401508/1‑151 (MQ=255) aaCACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAAt > 8:1731683/1‑89 (MQ=255) actcccTTATTGGTCGTTAGCTCATTTGTTATAGCAGTTGTTTTTTTATCATTTGCTCGAAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAggg < 7:1798461/147‑1 (MQ=18) accaccattggggTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGc < 4:1227824/141‑1 (MQ=255) cgctgaggggTGGTGAGCGCATCTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGGCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCgag < 3:800612/144‑1 (MQ=18) ccccacggggTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCgag < 1:519729/144‑1 (MQ=255) aTGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTTACTTTTAATCAATTGCGCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTTCTGTTAGATAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGaa < 5:421877/151‑1 (MQ=18) gggTCTTTAGCTCAGTTGGTCGCGCAGTTCACTTTTAATCAATTGGGCGCAGGTTCTAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGt < 8:639592/151‑1 (MQ=18) gggTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAg < 7:1189193/84‑1 (MQ=34) gggTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAg > 3:1189781/1‑84 (MQ=34) ggTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTGGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTc < 6:389804/151‑1 (MQ=255) ggTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTCGTTAATGGTAGAGAACGTGAAGGa > 5:172700/1‑110 (MQ=255) gTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGaa < 8:505473/106‑1 (MQ=255) cGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCg > 1:15235/1‑149 (MQ=255) cGTTAGCTCAGTTGG‑AGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAg < 1:180567/150‑1 (MQ=255) gTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAAATGGTTACTCGTAGAGAACGTTAAGTATAACGTTGACTTAGCAAATGCCCGAAGGGCGAGACGAACTCGAGt > 8:386607/1‑151 (MQ=18) ttAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAACGTGGTTAGTGGTAGATAACGTGAAGGATAACCTTgg > 1:17218/1‑113 (MQ=18) tAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATaa < 6:1056420/107‑1 (MQ=255) aGCTCAGTTGGGCGAGCAGGTGACTTTTACTCACTGGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCAt < 8:1556375/151‑1 (MQ=18) gCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATc < 6:819536/151‑1 (MQ=255) gCTCAGTTGGTAGAGAAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCTAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATc < 4:68864/151‑1 (MQ=255) tCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCt > 4:455106/1‑151 (MQ=255) cAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTAAATCAATGGGTCGCAGGTTCCAACCCTGCACGACCCACCATTTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCt < 8:104782/150‑1 (MQ=255) aGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGc < 2:617172/151‑1 (MQ=255) ggTAGAGCAGTTTACTTTTAATCAATTGTTCGCACGTTCTAATCCTGCACGACCCACCAATTTATAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTCAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACg < 5:13326/150‑1 (MQ=18) ggTAGAGCAGTTGACTTTTAATGACTTGGGCGGAGGTTCGAATCCTGCACGACCCAGCAATTTAAACGCTGTTACTGGTAGAGACCGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACg < 1:729785/150‑1 (MQ=18) ggTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACgc > 7:117279/1‑150 (MQ=255) gagagCAGTTGACTTTTAATCACTTGGTCGCAGGTTCGAAGCCGGCACGACCCACCAATTTACAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGGGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGAcc < 8:1284350/150‑1 (MQ=255) agagCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTAGTaga > 5:1073778/1‑79 (MQ=255) agCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACcca < 2:15200/150‑1 (MQ=255) cgTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCTAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTAGTGGTAGAGAAGGTGAAGGATAACGTTGCGTTACCAACGGCCCGAAGGGCTAGACGAAGGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAt < 3:337032/150‑1 (MQ=18) gtGACTTTTATTTTATTTCTCGCAGGTTCGAATACTGCACGACCACCCCATTTAATGGTGGTTACTGGTTGTGTACGGGAATGATAACGTTGCGCTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATcc < 1:672434/150‑1 (MQ=18) ttaCTTTCAAGCACGTGTTCGCAGCTGCCAATCCTGCACGCCCCACCTTTTTTAATTTTGTTACTGGTAGATATCGTGAATGATAACTTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATcc < 4:1073744/148‑1 (MQ=12) gACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTg < 6:1099976/151‑1 (MQ=255) tttAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTTAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGCCGAAGTCGCGTCGTCCTGCACGACCCCCCATCCTGAATg > 3:1778230/1‑151 (MQ=255) tttAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGaa < 3:1026115/149‑1 (MQ=255) tttAATCAATTGCTCGAATTTTTTAATCCTTCACGACCCACCAATTTTAATGTGTTTACTGGTATAGATCTTGAATGATAACGTTGCTTTAGCAACGGCCCGAAGTGCGAGAGGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAAt < 5:1563972/150‑1 (MQ=18) ttAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATg < 1:1144146/150‑1 (MQ=255) ttAAGCACTTGCTCGAAGTTTCTAATCCTGCACGAGCCACCAATTTAAAGGCGGTTACTGGTCGTGAACGTGTTGTATAACTTTGATTTACCAACGGGCCGAAGGGCGAGACGAATTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATg < 8:774421/150‑1 (MQ=21) tAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGCCCCCCCCTCCTGAATGAt > 6:17095/1‑151 (MQ=255) tattttgtggCATGTTCGATTGCTGCACTTCCCACCTATTTAAAGGTTTTTTCTGTTAGTGAACGTGTTGTATAACTTTGGGTTAGCTACGGCGCGAAGGGCGAGACGTAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTaa < 4:347968/141‑1 (MQ=16) cAATTGTTCGCAGGTTCGAAGCCCCCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGACAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTaa < 4:56001/150‑1 (MQ=255) cAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAg < 6:1264937/151‑1 (MQ=255) gctCGCAGGCGCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGTTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGTATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGgcag < 4:163547/148‑1 (MQ=255) cGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCCACGGCCCGCAGGGCGAGCCGACGTAGAGTCATCCGGCACGACCCACCCGCCTGAATGATTAAgcccgaat > 8:1441671/1‑143 (MQ=21) cGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACATATTTAAAGTTTGTTACTGTTATTGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATa < 7:340283/151‑1 (MQ=25) cAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAAAAGGTTACTGGTAGAGAAGGTGAACTATAACGTAGCGTTAGAAACAGCCGGCACGGCTAGACGAAGACGAGTCAACCTGCACGACAGACCAGGGTGAAAGATTTAGGCAGAATaa > 7:1450649/1‑150 (MQ=16) aGGTTGTAATCCTGCACGACACACCAATATAAAGGTGTTTACTGGTAGAGTAGCGGAAGGATCAGGTGGCGTTAGATACGGCCCGAAGCGCGAGACGCAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATc < 8:1800433/151‑1 (MQ=25) ggTTCTAATCCTGCACGACCAACAAATTTAAATTTTTTTACTGTTATTTAACGTGAAGTATAACTTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATcc < 7:715775/151‑1 (MQ=21) ttCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGCAGGTTACTGGTAGAGAACGTGAACGATAAAGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACCAAGTCGAGTCATCCTGAACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCg > 3:890551/1‑151 (MQ=37) ttCGAATCCTCCACGATCCACCTATTTAAATGTTCTTACTGTTATTTAACGTGAATGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCGCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATccc < 5:834512/150‑1 (MQ=21) tCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGAGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCACGc > 4:1709725/1‑151 (MQ=255) ggAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCa < 1:415322/150‑1 (MQ=255) ccaatcattctctaCCCAAGAATTTTAAGGTCGTTACTGGTAGAGATCTCTCTGGTTCAGGTTTCTTGACCTACGCCCTGAATGGGGAGACCTATTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCa < 6:67858/138‑1 (MQ=255) aaTCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTGACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAACCTGAATGAGTAAGGCAGCATAAACCCGCa > 5:726349/1‑149 (MQ=255) aaTCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGCTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTAGAGTTAGAACCGGCCCGAAGCGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCAGAATGATTAACGCAGCATAATCCCGCa > 6:1538293/1‑149 (MQ=25) aTCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAgg < 8:328097/151‑1 (MQ=255) aTCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAgg > 8:474158/1‑151 (MQ=255) ccTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAgggg < 8:1122988/151‑1 (MQ=255) ttGCACCACGCACCACTTTATAGGTTTTTACTGGTATTGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAgggg < 7:462520/149‑1 (MQ=21) cTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTCGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAACGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCAGCAAGGGGt > 4:1309953/1‑151 (MQ=255) gCACGACCCAGCAATTTAAACGTTGTTACTGCTATAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGAGGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCg < 3:471338/151‑1 (MQ=25) cACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAAAGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGt < 3:718202/151‑1 (MQ=255) aCGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGtt > 2:475130/1‑151 (MQ=255) cGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGtt > 2:1491690/1‑150 (MQ=255) aCCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGc > 3:1828366/1‑151 (MQ=255) cccACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGTAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCt > 6:1804804/1‑151 (MQ=255) ccaccaATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTc < 6:1174470/151‑1 (MQ=255) caccaATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCa < 1:1402556/151‑1 (MQ=255) caccaATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCa < 1:136509/151‑1 (MQ=255) caATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGtt > 3:1648199/1‑151 (MQ=255) aaaTTTAATGGGGGTTACTGTTACAGAAGCGGACGGTTCAGGTGGGTTTTGCAACGGCCCGATGGGGGAGACGAAGGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGtt < 3:1336292/150‑1 (MQ=21) aaaTTTAAAGGTGGTTACTGGTACAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAACTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATCATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGtt < 1:1006271/150‑1 (MQ=255) aaTTTTAATGTTGTTACTGTTATTTAACGTGATGGATAACGTTGCGTTAGCAACTGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTg < 7:579736/151‑1 (MQ=25) aTTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTgg > 3:1488581/1‑151 (MQ=255) | GAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGG > NC_000913/781298‑781595 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |