| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,560,996 | 0 | G | T | 26.3% | 587.2 / 70.0 | 343 | intergenic (+98/‑372) | yffL/yffM | CPZ‑55 prophage; uncharacterized protein/CPZ‑55 prophage; uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (136/116); new base T (41/49); total (177/166) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.79e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 347 total aligned reads displayed.
AAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAA‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGC > NC_000913/2560847‑2561146 | aGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAA‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGtt < 4:631105/151‑1 (MQ=255) gTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGGTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAA‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGt < 7:139671/151‑1 (MQ=255) gCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAA‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTg < 7:278557/150‑1 (MQ=255) aaCGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATTACTGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTATTTCCATGAA‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGt < 5:1002122/151‑1 (MQ=255) aaCGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCGTGAA‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGTTGGGTAAAAAGTTGCCGTTAAGGAGGGt > 2:830524/1‑151 (MQ=255) aaCGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAACCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAA‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTgggg > 3:1356144/1‑150 (MQ=255) gAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAA‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTAAAAAGTTGCCGTTAAGTTGGGTCa > 5:1353425/1‑150 (MQ=255) aaTACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAA‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCaaa < 8:113827/151‑1 (MQ=255) aTACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAA‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGATAAGGAGGGTCaaa > 6:958849/1‑150 (MQ=255) aCCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAA‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTTAGGTGGGTCAAAAGt > 1:1325996/1‑151 (MQ=255) aCCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAA‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGt < 6:1340839/151‑1 (MQ=255) acAGTTAATATTCAACCCCTACATCAACAAATAACGGATTAAGGATGGCTTATTTCCCTCATTTTATTTGCCTTAATTGCATCAT‑TTCAGGTTGTTCAAAAATTTGCGTTACTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGtt < 4:142430/150‑1 (MQ=12) aGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAA‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTATTGGTGGGTAAAAAGTAGACTTTAAGGAGCGTCAAAAGTTGc > 2:1271215/1‑151 (MQ=255) aGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAA‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGACGTTAAGGTGGGTCAAATGTTGc > 1:1627497/1‑151 (MQ=255) gTTATTATTCAAGCCGTACAAGATGTAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAA‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGcc < 6:85366/151‑1 (MQ=255) gTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAA‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAATTTGCCGTTAAGGAGTGTAAAAATTTga > 2:777223/1‑149 (MQ=255) ttattaTTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAA‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAATTTGc > 6:1257174/1‑149 (MQ=255) tattatTCAATCCGTACAACATTAAATAACGGAATCATTCTGGCAATGTTCCCGCGTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAA‑TTCAGGTTGGTCAAAAGTTGCCTTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTTCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCg < 2:1547925/150‑1 (MQ=255) tattatTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAA‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTAAAAAGTTGCCTTTAAGGAGGGTCAATAGtttcagt > 5:342082/1‑146 (MQ=255) ttattCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGACTTAATTCCATGAA‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCTTTAAGGGGGGTCAAAATTAGACGtt > 3:32987/1‑150 (MQ=255) tattCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAA‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTa < 8:165310/150‑1 (MQ=255) tattCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAA‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTa < 8:463475/150‑1 (MQ=255) tattCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAA‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGCTGGGTCAAAAGTTGCGGTTAAGGTGGCTCAAATTTTGCAGTTa > 1:268447/1‑150 (MQ=255) attCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAA‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTaa < 3:420992/150‑1 (MQ=255) attCAAGCAGTACAACATGAAATAACGGAATCAGTCGGGCATTCTTTCCGCCTTTTCTTTTCCTTAATTCCATGAA‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGGCGTTTGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAg < 7:1049938/151‑1 (MQ=255) tCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAA‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGATAGTGGTGGGTCAAATTTTGCCGGTAAGGTGGGGGAAAAGTTGGCGTTAAgcg > 8:906755/1‑149 (MQ=255) cAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAA‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGt < 4:1579046/150‑1 (MQ=255) gCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAA‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCTTTAAGGTGTGTCAAAAGTTGCAGTTAAGGTggcg > 3:355418/1‑149 (MQ=255) ccGTACAACATGAAATTACGGAATCCGTCTGGCATTTTTCCCGCATTTTCTTTGCCTTTATTCCATGAA‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGGCGTTATTGGTGGGTAAATTGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTc < 7:409162/151‑1 (MQ=25) cGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAA‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGATGCCGTAAAGGTGGCTCAAAAGTTGCAGTTTACGTgtggc > 3:21767/1‑146 (MQ=255) gTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAA‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCaa < 6:1703190/151‑1 (MQ=255) caacaTGAAATACCGTAATCTGGCGTGCATTGTTCCCGGCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAA‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAATGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAg < 2:222851/151‑1 (MQ=37) aTGAAATAAAGGAATCAGTCGGGCATTGTTGCCGCCTTTTCTTTTCCATAAATCAATGAA‑TTCAGGGGGGTCAAAAGTAGGCGTTAGTGGTGGGTAAAAAGGTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGc < 6:1531011/151‑1 (MQ=25) gAAATAACCGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAA‑TTCAGGTGGGGCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGcc < 6:1066542/150‑1 (MQ=255) aaaTAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAA‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGGCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCg > 1:1054961/1‑150 (MQ=255) taCGTAATCAGTAGGGCATTGATGCAGCCTTATCTTTTCCTTAAATTCATGAA‑TTCAGGGGGGTCAAAAGTTGGCTTTAGGGGTGGGTAAAAAGTTGCATTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTa < 5:601097/149‑1 (MQ=21) ggAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAA‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTGAAGGTGGGGGAAAAGTTGGAGAGTAAgc > 8:1439667/1‑149 (MQ=38) ggAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAA‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGGCAAAAGTTGCCGTTAAGCGGGGTCAAAAGTTGCGGAGTAAgc > 8:1239641/1‑149 (MQ=255) ggAACCTGGCTGGCATTGTTACTGGCTTTTGTATCCCATAATTAAATGAA‑TTCTGGGGGGGAAAATGCAGGCGTTATGGGTGGGTCAAAAGTTGCCTTTAAGTTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGa < 3:1660195/150‑1 (MQ=12) aaTCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAA‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTGAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGGCGTTTAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTGTAAGGAtt > 6:1013072/1‑151 (MQ=255) cctgctgccactGTTTCAGCCTTTGGTTTGCCTTAAATCCATGAA‑TTCCTGTGGGTCAAAAGCTGCCTTTTCTGGTGGGTCAATAGATGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTcta < 5:1502673/140‑1 (MQ=21) aGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAA‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTAAAAAGTTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGGGAAAAGTTGACGAGTAACAATTcta > 3:1017787/1‑150 (MQ=38) cAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAA‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTACTGGTGGCTAAAAATTTGACTTAAAGGAGGGTCAAAAGTTGAAGTGAAGGGGTGTGAAAATTTGCCGAGGAAGAAGTGTACTATTaat > 3:1631313/1‑150 (MQ=255) acttatatcGCCTTTTGATTTCCTTTAATTAATGAA‑TTCTGTGGGGTTTAAATTAGGCTTTACTGGTGGGTAAAATGTTGCCTTTTAGGTGGGTCAAAAGTTTCATTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGa < 5:238663/143‑1 (MQ=16) tCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAA‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTATTGGTGGGTCAAAAGTTGCATTTAAGGTGGGTCAACAGTTGAAGTTAAGGTGGGGCAAAATTTGCCGAGTAACTATTATAATATTATGAAttgt > 8:1513023/1‑149 (MQ=37) tCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAA‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAATTTGCCGTTAAGGTGTGTCAAAAGTTGACGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGACGAGTAAGAATTCTACAATTAAAAAttat > 7:728457/1‑149 (MQ=38) cccGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAA‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCt < 1:1099895/150‑1 (MQ=255) cccGCCTTTGAATTGCATTAATTCC‑TGAATTTCTGGTGGGT‑AAAATGTGCCGTTTAGGGGGGGTAAAAACGTGCCGTTTAGTTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTa < 1:91194/150‑1 (MQ=19) gcGCCTTATCTATTCCATTATTCATTGAA‑TTCATTGGGGTATAAATTTCCCGTTAGTTGTGGGTAAATAGGTGCCGTTAATTTGGGTCAAAAGTTGCCCTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAg < 8:708781/150‑1 (MQ=16) gCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAA‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGTGTCAAAATTTGCCGAGTAAGGATGGTACAAGTAAGATTTATAGGc > 7:1744775/1‑151 (MQ=25) ccatttctttcCCATAATAACATGCA‑TTCAGGTGGGTAATAAGTTCCCCTTAGTGTTGGGTCAAAAGTTGCCCTTAAGCTGGGGCAAAAGTTGCCGTTAAGGAGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCg < 4:338890/148‑1 (MQ=255) ccTTTTCTTTTCCTTAATTCATTGAT‑TTCTGTGGTGTTAAAATTTGCCGTTTTTTGTGGGTAATTTGTTGCCGTTTAGTTGGGTCAAATGTTTCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGGCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCg < 5:1186774/151‑1 (MQ=255) cTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAA‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAATGTTGGCTCAAAATTTGCCTTAAAGGTGGGTCAAAAGTTGACGAAAACCTGGCTCTAAAATAGCCTAGTAAGCATTCTAAAATAAACAATACTAAGcc > 2:9776/1‑149 (MQ=16) ttttCTTTGCCTTAATTCCATGAA‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAATGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCGGCGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGAc > 3:573822/1‑151 (MQ=255) ttttCTTTGCCTTAATTCCATGAA‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGAGGTGGGTCAAATGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCGGTTAAGGTGGGTCAAATGTTGCCGAGTAAGACTTCTACTATTAACAATTCTACGCGAc > 1:169636/1‑151 (MQ=37) ttttttTGCCTTAATTACATGAA‑TTCAGTTGGGTCTATTTTTGGCTTTAGTGTTGTGTAAATAGTTGCCTTTTATGTGGGTTAAATGTTTCATTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGAc < 2:1044148/150‑1 (MQ=255) tttCTTTGCCTTAATTCCATGAA‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTTAGGTGGGTGAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTACTAATTCTTGGCGACg > 1:1558495/1‑151 (MQ=255) tCTTTGCCTTAATTCCATGAA‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGTTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGAGGGTCAAAAGTTGAAGATAAGGTGTGTCAAAATTTGACGAGAAACAATTCTAAAATTAAGTATTATAGGCGaag > 2:377035/1‑147 (MQ=25) ttGCCTTAATTCCATGAA‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAACTTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGa < 8:286634/149‑1 (MQ=255) gCCTTAATTCCATGAA‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGACGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTGAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAACAATTCTACTATTAAAAATAGTAGGCGACGGGAGttt > 6:531702/1‑151 (MQ=37) cTTAATTCCATGAA‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAATGGTGGGTCAAAAGTTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGACGATAAGGTGGCGCAAAATTTGAAGAGTAACAATAATAAAATAAATAATACTAGTCGaagagacttatt > 7:983875/1‑140 (MQ=12) ttAATTCCATGAA‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTAAAAATTTGCATTTAAGGAGGGTCAAAATTTTAAGTAAACGGGGCTCAAATTTTGACTAGTAAGAATTCTACAATTAATATTAATACGCGACGTGAGttttat > 4:284017/1‑149 (MQ=255) ttaattaaTGAA‑TTCTGTTTGGTTAAAATTTGGCTTTATTGGTGGGTAAATTGCTGCCTTTTATTTGGGTTAAAAGTTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGttttt < 4:1368171/142‑1 (MQ=255) tAAATCCATCAA‑TTCATGGTGCTCAAAAGTAGGCGTTACGGGTGGGTCAAACGGCGCCTTTTCGGTGGGTCAAAAGGTGCCCTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGtttttt < 3:798669/150‑1 (MQ=25) aaTTCCATGAA‑TTCAGGTTGGTAAAAAGTTGGCTTTATTGGTGGGTCAAATGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTa < 7:209046/150‑1 (MQ=37) aaTTCCATGAA‑TTCAGGTGGCTCAAAAGCTGCCGTTAGTGGTGGGTAAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTa < 8:792490/150‑1 (MQ=255) aTTCCATGAA‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTGAAGGTGGGTCAAAAGTTGACGCGTAAGAATTCTACAATTATGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGc > 1:1759276/1‑151 (MQ=255) tCCATGAA‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGcgt > 6:1494852/1‑149 (MQ=255) tCCATGAA‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTAAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGcc < 1:809338/150‑1 (MQ=255) cATGAA‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCTAAAGTTGCCGAGTAAGCATTCTAATATTAAGAATTCTAGGCGAAGGGAGTTTTTTAGCCttc > 3:1088393/1‑149 (MQ=255) aa‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCAGTTAAGGTGGGTGTAAATTTGACGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGTGAGTTTTTTAGACTACcggg > 8:722660/1‑150 (MQ=37) a‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTTGTGGGTCATAAGGTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCAGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCcggtc < 3:992930/151‑1 (MQ=255) attccgggtggTAAATAGTTGGCGTTATTGGTGGGTAAATAGTTGCCTTTTAGGTGGGTAAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCcggtc < 4:186363/142‑1 (MQ=37) aGGTGGGTAAAAAGGTGGCGTTAGTGGTGGGTCAAAACTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCggtcggtc < 6:644159/151‑1 (MQ=255) gTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAATTTGACGTGAAGGGGGGTCTAATGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGATTTATAGGCGACGGGAGTTTTTTAGTCTCCCGGTGGGTCa > 1:1189661/1‑150 (MQ=37) tGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCAt > 1:1376319/1‑150 (MQ=255) aaGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCg > 4:487918/1‑151 (MQ=255) agaagCCGTTAGTGGTGGGTCAAAACTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGc < 8:13018/147‑1 (MQ=255) aGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGc > 3:96497/1‑151 (MQ=255) ttGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCt > 6:1035812/1‑151 (MQ=255) ttGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGCTCAAAAGATCCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCACCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCt > 4:753154/1‑151 (MQ=255) ggcGTTAGTGGTGGGTAAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTa < 3:1424754/148‑1 (MQ=255) ggtttATTGGTGGGTATATTGTTGCCTTTTATGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTaga < 5:1775412/148‑1 (MQ=38) ccGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCt > 4:1046477/1‑148 (MQ=255) ccGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGACt > 7:1084984/1‑148 (MQ=255) ccGTTAGTGGGGGGTCAAATGGGGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTCCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTaga < 3:669132/151‑1 (MQ=39) cGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGACTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTag > 4:236149/1‑149 (MQ=255) ttATTGGTGGGTAAAATGTTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTTCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGt < 3:1216695/150‑1 (MQ=255) aGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTa > 2:551393/1‑150 (MQ=255) ggggtggCTCAAATCTTGCCTTTAAGTTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTaaa < 3:1788843/149‑1 (MQ=38) gTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACaga > 6:227697/1‑148 (MQ=255) aaaaGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAatt > 7:1590323/1‑151 (MQ=255) aactggCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAattat < 1:708981/146‑1 (MQ=255) aaGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAattat < 1:511080/151‑1 (MQ=255) gTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTAttt > 7:1431167/1‑151 (MQ=255) tGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTc < 5:738692/150‑1 (MQ=255) tGCAGTTAAGGTGGGTAAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTc < 5:1791060/150‑1 (MQ=255) gCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCggtcggtc < 8:64524/111‑1 (MQ=255) ccGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTcgcc > 4:1617257/1‑151 (MQ=255) gTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTcgccgc > 8:320674/1‑151 (MQ=255) | AAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAA‑TTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGC > NC_000913/2560847‑2561146 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |