Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 2,041,411 | 0 | G | A | 55.3% | 136.8 / inf | 470 | G13S (GGT→AGT) | zinT | zinc and cadmium binding protein, periplasmic |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.43e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.68e-01 |
Only 100 of 471 total aligned reads displayed.
AGATAAGTAGAACTGAGAAAGCCATGCTCTCGTTTCCTAAGAGTTGTTGCATTTTGCTATATGTTACAATATAACATTACACATCATATACATTAACTCTGGAGGAAACTGTTTTGGCGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACTCACACGGCAAACCCTTAACAGAGGTCGAACAAAAAGCTGCTAATGGTGTTTTTGATGATGCCAATGTACAAAACCGAACGCTCAGTGACTGGGATGGAGTCTGG > NC_000913/2041262‑2041560 | agataAGTAGAACTGAGAAAGCCATGCTCTCGTTTCCTAAGAGTTGTTGCATTTTGCTATATGTTACAATATAACATTACACATCATATACATTAACTCTGGAGGAAACTGTTTTGGCGATTCGTCTTTACACACTGGCTGTTGCTTTAgg > 8:807666/1‑151 (MQ=255) tAGAACTGAGAAAGCCATGCTCTCGTTTCCTAAGAGTTGTTGCATTTTGCTATATGTTACAATATAACATTACACATCATATACATTAACTCTGGAGGAAACTGTTTTGGCGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCttt > 5:835056/1‑151 (MQ=255) gtagtGAGATTGCGATGCTGTCGTTTCCTATGAGTTGTTGGATTTTGGTATATGTTAGAATATAACATTAGACTTCATATAGTTTTTCTCTGGTGGTAAGTGTTTTGGGGTTTCGTCTTTACTTACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTa < 2:850351/146‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |