| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 1,673,557 | Δ120 bp | intergenic (‑56/‑237) | mdtJ ← / → tqsA | multidrug efflux system transporter/pheromone AI‑2 transporter |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1673556 | 0 (0.000) | 275 (0.560) | 173/296 | 2.8 | 100% | intergenic (‑55/‑357) | mdtJ/tqsA | multidrug efflux system transporter/pheromone AI‑2 transporter |
| ? | NC_000913 | 1673677 = | 0 (0.000) | intergenic (‑176/‑236) | mdtJ/tqsA | multidrug efflux system transporter/pheromone AI‑2 transporter | |||||
Only 100 of 279 total aligned reads displayed.
GCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1673406‑1673556‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACT > NC_000913/1673677‑1673825 GCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCA > 5:1547406/1‑150GCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGGACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCA > 1:686602/1‑150 TTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAATTCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTA < 5:1964220/150‑1 TTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGT > 2:962766/1‑149 CCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGA < 6:522233/150‑1 TCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGAAGAAAAT > 7:724001/1‑151 CACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAAT > 1:1648632/1‑150 ACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTATAAAATAA < 8:1152887/151‑1 ACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATA > 1:1762174/1‑150 TGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACG > 8:361650/1‑151 TGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACG > 8:1634091/1‑151 GCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCT > 4:1391613/1‑151 CTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTG > 5:1498153/1‑151 CGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGA < 5:1271800/150‑1 CATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAA > 1:810788/1‑150 TTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATT < 1:731657/150‑1 TTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATT < 6:1586785/150‑1 TCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGT > 5:517792/1‑151 TGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCA < 5:1932072/150‑1 TGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCA < 1:935307/150‑1 TGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCA < 5:1062920/150‑1 GACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCAT < 2:713921/150‑1 ACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTAC < 6:443052/150‑1 ACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTAC < 3:362900/150‑1 CCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAA < 6:1178225/151‑1 CGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAAT > 3:1358539/1‑151 GGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTGCTTCTCCTGCAAGATAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATT < 1:1354258/151‑1 GTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATT > 8:1208355/1‑150 AATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATC < 3:848365/151‑1 AATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTAT < 1:199446/150‑1 TCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGC < 2:1210659/150‑1 GTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAG < 4:1439498/149‑1 GTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCA < 5:413727/148‑1 TAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGT > 5:750266/1‑151 AGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTT < 4:427461/151‑1 GCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTG < 3:1760265/151‑1 CAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCTCTTAAATAAGAGAAACAAATGTAGAAAATAACGACATGAACAAATTCTCCATAATATTACAATTATCCAAAGTTTTG > 8:384674/1‑150 TAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTT > 1:1616809/1‑150 CAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGT > 3:723866/1‑151 CAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGT > 7:1610739/1‑151 CAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGT > 2:1957006/1‑151 ACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCAT > 8:654692/1‑151 CCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATC > 4:618500/1‑151 AATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGC < 2:79702/150‑1 ATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGG > 6:1515601/1‑151 AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGAT > 3:1835738/1‑151 AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGAT > 3:1445745/1‑151 AAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATG > 8:264924/1‑151 CAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAAT > 8:1566862/1‑151 CAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAAT > 4:343879/1‑151 CAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAAT > 6:28617/1‑151 CAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGAAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAAT > 5:1653298/1‑151 AATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATT < 6:962449/151‑1 AAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTC > 2:1382736/1‑151 AATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCC > 7:23901/1‑151 CATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTA < 6:765290/151‑1 CATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGT > 2:351194/1‑150 ATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCGTCGGT > 1:1113523/1‑149 ATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGT > 7:631460/1‑149 TGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTT > 4:1277121/1‑151 TGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGT < 6:1704145/150‑1 GTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTT < 4:1207063/150‑1 CCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAA < 3:1083512/151‑1 CTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAAC > 5:860577/1‑151 CTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAACAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTAGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAAC > 4:1021304/1‑151 TTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAAC > 4:191081/1‑150 CTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACG > 7:1441897/1‑151 TCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGC > 4:162918/1‑151 CCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACAC < 7:1775948/148‑1 TGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTG > 2:1072627/1‑151 GCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTG > 4:763634/1‑150 CAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGAT > 6:1882828/1‑151 AGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTT > 8:474059/1‑151 ATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATC > 6:579834/1‑151 ATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATC > 7:1353344/1‑151 TTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATC > 4:278748/1‑150 ATTTTAATTTTCGCTTAATTGAGCGAAACCAATTTAGAATATAACGTCCTGAACAAATTGTCGATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATATTTGTCCTCGGTTGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATA < 6:1261671/151‑1 ATTTTAATTTTCGCTTAATTCATCGAAACCAATGTAGAAAATTACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCAT < 5:993821/150‑1 TTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGC > 5:1367496/1‑151 TAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTT > 6:1865720/1‑151 TAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCT < 2:1664558/150‑1 AATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTA < 7:362128/151‑1 AATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTT < 1:1069196/150‑1 AATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTT < 2:509575/150‑1 attaCGCTTAATTCATCCAAACCAATATACTAAATAAAGTCATGAACAAATTCTCCATAATATTACAATTATACGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTCTCCTCGGTAGTTGAACACGCATGATTTGTATCATACCTTAAG < 8:1034966/147‑1 TTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACCCGCCTGATTTGTATCATAGCTTA > 3:156865/1‑149 TTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGA > 8:1530368/1‑150 TTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGA < 3:414901/150‑1 TCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAA < 8:901638/150‑1 CGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATT > 1:1516674/1‑151 TTAATTCAGTGAAAGGATTTTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCTGAGTGTTTCTTCTCGTAATCGCGGATGATAATTGTGCTAGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAATAATTAA < 2:1422848/150‑1 TAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACT > 7:515130/1‑151 AATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACT < 3:1871887/150‑1 TTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCA > 8:185103/1‑150 TTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCA > 4:54605/1‑150 TCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAA < 8:1806411/150‑1 AGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAAT > 4:692422/1‑151 AACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTT < 6:647767/151‑1 ACCAATGTAGAAAATTACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTCCAATTTTCCGGAGTGTTGCTTCTCGTGATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTATCTCAAAATATTTTC < 3:95418/151‑1 CAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCAC > 7:1127538/1‑151 GCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1673406‑1673556‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACT > NC_000913/1673677‑1673825 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |