Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 1,297,496 | 0 | G | A | 58.4% | 251.7 / inf | 479 | A209V (GCT→GTT) | adhE | fused acetaldehyde‑CoA dehydrogenase/iron‑dependent alcohol dehydrogenase/pyruvate‑formate lyase deactivase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (116/82); new base A (142/136); total (260/219) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.13e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.46e-01 |
Only 100 of 484 total aligned reads displayed.
AAACAGAGTCAACAACAACAACAGACTGTTCAGAAGCACAGATTACGCCG‑TTGTCGAAGGTTTTGGACATCAGTACAGATGCAACTGCACGTTTGATATCAGCAGTTTCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACAGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAG > NC_000913/1297347‑1297646 | aaaCAGAGTCAACAACAACAACAGACTGTTCAGAAGCACAGATTACGCCG‑TTGTCGAAGGTTTTGGACATCAGTACAGATGCAACTGCACGTTTGATATCAGCAGTTTCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGc > 1:518811/1‑151 (MQ=255) aCAGAGTCAACAACAACAACAGACTGTTCAGAAGCACAGATTACGCCG‑TTGTCGAAGGTTTTGGACATCAGTACAGATGCAACTGCACGTTTGATATCAGCAGTTTCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAACTg < 4:771973/151‑1 (MQ=255) agagTCAACAACAACAACAGACTGTTCAGAAGCACAGATTACGCCG‑TTGTCGAAGGTTTTGGACATCAGTACAGATGCAACTGCACGTTTGATATCAGCAGTTTCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAACTGGt > 7:1070917/1‑151 (MQ=255) caacaacaacaaCAGACTGTTCAGAAGCACAGATTACGCCG‑TTGTCGAAGGTTTTGGACATCAGTACAGATGCAACTGCACGTTTGATATCAGCAGTTTCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAACTGGTTTAcc > 3:1498906/1‑151 (MQ=255) aacaacaacaacAGACTGTTCAGAAGCACAGATTACGCCG‑TTGTCGAAGGTTTTGGACATCAGTACAGATGCAACTGCACGTTTGATATCAGCAGTTTCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACCCCGATAGCTGGTTTACCg > 7:1330783/1‑151 (MQ=255) acaacaacaacaGACTGTTCAGAAGCACAGATTACGGCG‑TTGTCGAAGGTTTTGGACATCAGTACAGATGCAACTGCACGTTTGATATCAGCAGTTTCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAACTGGTTTACCgg < 6:1940245/151‑1 (MQ=255) acaacaacaGACTGTTCAGAAGCACAGATTACGCCG‑TTGTCGAAGGTTTTGGACATCAGTACAGATGCAACTGCACGTTTGATATCAGCAGTTTCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGc < 1:1901795/151‑1 (MQ=255) caacaGACTGTTCAGAAGCACAGATTACGCCG‑TTGTCGAAGGTTTTGGACATCAGTACAGATGCAACTGCACGTTTGATATCAGCAGTTTCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTa < 4:847976/151‑1 (MQ=255) aacaGACTGTTCAGAAGCACAGATTACGCCG‑TTGTCGAAGGTTTTGGACATCAGTACAGATGCAACTGCTCGTTTGATATCAGCAGTTTCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTAt < 8:1402647/151‑1 (MQ=255) aacaGACTGTTCAGAAGCACAGATTACGCCG‑TTGTCGAAGGTTTTGGACATCAGTACAGATGCAACTGCACGTTTGATATCAGCAGTTTCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTAt < 6:1368282/151‑1 (MQ=255) aacaGACTGTTCAGAAGCACAGATTACGCCG‑TTGTCGAAGGTTTTGGACATCAGTACAGATGCAACTGCACGTTTGATATCAGCAGTTTCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAACTGGTTTACCGGAGCTGTAt > 3:1720867/1‑151 (MQ=255) aacaGACTGTTCAGAAGCACAGATTACGCCG‑TTGTCGAAGGTTTTGGACATCAGTACAGATGCAACTGCACGTTTGATATCAGCAGTTTCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAACTGGTTTACCGGAGCTGTAt > 8:514381/1‑151 (MQ=255) gACTGTTCAGAAGCACAGATTACGCCG‑TTGTCGAAGGATTTGGACATCAGTACAGATGCAACTGCACGTTTGATATCAGCAGATTCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACAACGATAACAGGTTTACCGGAGCTGTATGCgc > 2:1886829/1‑150 (MQ=255) aCTGTTCAGAAGCACAGATTACGCCG‑TTGTCGAAGGTTTTGGACATCAGTACAGATGCAACTGCACGTTTGATATCAGCAGTTTCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGc < 7:1580929/151‑1 (MQ=255) cTGTTCAGAAGCACAGATTACGCCG‑TTGTCGAAGGTTTTGGACATCAGTACAGATGCAACTGCACGTTTGATATCAGCAGTTTCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAACTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCt > 7:1011976/1‑151 (MQ=255) cTGTTCAGAAGCACAGATTACGCCG‑TTGTCGAAGGTTTTGGACATCACTACAGATGCAACTGCACGTTTGATATCAGCAGTTTCATCGATAACAACTCGAGTCTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGACCTGTATGCCGc > 1:1529155/1‑150 (MQ=255) ttCAGAAGCACAGATTACGCCG‑TTGTCGAAGGTTTTGGACATCAGTACAGATGCAACTGCACGTTTGATATCAGCAGTTTCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCttt > 6:1232853/1‑150 (MQ=255) tCAGAAGCACAGATTACGCCG‑TTGTCGAAGGTTTTGGACATCAGTACAGATGCAACTGCACGTTTGATATCAGCAGTTTCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAACTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTa > 4:707769/1‑150 (MQ=255) 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cTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGCGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTTCATCAGTGCGTTAGACAGTTGAACAGAAGGTTGATAGCTccc > 6:1676409/1‑150 (MQ=255) tGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGCTCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACAGTTCAAGAGAAGGTTGATCGATACac > 4:557847/1‑150 (MQ=255) tGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAACTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGAGGTGCATCAGTGCGTTAGACAGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCac > 1:598310/1‑150 (MQ=255) ggAGTGTTGGCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACGACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGTGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACAGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAg < 2:690728/150‑1 (MQ=255) tgtTGCCCGCGCCTACACCGATAACTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACAGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGAt > 4:1947180/1‑151 (MQ=255) ggtTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACAGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGAt < 6:479607/150‑1 (MQ=255) gtTGCCCGCGCCTACACCGATAACTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACAGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGAt < 7:218109/150‑1 (MQ=255) gtTGCCCGCGCCTACACCGATAACTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACAGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATc > 5:1470909/1‑151 (MQ=255) ttGCCCGCGCCTACCCCGATAACTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGCCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACAGTTCAACAGAAGGTTGCTCGATCCAGCCGATc > 5:216256/1‑150 (MQ=255) ttGCCCGCGCCTACACCGATAACTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACAGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATc > 4:72605/1‑150 (MQ=255) tGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACAGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATc > 7:834186/1‑149 (MQ=255) gCCCGCGCCTACACCGATAACTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACAGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATc > 5:1525771/1‑148 (MQ=255) cccGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACAGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGAt < 1:1684384/151‑1 (MQ=255) ccGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACAGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGAt > 5:71438/1‑150 (MQ=255) ccGCGCCTACACCGATAACTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGAACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACAGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATc < 8:938503/151‑1 (MQ=255) gcCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACAGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTc < 2:458791/151‑1 (MQ=255) ccTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACAGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCg > 1:1072355/1‑151 (MQ=255) ccTACACCGATAACTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCACGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACAGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCg > 8:662984/1‑151 (MQ=255) acacCGATAACTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACAGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGa < 5:1226610/150‑1 (MQ=255) acCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACAGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGc > 1:825342/1‑150 (MQ=255) cGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACAGTTCAACACAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCAcc > 7:1663929/1‑151 (MQ=255) aTAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACAGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCgg > 4:142535/1‑151 (MQ=255) | AAACAGAGTCAACAACAACAACAGACTGTTCAGAAGCACAGATTACGCCG‑TTGTCGAAGGTTTTGGACATCAGTACAGATGCAACTGCACGTTTGATATCAGCAGTTTCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACAGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAG > NC_000913/1297347‑1297646 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |