| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 1,673,557 | Δ120 bp | intergenic (‑56/‑237) | mdtJ ← / → tqsA | multidrug efflux system transporter/pheromone AI‑2 transporter |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1673556 | 0 (0.000) | 320 (0.640) | 184/296 | 1.7 | 100% | intergenic (‑55/‑357) | mdtJ/tqsA | multidrug efflux system transporter/pheromone AI‑2 transporter |
| ? | NC_000913 | 1673677 = | 0 (0.000) | intergenic (‑176/‑236) | mdtJ/tqsA | multidrug efflux system transporter/pheromone AI‑2 transporter | |||||
Only 100 of 324 total aligned reads displayed.
CCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1673407‑1673556‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTT > NC_000913/1673677‑1673826 CATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACGGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATG < 5:161411/151‑1 ATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGT > 4:975454/1‑151 TCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGT > 5:1794097/1‑148 CCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGA < 2:1348546/150‑1 CCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAA > 4:1222999/1‑150 CACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAAT > 8:1226528/1‑150 ACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAA < 5:311612/151‑1 ACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATA > 1:1991002/1‑150 TGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACG > 7:109174/1‑151 GACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGT > 3:604564/1‑151 GACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGT > 3:1264075/1‑151 GACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACG < 6:1647548/150‑1 GCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCT < 8:880239/151‑1 CGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGA < 4:1020114/150‑1 GCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAAC < 2:1446112/151‑1 CCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAAC > 6:1906379/1‑150 CCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAA < 6:974853/151‑1 CCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACA > 5:1690855/1‑150 CATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAA > 5:191922/1‑150 TTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATT > 1:1648572/1‑151 TTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATT > 3:1598589/1‑151 aATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTC < 8:1929686/150‑1 GACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCAT < 4:329537/150‑1 CAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAAT > 1:960493/1‑151 GTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAAGAAATTGTCCATAATATT > 1:1016506/1‑150 CGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAAT < 2:1871596/151‑1 GGTGATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTAGATTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCGTGAACAAAGTGTCCATAATATTACAATT > 1:1245636/1‑151 GGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATT > 5:1750431/1‑151 GGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATT > 1:422651/1‑151 GTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTA < 2:1147894/151‑1 AATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATC < 8:1614884/151‑1 AATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTAT < 6:1353401/150‑1 AATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATCTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTAT < 7:1205425/150‑1 AATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCAGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATC < 7:328530/151‑1 TTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATAAACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAAATATTTTAATTTTCGCATAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTCAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCcc > 1:1359931/1‑149 TGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGT > 5:1027612/1‑151 CAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGC > 2:944958/1‑151 ATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTT > 1:759769/1‑151 TAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTC > 8:1748624/1‑151 AGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCT < 7:1828870/151‑1 GACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCA < 7:1890784/151‑1 ACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCAT < 3:1849865/151‑1 TAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGATAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGC > 4:1612149/1‑151 TAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGC > 8:262751/1‑151 AATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTAATAGCG > 1:54776/1‑151 ATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGG > 2:526341/1‑151 AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGAT > 8:1910168/1‑151 AAATCCAATAACTATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATG < 3:286748/151‑1 AAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGCATG > 6:1500420/1‑151 ATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGAT > 3:1513024/1‑151 AAATATACATTGTCCTTCTCCTGCTAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGT < 2:317989/150‑1 AATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCC > 2:984696/1‑151 ATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTC < 8:1396158/150‑1 ACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGT < 3:1770534/151‑1 ACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGG < 2:1520090/150‑1 TGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTT > 3:1404249/1‑151 GTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTG > 6:556752/1‑151 TCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACAC > 4:1055574/1‑151 TCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAAC < 5:1334230/149‑1 TCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAAC < 3:1656174/149‑1 TCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGC > 4:25336/1‑151 GCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTG > 2:1660204/1‑150 GCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTG < 7:1383111/150‑1 GCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCT < 7:682882/149‑1 GCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCT < 7:1963367/149‑1 CAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGAT > 5:894739/1‑151 AGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTT > 5:420627/1‑151 GAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGT > 3:880839/1‑150 AATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTAT > 2:241839/1‑151 AATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTAT < 5:1463332/151‑1 ATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATg < 6:1775679/151‑2 ATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATC > 3:326694/1‑151 ATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATA < 4:615047/151‑1 TTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCAT > 8:1527580/1‑149 TTTAATTTTCTCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAATATAAAGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTTTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTTTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAG < 6:603786/150‑1 TAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCT < 2:852197/150‑1 AATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTA < 1:837358/151‑1 AATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTT > 8:1188869/1‑150 TTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGA < 4:376099/150‑1 TTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGA < 1:1746623/150‑1 TTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGA > 2:410301/1‑150 TTCGCTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGA > 6:781729/1‑150 CTTAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTA > 6:1148412/1‑150 TAATTCAGCGAAACCAATGTTGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTAGAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCTGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATAATAGCTTAAGAATT < 7:834632/147‑1 TAATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAA < 7:151767/149‑1 ATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCA < 7:889095/151‑1 ATTCAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCA < 7:975804/151‑1 CAGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAA < 3:518086/151‑1 AGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAAT < 7:1750169/151‑1 AGCGAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAAT < 8:208434/151‑1 GAAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATT > 6:388312/1‑151 AAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTT > 8:475363/1‑151 AAACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTT > 4:840927/1‑151 AACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTT < 4:1862178/151‑1 ACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTT > 4:1509507/1‑150 ACCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTT > 5:254607/1‑150 CCAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTC > 2:1725867/1‑150 CAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCAC < 1:1595721/151‑1 AATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACT > 1:746475/1‑151 AATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACT > 5:68268/1‑151 CCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1673407‑1673556‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTT > NC_000913/1673677‑1673826 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |