| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 273955 = | NA (NA) | 303 (0.540) | 168/300 | 2.4 | 45.2% | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 295085 | 368 (0.660) | intergenic (‑286/+54) | yagM/yagN | CP4‑6 prophage; uncharacterized protein/CP4‑6 prophage; uncharacterized protein | |||||
Only 100 of 974 total aligned reads displayed.
AGAAAATGTATCTATAAAATCGAGGACATCTTTACGTAACCAGTAATGGCGGCCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGAGATGTATCCGGGAGTTTGAATGCGCTCATTTTGCCACCTCAGTGATTGAGATATTGGCAAAGAAAGCTTTAAGCATTATTGAATTAGTAGGGGTAGTAATGAAGGCAGAAGGAAACGTTTCG > NC_000913/294936‑295235 | ggacaagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAAc > 4:312167‑M2/147‑151 (MQ=255)aGAAAATGTATCTATAAAATCGAGGACATCTTTACGTAACCAGTAATGGCGGCCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAAg > 7:662850‑M2/1‑150 (MQ=255) acaagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAACTc > 8:454334‑M2/145‑151 (MQ=255) aaaTGTATCTATAAAATCGAGGCCATCTTTACGTAACCAGTAATGGCGGCCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAACTc > 8:328922/1‑150 (MQ=255) aagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAACTCAg < 1:493195‑M2/9‑1 (MQ=255) aaTGTATCTATAAAATCGAGGACATCTTTACGTAACCAGTAATGGCGGCCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAACTCAg < 3:422325/151‑1 (MQ=255) aTGTATCTATAAAATCGAGGACATCTTTACGTAACCAGTAATGGCGGCCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTATCTAAggaagg < 7:1742068‑M2/151‑7 (MQ=255) aTCTATAAAATCGAGGACATCTTTACGTAACCAGTAATGGCGGCCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAAggaaggtgcg < 4:1587055‑M2/151‑11 (MQ=255) atctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgattaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatataagggacttgttcgcaccttccATAACTCAGCTgttt > 5:1792124‑M2/137‑150 (MQ=255) cTATAAAATCGAGGACATCTTTACGTAACCAGTAATGGCGGCCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAACTCAGCTGTTg > 2:195041/1‑150 (MQ=255) ataAAATCGAGGACATCTTTACGTAACCAGTAATGGCGGCCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAAggaaggtgcgaat > 2:2211659‑M2/1‑137 (MQ=255) ataAAATCGAGGACATCTTTACGTAACCAGTAATGGCGGCCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAAggaaggtgcga > 1:1561069‑M2/1‑137 (MQ=255) ataAAATCGAGGACATCTTTACGTAACCAGTAATGGCGGCCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAACTCAGCTGTTGaaa < 3:1961700/151‑1 (MQ=255) aaaaTCGAGGACATCTTTACGTAACCAGTAATGGCGGCCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAAggaaggtgcgaataa > 4:1278710‑M2/1‑135 (MQ=255) ttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAACTCAGCTGTTGAAATGa < 8:212377‑M2/21‑1 (MQ=255) aTCGAGGACATCTTTACGTAACCAGTAATGGCGGCCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGc > 2:1157150/1‑151 (MQ=255) tCGAGGACATCTTTACGTAACCAGTAATGGCGGCCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGCTTTGAGATTTGTAGATAATGATTTTAGCTTACTCAGCTGATGAAATGAGc > 5:1075244/1‑150 (MQ=255) aGGACATCTTTACGTAACCAGTAATGGCGGCCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAAggaaggtgcgaataagcggggaa > 3:599569‑M2/1‑128 (MQ=255) ggACATCTTTACGTAACCAGTAATGGCGGCCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGa < 6:1066405/151‑1 (MQ=255) gACATCTTTACGTAACCAGTAATGGCGGCCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGAt < 5:928218/151‑1 (MQ=255) ctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGAt > 2:554406‑M2/123‑151 (MQ=255) tgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGAtt > 3:719963‑M2/122‑151 (MQ=255) aTCTTTACGTAACCAGTAATGGCGGCCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTg > 2:1619529/1‑150 (MQ=255) atttaCGTTAGCAGTAATTGCGGCCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCGCTGAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTTCGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattctt > 7:795691‑M2/2‑121 (MQ=255) ttACGTAACCAGTAATGGCGGCCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttc > 6:2002464‑M2/1‑119 (MQ=255) cgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGAGATg > 3:176054‑M2/116‑151 (MQ=255) aCCAGTAATGGCGGCCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGAGATGTATCCgg < 7:2022269/151‑1 (MQ=255) tAATGGCGGCCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGAGATGTATCCGGGAGtt > 7:897346/1‑151 (MQ=255) aattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGAGATGTATCCGGGAGtt < 5:1270227‑M2/48‑1 (MQ=255) ggcggcCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGAGATGTATCCGGGAGTTTGa < 8:1002532/150‑1 (MQ=255) gcggcCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGAGATGTATCCGGGAGTTTGAAt < 7:423236/151‑1 (MQ=255) actgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGAGATGTATCCGGGAGTTTGAAt < 3:2103347‑M2/53‑1 (MQ=255) ggcGATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTATCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCTTTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGAGATGTATCCGGGAGTTTGAATgc < 7:1884165/151‑1 (MQ=255) ggcCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttca > 5:2149478‑M2/1‑100 (MQ=255) gcCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcat < 2:1280595‑M2/151‑53 (MQ=255) cATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcattt > 8:1555818‑M2/1‑97 (MQ=255) tGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGAGATGTATCCGGGAGTTTGAATGCGCTCa < 6:1486430/150‑1 (MQ=255) gTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGAGATGTATCCGGGAGTTTGAATGCGCTCATTTTGc < 7:1234995/150‑1 (MQ=255) ttttGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGAGATGTATCCGGGAGTTTGAATGCGCTCATTTTGcc > 8:1257089/1‑150 (MQ=255) ttttGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGACATGTATCCGGGAGTTTGAATGCGCTCATTTTGcc > 3:290235/1‑150 (MQ=255) gttgatgactcatgctgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGAGATGTATCCGGGAGTTTGAATGCGCTCATTTTGCCAcc < 1:1899833‑M2/70‑1 (MQ=255) tGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGAGATGTATCCGGGAGTTTGAATGCTCTCATTTTGCCACCt > 3:1099240/1‑151 (MQ=255) ggCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGAGATGTATCCGGGAGTTTGAATGCGCTCATTTTGCCACCTCa < 2:1727708/151‑1 (MQ=255) 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tatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGAGATGTATCCGGGAGTTTGAATGCGCTCATTTTGCCACCTCAGTGATTGAGATATTGGCaaagaa > 5:636423‑M2/55‑150 (MQ=255) gTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTATCTAATGATTTTAGCTAAggaaggtgcgaataagcggtgaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttg > 4:957666‑M2/1‑57 (MQ=255) atggctccatatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGAGATGTATCCGGGAGTTTGAATGCGCTCATTTTGCCACCTCAGTGATTGAGATATTGGCaaagaa < 2:904588‑M2/96‑1 (MQ=255) atggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGAGATGTATCCGGGAGTTTGAATGCGCTCATTTTGCCACCTCAGTGATTGAGATATTGGCaaagaa < 3:1519016‑M2/96‑1 (MQ=255) gctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGAGATGTATCCGGGAGTTTGAATGCGCTCATTTTGCCACCTCAGTGATTGAGATATTGGCAAAGAAAGCtt > 5:1891083‑M2/51‑151 (MQ=255) 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gTAGCTAATGATTTTAGCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGAGATGTATCCGGGAGTTTGAATGCGCTCATTTTGCCACCTCAGTGATTGAGATATTGGCAAAGAAAGCTTTAAGCATTATTGAATTAGTAGGGGTAGTAATg < 4:625335/150‑1 (MQ=255) ttgttcgcaccttccCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGAGATGTATCCGGGAGTTTGAATGCGCTCATTTTGCCACCTCAGTGATTGAGATATTGGCAAAGAAAGCTTTAAGCATTATTGAATTAGTAGGGGTAGTAATGa > 7:1546717‑M2/16‑149 (MQ=255) aGCTAATGATTTTAGCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaagg > 2:2054470‑M2/1‑19 (MQ=255) aGCTAATGATTTTAGCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGAGATGTATCCGGGAGTTTGAATGCGCTCATTTTGCCACCTCAGTGATTGAGATATTGGCAAAGAAAGCTTTAAGCATTATTGAATTAGTAGGGGTAGTAATGAAg < 5:1667901/151‑1 (MQ=255) tgttcgcaccttccCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGAGATGTATCCGGGAGTTTGAATGCGCTCATTTTGCCACCTCAGTGATTGAGATATTGGCAAAGAAAGCTTTAAGCATTATTGAATTAGTAGGGGTAGTAATGaa < 6:1350127‑M2/135‑1 (MQ=255) 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gATTTTAGCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgttatcc > 8:1432736‑M2/1‑12 (MQ=255) caccttccCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGAGATGTATCCGGGAGTTTGAATGCGCTCATTTTGCCACCTCAGTGATTGAGATATTGGCAAAGAAAGCTTTAAGCATTATTGAATTAGTAGGGGTAGTAATGAAGGCAGa > 2:36892‑M2/9‑149 (MQ=255) ttAGCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgttatcccc < 8:1858935‑M2/149‑142 (MQ=255) cCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGAGATGTATCCGGGAGTTTGAATGCGCTCATTTTGCCACCTCAGTGATTGAGATATTGGCAAAGAAAGCTTTAAGCATTATTGAATTAGTAGGGGTAGTAATGAAGGCAGAAGGAAACGt < 5:357374‑M2/150‑1 (MQ=255) cTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGAGATGTATCCGGGAGTTTGAATGCGCTCATTTTGCCACCTCAGTGATTGAGATATTGGCAAAGAAAGCTTTAAGCATTATTGAATTAGTAGGGGTAGTAATGAAGGCAGAAGGAAACGtt > 1:95525/1‑151 (MQ=255) tAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgttatccccagtttt > 7:1012786‑M2/1‑3 (MQ=255) aaggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgcatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgttatccccagttttt < 6:2158143‑M2/150‑149 (MQ=255) aaggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgttatccccagttttt < 8:1169139‑M2/150‑149 (MQ=255) aaggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgttatccccagttttt < 5:792583‑M2/150‑149 (MQ=255) aaCTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGAGATGTATCCGGGAGTTTGAATGCGCTCATTTTGCCACCTCAGTGATTGAGATATTGGCAAAGAAAGCTTTAAGCATTATTGAATTAGTAGGGGTAGTAATGAAGGCAGAAGGAAACGtt < 6:1225640/149‑1 (MQ=255) aaCTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGAGATGTATCCGGGAGTTTGAATGCGCTCATTTTGCCACCTCAGTGATTGAGATATTGGCAAAGAAAGCTTTAAGCATTATTGAATTAGTAGGGGTAGTAATGAAGGCAGAAGGAAACGTTTc < 1:209882/151‑1 (MQ=255) aggaaggtgcgaatcagcggggaaattcttctcggctgactaagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcgtatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgttatccccagtttttag > 4:1488691‑M2/1‑1 (MQ=255) | AGAAAATGTATCTATAAAATCGAGGACATCTTTACGTAACCAGTAATGGCGGCCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGAGATGTATCCGGGAGTTTGAATGCGCTCATTTTGCCACCTCAGTGATTGAGATATTGGCAAAGAAAGCTTTAAGCATTATTGAATTAGTAGGGGTAGTAATGAAGGCAGAAGGAAACGTTTCG > NC_000913/294936‑295235 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |