| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_000913 | 3,581,850 | 0 | G | A | 52.7% | 90.3 / inf | 778 | intergenic (+224/‑13) | yhhY/yhhZ | aminoacyl nucleotide detoxifying acetyltransferase/putative Hcp1 family polymorphic toxin protein; putative colicin‑like DNase/tRNase activity |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (225/143); new base A (240/170); total (465/313) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.65e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 794 total aligned reads displayed.
GCCCAATACATATATTGAGATTTAACTCATAATTACTTCCTAAAGTGTAATATTTTATTTTTTAATAT‑ATACGCCTACAATTTCCTGGAGTAAATAAATAACAATTAACAAGCATAATATTGCCATTGATAAAA‑TAGCATGCCATAAAAGGACTTTTCAGGGATGAGTAATATTGTTTACCTGACAGTAACGGGAGAACAACAAGGAAGCATCTCCGCAGGTTGTGGGACTTCTGAGTCTACAGGTAATCGTTGGCAGAGCGGGCATGAGGATGAAATATTTACATTCTCACTCTTAAAT > NC_000913/3581701‑3582000 | ccAATACATATATTGAGATTTAACTCATAATTACTTCCTAAAGTGTAATATTTTATTTTTTAATAT‑ATACGCCTACAATTTCCTGGAGTAAATAAATAACAATTAACAAGCATAATATTGCCATTGATAAAA‑TAGCATGCCATAAAAgg > 2:1326153/1‑149 (MQ=255) ccAATACATATATTGAGATTTAACTCATAATTACTTCCTAAAGTGTAATATTTTATTTTTTAATAT‑ATACGCCTACAATTTCCTGGAGTAAATAAATAACAATTAACAAGCATAATATTGCCATTGATAAAA‑TAGCATGCCATAAAAGGAc < 7:649169/151‑1 (MQ=255) ccAATACATATATTGAGATTTAACTCATAATTACTTCCTAAAGTGTAATATTTTATTTTTTAATAT‑ATACGCCTACAATTTCCTGGAGTAAATAAATAACAATTAACAAGCATAATATTGCCATTGATAAAA‑TAGCATGCCATAAAAAGAc < 3:849343/151‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |