| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 1,673,557 | Δ120 bp | intergenic (‑56/‑237) | mdtJ ← / → tqsA | multidrug efflux system transporter/pheromone AI‑2 transporter |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1673556 | 3 (0.010) | 454 (1.030) | 224/296 | 0.0 | 99.5% | intergenic (‑55/‑357) | mdtJ/tqsA | multidrug efflux system transporter/pheromone AI‑2 transporter |
| ? | NC_000913 | 1673677 = | 2 (0.000) | intergenic (‑176/‑236) | mdtJ/tqsA | multidrug efflux system transporter/pheromone AI‑2 transporter | |||||
Only 100 of 467 total aligned reads displayed.
GCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAAGTAAAGTGGTCAAGCCCCGCGCATAGCGCAAGCTTTGGCAGAAGAAAGGACTAAAGCGCGTTGCGCCAGTGCTGCTCACCTACGAGCAAGATAGTGGATGAGGTACGAAGATGGGTAAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTC > NC_000913/1673406‑1673706 | ccATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAt > 3:1615285‑M1/1‑150 (MQ=255) cATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtg > 2:1554749‑M1/1‑149 (MQ=255) aTTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgt < 8:253207‑M1/151‑4 (MQ=255) tttCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgt > 2:1188586‑M1/1‑147 (MQ=255) gCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcgt < 7:832181‑M1/151‑19 (MQ=255) gCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcct > 8:688933‑M1/1‑133 (MQ=255) gCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcct < 6:1525088‑M1/151‑19 (MQ=255) gCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcct < 8:1209093‑M1/151‑19 (MQ=255) tCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctg > 4:1472257‑M1/1‑131 (MQ=255) cGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaa < 2:603314‑M1/151‑22 (MQ=255) cGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctga < 5:1050937‑M1/150‑21 (MQ=255) cGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctg < 7:1452205‑M1/149‑20 (MQ=255) gCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaac < 2:1087967‑M1/151‑23 (MQ=255) cccATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaac > 1:1554762‑M1/1‑128 (MQ=255) aTTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaat > 4:1698422‑M1/1‑125 (MQ=255) aTTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaat > 5:908951‑M1/1‑125 (MQ=255) tttCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaatt > 2:19343‑M1/1‑124 (MQ=255) tCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattg < 5:779392‑M1/150‑29 (MQ=255) tCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattg < 7:25774‑M1/150‑29 (MQ=255) ttGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtcc > 4:590339‑M1/1‑119 (MQ=255) gACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccata < 3:1109422‑M1/151‑35 (MQ=255) aGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATACAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataat > 3:8193‑M1/1‑114 (MQ=255) aCCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattac > 6:1018677‑M1/1‑109 (MQ=255) cGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaat < 6:1174351‑M1/151‑45 (MQ=255) gTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaatt > 7:947701‑M1/1‑105 (MQ=255) aaTTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatc < 1:1405255‑M1/151‑49 (MQ=255) aaTTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattat > 7:1305601‑M1/1‑103 (MQ=255) aTTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatcc < 1:665689‑M1/151‑50 (MQ=255) tttCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccg > 1:977194‑M1/1‑101 (MQ=255) gTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcag < 5:367691‑M1/149‑54 (MQ=255) cAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgcacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgc > 8:1382833‑M1/1‑92 (MQ=255) aaTAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgct > 2:861500‑M1/1‑91 (MQ=255) aGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttct < 6:943217‑M1/151‑64 (MQ=255) cAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgt > 5:704088‑M1/1‑85 (MQ=255) cAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgt > 4:1159378‑M1/1‑85 (MQ=255) taataaAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgc > 3:457538‑M1/1‑79 (MQ=255) ataaAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcgg > 3:1511193‑M1/1‑77 (MQ=255) ataaAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcgg > 7:589269‑M1/1‑77 (MQ=255) aaaTCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatg > 1:1332851‑M1/1‑74 (MQ=255) aaTCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgaggatg > 7:1230815‑M1/1‑73 (MQ=255) cAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataat > 3:957111‑M1/1‑69 (MQ=255) ataaataTACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattg < 6:220724‑M1/151‑85 (MQ=255) aaataTACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtc > 3:231861‑M1/1‑65 (MQ=255) aataTACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcc < 2:29013‑M1/151‑88 (MQ=255) atatACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcat > 8:84317‑M1/1‑63 (MQ=255) ataCATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcg < 4:375018‑M1/151‑91 (MQ=255) ataCATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcg < 8:313041‑M1/151‑91 (MQ=255) ataCATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcg > 7:1537561‑M1/1‑61 (MQ=255) ataCATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcg > 8:1696042‑M1/1‑61 (MQ=255) aCATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggt > 5:1154336‑M1/1‑59 (MQ=255) aTTGTCCTTCTCCGGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggt > 6:606971‑M1/1‑57 (MQ=255) gTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttg > 4:1288078‑M1/1‑54 (MQ=255) ttCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaac > 5:539335‑M1/1‑50 (MQ=255) ctcCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacg > 1:737954‑M1/1‑48 (MQ=255) tcCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgc > 7:986112‑M1/1‑47 (MQ=255) ccTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacg < 4:292705‑M1/149‑104 (MQ=255) atgCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcct < 4:931221‑M1/150‑107 (MQ=255) gCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcct < 8:1055722‑M1/149‑107 (MQ=255) agagAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgattt < 4:1611232‑M1/151‑112 (MQ=255) agaATTATTTTAATTTTAGCTTAATTCATCTAAACGAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcgtattataattgtcctcggtagtttaacacgcctgatttgt < 6:1275999‑M1/151‑114 (MQ=255) gaATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgt > 1:566307‑M1/1‑37 (MQ=255) attattTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtat > 3:759998‑M1/1‑35 (MQ=255) tattTTAATTTTGGCTTTATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatca < 1:1228020‑M1/150‑118 (MQ=255) tattTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatca < 8:1588562‑M1/150‑118 (MQ=255) attTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcat < 8:1477531‑M1/150‑119 (MQ=255) attTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcat < 8:569933‑M1/150‑119 (MQ=255) attTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcat < 7:1068913‑M1/150‑119 (MQ=255) tttAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagg > 4:678510‑M1/1‑30 (MQ=255) tttAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagc > 1:1026444‑M1/1‑30 (MQ=255) tAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagct < 5:1505434‑M1/150‑123 (MQ=255) aaTTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagctta < 1:1729815‑M1/151‑125 (MQ=255) aaTTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAAGTAAAGTGGTCAAGCCCCGCGCATAGCGCAAGCTTTGGCAGAAGAAAGGACTAAAGCGCGTTGCGCCAGTGCTGCTCACCTACGAGCAAGATAGTGGATGAGGTACGAAGATGGGTAAATGTa < 7:191928/151‑1 (MQ=255) aTTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagctta > 6:357787‑M1/1‑26 (MQ=255) tttCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagctta > 2:1625665‑M1/1‑24 (MQ=255) ttCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaaga > 4:464752‑M1/1‑23 (MQ=255) ttCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaaga < 7:419262‑M1/150‑128 (MQ=255) ggcTTAATTTATCGAAAGGATtgtagaaaataatgtcgtgtacaatttgtccttaatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaactcgcctgatttgtatcatagcttaagaat < 6:1747358‑M1/149‑130 (MQ=255) gCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaatt > 5:1377833‑M1/1‑20 (MQ=255) tAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaac < 3:1353905‑M1/150‑134 (MQ=255) cAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaa < 2:1318240‑M1/151‑140 (MQ=255) cAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaa < 5:225302‑M1/150‑139 (MQ=255) cAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaa > 1:855804‑M1/1‑12 (MQ=255) cAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaa > 4:24962‑M1/1‑12 (MQ=255) cAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaa > 4:517647‑M1/1‑12 (MQ=255) gCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaata < 8:1755687‑M1/151‑142 (MQ=255) gCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaat > 1:425072‑M1/1‑10 (MQ=255) cGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatat < 2:416461‑M1/151‑143 (MQ=255) cGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatat < 2:691688‑M1/151‑143 (MQ=255) aaCCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatatttt < 7:673199‑M1/151‑146 (MQ=255) aaCCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatatttt > 6:1417532‑M1/1‑6 (MQ=255) aaCCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatatttt > 8:1290997‑M1/1‑6 (MQ=255) aCCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttc > 3:650060‑M1/1‑5 (MQ=255) ccAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttg > 6:860465‑M1/1‑4 (MQ=255) acaAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttca < 3:1233317‑M1/150‑148 (MQ=255) cAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcac < 3:494216‑M1/151‑149 (MQ=255) aatgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcact > 5:1723185‑M1/1‑2 (MQ=255) aatgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcact > 6:655422‑M1/1‑2 (MQ=255) aatgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcact < 8:737295‑M1/151‑150 (MQ=255) aatgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcact > 6:485847‑M1/1‑2 (MQ=255) atgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgggtatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttcactt < 2:1421345‑M1/151‑151 (MQ=255) | GCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAAGTAAAGTGGTCAAGCCCCGCGCATAGCGCAAGCTTTGGCAGAAGAAAGGACTAAAGCGCGTTGCGCCAGTGCTGCTCACCTACGAGCAAGATAGTGGATGAGGTACGAAGATGGGTAAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTC > NC_000913/1673406‑1673706 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |