Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 736,686 | 0 | G | T | 54.4% | 22.3 / inf | 496 | intergenic (+2/‑139) | ybfQ/ybfL | pseudogene, H repeat‑associated protein/pseudogene, DDE domain transposase family;putative factor; Not classified; putative receptor protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (97/129); new base T (124/146); total (221/275) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.26e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.05e-01 |
Only 100 of 501 total aligned reads displayed.
TGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAA > NC_000913/736536‑736836 | tGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGTaa > 6:1558649/1‑150 (MQ=21) tGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGGaa < 5:46170/150‑1 (MQ=37) aCTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGGaa > 5:84215/1‑148 (MQ=37) aTTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGGAAAGAt < 5:1703779/149‑1 (MQ=40) aTTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGGAAAGATCa < 5:677015/151‑1 (MQ=40) ttGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCACTGCCAGAGTTGTATCCCAGGTAAAGATCAc < 7:748545/150‑1 (MQ=255) tgtgCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGTAAAGATAACGt > 6:65686/1‑151 (MQ=255) tgtgCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGGAAAGATCACg < 7:127336/150‑1 (MQ=255) gtgCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGGAAAGATCACGTa < 3:700134/151‑1 (MQ=255) gtgCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGGAAAGATCACGTa < 6:945327/151‑1 (MQ=255) gCCGTTATTTCTTGTGCATAAGGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGTAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTTTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGTAAAGATCACGTaa < 4:674850/150‑1 (MQ=255) gTTATTTCTGGTGCAGAAGGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGTAAAGATCACGTAACGCt > 5:1523530/1‑151 (MQ=255) gTTATTTCTGGTGCAGAAGGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGTAAAGATCACGTAACGCt < 1:1037118/151‑1 (MQ=255) tttCTGGTGCAGAAGGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGTAAAGATCACGTAACGCTAcgt > 3:1376499/1‑149 (MQ=255) ttCTGGTGCAGAAGGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGTAAAGATCACGTAACGCTACttt > 8:176681/1‑151 (MQ=255) ttCTGGTGCAGAAGGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGTAAAGATCACGTAACGCTACtt < 6:1126531/150‑1 (MQ=255) tCTGGTGCAGAAGGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGTAAAGATCACGTAAGGCTACttt < 3:1099950/150‑1 (MQ=255) cTGGTGCAGAAGGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACttttt > 1:1406846/1‑151 (MQ=255) tGGTGCAGAAGGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACtttttt > 8:788805/1‑151 (MQ=255) ggTGCAGAAGGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGTAAAGATCACGTAACGCTACtttttt < 3:1697944/150‑1 (MQ=255) ggTGCAGAAGGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGTAAAGATCACGTAACGCTACtttttt < 4:419295/150‑1 (MQ=255) ggTGCAGAAGGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGTAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTg < 4:590827/151‑1 (MQ=255) ggTGCAGAAGGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACttttt < 4:1052907/149‑1 (MQ=255) gTGCATAAGGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACAAATCTCGTTTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGt < 7:1171901/151‑1 (MQ=255) cAGAAGGTTGGTAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTTATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGTAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACt < 2:1493377/151‑1 (MQ=255) cAGAAGGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATCGTATTCCAGTTCAAGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCACGTAAAGATAACGTAACGCTACTTTTTTGAACt > 8:711956/1‑151 (MQ=17) gAAGGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTa > 8:1673275/1‑150 (MQ=255) aaGGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTaa > 2:884004/1‑150 (MQ=255) tGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGTAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAAtt > 1:1243755/1‑151 (MQ=255) gggAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATCTTGTGATTTTGAAAATGTTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAAtt < 5:1642410/150‑1 (MQ=255) ggAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGTAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCg < 2:483152/151‑1 (MQ=255) gAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGc < 5:337307/151‑1 (MQ=255) aaGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGc > 4:1117352/1‑150 (MQ=255) aGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGTAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCAt < 2:1305832/151‑1 (MQ=255) atatAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGTAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCAttt < 8:88830/151‑1 (MQ=255) atatAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGTAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCAttt > 8:1513471/1‑151 (MQ=255) ataGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGTAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCAtttt < 7:240853/150‑1 (MQ=255) ataGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGTAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTa < 8:384854/151‑1 (MQ=255) ataGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCAtttt < 7:961042/150‑1 (MQ=255) ataGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTa < 7:575870/151‑1 (MQ=255) agagGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATg > 5:276339/1‑151 (MQ=255) gagGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGTAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGt < 5:598814/151‑1 (MQ=255) ggATTTCGTGGAAACACATCTCGAGTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATTGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTTTATCCCAGGTAAAGATCACGTAACTCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGttt < 2:1418758/151‑1 (MQ=21) ggggAAACAGATCTCGATTTTTTGAAGGAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATAGGATTGCCATAGTTGTATCCCAGGTAAAGATGACGTTTCGCTACTTTTTTGTTCTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAAtt < 6:123689/151‑1 (MQ=21) gggAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTg > 3:248046/1‑151 (MQ=255) ggAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTga < 3:588883/151‑1 (MQ=255) ggAAACACATCTCGATTTATTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGTAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTg > 2:1700950/1‑150 (MQ=255) aaCACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTACTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGat < 3:1539321/151‑1 (MQ=255) caTCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGGAAACATCACCTAACGCTACTTTTTAGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTc > 7:1564772/1‑151 (MQ=255) cGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCt < 6:1412041/148‑1 (MQ=255) aTTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGTAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCttatta < 5:1328698/151‑1 (MQ=255) aTTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCttatta < 5:1258452/151‑1 (MQ=255) ttttttGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTAc > 7:323673/1‑151 (MQ=255) tttttGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGTAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTAcc > 4:1550106/1‑151 (MQ=255) ttGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGTAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTa < 5:65795/150‑1 (MQ=255) gAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTaa > 8:1109999/1‑149 (MQ=255) gCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACGATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGTAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTg < 8:1398206/151‑1 (MQ=255) gCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCtt > 1:821480/1‑150 (MQ=255) cAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGTAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGt > 6:342/1‑151 (MQ=255) cAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGt < 2:1160659/151‑1 (MQ=255) aaTATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGtt > 5:1371867/1‑151 (MQ=255) aaTATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGtt > 4:1328105/1‑151 (MQ=255) atGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGTAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGttttt > 3:1222407/1‑151 (MQ=255) atGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGttttt < 7:1052192/151‑1 (MQ=255) gTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGTAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTCAt > 1:1509314/1‑151 (MQ=255) gTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTGCACGATACCATTGCGAGAGTTGTATCCCAGGTAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGAATTTTATGTTTAAATATTGAGATATTCCTTATTGCGTAAAGCTGTTTTTCAt > 6:707205/1‑151 (MQ=25) tGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGTAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTCAt > 2:676372/1‑150 (MQ=255) gATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGGAAATATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTCATAg < 3:1288906/151‑1 (MQ=255) gATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTCATAg < 8:1278058/151‑1 (MQ=255) ttttGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTCATAGCt > 1:1730899/1‑151 (MQ=255) ttGAAAATGGTATTCCTGTTCAGGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGTAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTCATAGCtt < 6:510288/150‑1 (MQ=255) tGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTtat > 1:439922/1‑151 (MQ=255) gAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGTAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTtat > 6:1729903/1‑150 (MQ=255) aaaaTGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGTAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATAc < 4:175417/151‑1 (MQ=255) aaaaTGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATAc > 2:786875/1‑151 (MQ=255) aTGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGTAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACAtt > 3:852076/1‑150 (MQ=255) aTGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTGGTATCCCAGGTAAAGATCACGTACCGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATg < 6:149489/151‑1 (MQ=255) ggTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGTAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGa < 7:1736114/150‑1 (MQ=255) aTTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGTAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCa > 5:1120230/1‑150 (MQ=255) tCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTCTATCCCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCaaa < 7:1403914/150‑1 (MQ=255) cctgagcACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGTAAAGAGCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATa < 8:531013/145‑1 (MQ=255) tGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACt > 2:370570/1‑151 (MQ=255) gTTGACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGTAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATAc < 1:1627661/149‑1 (MQ=255) gTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACt < 2:996846/150‑1 (MQ=255) ttCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGTAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACt < 6:83706/149‑1 (MQ=255) tCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTcc < 7:441229/150‑1 (MQ=255) tCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTcc < 8:58087/150‑1 (MQ=255) aaCGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGTAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCtt < 2:271566/150‑1 (MQ=255) aCGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGTAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCtt > 1:696858/1‑150 (MQ=255) aCGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTa < 1:987064/151‑1 (MQ=255) aCCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACataa < 6:104867/151‑1 (MQ=255) cATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACataaat > 4:920280/1‑151 (MQ=255) gCCAGAGTTGTATCCCAGGTAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAAATCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAg < 3:1485435/150‑1 (MQ=255) agTTGTATCCCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGaa > 7:887279/1‑150 (MQ=255) ttGTATCCCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACa > 7:685545/1‑150 (MQ=255) gTATCCCAGGTAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAAt < 1:593029/151‑1 (MQ=255) aTCCCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATg < 1:2317/150‑1 (MQ=255) ccAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAAc < 1:911031/151‑1 (MQ=255) aGGTAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACtt > 2:530830/1‑151 (MQ=255) gggAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACtt > 3:447710/1‑150 (MQ=255) | TGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGGAAAGATCACGTAACGCTACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTGTTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAA > NC_000913/736536‑736836 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |