| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1673531 | 28 (0.050) | 211 (0.410) | 148/300 | 3.0 | 64.7% | intergenic (‑30/‑382) | mdtJ/tqsA | multidrug efflux system transporter/pheromone AI‑2 transporter |
| ? | NC_000913 | 1676567 = | 202 (0.390) | coding (1337/1533 nt) | pntA | pyridine nucleotide transhydrogenase, alpha subunit | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 264 total aligned reads displayed.
CATCACCAGCATTAAAATAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAAGTAAAGTGGTCAAGCCCCGCGCATAGCGCAAGCTTTGGCAGAAGAAAGGACTAAAGCGCGTTGCGCCAGTGCTGCTCACCTACGAGCAAGATAGTGGATGAGGTACGAAGATGGGTAAATG > NC_000913/1673382‑1673678 | catcaGCAGCATTAAAATAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTaag < 7:156263/151‑2 (MQ=255) tcaCCAGCATTAAAATAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAAttt > 7:1299373/1‑151 (MQ=255) caCCAGCATTAAAATAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTaagata < 1:579617/151‑5 (MQ=255) caCCAGCATTAAAATAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTaagat > 1:1693601/1‑147 (MQ=255) aCCAGCATTAAAATAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTc < 3:621979/151‑1 (MQ=255) cAGCATTAAAATAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTaagatacat > 8:1460237/1‑144 (MQ=255) aGCATTAAAATAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTaagatacatt > 6:1132671/1‑143 (MQ=255) aGCATTAAAATAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCt < 7:1282588/151‑1 (MQ=255) gCATTAAAATAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGATGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTaagatacattc > 7:1346146/1‑142 (MQ=255) cATTAAAATAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTaagatacattcc < 2:157796/151‑11 (MQ=255) aTTAAAATAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTaagatacattcca < 5:348919/151‑12 (MQ=255) aTTAAAATAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTaagatacattcc > 1:693208/1‑140 (MQ=255) aTTAAAATAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTa > 2:933058/1‑150 (MQ=255) aTTAAAATAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTa > 5:2011145/1‑150 (MQ=255) tAAAATAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTaa < 4:714607/150‑1 (MQ=255) tAAAATAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTaagatacattccac < 4:1124484/150‑13 (MQ=255) aaaaTAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGAAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTc < 2:186517/151‑1 (MQ=255) aaaaTAAAGCCGCCAATTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGGAATAGCCAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAAtt < 1:1372144/150‑1 (MQ=255) aaaTAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTaagatacattccacacc > 3:1122813/1‑136 (MQ=255) aaTAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTc > 7:1618353/1‑149 (MQ=255) aTAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGc < 7:472575/151‑1 (MQ=255) ccgccATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAAcc < 3:994217/151‑1 (MQ=255) cGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCA < 7:2033650‑M1/151‑1 (MQ=255) cGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCA < 7:670683‑M1/151‑1 (MQ=255) cccTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaa < 4:531958‑M1/151‑8 (MQ=255) cTCACTGACGCTCGCCCATTTTATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaa > 2:1268250‑M1/1‑142 (MQ=255) tGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacg > 5:833919‑M1/1‑137 (MQ=255) gACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacg < 6:482001‑M1/150‑15 (MQ=255) gACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataac < 6:1985137‑M1/149‑14 (MQ=255) aCGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtc > 5:1292764‑M1/1‑135 (MQ=255) gCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACTGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcct < 2:585604‑M1/151‑19 (MQ=255) gCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcct > 5:1634579‑M1/1‑133 (MQ=255) cGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctg < 6:1361889‑M1/149‑20 (MQ=255) cccATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaaca < 5:1708569‑M1/151‑24 (MQ=255) cccATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaac > 2:836337‑M1/1‑128 (MQ=255) ccATTTCATTGACATCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaaaaa < 6:1849676‑M1/151‑25 (MQ=255) ttCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaatt < 1:1077009‑M1/150‑28 (MQ=255) aTTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtcc < 6:418093‑M1/151‑32 (MQ=255) aTTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtcc > 2:274398‑M1/1‑120 (MQ=255) tGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccat > 7:618092‑M1/1‑118 (MQ=255) gACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccat < 6:1524912‑M1/150‑34 (MQ=255) aGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtcaataat > 2:142472‑M1/1‑114 (MQ=255) gTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatatta < 7:905826‑M1/151‑41 (MQ=255) gTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatatt > 4:5706‑M1/1‑111 (MQ=255) ccGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattaca > 4:173072‑M1/1‑108 (MQ=255) cGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaat < 4:931909‑M1/151‑45 (MQ=255) cGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAAT‑AAAATACAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaat < 6:613223‑M1/151‑45 (MQ=255) aTTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatcc > 7:1984903‑M1/1‑102 (MQ=255) ttCTGTAGCAATAGCCAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccg < 5:63155‑M1/150‑51 (MQ=255) tCTGTAGCAATAGCCAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatcagc > 8:1201827‑M1/1‑99 (MQ=255) tCTGTAGCAATAGCCAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGATTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattaaaattatcagc > 1:381379‑M1/1‑99 (MQ=255) gTAGCAATAGCCAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgca < 5:1316477‑M1/148‑53 (MQ=255) tAGGAATAGCCAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtg < 7:1387413‑M1/150‑56 (MQ=255) aGCAATAGCCAGACCTAAT‑AAAATCGAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgtt < 7:1064708‑M1/151‑58 (MQ=255) aGCAATAGCCAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgt < 4:1245758‑M1/150‑57 (MQ=255) aaTAGCCAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgct < 8:1509056‑M1/151‑61 (MQ=255) gCCAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctc < 6:1638691‑M1/151‑65 (MQ=255) ccAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcg < 6:80650‑M1/151‑66 (MQ=255) cAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgt > 1:1248333‑M1/1‑85 (MQ=255) cAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgt > 2:171411‑M1/1‑85 (MQ=255) cAGACCTAAT‑AAAATACAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgt < 4:384599‑M1/151‑67 (MQ=255) aGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtc > 8:538583‑M1/1‑84 (MQ=255) aGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtc < 6:93567‑M1/151‑68 (MQ=255) aGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtc > 6:1171236‑M1/1‑84 (MQ=255) gACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtc > 2:20086‑M1/1‑83 (MQ=255) gACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtc > 6:22163‑M1/1‑83 (MQ=255) cTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcg > 5:1018966‑M1/1‑80 (MQ=255) taat‑aaAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgc > 6:568307‑M1/1‑79 (MQ=255) aat‑aaAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcg > 1:490893‑M1/1‑78 (MQ=255) t‑aaAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcgg > 8:1859684‑M1/1‑76 (MQ=255) t‑aaAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcgg > 3:1537152‑M1/1‑76 (MQ=255) aaaaTCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggat > 1:219466‑M1/1‑75 (MQ=255) aTCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaattaacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgat < 8:1989855‑M1/151‑80 (MQ=255) aTCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgat > 5:642037‑M1/1‑72 (MQ=255) ataaataTACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattg > 2:1971606‑M1/1‑67 (MQ=255) ataaataTACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattg < 2:1098567‑M1/151‑85 (MQ=255) taaataTACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgt > 2:368005‑M1/1‑66 (MQ=255) aaataTACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcttcatcgcggatgataattgtc > 3:14777‑M1/1‑65 (MQ=255) tataCATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctc > 8:72023‑M1/1‑62 (MQ=255) ataCATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAAATCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcg < 3:377005‑M1/151‑91 (MQ=255) cATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggt > 4:1684897‑M1/1‑58 (MQ=255) cATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggt > 8:449545‑M1/1‑58 (MQ=255) cATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggt > 3:1346523‑M1/1‑58 (MQ=255) aTTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtag < 4:1889502‑M1/151‑95 (MQ=255) ccTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttga > 3:1847539‑M1/1‑52 (MQ=255) ttCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaac > 2:1793084‑M1/1‑50 (MQ=255) cTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAngtagaaaataacgtcctgnnnannntnnnnannatantnnaattntncgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaanacgcct > 7:1653240‑M1/1‑45 (MQ=255) gCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataccgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctga < 3:1603600‑M1/151‑109 (MQ=255) gCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctg > 5:494008‑M1/1‑43 (MQ=255) gCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcct < 5:1157709‑M1/149‑107 (MQ=255) gCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacctcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcct < 7:391806‑M1/149‑107 (MQ=255) cAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgat > 5:998263‑M1/1‑42 (MQ=255) cAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgat < 7:187669‑M1/151‑110 (MQ=255) aaGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatt < 1:2045120‑M1/151‑111 (MQ=255) agagAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgattt < 4:1867224‑M1/151‑112 (MQ=255) gaATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattctccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgt > 1:1460649‑M1/1‑37 (MQ=255) attattTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtat > 8:501428‑M1/1‑35 (MQ=255) tattTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctcatttgtatcat > 6:978962‑M1/1‑33 (MQ=255) ttttAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcat > 4:816513‑M1/1‑31 (MQ=255) tAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagct < 8:1662030‑M1/150‑123 (MQ=255) | CATCACCAGCATTAAAATAAAGCCGCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAAT‑AAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAAGTAAAGTGGTCAAGCCCCGCGCATAGCGCAAGCTTTGGCAGAAGAAAGGACTAAAGCGCGTTGCGCCAGTGCTGCTCACCTACGAGCAAGATAGTGGATGAGGTACGAAGATGGGTAAATG > NC_000913/1673382‑1673678 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |