| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4020781 | 273 (0.530) | 267 (0.520) | 177/300 | 1.4 | 49.7% | coding (556/1641 nt) | ubiB | regulator of octaprenylphenol hydroxylation, ubiquinone synthesis; regulator of 2'‑N‑acetyltransferase; putative ABC1 family protein kinase |
| ? | NC_000913 | 4020794 = | 267 (0.520) | coding (569/1641 nt) | ubiB | regulator of octaprenylphenol hydroxylation, ubiquinone synthesis; regulator of 2'‑N‑acetyltransferase; putative ABC1 family protein kinase | |||||
Only 100 of 547 total aligned reads displayed.
GCCCAGGTTCATACCGCGCGATTGAAATCGAATGGTAAAGAGGTGGTGATTAAAGTCATCCGCCCGGATATTTTGCCGGTTATTAAAGCGGATCTGAAACTTATCTACCGTCTGGCTCGCTGGGTGCCGCGTTTGCTGCCGGATGGTCGCCGTCTGCGCCCAACCGAAGTGGTGCGCGAGTACGAAAAGACATTGATTGATGAACTGAATTTGCTGCGGGAATCTGCCAACGCCATTCAGCTTCGGCGCAATTTTGAAGACAGCCCGATGCTCTACATCCCGGAAGTTTACCCTGACTATT > NC_000913/4020631‑4020931 | gCCCAGGTTCATACCGCGCGATTGAAATCGAATGGTAAAGAGGTGGTGATTAAAGTCATCCGCCCGGATATTTTGCCGGTTATTAAAGCGGATCTGAAACTTATCTACCGTCTGGCTCGCTGGGTGCCGCGTTTGCTGCCGGATGGTCGcc < 3:439249/151‑1 (MQ=255)gCCCAGGTTCATACCGCGCGATTGAAATCGAATGGTAAAGAGGTGGTGATTAAAGTCATCCGCCCGGAGATTTTGCCGGTTATTAAAGCGGATCTGAACCTTATCTACCGTCTGGCTCGCTGGGTGCCGCGTTTGCTGCCGGATGGTCGcc > 8:1691156/1‑151 (MQ=255) ggTTCATACCGCGCGATTGAAATCGAATGGTAAAGAGGTGGTGATTAAAGTCATCCGCCCGGATATTTTGCCGGTTATTAAAGCGGATCTGAAACTTATCTACCGTCTGGCTCGCTGGGTGCCGCGTTTGCTGCCGGATGGTCGCCGTCTg > 5:1547353/1‑151 (MQ=255) gTTCATACCGCGCGATTGAAATCGAATGGTAAAGAGGTGGTGATTAAAGTCATCCGCCCGGATATTTTGCCGGTTATTAAAGCGGATCTGAAACTTATCTACCGTCTGGCTCGCTGGGTGCCGCGTTTGCTGCCGGATGGTCGCCGTCTgc > 4:809889/1‑151 (MQ=255) cATAGCGCGCGATTGAAATCTAATGGGAAAGAGGTGGTTATTAAAGTCATCCGCCCGGATATTTTGCCGGTTATTAAAGCGGATCTGAAACTTATCTACCGTCTGGCTCGCTGGGTGCCGCGTTTGCTGCCGGATGGTCGCCccgaagtg < 2:1300502‑M1/150‑9 (MQ=255) cATACCGCGCGATTGAAATCGAATGGTAAAGAGGTGGTGATTAAAGTCATCCGCCCGGATATTTTGCCGGTTATTAAAGCGGATCTGAAACTTATCTACCGTCTGGCTCGCTGGGTGCCGCGTTTGCTGCCGGATGGTCGCCccgaagtgg > 1:87239‑M1/1‑142 (MQ=255) cATACCGCGCGATTGAAATCGAATGGTAAAGAGGTGGTGATTAAAGTCATCCGCCCGGATATTTTGCCGGTTATTAAAGCGGATCTGAAACTTATCTACCGTCTGGCTCGCTGGGTGCCGCGGTTGCTGCCGGATGGTCGCGGTCTGCGcc > 8:367394/1‑151 (MQ=255) tACCGCGCGATTGAAATCGAATGGTAAAGAGGTGGTGATTAAAGTCATCCGCCCGGATATTTTGCCGGTTATTAAAGCGGATCTGAAACTTATCTACCGTCTGGCTCGCTGGGTGCCGCGTTTGCTGCCGGATGGTCGCCGTCTGCGccc > 6:1523262/1‑150 (MQ=255) gcgATTGAAATCGAATGGTAAAGAGGTGGTGATTAAAGTCATCCGCCCGGATATTTTGCCGGTTATTAAAGCGGATCTGAAACTTATCTACCGTCTGGCTCGCTGGGTGCCGCGTTTGCTGCCGGATGGTCGCCccgaagtggtgcgcg > 3:1069744‑M1/1‑134 (MQ=255) cgATTGAAATCGAATGGTAAAGAGGTGGTGATTAAAGTCATCCGCCCGGATATTTTGCCGGTTATTAAAGCGGATCTGAAACTTATCTACCGTCTGGCTCGCTGGGTGCCGCGTTTGCTGCCGGATGGTCGCCGTCTGCGCCCAACCGa > 3:1308689/1‑149 (MQ=255) aTTGAAATCGAATGGTAAAGAGGTGGTGATTAAAGTCATCCGCCCGGATATTTTGCCGGTTATTAAAGCGGATCTGAAACTTATCTACCGTCTGGCTCGCTGGGTGCCGCGTTTGCTGCCGGATGGTCGCCccgaagtggtgcgcgagtac > 1:1000061‑M1/1‑131 (MQ=255) tGAAATCGAATGGTAAAGAGGTGGTGATTAAAGTCATCCGCCCGGATATTTTGCCGGTTATTAAAGCGGATCTGAAACTTATCTACCGTCTGGCTCGCTGGGTGCCGCGTTTGCTGCCGGATGGTCGCCccgaagtggtgcgcgagtacg < 5:646203‑M1/150‑22 (MQ=255) gAAATCGAATGGTAAAGAGGTGGTGATTAAAGTCATCCGCCCGGATATTTTGCCGGTTATTAAAGCGGATCTGAAACTTATCTACCGTCTGGCTCGCTGGGTGCCGCGTTTGCTGCCGGATGGTCGCCGTCTGCGCCCAACCGAAgtggtg > 1:188934/1‑151 (MQ=255) aaaTCGAATGGTAAAGAGGTGGTGATTAAAGTCATCCGCCCGGATATTTTGCCGGTTATTAAAGCGGATCTGAAACTTATCTACCGTCTGGCTCGCTGGGTGCCGCGTTTGCTGCCGGATGGTCGCCGTCTGCGCCCAACCGAAGTGGTgc < 3:1588105/151‑1 (MQ=255) aaaTCGAATGGTAAAGAGGTGGTGATTAAAGGCATCCGCCCGGATATTTTGCCGGTTATTAAAGCGGATCTGAAACTTATCTACCGTCTGGCTCGCTGGGTGCCGCGTTTGCTGCCGGATGGTCGCCccgaagtggtgcgcgagtacgaaa < 6:1124757‑M1/151‑25 (MQ=255) aaTCGAATGGTAAAGAGGTGGTGATTAAAGTCATCCGCCCGGATATTTTGCCGGTTATTAAAGCGGATCTGAAACTTATCTACCGTCTGGCTCGCTGGGTGCCGCGTTTGCTGCCGGATGGTCGCCccgaagtggtgcgcgagtacgaaa > 5:890352‑M1/1‑126 (MQ=255) aTCGAATGGTAAAGAGGTGGTGATTAAAGTCATCCGCCCGGATATTTTGCCGGTTATTAAAGCGGATCTGAAACTTATCTACCGTCTGGCTCGCTGGGTGCCGCGTTTGCTGCCGGATGGTCGCCccgaagtggtgcgcgagtacgaaaag < 5:243155‑M1/151‑27 (MQ=255) cGAATGGTAAAGAGGTGGTGATTAAAGTCATCCGCCCGGATATTTTGCCGGTTATTAAAGCGGATCTGAAACTTATCTACCGTCTGGCTCGCTGGGTGCCGCGTTTGCTGCCGGATGGTCGCCccgaagtggtgcgcgagtacgaaaagac < 1:536143‑M1/151‑29 (MQ=255) gAATGGTAAAGAGGTGGTGATTAAAGTCATCCGCCCGGATATTTTGCCGGTTATTAAAGCGGATCTGAAACTTATCTACCGTCTGGCTCGCTGGGTGCCGCGTTTGCTGCCGGATGGTCGCCGTCTGCGCCCAACCGAAGTGGTGcgcg > 7:1966627/1‑149 (MQ=255) aaTGGTAAAGAGGTGGTGATTAAAGTCATCCGCCCGGATATTTTGCCGGTTATTAAAGCGGATCTGAAACTTATCTACCGTCTGGCTCGCTGGGTGCCGCGTTTGCTGCCGGATGGTCGCCGTCTGCGCCCAACCGAAGTGGTGCGCGAGt < 2:342413/151‑1 (MQ=255) aTGGTAATGAGGTGGTGATTAAAGTCATCCGCCAGGATATTTTTCGGGTTATTAAAGCGGATCTGAAACTTATCTACCGTCTGGCTGGCTGGGTGCCGCGTTTGCTGGGGGATGCTCGCCccgtagtggtgcgcgagtacgaaaagagttt < 3:1984593‑M1/151‑32 (MQ=255) aTGGTAAAGAGGTGGTGATTAAAGTCATCCGCCCGGATATTTTGCCGGTTATTAAAGCGGATCTGAAACTTATCTACCGTCTGGCTCGCTGGGTGCCGCGTTTGCTGCCGGATGGTCGCCGTCTGCGCCCAACCGAAGTGGTGCGCGAGTa < 1:174425/151‑1 (MQ=255) ggTAAAGAGGTGGTGATTAAAGTCATCCGCCCGGATATTTTGCCGGTTATTAAAGCGGATCTGAAACTTATCTACCGTCTGGCTCGCTGGGTGCCGCGTTTGCTGCCGGATGGTCGCCccgaagtggtgcgcgagtacgaaaagacattga < 4:1818385‑M1/151‑34 (MQ=255) gTAAAGAGGTGGTGATTAAAGTCATCCGCCCGGATATTTTGCCGGTTATTAAAGCGGATCTGAAACTTATCTACCGTCTGGCTCGCTGGGTGCCGCGTTTGCTGCCGGATGGTCGCCccgaagtggtgcgcgagtacgaaaagacattgat < 4:1058288‑M1/151‑35 (MQ=255) tAAAGAGGTGGTGATTAAATTCATCCGCCCGGATATTTTGCCGGTTATTAAAGCGGATCTGAAACTTATCTACCGTCTGGCTCGCTGGGTGCCGCGGTTGCTGCCGGATGGTCGACccgaagtggtgcgcgagtacgaaaagacattgatt > 6:715312‑M1/1‑116 (MQ=255) aaGAGGTGGTGATTAAAGTCATCCGCCCGGATATTTTGCCGGTTATTAAAGCGGATCTGAAACTTATCTAGCGTCTGGCTCGCTGGGTGCCGCGTTTGCTGCCGGATGGTCGCCGTCTGCGCCCAACCGAAGTGGTGCGCGAGTACGaaa > 7:1107632/1‑150 (MQ=255) agagGTGGTGATTAAAGTCATCCGCCCGGATATTTTGCCGGTTATTAAAGCGGATCTGAAACTTATCTACCGTCTGGCTCGCTGGGTGCCGCGTTTGCTGCCGGATGGTCGCCGTCTGCGCCCAACCGAAGTGGTGCGCGAGTACGAAAAg < 4:1988671/151‑1 (MQ=255) agagGTGGTGATTAAAGTCATCCGCCCGGATATTTTGCCGGTTATTAAAGCGGATCTGAAACTTATCTACCGTCTGGCTCGCTGGGTGCCGCGTTTGCTGCCGGATGGTCGCCGTCTGCGCCCAACCGAAGTGGTGCGCGAGTACGAAAAg < 5:1461593/151‑1 (MQ=255) 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gggTGCCGCGTTTGCTGCCGGATGGTCGCCccgaagtggtgcgcgagtacgaaaagacattgattgatgaactgaatttgctgcgggaatctgccaacgccattcagcttcggcgcaattttgaagacagcccgatgctctacatcccgga < 8:87067‑M1/151‑122 (MQ=255) gggTGCCGCGTTTGCTGCCGGATGGTCGCCccgaagtggtgcgcgagtacgaaaagacattgattgatgaactgaatttgctgcgggaatctgccaacgccattcagcttcggcgcaattttgaagacagcccgatgctctacatcccgg < 6:1201301‑M1/150‑121 (MQ=255) gggTGCCGCGTTTGCTGCCGGATGGTCGCCGTCTGCGCCCAACCGAAGTGGTGCGCGAGTACGAAAAGACATTGATTGATGAACTGAATTTGCTGCGGGAATCTGCCAACGCCATTCAGCTTCGGCGCAATTTTGAAGACAGCCCGATGct < 3:1740339/151‑1 (MQ=255) gCCGCGTTTGCTGCCGGATGGTCGCCccgaagtggtgcgcgagtacgaaaagacattgattgatgaactgaatttgctgcgggaatctgccaacgccattcagcttcggcgcaattttgaagacagcccgatgctctacatcccggaagtt < 7:890802‑M1/151‑126 (MQ=255) ccGCGTTTGCTGCCGGATGGTCGCCccgaagtggtgcgcgagtacgaaaagacattgattgatgaactgaatttgctgcgggaatctgccaacgccattcagcttcggcgcaattttgaagacagcccgatgctctacatcccggaagttt > 2:454748‑M1/1‑25 (MQ=255) ccGCGTTTGCTGCCGGATGGTCGCCGTCTGCGCCCAACCGAAGTGGTGCGCGAGTACGAAAAGACATTGATTGATGAACTGAATTTGCTGCGGGAATCTGCCAACGCCATTCAGCTTCGGCGCAATTTTGAAGACAGCCCGATGCTCTACa < 3:1367600/151‑1 (MQ=255) cgcgTTTGCTGCCGGATGGTCGCCccgaagtggtgcgcgagtacgaaaagacattgattgatgaactgaatttgctgcgggaatctgccaacgccattcagcttcggcgcaattttgaagacagcccgatgctctacatcccggaagttta < 5:1230856‑M1/151‑128 (MQ=255) cgTTTGCTGCCGGATGGTCGCCGTCTGCGCCCAACCGAAGTGGTGCGCGAGTACGAAAAGCCATTGATTGATGAACTGAATTTGCTGCGGGAATCTGCCAACGCCATTCAGCTTCGGCGCAATTTTGAAGCCAGCCCGATGCTCTACATcc > 2:1515231/1‑151 (MQ=255) cgTTTGCTGCCGGATGGTCGCCGTCTGCGCCCAACCGAAGTGGTGCGCGAGTACGAAAAGACATTGATTGATGAACTGAATTTGCTGCGGGAATCTGCCAACGCCATTCAGCTTCGGCGCAATTTTGAAGACAGCCCGATGCTCTACATcc < 5:805794/151‑1 (MQ=255) tttGCTGCCGGATGGTCGCCGTCTGCGCCCAACCGAAGTGGTGCGCGAGTACGAAAAGACATTGATTGATGAACTGAATTTGCTGCGGGAATCTGCCAACGCCATTCAGCTTCGGCGCAATTTTGAAGACAGCCCGATGCTCTACATCCCg > 8:81439/1‑151 (MQ=255) gctgcCGGATGGTCGCCccgaagtggtgcgcgagtacgaaaagacattgattgatgaactgaatttgctgcgggaatctgccaacgccattcagcttcggcgcaattttgaagacagcccgatgctctacatcccggaagtttaccctga < 3:1808306‑M1/150‑134 (MQ=255) cGGATGGTCGCCGTCTGCGCCCAACCGAAGTGGTGCGCGAGTACGAAAAGACATTGATTGATGAACTGAATTTGCTGCGGGAATCTGCCAACGCCATTCAGCTTCGGCGCAATTTTGAAGACAGCCCGATGCTCTACATCCCGGAAGTTTa < 6:1757928/151‑1 (MQ=255) ggATGGTCGCCccgaagtggtgcgcgagtacgaaaagacattgattgatgaactgaatttgctgcgggaatctgccaacgccattcagcttcggcgcaattttgaagacagcccgatgctctacatcccgaaagtttaccctgactattgt < 5:1753308‑M1/151‑141 (MQ=255) ggTCGCCccgaagtggtgcgcgagtacgaaaagacattgattgatgaactgaatttgctgcgggaatctgccaacgccattcagcttcggcgcaattttgaagacagcccgatgctctacatcccggaagtttaccctgactattgtagt < 2:1980206‑M1/150‑144 (MQ=255) cccgaagtggtgcgcgagtacgaaaagacattgattgatgaactgaatttgctgcgggaatctgccaacgccattcagcttcggcgcaattttgaagacagcccgatgctctacatcccggaagtttaccctgactattgtagtgaaggga < 7:2002517‑M1/151‑151 (MQ=255) cccgaagtggtgcgcgagtacgaaaagacattgattgatgaactgaatttgctgcgggaatctgccaacgccattcagcttcggcgcaattttgaagacagcccgatgctctacatcccggaagtttaccctgactattgtagtgaaggg > 7:658614‑M1/1‑1 (MQ=255) cGTCTGCGCCCAACCGAAGTGGTGCGCGAGTACGAAAAGTCATTGATTGATGAAGTGAATTTGCTGCGGGAATCTGCGAACGCCATTCAGCTTGGGCGCAATTTTGAAGACAGGCCGATGCTCTACATCCCGGAAGTTTACGCTGACTAtt < 8:1389283/151‑1 (MQ=255) | GCCCAGGTTCATACCGCGCGATTGAAATCGAATGGTAAAGAGGTGGTGATTAAAGTCATCCGCCCGGATATTTTGCCGGTTATTAAAGCGGATCTGAAACTTATCTACCGTCTGGCTCGCTGGGTGCCGCGTTTGCTGCCGGATGGTCGCCGTCTGCGCCCAACCGAAGTGGTGCGCGAGTACGAAAAGACATTGATTGATGAACTGAATTTGCTGCGGGAATCTGCCAACGCCATTCAGCTTCGGCGCAATTTTGAAGACAGCCCGATGCTCTACATCCCGGAAGTTTACCCTGACTATT > NC_000913/4020631‑4020931 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |