| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | 295082 = | 283 (0.550) | intergenic (‑283/+57) | yagM/yagN | CP4‑6 prophage; uncharacterized protein/CP4‑6 prophage; uncharacterized protein | |||||
Only 100 of 832 total aligned reads displayed.
GTACAGAAAATGTATCTATAAAATCGAGGACATCTTTACGTAACCAGTAATGGCGGCCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGAGATGTATCCGGGAGTTTGAATGCGCTCATTTTGCCACCTCAGTGATTGAGATATTGGCAAAGAAAGCTTTAAGCATTATTGAATTAGTAGGGGTAGTAATGAAGGCAGAAGGAAACGTT > NC_000913/294932‑295232 | tACAGAAAATGTATCTATAAAATCGAGGACATCTTTACGTAACCAGTAATGGCGGCCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCt > 1:422231/1‑151 (MQ=255) gcgggacaagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccc < 7:38478‑M2/1‑1 (MQ=255) aaaaTGTATCTATAAAATCGAGGACATCTTTAGGTAACCAGTAATGGCGGCCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAAgga > 3:1430714‑M2/1‑148 (MQ=255) aaaaTGTATCTATAAAATCGAGGACATCTTTACGTAACCAGTAATGGCGGCCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAAgga > 6:761820‑M2/1‑148 (MQ=255) aaaTGTATCTATAAAATCGAGGACATCTTTACGTAACCAGTAATGGCGGCCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAACTCa < 5:993416/151‑1 (MQ=255) aaTGTATCTATAAAATCGAGGACATCTTTACGTAACCAGTAATGGCGGCCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAACTc > 5:866783/1‑149 (MQ=255) tataAAATCGAGGACATCTTTACGTAACCAGTAATGGCGGCCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAACTCAGCTGTTGa > 6:1354825/1‑150 (MQ=255) ataAAATCGAGGACATCTTTACGTAACCAGTAATGGCGGCCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAAggaaggtgcgaata > 1:1654166‑M2/1‑137 (MQ=255) ataAAATCGAGGACATCTTTACGTAACCAGTAATGGCGGCCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAACTCAGCTGTTGaa < 2:1644128/150‑1 (MQ=255) aataTCGAGGACATCTTTACGTAACCAGTAATGGCGGCCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAACTCAGCTGTTGAAAt < 8:746448/147‑1 (MQ=255) aaaaTCGAGGACATCTTTACGTAACCAGTAATGGCGGCCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAACTCAGCTGTTGAAATg < 6:295191/151‑1 (MQ=255) tctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGc > 3:215289‑M2/129‑151 (MQ=255) gtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccttaggtaagctgtttggctgggatatt < 5:1413835‑M2/27‑14 (MQ=255) aCATCTTTACGTAACCAGTAATGGCGGCCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGAtt < 4:516610/151‑1 (MQ=255) gacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTg < 3:1801409‑M2/31‑1 (MQ=255) ggcgcttactgctgaattcactttcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTTATTgaga < 7:211401‑M2/34‑1 (MQ=255) tACGTAACCAGTAATGGCGGCCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGAGATGt > 4:963320/1‑151 (MQ=255) cttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAACTCAGATGTTGAAATGAGCGGTGATTGAGATGt > 8:1537292‑M2/114‑150 (MQ=255) 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tcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGAGATGTATCCGGGAGTTTg < 4:1129455‑M2/50‑1 (MQ=255) ggcggcCATTTTTTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGACATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGAGATGTATCCGGGAGTTTGaa < 8:103406/151‑1 (MQ=255) gcggcCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcattt > 2:1490852‑M2/1‑102 (MQ=255) gcggcCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGAGATGTATCCGGGAGTTTGAAt < 1:963935/151‑1 (MQ=255) ggcCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTACTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGAGATGTATCCGGGAGTTTGAATgc < 1:1604055/151‑1 (MQ=255) 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agaTTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgcc < 6:1226153‑M2/150‑124 (MQ=255) tttGTAGCTAATGATTTTAGCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccattt < 4:128335‑M2/151‑128 (MQ=255) ttGTAGCTAATGATTTTAGCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGAGATGTATCCGGGAGTTTGAATGCGCTCATTTTGCCACCTCAGTGATTGAGATATTGGCAAAGAAAGCTTTAAGCATTATTGAATTAGTAGGGGTAGTAAt > 5:1613599/1‑151 (MQ=255) ttGTAGCTAATGATTTTAGCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGAGATGTATCCGGGAGTTTGAATGCGCTCATTTTGCCACCTCAGTGATTGAGATATTGGCAAAGAAAGCTTTAAGCATTATTGAATTAGTAGGGGTAGTAAt > 2:121968/1‑151 (MQ=255) ggacttgttcgcaccttccCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGAGATGTATCCGGGAGTTTGAATGCGCTCATTTTGCCACCTCAGTGATTGAGATATTGGCAAAGAAAGCTTTAAGCATTATTGAATTAGTAGGGGTAGTAAt > 1:2735‑M2/20‑151 (MQ=255) acttgttcgcaccttccCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGAGATGTATCCGGGAGTTTGAATGCGCTCATTTTGCCACCTCAGTGATTGAGATATTGGCAAAGAAAGCTTTAAGCATTATTGAATTAGTAGGGGTAGTAATGa < 7:1196160‑M2/134‑1 (MQ=255) acttgttcgcaccttccCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGAGATGTATCCGGGAGTTTGAATGCGCTCATTTTGCCACCTCAGTGATTGAGATATTGGCAAAGAAAGCTTTAAGCATTATTGAATTAGTAGGGGTAGTAATGa < 4:1648806‑M2/134‑1 (MQ=255) aGCTAATGATTTTAGCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGAGATGTATCCGGGAGTTTGAATGCGCTCATTTTGCCACCTCAGTGATTGAGATATTGGCAAAGAAAGCTTTAAGCATTATTGAATTAGTAGGGGTAGTAATGa > 5:1759912/1‑149 (MQ=255) tgttcgcaccttccCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGAGATGTATCCGGGAGTTTGAATGCGCTCATTTTGCCACCTCAGTGATTGAGATATTGGCAAAGAAAGCTTTAAGCATTATTGAATTAGTAGGGGTAGTAATGAAg < 3:948529‑M2/136‑1 (MQ=255) gCTAATGATTTTAGCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcg > 6:1996156‑M2/1‑18 (MQ=255) gttcgcaccttccCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGAGATGTATCCGGGAGTTTGAATGCGCTCATTTTGCCACCTCAGTGATTGAGATATTGGCAAAGAAAGCTTTAAGCATTATTGAATTAGTAGGGGTAGTAATGAAgg < 4:1967791‑M2/137‑1 (MQ=255) cTAATGATTTTAGCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgt < 3:1259630‑M2/151‑135 (MQ=255) aaTGATTTTAGCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgtt < 6:431049‑M2/150‑136 (MQ=255) ttAGCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGAGATGTATCCGGGAGTTTGAATGCGCTCATTTTGCCACCTCAGTGATTGAGATATTGGCAAAGAAAGCTTTAAGCATTATTGAATTAGTAGGGGTAGTAATGAAGGCAGAAGGaa > 2:971081/1‑150 (MQ=255) ccCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGAGATGTATCCGGGAGTTTGAATGCGCTCATTTTGCCACCTCAGTGATTGAGATATTGGCAAAGAAAGCTTTAAGCATTATTGAATTAGTAGGGGTAGTAATGAAGGCAGAAGGAAACg < 2:883927‑M2/149‑1 (MQ=255) cTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGAGATGTATCCGGGAGTTTGAATGCGCTCATTTTGCCACCTCAGTGATTGAGATATTGGCAAAGAAAGCTTTAAGCATTATTGAATTAGTAGGGGTAGTAATGAAGGCAGAAGGAAACGtt > 8:1132430/1‑151 (MQ=255) cTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGAGATGTATCCGGGAGTTTGAATGCGCTCATTTTGCCACCTCAGTGATTGAGATATTGGCAAAGAAAGCTTTAAGCATTATTGAATTAGTAGGGGTAGTAATGAAGGAAGAAGGAAACGtt > 4:1363941/1‑151 (MQ=255) | GTACAGAAAATGTATCTATAAAATCGAGGACATCTTTACGTAACCAGTAATGGCGGCCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGAGATGTATCCGGGAGTTTGAATGCGCTCATTTTGCCACCTCAGTGATTGAGATATTGGCAAAGAAAGCTTTAAGCATTATTGAATTAGTAGGGGTAGTAATGAAGGCAGAAGGAAACGTT > NC_000913/294932‑295232 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |