| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 1,673,557 | Δ120 bp | intergenic (‑56/‑237) | mdtJ ← / → tqsA | multidrug efflux system transporter/pheromone AI‑2 transporter |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1673556 | 1 (0.000) | 244 (0.480) | 162/296 | 2.0 | 99.8% | intergenic (‑55/‑357) | mdtJ/tqsA | multidrug efflux system transporter/pheromone AI‑2 transporter |
| ? | NC_000913 | 1673677 = | 0 (0.000) | intergenic (‑176/‑236) | mdtJ/tqsA | multidrug efflux system transporter/pheromone AI‑2 transporter | |||||
Only 100 of 250 total aligned reads displayed.
TAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAAGTAAAGTGGTCAAGCCCCGCGCATAGCGCAAGCTTTGGCAGAAGAAAGGACTAAAGCGCGTTGCGCCAGTGCTGCTCACCTACGAGCAAGATAGTGGATGAGGTACGAAGATGGGTAAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTT > NC_000913/1673529‑1673826 | atttccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGt > 4:850999‑M2/149‑151 (MQ=255) ttccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGt > 5:1296807‑M2/147‑149 (MQ=255) tccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacataataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGt > 7:655120‑M2/146‑148 (MQ=255) ccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGaa < 4:531958‑M2/7‑1 (MQ=255) ctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGaaa > 8:527119‑M2/143‑150 (MQ=255) cactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAAt < 7:445539‑M2/10‑1 (MQ=255) tgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACg > 5:833919‑M2/138‑151 (MQ=255) tgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACg > 2:1312084‑M2/138‑151 (MQ=255) gacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAAc < 5:317665‑M2/13‑1 (MQ=255) gacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACg < 6:482001‑M2/14‑1 (MQ=255) acgctcgcccatttcattgacagcgtacctgtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttgtcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTc < 6:1100584‑M2/16‑1 (MQ=255) gctcgcccatttcattgacagcgtactggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCt < 2:585604‑M2/18‑1 (MQ=255) tcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTg > 5:391411‑M2/132‑150 (MQ=255) cgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttatgtagcaatagccatacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaatagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGa < 1:402162‑M2/20‑1 (MQ=255) cccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAAc > 2:836337‑M2/129‑150 (MQ=255) ccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACaa < 7:200630‑M2/24‑1 (MQ=255) catttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACaa > 3:1921131‑M2/127‑150 (MQ=255) catttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACaa > 2:1711727‑M2/127‑150 (MQ=255) ttcattgactgcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAAtt < 7:1902611‑M2/27‑1 (MQ=255) ttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAAtt < 1:1077009‑M2/27‑1 (MQ=255) attgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTcc > 2:274398‑M2/121‑151 (MQ=255) attgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTcc < 6:418093‑M2/31‑1 (MQ=255) gacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCat < 4:1125750‑M2/33‑1 (MQ=255) acagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCataa < 1:207919‑M2/35‑1 (MQ=255) accggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTa < 3:529872‑M2/40‑1 (MQ=255) accggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTAc < 3:1420510‑M2/41‑1 (MQ=255) ccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACa > 4:173072‑M2/109‑150 (MQ=255) cggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAAt < 4:931909‑M2/44‑1 (MQ=255) ggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAAtt < 7:1317254‑M2/45‑1 (MQ=255) gttatttctgtagcaatagccagacctaataaaatcgaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTa < 6:1284322‑M2/46‑1 (MQ=255) ttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCg < 3:1290389‑M2/50‑1 (MQ=255) tctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGc < 6:1795622‑M2/51‑1 (MQ=255) tctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCAGc > 8:1201827‑M2/100‑150 (MQ=255) tgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAgt > 5:551308‑M2/98‑151 (MQ=255) tgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAgt > 2:1757723‑M2/98‑151 (MQ=255) gtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAgt < 2:99422‑M2/54‑1 (MQ=255) agcaatagccagacctaataaaatcgaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGtt < 7:1064708‑M2/57‑1 (MQ=255) agcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAgtgt < 4:1245758‑M2/56‑1 (MQ=255) agcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGtt > 4:1922285‑M2/95‑151 (MQ=255) aatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCt < 1:191953‑M2/60‑1 (MQ=255) aatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCt < 8:1509056‑M2/60‑1 (MQ=255) agccagacctaataaattccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTtct > 1:737147‑M2/89‑151 (MQ=255) agccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTtct > 6:1149540‑M2/89‑151 (MQ=255) cagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGt > 1:1248333‑M2/86‑151 (MQ=255) agacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTc < 6:93567‑M2/67‑1 (MQ=255) gacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTc > 3:1788474‑M2/84‑150 (MQ=255) cctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATc > 4:59005‑M2/82‑151 (MQ=255) aataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATcg < 7:1811816‑M2/71‑1 (MQ=255) aataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATcg < 5:64163‑M2/71‑1 (MQ=255) taaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCgg > 8:1859684‑M2/77‑150 (MQ=255) tccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGgatgat > 2:2003945‑M2/72‑150 (MQ=255) caataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAAt > 8:1421848‑M2/70‑151 (MQ=255) ataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTg < 2:1098567‑M2/84‑1 (MQ=255) ataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTg > 2:1971606‑M2/68‑151 (MQ=255) taaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGt > 6:1613471‑M2/67‑151 (MQ=255) taaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGt > 2:368005‑M2/67‑151 (MQ=255) aatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTcc > 7:1492429‑M2/65‑151 (MQ=255) aatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTcc < 6:528674‑M2/87‑1 (MQ=255) atatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCt > 6:188050‑M2/64‑151 (MQ=255) atacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCg > 3:1497630‑M2/62‑151 (MQ=255) atacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaaatcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCg < 3:377005‑M2/90‑1 (MQ=255) acattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaaatcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGt < 5:1642028‑M2/92‑1 (MQ=255) cattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGt > 8:449545‑M2/59‑150 (MQ=255) attgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAg < 7:1603496‑M2/94‑1 (MQ=255) attgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAg < 7:834241‑M2/94‑1 (MQ=255) gtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTg > 6:1398301‑M2/55‑151 (MQ=255) ccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGa > 6:1992802‑M2/53‑150 (MQ=255) ctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCt > 8:62259‑M2/46‑151 (MQ=255) ctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaNGTAGAAAATAACGTCCTGNNNANNNTNNNNANNATANTNNAATTNTNCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAANACGCCt > 7:1653240‑M2/46‑151 (MQ=255) gcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATACCGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGa < 3:1603600‑M2/108‑1 (MQ=255) gcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCt < 5:1157709‑M2/106‑1 (MQ=255) gcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTg < 6:851640‑M2/107‑1 (MQ=255) gcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACCTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCt < 7:391806‑M2/106‑1 (MQ=255) caagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGTTGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGAt > 2:1874504‑M2/43‑151 (MQ=255) caagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGAt > 4:444230‑M2/43‑151 (MQ=255) aagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGAtt > 8:1699832‑M2/42‑151 (MQ=255) agagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGAttt < 4:1867224‑M2/111‑1 (MQ=255) agaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGt > 5:1576160‑M2/39‑151 (MQ=255) gaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTCTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGt > 1:1460649‑M2/38‑150 (MQ=255) aattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTAt < 6:227927‑M2/115‑1 (MQ=255) aattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTAt > 5:1055240‑M2/37‑151 (MQ=255) tttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCAt > 6:707686‑M2/31‑148 (MQ=255) tttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAg < 7:1375554‑M2/120‑1 (MQ=255) ttttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTa > 6:610070‑M2/26‑149 (MQ=255) tttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAg < 1:753199‑M2/126‑1 (MQ=255) gcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAAtt > 5:1393990‑M2/21‑150 (MQ=255) cttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACGAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTa > 1:342932‑M2/20‑150 (MQ=255) attcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCa < 7:1024315‑M2/136‑1 (MQ=255) cagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCaaa < 1:1344850‑M2/138‑1 (MQ=255) agcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAAGTCAAAat > 8:1539292‑M2/12‑151 (MQ=255) cgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAatat < 5:654397‑M2/142‑1 (MQ=255) gaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATAtt > 4:978260‑M2/9‑151 (MQ=255) aaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATAttt < 3:450057‑M2/144‑1 (MQ=255) aaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATAttt > 8:395903‑M2/8‑151 (MQ=255) aaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATAATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATAttt < 5:1740643‑M2/144‑1 (MQ=255) caaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCAc < 2:1848098‑M2/148‑1 (MQ=255) aaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACt > 3:261513‑M2/3‑151 (MQ=255) aTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACtt > 4:1348991‑M2/2‑151 (MQ=255) aTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACtt < 4:739753‑M2/150‑1 (MQ=255) tGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCActt > 3:651951/1‑150 (MQ=255) | TAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAAGTAAAGTGGTCAAGCCCCGCGCATAGCGCAAGCTTTGGCAGAAGAAAGGACTAAAGCGCGTTGCGCCAGTGCTGCTCACCTACGAGCAAGATAGTGGATGAGGTACGAAGATGGGTAAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTT > NC_000913/1673529‑1673826 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |