| Read alignment evidence... | |||||||||||
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Only 100 of 470 total aligned reads displayed.
ACACCTTCTTTGACGGTCCGCTTTCAGGTCTGACGCTGGGCACCGGTGGTCGTTATACTGGCTCCAGTTATGGTGATCCGGCTAACTCCTTTAAAGTGGGAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGG > NC_000913/169441‑169740 | acacCTTCTTTGACGGTCCGCTTTCAGGTCTGACGCTGGGCACCGGTGGTCGTTATACTGGCTCCAGTTATGGTGATCCGGCTAACTCCTTTAAAGTGGGAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCg < 3:1713897/150‑1 (MQ=255)acacCTTCTTTGACGGTCCGCTTTCAGGTCTGACGCTGGGCACCGGTGGTCGTTATACTGGCTCCAGTTATGGTGATCCGGCTAACTCCTTTAAAGTGGGAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATATGGCGCGAGTCgg > 3:562845/1‑151 (MQ=255) ccTTCTTTGACGGTCCGCTTTCAGGTCTGACGCTGGGCACCGGTGGTCGTTATACTGGCTCCAGTTATGGTGATCCGGCTAACTCCTTTAAAGTGTGAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCgcatg < 3:288491/151‑5 (MQ=255) ccTTCTTTGACGGTCCGCTTTCAGGTCTGACGCTGGGCACCGGTGGTCGTTATACTGGCTCCAGTTATGGTGATCCGGCTAACTCCTTTAAAGTGGGAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCAt < 3:496603/151‑1 (MQ=255) cttcttTGACGGTCCGCTTTCAGGTCTGACGCTGGGCACCGGTGGTCGTTATACTGGCTCCAGTTATGGTGATCCGGCTAACTCCTTTAAAGTGGGAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCAtg > 7:455848/1‑151 (MQ=255) ttcttTGACGGTCCGCTTTCAGGTCTGACGCTGGGCACCGGTGGTCGTTATACTGGCTCCAGTTATGGTGATCCGGCTAACTCCTTTAAAGTGGGAAGTTATACGGTCGTGGATGGGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGCGTCGGCAtgg > 8:1921129/1‑151 (MQ=255) tttGACGGTCCGCTTTCAGGTCTGACGCTGGGCACCGGTGGTCGTTATACTGGCTCCAGTTATGGTGATCCGGCTAACTCCTTTAAAGTGGGAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTC‑GCAtggctgg > 6:438361/1‑151 (MQ=255) tGACGGTCCGCTTTCAGGTCTGACGCTGGGCACCGGTGGTCGTTATACTGGCTCCAGTTATGGTGATCCGGCTAACTCCTTTAAAGTGGGAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTTGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTC‑GCATggctggct > 8:532498/1‑151 (MQ=255) 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cGCTTTCAGGTCTGACGCTGGGCACCGGTGGTCGTTATACTGGCTCCAGTTATGGTGATCCGGCTAACTCCTTTAAAGTGGGAAGTTATACGGTCGGGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTC‑GCATGGCTGGCTCCAACGTg < 3:1160943/151‑1 (MQ=255) gCTTTCAGGTCTGACGCTGGGCACCGGTGGTCGTTATACTGGCTCCAGTTATGGTGATCCGGCTAACTCCTTTAAAGTGGGAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTg > 7:1181927/1‑151 (MQ=255) tttCAGGTCTGACGCTGGGCACCGGTGGTCGTTATACTGGCTCCAGTTATGGTGATCCGGCTAACTCCTTTAAAGTGGGAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTC‑GCATGGCTGGCTCCAACGTGgcg > 1:826911/1‑151 (MQ=255) aGGTCTGACGCTGGACACCGGTGGTCGTTATACTGGCTCCAGTTATGGTGATCCGGCTAACTCCTTTAAAGTGGGAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTC‑GCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGc > 5:1361605/1‑151 (MQ=255) ggTCTGACGCTGGGCACCGGTGGTCGTTATACTGGCTCCAGTTATGGTGATCCGGCTAACTCCTTTAAAGTGGGAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGc < 7:858708/151‑1 (MQ=255) 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gTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTgcaaccgca < 7:1395808/151‑1 (MQ=255) ttAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTgccaccgcac > 8:1110515/1‑150 (MQ=255) aGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTC‑GCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTgcaaccgcaacc < 5:1005117/150‑1 (MQ=255) aGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTC‑GCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCt < 6:1150530/151‑1 (MQ=255) tACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCtt > 2:1412150/1‑151 (MQ=255) aCGTTATGATCTGGCGCGAGTC‑GCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTc < 5:1679116/150‑1 (MQ=255) cGTTATGATCTGGCGCGAGTC‑GCAGGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGGCAGGGCGTTGCAACCGCAACCTTCCg < 6:1416396/151‑1 (MQ=255) gTTATGATCTGGCGCGAGTC‑GCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGt < 5:92664/151‑1 (MQ=255) tATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGtt > 5:584534/1‑151 (MQ=255) tATGATCTGGCGCGAGTC‑GCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGttt > 7:1918075/1‑151 (MQ=255) aTGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGttt > 3:1406098/1‑151 (MQ=255) aTGATCTGGCGCGAGTC‑GCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTc < 7:746678/151‑1 (MQ=255) tGATCTGGCGCGAGTC‑GCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCt > 1:1047075/1‑151 (MQ=255) ggCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAAtt < 4:202077/150‑1 (MQ=255) ggCGCGAGTC‑GCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTa < 7:56122/146‑1 (MQ=255) ggCGCGAGTC‑GCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGGGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGGTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTa < 7:1631786/146‑1 (MQ=255) ggCGCGAGGC‑GCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAAttt < 6:758782/150‑1 (MQ=255) gcgcGAGTC‑GCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTtct < 2:1222782/151‑1 (MQ=255) gcgAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTtctc > 4:1626357/1‑151 (MQ=255) aGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCttt < 2:1767197/151‑1 (MQ=255) aGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCttt < 6:517752/151‑1 (MQ=255) ggCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTggg > 2:1140508/1‑151 (MQ=255) | ACACCTTCTTTGACGGTCCGCTTTCAGGTCTGACGCTGGGCACCGGTGGTCGTTATACTGGCTCCAGTTATGGTGATCCGGCTAACTCCTTTAAAGTGGGAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGG > NC_000913/169441‑169740 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |