| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2067353 | NA (NA) | 214 (0.500) | 49/292 | 19.9 | 42.5% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 3393816 = | 298 (0.680) | coding (2443/3801 nt) | yhdP | DUF3971‑AsmA2 domains protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 236 total aligned reads displayed.
TGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCCATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCctag‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2067204‑2067353‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGCCACTCAATGC > NC_000913/3393816‑3393969 GCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCCATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCT < 5:845487/151‑1 GCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCCATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCC < 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AGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGTGGTTC < 5:758843/151‑1 AGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGTGGTTC > 1:872144/1‑151 cAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGTGGTTCA < 6:1449483/150‑1 AAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGTGGTTCAC > 7:506340/1‑151 AAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGTGGTTCAC > 8:499728/1‑151 CTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGATGATGACTCATGATGAAACCTGTTCTATGGATACAGATTACAAACATGATCTCATATCACGGACTTGTTCGCACCTTCGCTAGTGGTTCACCCGC > 4:72622/1‑150 CTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGTGGTTCACCCGCAGG > 4:1567909/1‑151 CTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGTGGTTCACCCGCA < 1:1023626/149‑1 CTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGTGGTTCACCCGCA < 4:485914/149‑1 CTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGTGGTTCACCCGCA < 7:297923/149‑1 TTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTT > 7:1015466/1‑151 TTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTT > 5:1209856/1‑151 TCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTG > 1:324588/1‑151 CTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGG > 7:584829/1‑151 CTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGG > 6:648026/1‑151 CTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAAC > 8:208678/1‑151 GGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTA < 8:1262026/144‑1 ACTGCTTAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGTGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAG < 8:79933/151‑1 ACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAA < 6:197497/150‑1 ACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAA < 4:1722868/150‑1 CTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTAATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGT > 4:651296/1‑151 GCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGA < 8:1626351/151‑1 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GAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTT > 8:1397858/1‑148 GAAGGTAAGTTGATGACTAATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGA < 2:624285/151‑1 AGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATC < 1:405480/151‑1 GGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTT > 8:1045687/1‑145 TAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCC > 3:1708675/1‑151 AGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCGTATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATAGCCGT > 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4:293206/1‑151 AGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATC < 5:484533/151‑1 GGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGTGGTTCAGCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCGACTTTACCATCCC < 1:1395603/151‑1 GGACTTGTTCGCACCTTCCCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCC < 1:275034/151‑1 GACTTGTTCGCACCTTCCCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCC > 5:94822/1‑150 cCTTGTTCTCACCTTCCCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCAC < 1:1486077/150‑1 ACTTGTTCGCACCTTCCCTAGTGGTTCACCCTCAGGTTTGTCTAACGGTGAAGGTAAGTTACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCTAACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCATTTTACCATCCCAC < 4:1045456/151‑1 ACTTGTTCGCACCTTCCCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCAC < 5:563740/151‑1 ACTTGTTCGCACCTTCCCTAGTGGGTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCAC < 2:1207645/151‑1 TTGTTCGCACCTTCCCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGC > 1:1009240/1‑151 GTTCGCACCTTCCCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTACTCGCATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCC > 7:1145562/1‑150 GTTCGCACCTTCCCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAAAGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCATCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCA < 2:1388533/151‑1 TTCGCACCTTCCCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCA < 4:879662/150‑1 TCGCACCTTCCCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACG > 3:1475072/1‑151 CGCACCTTCCCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACG < 3:262016/150‑1 ACCTTCCCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGC > 3:303483/1‑151 CCCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGCCACT < 4:583878/150‑1 TAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGCCACTCAAT > 2:1320285/1‑151 TAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGCCACTCAAT > 2:236671/1‑151 AGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGCCACTCAATG > 1:232608/1‑151 GTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGCCACTCAATGC > 5:636986/1‑151 GTGGTGCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGCCACTCAATG < 7:385184/150‑1 TGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCCATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCctag‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2067204‑2067353‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGCCACTCAATGC > NC_000913/3393816‑3393969 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |