| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,674,765 | 0 | G | . | 31.7% | 631.0 / 310.3 | 244 | coding (853/1035 nt) | tqsA | pheromone AI‑2 transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (90/76); new base . (38/39); total (128/116) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.93e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.01e-01 | |||||||||||
Only 100 of 250 total aligned reads displayed.
TACATCCCGAATATTGGTTCAGTCCTCGCGGCAATCCCCCCTATCGCTCAGGTACTGGTGTTTAATGGCTTCTACGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTGACAATTATTGTCAAAATTGCGCTTGAACAAACAGCGGGAGGTCAAAGCATC > NC_000913/1674615‑1674914 | tACATCCCGAATATTGGTTCAGTCCTCGCGGCAATCCCCCCTATCGCTCAGGTACTGGTGTTTAATGGCTTCTACGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATgg > 8:1472805/1‑151 (MQ=255) cATCCCGAATATTGGTTCAGTCCTCGCGGCAATCCCCCCTATCGCTCAGGTACTGGTGTTTAATGGCTTCTACGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATgggg > 4:563475/1‑151 (MQ=255) cATCCCGAATATTGGTTCAGTCCTCGCGGCAATCCCCCCTATCGCTCAGGTACTGGTGTTTAATGGCTTCTACGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATgggg > 5:1649117/1‑151 (MQ=255) aTCCCGAATATTGGTTCAGTCCTCGCGGCAATCCCCCCTATCGCTCAGGTACTGGTGTTTAATGGCTTCTACGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGc > 7:148261/1‑151 (MQ=255) tCCCGAATATTGGTTCAGTCCTCGCGGCAATCCCCCCTATCGCTCAGGTACTGGTGTTTAATGGCTTCTACGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGCCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCg > 8:194545/1‑151 (MQ=255) ccGAATATTGGTTCAGTCCTCGCGGCAATCCCCCCTATCGCTCAGGTACTGGTGTTTAATGGCTTCTACGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTg < 4:329550/151‑1 (MQ=255) ccGAATATTGGTTCAGTCCTCGCGGCAATCCCCCCTATCGCTCAGGTACTGGTGTTTAATGGCTTCTACGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTg > 2:538411/1‑151 (MQ=255) aaTATTGGTTCAGTCCTCGCGGCAATCCCCCCTATCGCTCAGCTACTGGTGTTTAATGGCTTCTACGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATGTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGctttcc > 5:403686/1‑145 (MQ=255) atatTGGTTCAGTCCTCGCGGCAATCCCCCCTATCGCTCAGGTACTGGTGTTTAATGGCTTCTACGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCt > 2:1087197/1‑151 (MQ=255) atTGGTTCAGTCCTCGCGGCAATCCCCCCTATCGCTCAGGTACTGGTGTTTAATGGCTTCTACGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTgg < 2:1019008/151‑1 (MQ=255) ttGGTTCAGTCCTCGCGGCAATCCCCCCTATCGCTCAGGTACTGGTGTTTAATGGCTTCTACGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGctttccacatt > 8:1486601/1‑141 (MQ=255) ttGGTTCAGTCCTCGCGGCAATCCCCCCTATCGCTCAGGTACTGGTGTTTAATGGCTTCTACGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTggg > 4:882559/1‑151 (MQ=255) tGGTTCAGTCCTCGCGGCAATCCCCCCTATCGCTCAGGTACTGGTGTTTAATGGCTTCTACGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTggcg > 3:510159/1‑149 (MQ=255) ggTTCAGTCCTCGCGGCAATCCCCCCTATCGCTCAGGTACTGGTGTTTAATGGCTTCTACGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTgggg < 4:762203/150‑1 (MQ=255) gTCCTCGCGGCAATCCCCCCTATCGCTCAGGTACTGGTGTTTAATGGCTTCTACGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCca < 2:282252/151‑1 (MQ=255) cTCGCGGCAATCCCCCCTATCGCTCAGGTACTGGTGTTTAATGGCTTCTACGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACAt > 3:1203405/1‑151 (MQ=255) gcgcgGCAATCCCCGCTATCGCTCAGGTACTGGTGTTTAATGGCTTCTACGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGTATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTTGGCTGGGGCTTTCCACAtt < 2:318455/150‑1 (MQ=255) cgcgGCAATCCCCCCTATCGCTCAGGTACTGGTGTTTAATGGCTTCTACGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACAt < 2:1358980/149‑1 (MQ=255) cgcgGCAATCCCCCCTATCGCTCAGGTACTGGTGTTTAATGGCTTCTACGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATtg < 5:1592889/151‑1 (MQ=255) gcgTCAATCCCGCCTATCGGTCAGGTACTGGTGTTTAATGGCTTCTACGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATtg < 1:600964/150‑1 (MQ=255) gcgGCAATCCCCCCTATCGCTCAGGTACTGGTGTTTAATGGCTTCTACGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATtgg < 7:81394/151‑1 (MQ=255) ggCAATCCCCCCTCTCGCTCAGGTACTGGTGTTTAATGGCTTCTAGGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATtggtg < 1:194424/151‑1 (MQ=255) ggCAATCCCCCCTATCGCTGAGGTACTGGTGTTTAATGGCTTCTACGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATtggtg < 8:1140878/151‑1 (MQ=255) cAATCCCCCCTATCGCTCAGGTACTGGTGTTTAATGGCTTCTACGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATTggtggt > 7:1175623/1‑151 (MQ=255) cccTATCGCTCAGGTACTGGTGTTTAATGGCTTCTACGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTg > 3:1497362/1‑151 (MQ=255) aTCGCTCAGGTACTGGTGTTTAATGGCTTCTACGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGt < 6:1516316/151‑1 (MQ=255) aTCGCTCAGGTACTGGTGTTTAATGGCTTCTACGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGt < 6:368181/151‑1 (MQ=255) tCAGGTACTGGTGTTTAATGGCTTCTACGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGAtt > 4:966488/1‑151 (MQ=255) cAGGTACTGGTGTTTAATGGCTTCTACGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATgg < 2:623247/150‑1 (MQ=255) cAGGTACTGGTGTTTAATGGCTTCTACGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGgt > 5:1240902/1‑151 (MQ=255) cAGGTACTGGTGTTTAATGGCTTCTACGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGgt < 1:1469896/151‑1 (MQ=255) cAGGTACTGGTGTTTAATGGCTTCTACGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGgt > 3:731806/1‑151 (MQ=255) tACTGGTGTTTAATGGCTTCTACGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGgttgtt > 4:1628001/1‑151 (MQ=255) tACTGGTGTTTAATGGCTTCTACGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGgttgtt > 7:1305815/1‑151 (MQ=255) aCTGGTGTTTAATGGCTTCTACGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGGTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTgg < 8:609877/151‑1 (MQ=255) aCTGGTGTTTAATGGCTTCTACGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTgg < 5:496039/151‑1 (MQ=255) tGGTGTTTAATGGCTTCTACGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAgg > 5:27541/1‑151 (MQ=255) ggTGTTTAATGGCTTCTACGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATGAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTgggg > 3:972254/1‑150 (MQ=255) gtTTAATGGCTTCTACGAAGGGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGGCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATg < 5:771307/150‑1 (MQ=255) tttAATGGCTTCTACGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATGTTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGgt > 4:110533/1‑151 (MQ=255) aaTGGCTTCTACGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTgg < 7:234911/151‑1 (MQ=255) aaTGGCTTCTACGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTgg < 7:226956/151‑1 (MQ=255) aTGGCTTCTACGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGgttgtt < 2:392012/151‑1 (MQ=255) tGGCTTCTACGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGt > 5:1047301/1‑151 (MQ=255) gCTTCTACGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTAt < 6:1646143/151‑1 (MQ=255) gCTTCTACGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTAt > 5:1309854/1‑151 (MQ=255) gCTTCTACGAAGCGTTGCTGGTGCGGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAgg < 8:729658/151‑1 (MQ=255) aCGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTAtgct < 6:1021976/148‑1 (MQ=255) aCGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATgctgct > 2:1648258/1‑151 (MQ=255) aaGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTggg > 2:1562245/1‑151 (MQ=255) aaGCCTTGCTGGTGCTGCCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTCGGCAGCGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTAGTTAGGACCGGTggg > 1:411425/1‑151 (MQ=255) gCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCg < 6:1238939/151‑1 (MQ=255) cGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGt < 5:1471677/151‑1 (MQ=255) gTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTAtg > 7:642651/1‑151 (MQ=255) ttGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGTGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGc > 3:1016137/1‑151 (MQ=255) ctggtgctggCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGA‑TTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGtt > 1:1092539/1‑151 (MQ=255) ggtgctggCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGt < 6:1705281/149‑1 (MQ=255) ggtgctggCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGGCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTg < 6:1554021/151‑1 (MQ=255) ggtgctggCGCGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTg < 6:655554/151‑1 (MQ=255) gtgctggCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCAGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCttt < 2:1166892/151‑1 (MQ=255) gctggCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTcc > 7:1210927/1‑151 (MQ=255) ggCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTg < 6:251364/151‑1 (MQ=255) ggCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGGCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTGACaa < 7:509209/149‑1 (MQ=255) gggATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTGACAattatt > 3:1601970/1‑151 (MQ=255) ggATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGt > 2:854395/1‑151 (MQ=255) tatCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTg > 8:1108431/1‑150 (MQ=255) tatCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTGACAATTATTGTc > 7:715940/1‑150 (MQ=255) gctgATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTGACaa < 6:1293780/149‑1 (MQ=255) gctgATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTGACAatt > 1:746353/1‑151 (MQ=255) gctgATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTGACAATTATTGTCaaa < 2:1317167/148‑1 (MQ=255) ctgATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTGACAatt > 7:482176/1‑150 (MQ=255) gATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTGACAattat < 4:301206/150‑1 (MQ=255) gATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTGACAATTATTGTCAAAATTgcg > 3:793123/1‑151 (MQ=255) gATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTGACAATTATTGTCAAAATTgcg > 8:608610/1‑151 (MQ=255) aTTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTGACAATTATTGTCAAAATTgcgc > 5:715677/1‑151 (MQ=255) tAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTGACAATTATTGTCAAAATTGCGCtt > 3:862924/1‑151 (MQ=255) tAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTGACAATTATTGTCAAAATTGCGCt < 5:898599/150‑1 (MQ=255) aaTCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTGACAATTATTGTc < 7:97488/150‑1 (MQ=255) tCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGATGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTGACAATTATTGTCaa > 6:1391251/1‑150 (MQ=255) tGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTGACAATTATTGTCAAAAt > 1:1125681/1‑151 (MQ=255) ggTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTGACAATTATTGTCaaa < 1:1680954/148‑1 (MQ=255) gTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTGACAATTATTGTCAAAATTg < 7:1700232/151‑1 (MQ=255) gTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTGACAATTATTGTCAAAATTg < 5:1439532/151‑1 (MQ=255) cGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTGCCAATTATTGTCAAAATTGCGCtg > 3:1713673/1‑150 (MQ=255) ggCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTGACAATTATTGTCAAAATTGCGCTTg < 8:834081/151‑1 (MQ=255) aaTATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTGACAATTATTGTCAAAATTGCGCTTGaac > 2:1062981/1‑151 (MQ=255) atatTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTCTTAGGACCGCTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTGACAATTATTGTCAAAATTGCGCTTGaaa > 6:114386/1‑149 (MQ=255) atTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTGACAATTATTGTCAAAATTGCGCTTGaacaa > 1:686342/1‑150 (MQ=255) tCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTGACAATTATTGTCAAAATTGCGCTTGaacaaac > 1:848110/1‑150 (MQ=255) tCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTGACAATTATTGTCAAAATTGCGCTTGaacaaac < 2:435894/150‑1 (MQ=255) ggAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTGACAATTATTGTCAAAATTGCGCTTGaacaaaca < 1:1218744/148‑1 (MQ=255) ggAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTGACAATTATTGTCAAAATTGCGCTTGAACAAACAGCg > 7:1666587/1‑151 (MQ=255) aGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTGACAATTATTGTCAAAATTGCGCTTGAACAAACAGCggg < 4:148021/151‑1 (MQ=255) ccGCGTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTGACAATTATTGTCAAAATTGCGCTTGAACAAACAGCggg > 8:237354/1‑149 (MQ=255) cgcgTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTGACAATTATTGTCAAAATTGCGCTTGAACAAACAGCGGGAgg > 5:587360/1‑151 (MQ=255) cgTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATTGTTGTTAGGACCGTTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTGACAATTATTGTCAAAATTGCGCTTGAACAAACAGCGGGAGGTc > 3:1128023/1‑151 (MQ=255) cgTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTGACAATTATTGTCAAAATTGCGCTTGAACAAACAGCGGGAGGTc > 1:376484/1‑151 (MQ=255) tATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTGACAATTATTGTCGAAATTGCGCTTGAACAAACAGCGGGAGGTCa > 3:620720/1‑150 (MQ=255) cATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTGACAATTATTGTCAAAATTGCGCTTGAACAAACAGCGGGAGGTCAAAGc > 6:845543/1‑151 (MQ=255) ggggCGTGGTCTGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTGACAATTATTGTCAAAATTGCGCTTGAACAAACAGCGGGAGGTCAAAGCATc < 4:500775/151‑1 (MQ=255) | TACATCCCGAATATTGGTTCAGTCCTCGCGGCAATCCCCCCTATCGCTCAGGTACTGGTGTTTAATGGCTTCTACGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTGACAATTATTGTCAAAATTGCGCTTGAACAAACAGCGGGAGGTCAAAGCATC > NC_000913/1674615‑1674914 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |