| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 781369 = | 273 (0.600) | 115 (0.260) +G |
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| ? | NC_000913 | = 2521128 | 117 (0.260) | intergenic (+2/‑45) | valX/valY | tRNA‑Val/tRNA‑Val | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
TCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CC‑C‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/781513‑781369‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAATTTCTTGCTACACGGCGGAGACTACATAAAGTAGTTGGTGGGTGATGAC < NC_000913/2521128‑2520993 ||| cgcgagcttcCGGGCGGTTGCTAACGCAAGTTTACCCTTCACGTTATCTACGCGTAACCACGTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CC‑C‑G‑AGTG < 3:187936/140‑1 cCGCCGTCCGGCCCGTTGCTCACGCAAGGTTACCCTCCACGTTCTCTACCTTTTTTCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CC‑C‑G‑AGTGGTG < 5:863667/150‑1 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gCGGGCCGTTGCTAACGAAAGTTTAGCCTGCACGTTCTCTACGCCGAACCACCTTAAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CC‑C‑G‑AGTGGTGGGTGATG < 1:656407/150‑1 GCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CC‑C‑G‑AAAGGTTGGTGAAGAC > 4:971361/1‑149 GCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CC‑C‑C‑AGGGGGGGtttcagcccg > 5:564121/1‑141 CCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CC‑C‑C‑ACTGGTTGGTGATGACAGG > 4:1327711/1‑151 CGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CC‑C‑C‑TGGGGGGGGTGCTGgaggg > 1:1430732/1‑145 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CTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CC‑C‑G‑AGTGGTGGGTGATGAAGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTCTAATTGAGG > 3:159607/1‑151 TACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CC‑C‑G‑AGAGGTGGTTGAAGAAGTGATATATCCTCCGACCCAATCTTTGTAATTGAGGT > 4:898238/1‑151 actctTAACCATCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CC‑C‑G‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTG < 7:394422/146‑1 ccattaacgatgTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CC‑C‑G‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTG < 7:1217670/138‑1 GTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CC‑C‑G‑AGAGGTGGGTGATGAAGGGATCTAAac > 4:547960/1‑118 TAAGCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CC‑C‑G‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCT < 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ACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CC‑C‑GAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCCCTaagggagtagtcgc > 6:1092945/1‑137 CCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CC‑C‑GAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAATTTCTaaat > 2:1394554/1‑147 CGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CC‑C‑G‑AGGGGTGGGTGATGACGG > 2:1055321/1‑68 GACCAATTGATTAAAATTCAACTTCTTAACAAAATGATCTAACGAGCC‑T‑A‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAATTTCTTGCTACACG < 4:1007291/151‑1 GACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CC‑C‑GAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAATTTCTTGCTACACc > 7:1481627/1‑150 aaCAATTGATTATAATTCAACTTTTATCCCAAATTATCTAACGAGCG‑T‑A‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAATTTCTTGCTACACGG < 6:1620064/149‑1 CCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CC‑C‑GAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAATTTCagcgtacaaccc > 1:1375607/1‑139 CCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CC‑C‑GAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAAATTCataataaaccac > 7:136210/1‑139 CAATTGATTAAACGTCAACTGCTCTACCAAATGAGCTATCGA‑CC‑CTA‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAATTTCTTGCTACACGGCG < 8:136510/151‑1 atgtcTAAAAGTCACCTTCTTAACCCACTGATCGAAGGAGAC‑C‑A‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAATTTCTTGCTACACGGCGGAG < 8:1633584/146‑1 ttATTAAAATTCAACTGCTCAACCCACATATCTAACGA‑CA‑C‑GAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAATTTCTTGCTACACGGCGGAG < 8:1620142/148‑1 AAAAGTCAACTGCTATACCTACTGATCTCACGA‑CC‑CTA‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAATTTCTTGCTACACGGCGGAGACTACA < 7:974913/151‑1 AAATTCAAATGATCAACAAAATTAGCTAACGA‑CCGT‑A‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAATTTCTTGCTACACGGCGGAGACTACAT < 8:594317/151‑1 AGTCAACTGGTCTACCCACTGATCTAACGA‑CC‑C‑GAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAATTTCTTGCTACACGGCGGAGACTACATAA < 8:1484033/151‑1 attgTCTACCAACTGAGCTATCGA‑CA‑C‑GAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAATTTCTTGCTACACGGCGGAGACTACATAAAGTAGT < 1:6564/147‑1 CTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CC‑C‑GAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAATTTCTTGCTACAC > 4:415302/1‑129 CTACCAACTGAGCTAACGA‑CC‑C‑G‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCCAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCT > 8:1637962/1‑88 acacACTTAGCTCTCGA‑CC‑C‑AAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAATTTCTTGCTACACGGCGGAGACTACATAAAGTAGTTGGTGGG < 8:581757/147‑1 attatcgcACGA‑CC‑C‑TAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAATTTCTTGCTACACGGCGGAGACTACATAAAGTAGTTGGTGGGTGATG < 4:1162593/143‑1 tatcttACGT‑CC‑C‑G‑TGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGG < 7:110734/56‑1 gagcgcacgccCC‑C‑A‑AGTGGTGGGTGATGACTTGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGTTTCTCTCCCAGCTGATCTAATCACCCACTTCTCAATTTCTTGCTACACGGCGTAGACTACATAAAGTAGTTGGTGGGTGATGAC < 3:972739/140‑1 GAGCTAACGA‑CC‑C‑G‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGG > 8:111001/1‑62 AACGA‑CC‑C‑G‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCC > 8:1302315/1‑45 AACGA‑CC‑C‑G‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCC < 7:1299932/45‑1 C‑C‑G‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACC > 1:1422703/1‑37 ||| TCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CC‑C‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/781513‑781369‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAATTTCTTGCTACACGGCGGAGACTACATAAAGTAGTTGGTGGGTGATGAC < NC_000913/2521128‑2520993 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |