New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 696863 = | 128 (0.280) | 68 (0.160) +GAAGAAACAATC |
37/276 | 20.9 | 20.9% | intergenic (‑33/+2) | glnW/glnU | tRNA‑Gln/tRNA‑Gln |
? | NC_000913 | = 697134 | 433 (0.960) | intergenic (‑1/+379) | metT/asnB | tRNA‑Met/asparagine synthetase B | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
Only 100 of 145 total aligned reads displayed.
CCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTGCGGCGCCAGAACCT > NC_000913/696722‑697012 | ccAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTggg < 3:506836/151‑1 (MQ=255) cAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGACTGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCCCTTGGCGATACCCCAAGACCCGGGCGCTGACCCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTgggg > 5:394309/1‑151 (MQ=25) gAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCt < 2:1070697/151‑1 (MQ=255) aCGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCTGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGAt < 5:1230207/150‑1 (MQ=255) gctccccgagcgTTTATACGGTGGCTGGGGTACCAGGATTCGAACGCCGGAAGGCCGGTAGCATAAACCGGTGCCTTACCGCGTGGCGATCCCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCGTTCTCTAATAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCg < 8:18764/140‑1 (MQ=255) gATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAgg > 1:885602/1‑151 (MQ=255) gtcttgaataaattGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTGGGAATGCCGGTATCATAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTAc < 1:712306/121‑1 (MQ=17) gtctggaataccaTGGCTGGTGTACGTTGATTCGAACCACGGAATGCCGGAATCAGAAACCGGTGCCTTTCGGATTGGGGTTCGCGCAATAACGGGTCTGTGAAGCGCGTTCTGGAATAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAggg < 5:70165/139‑1 (MQ=255) aTTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATACCCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAAGCAggg > 1:1745856/1‑151 (MQ=255) ttgaataaattGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGc > 4:1642721/11‑123 (MQ=11) ttgaataaattGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCACAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATCCCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGc < 3:1645068/113‑1 (MQ=11) aataaattGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGc < 8:818637/113‑1 (MQ=18) aataaattGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAAAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAAGAACCGGGAGTTGAACAGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGCCGTAcgt > 6:1062171/8‑128 (MQ=11) tccgaggCTGGCGTACGAGGATGCGAACCACGGAATGCCTGTATCATAATCCGGTGCCTTAACGCTTGCCGATAGCGCAATAACCGCGCGGTGAACCGCTTACTCGAATAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGcc < 3:779420/143‑1 (MQ=25) attGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCATAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGAt < 6:888214/110‑1 (MQ=14) attGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTCCTCGAAGAAGAt > 5:889898/3‑112 (MQ=11) tGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCATAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGc < 6:922484/113‑1 (MQ=17) tGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGc > 5:924207/1‑113 (MQ=14) tGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGCCGGTGAACCGCGTAGTCGAAGACGATGGCGGCGGTACCTGGATGCGAACCCGGGCATGCCggatta > 5:1081591/1‑146 (MQ=18) ggggTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCTGGCGGTGAACCTCTTACTCGAAGAAGATg > 4:1293360/1‑106 (MQ=14) gcgctaccgagcttCGAACCACGGACGGCCGGCATCACAACCCGCTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAATAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCaaaa < 1:389834/137‑1 (MQ=25) ccTGTATTCTAACGAGGGAATGCCGGGATCAATAACCCGTCCCTTACAGCGTGCCGTTCCCGCACTAACCGCGCGCCGAAGCGCTTATTCGAATAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGc < 1:1453297/151‑1 (MQ=16) gaggATTCGAACCTCGGAATGCCGGTATCAAAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGaa < 3:917968/118‑1 (MQ=255) cTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGAGCCTTACCGCTTGCCGCTACCCCAAAAACCGCCCCGTTAACCGCGTACTCTAACAAGATCGCGGCGGTACCAGCCTTCGAAACACGGAATCCCGGGAACAACAACCCGtcgc > 5:748580/1‑148 (MQ=9) aTTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAGGCGAGCGGTGAAGCGGTTAGTCGAAGCAGATGGCTGGGGTACCTGGATGCGCAGCAGGGACTGGCGGTTTCAAAACCCGGTGcgtga > 8:336948/1‑146 (MQ=18) aTTCGAAACAGGGAATGCCGGTATCAAAAACAGGTGCCTTACCGCTTCGCGATACCACAATAAACGGGCGCTGAACCGATTAATCTAAGAATATGGCACGGTTAACTGCAATCCAACGCGCGAATGCCGCTATCAAAAACAGCTTCCttcc > 8:537815/1‑149 (MQ=12) ccACGGAATGCCGGTATCATAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAggg < 1:1686633/115‑1 (MQ=255) gggAATGCCGGTATCAAAACCCGGTGGCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGTGCGGGGAACCGCTTACTCGAATAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGa < 5:394579/151‑1 (MQ=255) ggAATGCCGGTATCAAAAACCGGCGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGAt < 5:704391/151‑1 (MQ=255) aTGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAGGCGGGCGGTGACGCGGTTAGTCGAAGAAGATGGCTGGGTTACCTCGCTTCGCTCCAGGGGATGCCGGGATCAAAAGCCGGTGCCTTACAGATTGGCCATccc > 1:396923/1‑151 (MQ=21) tGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTCGGGTACCTCGATTCGAACCAGGGAATCCAGGTATCAAAAACCGCTGCATTACCTCTAGCCGATAccc > 2:289660/1‑151 (MQ=37) cGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATACCCGGGCGGTGACCCGCTTACTCGAAGAAGCTGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTAGGCGATACCCCAt > 3:1204756/1‑151 (MQ=255) aTCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAAGAGGCGGGCGGTGAACCGCGTAGTCTGAGAAGATCGCTGGGGTACCTCGATGCGCTGCAGGGCATGCCGCGTTCAAAACCCGGTGCCTTACCGCTTGCCCCTACCCCATcac > 1:30279/1‑148 (MQ=19) aTCAAAAACCGGCTCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGCTGAACCGCGTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCg < 7:207058/150‑1 (MQ=255) cAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCTAAGAAGATGGCTCGGTTACCTGGATACGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAACCCGGTGCCTTACAGCTTGGCGCTACCCCaacagaac > 5:529724/1‑144 (MQ=25) agaatccGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTg < 2:1005186/69‑1 (MQ=255) 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ccGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTCGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGCTACCCCAAACGTACAACGCt > 2:1758764/1‑151 (MQ=255) accgcgCCTTACAGATTGCTGTTACCGCAATAACCGCGCTCTGTACCGAGTAGTCGTAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCt < 3:1442851/146‑1 (MQ=17) tGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCGCATCCGTACAACGCTTTCt > 5:1122665/1‑151 (MQ=255) ccTTACCGCTTGGCGATACCCCAATACCCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCGGGGGTACCTGGATTCGCAGCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTGGGCGATACCCCATCCGTACAACGCttggtgg > 7:756211/1‑146 (MQ=25) aCCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGGGTTCTGGTGa > 6:1587292/1‑150 (MQ=255) ccGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAAt > 8:851607/1‑151 (MQ=255) ccGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATAAAAAAGCGGTGCCTTACCGGTTGGCGATACCCCATACGTACAACGCTTTCTGGTGAAt > 1:1200717/1‑151 (MQ=255) cGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATg > 7:73836/1‑151 (MQ=255) cTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGt > 7:36169/1‑151 (MQ=255) cTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGt > 3:350621/1‑151 (MQ=255) ttGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTg > 6:549543/1‑151 (MQ=255) gtgccgagatctaaaTAACCGAGCTGAGTACCGCTTACGCGATGTAGATCTGTGTGTTTCCTGCATTCGTACCAGGTAATGCCGTTATCATAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTg < 5:1787136/138‑1 (MQ=16) tGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGc > 1:1330169/1‑151 (MQ=255) ggCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCg > 2:1190346/1‑151 (MQ=255) cGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCggg > 5:770113/1‑151 (MQ=255) 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cgacgaTGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTGCGGCGCCAGa < 1:313508/146‑1 (MQ=255) agaagaTGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCCCACCTTGCGGCGCCAGa > 2:645903/1‑150 (MQ=255) agaagaTGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTGCGGCGCCAGa > 1:954662/1‑150 (MQ=255) agaagaTGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTGCGGCGCCAGa > 6:124232/1‑150 (MQ=255) gacgaTGGCTGGGCTACCTGGAATCGAACCAGGGAATGCCGGGATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTGCGGCGCCAGAAc < 8:221532/148‑1 (MQ=255) 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CCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTGCGGCGCCAGAACCT > NC_000913/696722‑697012 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |