Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 935,551 | 0 | A | C | 25.9% | 392.8 / 54.3 | 288 | P776P (CCA→CCC) | ftsK | DNA translocase at septal ring sorting daughter chromsomes |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (101/99); new base C (70/0); total (187/101) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.96e-17 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 299 total aligned reads displayed.
CCACACGAACCGTTGTTTACGCCAATTGTTGAACCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATGCG > NC_000913/935402‑935700 | cacaCGAACCGTTGTTTACGCCAATTGTTGAACCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCcaca < 1:46280/151‑1 (MQ=255) cacGAACCGTTGTTTACGCCAATTGTTGAACCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCCCCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCACCAGCAACAACAGCCCGTTGCGCCGAAACCCCaa > 1:608834/1‑150 (MQ=21) cacGAACCGTTGTTTACGCCAATTGTTGAACCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGAGCCTCATCCCCaa > 2:1599165/1‑150 (MQ=255) 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ccGTTGTTTACTCCAATTGTTGAACCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCATCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATcagc < 2:712740/151‑1 (MQ=255) ttgttTACGCCAATTGTTGAACCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCACAACAACCAGTTCCGCCCCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTCCGCCGCAACCACAAAATCagcagc > 6:1396578/1‑151 (MQ=21) tgttTACGCCAATTGTTGAACCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCATTATCAGCAGCCGCAACAGCCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCCGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCATCGCCACTCTCAGCAGcc > 3:1012535/1‑151 (MQ=21) tgttTACGCCAATTGTTGAACCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCACCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCTCACCCACAGTATCACCAGcc > 3:1228620/1‑151 (MQ=255) ttACGCCAATTGTTGAACCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACACCCAGTTCCGCCGCACCCGCAGTATCACCAGCCACAACAGCACGTTCAGCCTAAACCCCACTAACagcagcagc > 6:782140/1‑150 (MQ=18) cGCCAATTGTTGAACCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTGCGCCGCAACCGCAGTATCCGCAGCGACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCCCACAATCAGCAGCAGcaac > 2:353693/1‑150 (MQ=21) gctaTTGTTGAACCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACGGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCTGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGcaaca < 7:368876/146‑1 (MQ=255) ccAATTGTTGAACCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCTCAGCCACAATAACCGCAGCAGCaacaac > 7:1486426/1‑151 (MQ=255) ccAATTGTTGAACCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGGATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCATCCCCACAATCAGCAGCAGCaacaac > 1:194380/1‑151 (MQ=21) aaTTGTTGAACCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCg > 8:527919/1‑151 (MQ=255) 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cagccgcagTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCCCAACAGCCAGTTg > 2:577076/1‑151 (MQ=255) cgcagcagTATCATCAGGCAGACCATCCGTATGCGCGGCAGGCACAAGATCAGCAGCCGCACCAACCGGTTGCTCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTgc < 1:1099323/147‑1 (MQ=17) gccgcagTATCAGCAGCCACAACAGCCTCTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCTCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTgcg < 6:1294798/151‑1 (MQ=255) gccgcagTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCGCAATATCACCAGCATCAACCACAGGTTCCGCCAAAGCACCACTCTCCGCAGCAGCATCAACCGGATCCGCCGCAGCAGGAGGATCAGCAGCAGCAACCGccgcatacc > 7:774199/1‑144 (MQ=255) gccgcagTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACACCCACAATATCACCAGCCTCAACAACCGGTTAAGCCACATGAACAATAACCTCAGCGCCAAAAACCGTATACGCCGCAGCCGCATCATCATAAGCACCAACAGCCacatcac > 4:673324/1‑145 (MQ=12) gcagTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAGTATCAGCAGCCGCAACACCCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCACCAACCGGGGGCGCCGCTGCAGCAGGATCATCAGCCCCAACAGCCACTGGCGcc > 1:1039881/1‑150 (MQ=25) cagcagCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCTCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGc > 5:463740/1‑151 (MQ=255) cacaACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATAc > 5:981774/1‑151 (MQ=255) acaacaGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCCCAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATccc > 8:430798/1‑151 (MQ=255) acaacaGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGAGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCAGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCCCAGGATAcc > 5:1545354/1‑151 (MQ=255) caacaGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCCGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGCTcccc > 4:541446/1‑151 (MQ=255) actcatctgcatGCGTCGCAGGAACATTTTCAGCAGCAGCATCAACTGCTTGCTCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATAccc < 2:184472/140‑1 (MQ=18) aacaGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCt > 3:73455/1‑151 (MQ=255) caGCCGGTTGCGCGGCAGCCACATTATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCTCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGc < 3:330009/151‑1 (MQ=255) ccGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTc > 3:1616629/1‑151 (MQ=255) agccgagtgatcaacaTTAACAGCAGCCGCAACAACCGGATGCTCCTCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATcc < 8:879711/138‑1 (MQ=18) tGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCCGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACAGCAGGATACCCTGCGTCATCCg > 1:728111/1‑151 (MQ=255) ccgcAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGt > 4:832970/1‑151 (MQ=255) gCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATg > 8:1708970/1‑151 (MQ=255) caacaTTATCATCAGCCTCAACAACCGCTTGCTACTCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCTCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATGc < 5:1425138/149‑1 (MQ=21) cacaATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATgac > 7:1189271/1‑149 (MQ=255) aacaTTATCAGCAGACCCAACATCCTGTTTCTCCTGATCATCAATATCAGCAGCCGCAACAACCTGTTGCTCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATGCg < 7:1442193/150‑1 (MQ=21) | CCACACGAACCGTTGTTTACGCCAATTGTTGAACCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATGCG > NC_000913/935402‑935700 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |