| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 781369 = | 236 (0.570) | 141 (0.340) +G |
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| ? | NC_000913 | = 2521128 | 100 (0.240) | intergenic (+2/‑45) | valX/valY | tRNA‑Val/tRNA‑Val | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 141 total aligned reads displayed.
GTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑C‑C‑C‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/781514‑781369‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAATTTCTTGCTACACGGCGGAGACTACATAAAGTAGTTGGTGG < NC_000913/2521128‑2521001 || GTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTAGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTAAACTGCTCTACCAAATGAGCTAACGA‑C‑C‑CG‑Aa > 6:562194/1‑148 TCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGTGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑C‑C‑CC‑AGTGG > 5:1638327/1‑151 gCGCCTTTCGGGCGGTTGCTACGGAAAGGTTTTCTTCCCGGTTCTCTTCGCCTAACCACGTTAAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑C‑C‑CG‑AGTGGTG < 2:1445975/150‑1 CCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑C‑C‑CC‑AAAGGTGGGTc > 4:162066/1‑150 CTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑C‑C‑CC‑AGTagctcgga > 5:1532436/1‑142 gCGGGCGGTTGCTAACGAAAGTTTAGCGTTCCCGTTATCTACCTCTAACCACGTTAAAAGTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑C‑C‑CG‑AGTGGTGGGTGATG < 8:1618530/150‑1 cgctcttccgatgtCAACGTTATCCTTCACGTTATCTACAACTTTGGAGGTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑C‑C‑CG‑AGTGGTGGGTGATGAC < 1:1491692/136‑1 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ccgttcttTCCTTCAGGTTCTCTTCTCTTAAGGACGTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑C‑C‑CG‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCC < 1:1541766/142‑1 aaagGTTATCCTTAACGTTATCTTCTATTAATGATCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑C‑C‑CG‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCG < 2:1076129/147‑1 CAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑C‑C‑CG‑ACTGGTTGGTCATGACacaacggaacagctc > 5:1484466/1‑136 GTTATCCTTCACGTCCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑C‑C‑CC‑AGTGGTGGTTGATGCCGTGATCGATCCTCCGGCCC > 5:200430/1‑151 TTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑C‑C‑CC‑AGGGGGGGGTGATGCCGGGATCGAACCGCCGCCCCC > 7:986902/1‑151 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CAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑C‑C‑CG‑AGAGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCTCCGACCCACTCCTTagataggaagag > 1:855147/1‑137 GTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑C‑C‑CG‑AATGGTGGGTGATGCAGTGATCGAAACTCCGACCCACTCATTATAATGGAGGTGaact > 1:519740/1‑147 ttatCACGTTAAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑C‑C‑CG‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCT < 4:158815/146‑1 tattgaagTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCTAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑C‑C‑CG‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCT < 4:1322307/142‑1 ACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑C‑C‑CG‑AGTGGTGGGTGATGCCGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTCTAAGGGAGGTGCTCTCCC > 5:1229790/1‑151 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agcttCGACCAATTTATTAAAAGTCAACTGCTATACCTACTTAGATAACGA‑C‑CGTA‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAATTTCTTGC < 2:1664/146‑1 CTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑C‑C‑CGAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAAATTCTTGCT > 1:1028202/1‑150 TGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑C‑C‑CGAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAAATTCTTCCTAt > 3:649371/1‑150 tctACCAATTTTTTAAAAGTCAAATTCTATAAATAATTATATAACGA‑CAC‑TA‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAATTTCTTGCTA < 4:1179915/146‑1 ccgatcattaatatAAGTCAAATGCTAAACCAACTTATCTAACGA‑C‑A‑CGAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAATTTCTTGCTACACG < 7:1341959/137‑1 ACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑C‑C‑CGAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAAGTTCTTaataaaagc > 8:63884/1‑142 CCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑C‑C‑CGAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAAATTCaaaataaaaca > 2:497853/1‑139 CAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑C‑C‑CGAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAATTTCTTGCTACACGGCG > 3:1435215/1‑151 CAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑C‑C‑CGAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAAGTTCTGGCTAAAAGGCG > 5:737438/1‑151 AAATTCAACTTCTATACCAAAATATCTAACGC‑G‑A‑CGAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAATTTCTTGCTACACGGCGGAGACTACA < 3:90143/150‑1 AGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑C‑C‑CG‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTG > 4:1287634/1‑100 aatttTCTACCAAATGATCTAACGC‑C‑C‑CGAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAATTTCTTGCTACACGGCGGAGACTACATAAAGTAG < 4:948083/146‑1 CTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑C‑C‑CG‑AGTGGTGGGT < 1:856861/38‑1 CTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑C‑C‑CG‑ACTGGTGGGT > 5:854109/1‑38 tatcaACCCACTGAGATCACGC‑C‑C‑CGAAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAATTTCTTGCTACACGGCGGAGACTACATAAAGTAGTT < 3:1429727/145‑1 tCTCTAACAACTGATCTAAGGA‑CAG‑TA‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAATTTCTTGCTACACGGCGGAGACTACATAAAGTAGTT < 6:1616237/149‑1 GCTCTACCAACTTAGCTATCGAGC‑C‑CA‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAATTTCTTGCTACACGGCGGAGACTACATAAAGTAGTT < 2:134889/150‑1 CAACTGAGCTAACGA‑C‑C‑CG‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGGTG > 7:1230216/1‑85 TGAGCTAACGA‑C‑C‑CG‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTG < 8:1460765/69‑1 TGAGCTAACGA‑C‑C‑CG‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTG > 2:1462163/1‑69 TGAGCTAACCA‑C‑C‑CG‑CGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGT < 8:1203878/59‑1 AACGC‑C‑C‑CG‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCC < 5:1271620/39‑1 GA‑C‑C‑CG‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAG > 2:324881/1‑57 GA‑C‑C‑CG‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAG < 8:325474/57‑1 || GTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑C‑C‑C‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/781514‑781369‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCACTTCTCAATTTCTTGCTACACGGCGGAGACTACATAAAGTAGTTGGTGG < NC_000913/2521128‑2521001 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |