| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 781446 | 238 (0.580) | 51 (0.140) | 25/260 | 31.3 | 15.6% | intergenic (+2/‑131) | lysZ/lysQ | tRNA‑Lys/tRNA‑Lys |
| ? | NC_000913 | 2521487 = | 347 (0.970) | intergenic (+159/+106) | lysV/xapR | tRNA‑Lys/transcriptional activator of xapAB | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 156 total aligned reads displayed.
GCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/781278‑781446‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑atcctgcacgacccaccaatGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATCTGCGATTTGCGAAATTGCCTGATGCGCTTCACTTAGCAGACTACTATTTCCGGCAATTCCTGTCTCCTCACCTACTGTGTCAATGCAGCCAACAGCTTAACCATCGCGGGCGTC > NC_000913/2521487‑2521635 gagCGTAGGTTGAGCGAAGCTAGTCATCCTGCAGTACCCAGCAATCTTAATGATTGGGGCGGAGTAAATATCTTTGATGTAACACCCTTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAAT < 6:867944/148‑1 CCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAAgct > 8:785989/1‑148 CCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCGCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCC > 8:1663284/1‑151 GTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCATTCAGGTAAAAACCGAATGGGTAGTTAGCTAAGTTGGAAGAGAAGTTGACTTTGTATAAATTTGTCGAAGGGTCGATTCGTG > 6:1294662/1‑151 TAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGAGGTTGATTCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGC > 2:1340021/1‑151 TAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGC > 7:791369/1‑151 GGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCAC < 6:663102/151‑1 aggctcttccgctctTCCTGCAGGACCGACCAATCTAACAGATTGGCCCCTTGTAAAAATATTTCTGTTAATACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACC < 4:1117754/136‑1 GCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATAGGCCAAGAGTAAAAATGTTTCAGTTAACAACCGAATGGGACGTTAGCTGAGTTGGTAGAGCAGTTGAATTTTAATCAATTGGTCGCAGGATCGAATCATGaaagaaac > 4:1484525/1‑142 CGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTTAAAATCTTACAGGTAACAGCCGTATGGGTCCTTAGCTCACTTGGTAGAGCAGGTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGGTCGCCTCCTGCACGCCCCAC > 5:778709/1‑151 CGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCAC < 8:1261490/151‑1 CGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTAGCTCGTTCGAGGACTCCACTACCCAC > 7:637810/1‑151 CGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTCGCCACGACTAAAAATATTTCAGGTAACAACCGTATTGGTAGTTAGATCAGTTGGTAGAGAAGTTGAAATTAAATAAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCAC > 2:1586870/1‑151 GAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTAAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACC > 8:211110/1‑151 AAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATGTTAAAGATTGGACGCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCAGTATGGGTCGTTAGCTAAGTTTGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCATGAACGAACCACC > 6:1480370/1‑150 AAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATAGGCCACGAGTAAAAATATTTCAGTAAACACACGTATGGGTAGTTAGCTCAGTTGATATAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCACGTTCGAATCCTCCACGACCAACC > 2:1197326/1‑150 AGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATATTTCAAGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTAAGTTGGTAGAGCAGATGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGAACCACCA > 6:202080/1‑150 GCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAAGGTTTCAGGTAACAAGCGTATGCGTCGTTAGTTCAGTGGCTAGAGGAGTTGACGTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCCCGACCCACCAAT > 7:422532/1‑151 GAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATGTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTGAGCGCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGT > 7:110550/1‑151 TCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCagcccggtacagctg > 3:1113585/1‑136 ttcaggaagcaaCAATGTTATAGATTGGCCCCTATTTCAAATCTTTCAGTTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTG < 2:149384/114‑1 TGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAAgatcgggggggg > 7:598757/1‑139 GCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGg > 5:1349906/1‑150 ACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAAAAGCGaac > 6:1046342/1‑148 GACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGaact > 4:1008558/1‑146 CCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCG > 8:714130/1‑151 CAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTA > 7:1338483/1‑131 TAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCAC > 6:1647670/1‑118 AAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAAAAGCGGCCTGAATGCGCAGTTTTt > 8:657671/1‑150 AAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGAACTAAAAGAGCTTTTTat > 1:1404488/1‑149 AGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAAAAGCGCACTAAAaccgatgtttatcg > 3:1518868/1‑137 gccgagctCCGCGTAAAAATCTTGCCGCTAACCCCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTA < 5:204835/143‑1 TTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAATGCGCCCTAAAGGAGCTTTTTTGCTAT > 7:490359/1‑150 cccatctacTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATCT < 5:56424/141‑1 GCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAAAAGCGAACTAATAGAGCTATTTTGCTATCacc > 4:1192006/1‑148 CCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATCTGCG < 6:491299/151‑1 CCCGATTAAATATCTTTATGTTTACACCGGTTTGGGTCGTTAGCTGAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCG < 5:1074076/122‑1 CCCGAGTATAAATCTTTCTGTTAAGACGCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATCTGCGA < 4:1526789/151‑1 CCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATC < 1:912069/145‑1 CCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTGTTTTGCTATC > 5:909494/1‑145 CCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCA < 8:935226/105‑1 CCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCA > 2:935311/1‑105 atatTAAAATTATTTCAGTTAAAAACCGTATGGGTCGTTATCTCAGTTTGTAGAGCAGTTTACTTTTTATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAtta < 8:1100842/126‑4 GAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCTACCTAAATGCGCTTGTTTTCTATatcctag > 3:48239/1‑142 AGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAAAAGCGACCTAAAGGCGATTTTTTGGTATCT > 1:56222/1‑143 GTAAAAATCTTTCAGGTAAAACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATCTGCGATact < 4:48384/150‑4 AAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAAAAGCGACCTAAAGGCGAATTTTTGCTATatcctatactaa > 4:641490/1‑138 AAATCTTTCAGGTAACACCGGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATCT < 2:933020/138‑1 AATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCTACCTAAAGGCGCATTTTAGCTATaagctatactcaaac > 1:747042/1‑135 TTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGATATTTTGCTA > 1:1059766/1‑130 TTTCACCTAACACCCGAATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTA < 5:1054229/130‑1 ACCGGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGAATTTTTGCTATCTG > 2:1409715/1‑123 ACCGGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAG < 6:1023115/105‑1 ACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAG > 7:1021534/1‑105 CCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGT < 5:456943/86‑1 GGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAA > 2:702257/1‑81 GGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCAC > 8:119488/1‑66 GTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCC < 6:1557248/67‑1 GTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCC > 7:1555857/1‑67 GTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCC > 7:1563834/1‑67 GTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCAC < 7:221931/62‑1 GTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCC > 1:304464/1‑57 TAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCT < 4:857656/103‑1 GTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAAAAGCTAACTAAAGGAGAAATTTTGCTATCa > 6:1212828/1‑99 GGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCAC > 3:960526/1‑50 GTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGAC < 4:180180/52‑1 AGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCT > 2:359892/1‑43 GCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGAACTAAAGGCGCTTTTTTGCTATatcctat > 4:1543706/1‑89 CAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAAT > 3:1584576/1‑36 CAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAAT < 4:1592404/36‑1 GTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACG < 7:1652272/42‑1 GTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACG > 1:1075246/1‑42 GACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGA < 6:1340800/40‑1 GACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGA > 7:1339146/1‑40 ACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTG < 1:186074/78‑1 TTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACC > 6:1375879/1‑38 TAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCC > 5:1520796/1‑37 ATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATCTGCGATTTGCGAAATTGCCTGATGCGCTTCACTTAGCAGACTACTATTTCCGGCAATTCCTGTCTCCTCACGTACTGTGTCAATGCAGCCAACAGC > 2:997502/1‑151 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ACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATCTGCGATTTGCGAAATTGCCTGATGCGCTTCACTTAGCAGACTACTATTTCCGGCAATTCCTGTCTCCTCACCTACTGTGTCAATGCAGCCAACAGCTTAACCATCG < 6:433896/151‑1 CCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATCTGCGATTTGCGAAATTGCCTGATGCGCTTCACTTAGCAGACTACTATTTCCGGCAATTCCTGTCTCCTCACCTACTGTGTCAATGCAGCCAACAGCTTAACCATCGC < 3:773696/151‑1 CCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATCTGCGATTTGCGAAATTGCCTGATGCGCTTCACTTAGCAGACTACTATTTCCGGCAATTCCTGTCTCCTCACCTACTGTGTCAATGCAGCCAACAGCTTAACCATCGCG > 5:393368/1‑151 CCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATCTGCGATTTGCGAAATTGCCTGATGCGCTTCACTTAGCAGACTACTATTTCCGGCAATTCCTGTCTCCTCACCTACTGTGTCAATGCAGCCAACAGCTTAACCATCGCG < 5:1011051/151‑1 CACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATCTGCGATTTGCGAAATTGCCTGATGCGCTTCACTTAGCAGACTACTATTTCCGGCAATTCCTGTCTCCTCACCTACTGTGTCAATGCAGCCAACAGCTTAACCATCGCGG < 4:71272/151‑1 ACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATCTGCGATTTGCGAAATTGCCTGATGCGCTTCACTTAGCAGACTACTATTTCCGGCAATTCCTGTCTCCTCACCTACTGTGTCAATGCAGCCAACAGCTTAACCATCGCGGG > 2:40085/1‑151 ACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATCTGCGATTTGCGAAATTGCCTGATGCGCTTCACTTAGCAGACTACTATTTCCGGCAATTCCTGTCTCCTCACCTACTGTGTCAATGCAGCCAACAGCTTAACCATCGCGGG < 7:1177956/151‑1 ACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATCTGCGATTTGCGAAATTGCCTGATGCGCTTCACTTAGCAGACTACTATTTCCGGCAATTCCTGTCTCCTCACCTACTGTGTCAATGCAGCCAACAGCTTAACCATCGCGGG > 3:369329/1‑151 CCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATCTGCGATTTGCGAAATTGCCTGATGCGCTTCACTTAGCAGACTACTATTTCCGGCAATTCCTGTCTCCTCACCTACTGTGTCAATGCAGCCAACAGCTTAACCATCGCGGGC < 3:976051/151‑1 ATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATCTGCGATTTGCGAAATTGCCTGATGCGCTTCACTTAGCAGACTACTATTTCCGGCAATTCCTGTCTCCTCCCCTACTGTGTCAATGCAGCCAACAGCTTAACCATCGCGGGCGTC > 5:1384150/1‑151 ATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATCTGCGATTTGCGAAATTGCCTGATGCGCTTCACTTAGCAGACTACTATTTCCGGCAATTCCTGTCTCCTCACCTACTGTGTCAATGCAGCCAACAGCTTAACCATCGCGGGCGTC > 7:447489/1‑151 GCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/781278‑781446‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑atcctgcacgacccaccaatGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATCTGCGATTTGCGAAATTGCCTGATGCGCTTCACTTAGCAGACTACTATTTCCGGCAATTCCTGTCTCCTCACCTACTGTGTCAATGCAGCCAACAGCTTAACCATCGCGGGCGTC > NC_000913/2521487‑2521635 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |