New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 696863 = | 146 (0.350) | 88 (0.230) +GAAGAAACAATC |
40/276 | 25.6 | 26.2% | intergenic (‑33/+2) | glnW/glnU | tRNA‑Gln/tRNA‑Gln |
? | NC_000913 | = 697134 | 393 (0.950) | intergenic (‑1/+379) | metT/asnB | tRNA‑Met/asparagine synthetase B | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
Only 100 of 161 total aligned reads displayed.
GCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTG‑AACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTGCGGCGCCAGAACCTA > NC_000913/696715‑697013 | caGCTACGTAGCCATATTGTGTCTTCGATGGCTGGTTACCCTCTATTCTAACGAGTGACTCCCTGTATCTAAACCCGTTGCCATACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTG‑AACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCt < 3:1533879/150‑1 (MQ=255) gttctttaattcaagggCTGGGGTACGTGGCTTCGACCCAGGGAATGCCGGTATCACAATCCGGGGCCTTACCGCGTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTG‑AACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAgg < 8:1409764/136‑1 (MQ=255) tatttaattaaaTGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGTATCAAAACCCGGGGCCTTACCGCTTGTCGATACCCCAATAACCGGGCGGTG‑AACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAggg < 5:1610246/139‑1 (MQ=25) tttttataaattGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCAGGGATTGCCGGTATCATAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCTGTG‑AACCGCTTACTCGAATAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGa < 8:406847/139‑1 (MQ=21) cttgaataaattGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTG‑AAACGCTTACTCGaagaag > 4:1559710/12‑119 (MQ=11) gtccgaccaTGGCTGGGGTACCCGGATTCGAACCACGGAATGCCGGTATCATCAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGG‑GTTGTAACGGCTTAGTGTAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATg < 8:215307/143‑1 (MQ=18) taaattGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAAACGGGCGGTG‑AACCGCTGACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTAcc > 7:1607617/6‑127 (MQ=14) ggattgtttaacttgATTCGAACTAGGTAATGATGGTATCATTATACGGTTTCTTTCCGCTTGTTGATATCTAAATAACTGTGCTTTG‑AAGCGATTATTTTTAGTAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCaa < 2:1302423/137‑1 (MQ=2) cgctACCAGGATTCGAACCCCGGAATGCCGGAATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTG‑AACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAAcc < 7:356214/148‑1 (MQ=255) acgaggATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCATAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTG‑AACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTc < 7:1355378/115‑1 (MQ=21) acgaggATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCTGGCGGTG‑AACATCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTAGATGGATTCg > 4:598017/5‑120 (MQ=17) acgaggATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCTGGAGGTG‑AACAGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGAACATGGATTc > 6:1356999/5‑119 (MQ=17) aCCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAAAACGGCGGTG‑ACACGGTTAATCTAAGAAGGTCGCTCGTTTACCTGGAATCGAAACAGGCAACGCCGGTAtaatatcccgctt > 5:775388/1‑139 (MQ=9) gaggATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCACAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTG‑AACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTa < 2:1013639/106‑1 (MQ=18) ttCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTG‑AACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACTAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTAcc > 7:928162/1‑151 (MQ=255) ttCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTG‑AACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATAAACAACCGGTGCCTTAcc > 7:631320/1‑151 (MQ=255) gCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTG‑AACCGCGTACTCGAATAAGAt > 5:981825/1‑78 (MQ=18) aaTCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTG‑AACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTa < 5:574868/82‑1 (MQ=255) aTCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTG‑AACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGt > 7:95134/1‑151 (MQ=255) aaaCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAAGACCCGGCCGCTG‑AACCGGTTAGTGTCAGAAGATCGAGGCGTTACCTCGATACGCAACAGGGGAAGGCACGATCATCAACAGGTGCCTGAACTATAGCCGCTACCCCATCAGAACa > 5:80347/1‑149 (MQ=255) atccGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTG‑AACAGCTTACTCGAAGAAGATGGCTggg > 1:1593985/3‑73 (MQ=255) aCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTG‑AACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTCGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACgg > 5:968081/1‑150 (MQ=255) ccGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAGCCGGGCGGTT‑ACGCGGTTAGTCTAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGATCCAGGGGAGGCCGGTATCATATACAGGTGCGTGAAATATGGGCGATACCCCAACCTTACAACGcg > 3:686967/1‑150 (MQ=16) ccGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTG‑ACCCGCGTACTCGAAGAAGATGGCGGGGGTACCTGGATTCGCACCAGGGAATGCCGGTATAAAATCCCGGTGCCTTACCGCTAGGCGATACCCCATCCGTACAACGcg > 3:207805/1‑150 (MQ=38) gCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTG‑AACCGGTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGATCCAGGGAATGCCGGTATCAAAACCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCGTTCTg > 5:1277739/1‑151 (MQ=255) cTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTG‑AACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGATGCAGGGAATGCCGGTATCAAAAGCCGGTGCGTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGt > 2:198047/1‑151 (MQ=255) tACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTG‑AACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTGCTGGTg > 2:1126591/1‑150 (MQ=255) tACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTG‑AACCGCTTACTCGAAGAAGATGGATGGGGTACCTCGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGGTTGGCGAGACCCCATCCGTACAACGGGTTgtggtg > 8:1288667/1‑150 (MQ=25) aCCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTG‑AACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGCTACCCCATCCGTACAACGCTTTCTCGTGa > 5:1134620/1‑150 (MQ=255) cGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTG‑AACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATg > 6:1558115/1‑151 (MQ=255) gCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTG‑AACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATgg > 6:1607477/1‑151 (MQ=255) cgtgccgagcccccAAAAACCGCGCGCCG‑AACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGCGTACCTGGCTTCGATCGAGTGAATTCCTGTATCAACAACCCGTGCGTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGt < 3:1076179/141‑1 (MQ=21) cTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTG‑AACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGt > 8:663182/1‑151 (MQ=255) cTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTG‑AACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGt > 6:370973/1‑151 (MQ=255) ggCGATACCCCAATAACCGGGCGGTG‑AACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCg > 6:292203/1‑151 (MQ=255) ggCGATACCCCAATAACCGGGCGGTG‑AACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCg > 8:1008607/1‑151 (MQ=255) ggCGATACACCAATAACCGGGCGGTG‑AACCGCATAATAGAAGAAGATGGCTGGTGTACCTGGATTCGAAACAGGGAATGCAAGTATCAAACACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCAATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGCTGCg > 6:595740/1‑151 (MQ=25) 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cGATACCCCAATAACCGGGCGGTG‑AACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTATCTGGTGAATGGTGCggg > 6:1424889/1‑151 (MQ=255) aCCCCAATAACCGGGCGGTG‑AACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCCTCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGc > 8:379399/1‑151 (MQ=255) aCCCCAATAACCGGGCGGTG‑AACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGc > 3:273076/1‑151 (MQ=255) aCCCCAATAACCGGGCGGTG‑AACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGc > 8:166230/1‑151 (MQ=255) ccAATAACCGGGCGGTG‑AACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCg > 3:846510/1‑149 (MQ=255) cAATAACCGGGCGGTG‑AACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCg > 2:1121038/1‑148 (MQ=255) aaaTAACCGGGCGGTG‑AACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCgaga < 6:94908/150‑1 (MQ=255) aTAACCGGGCGGTG‑AACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACt > 8:562139/1‑151 (MQ=255) taaactccccgTG‑AAACGCTTACTCGAAGAAGATCGCTGGGGTACAAGCAATCTAACCAGGGAATGCCTGTATCAAAAACAGGTGCCATACCGCTTGCAGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTAATGAATAGTGCCCGCGGCAAGACt > 2:1617465/11‑150 (MQ=255) tAACCGGGCGGTG‑AACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGCTACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGCCtt > 1:717790/1‑151 (MQ=255) tAACCGGGCGGTG‑AACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACtt > 5:1005643/1‑151 (MQ=255) tAACCGGGCGGTG‑AACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACtt > 8:286154/1‑151 (MQ=255) aaCCGGGCGGTG‑AACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTg > 4:1145904/1‑151 (MQ=255) ccGGGCGGTG‑AACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGa > 7:1429830/1‑150 (MQ=255) cGGTG‑AACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGCGACTTGAACTCGc > 1:363750/1‑151 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |