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Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
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(MQ=9) cgaggATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTG‑AACCGCTTACt > 6:1113378/4‑89 (MQ=11) cgaggATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCACAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTG‑AACCGCTTACt < 7:1111750/86‑1 (MQ=14) ccTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTG‑AACCGCTTAGTCGAAGAGGCTGGCTGGGGTACCTGGATTCGAAGCAGGGAATGCCGGTATCAAATCCCGGTGc > 8:1311069/1‑151 (MQ=25) gaggATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCACAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTG‑AACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTa < 2:1013639/106‑1 (MQ=18) ttCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTG‑AACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACTAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTAcc > 7:928162/1‑151 (MQ=255) ttCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTG‑AACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATAAACAACCGGTGCCTTAcc > 7:631320/1‑151 (MQ=255) tCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAAAAGGGCGGTG‑AAACGGTTAATCTAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAAACAGGGAAGGCCGGAATCAAAAGCAGGTgaggtaa > 4:543932/1‑143 (MQ=21) tcggAATGCTGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCTGGCGGTG‑a > 6:743235/3‑65 (MQ=1) ggAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGTTACCCCAATAACCGGGCGGTG‑AACCGCTTACt < 1:1546072/73‑1 (MQ=17) ggAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGGTACCCCAATAACCGGGCGGTG‑AACCGCTTACt > 5:1537930/1‑73 (MQ=17) gAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTG‑AACCGCTGAc > 2:653608/1‑71 (MQ=17) gAATGCCGGAATCACAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATACCCGGGCGGTG‑AACCGCTTAc < 8:653610/71‑1 (MQ=17) aaTGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTG‑AAc < 5:1340241/63‑1 (MQ=255) aTGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTG‑AACCGCTTACTCGAAGAACATCGATGGGGTACCTGGATTCGAAACAGGCAATGCAGGTATAAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGCCGATAcc > 7:775527/1‑151 (MQ=37) gCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTG‑AACCGCGTACTCGAATAAGAt > 5:981825/1‑78 (MQ=18) ccGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGc > 4:1159888/1‑52 (MQ=1) ccGGAATCACAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGc < 3:1155230/52‑1 (MQ=11) ccGGAATCACAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGc < 3:1181838/52‑1 (MQ=11) aTCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTG‑AACCGCTTACTc < 7:972892/63‑1 (MQ=255) aTCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTG‑AAGCGGTTAGTCGAAGAAGATGGCTGGGGGACCTCGAATCGCTGCAGGGGCGGGCGGGATCAAAAGCAGCTTCGTTACCGATAGGCGCTCCCCCATCCg > 1:603329/1‑150 (MQ=16) aTCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTG‑AACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGt > 7:95134/1‑151 (MQ=255) aCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTG‑AACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTCGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACgg > 5:968081/1‑150 (MQ=255) | ACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTG‑AACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGC > NC_000913/696652‑696951 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |