| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1287084 | 123 (0.330) | 77 (0.240) | 37/258 | 21.9 | 31.7% | intergenic (+558/+3) | narI/tpr | nitrate reductase 1, gamma (cytochrome b(NR)) subunit/protamine‑like protein |
| ? | NC_000913 | 1287557 = | 225 (0.700) | noncoding (66/85 nt) | tyrT | tRNA‑Tyr | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
GGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCT‑CATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTT > NC_000913/1286934‑1287234 | ggTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGCCGCTCAAGGCGAACCTTTGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAtt < 1:638194/151‑1 (MQ=255) gTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGATTGACAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAtt > 1:1092583/1‑150 (MQ=255) tCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAttcc > 1:148891/1‑149 (MQ=255) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGGTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAttcgac > 8:89031/1‑147 (MQ=255) gtGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCGGTCGCTCGAGGCGAACCTTTGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCa < 3:473872/150‑1 (MQ=255) tGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGCCGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCa < 6:949885/150‑1 (MQ=255) gCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGATTGAAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTCGTGGGGGAAGGAttccaaaa > 3:917029/1‑144 (MQ=11) gCGGCAACGCTCTCTCGCTGTCGCTCTAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAgcgc < 7:119412/149‑1 (MQ=255) gCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAttcgaaacaacat > 1:1181312/1‑140 (MQ=255) gCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCCAGCCGAACCTCAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAgcgc < 5:944401/149‑1 (MQ=255) cGGCAACGCTCTCTCGCTGCCGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTgc < 5:212782/151‑1 (MQ=255) aaCGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTTATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTAcaaccatctaagacc > 4:1174932/1‑137 (MQ=14) aaCGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGGTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAttcgaaccttcg > 2:1364074/1‑135 (MQ=255) aaCGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTagtaagatctgagagc > 4:538532/1‑136 (MQ=255) gACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGt < 2:1449945/151‑1 (MQ=255) gcGCTCTAGGCGAACCTTCGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTc < 8:309406/150‑1 (MQ=255) gAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCCCAGCCGCGCGCATCCCCCTTccgttccaagc > 6:266430/1‑140 (MQ=14) aCCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCg > 6:1457153/1‑127 (MQ=255) aCCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCg < 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gtcATCCTTCCCCGCATGGTCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGgc < 3:132264/150‑1 (MQ=255) ctcATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCg < 5:965540/132‑1 (MQ=37) ctcATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGAGCTGAGAGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGGGGCGACGCTCTCTCGCGGgc > 5:1435896/1‑151 (MQ=14) cATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGGTTGAGATTTCCGGGTCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTgg < 8:183700/148‑1 (MQ=2) cATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGTCTTTTTAAAGTGATGGTGGTTGGTGAATGATTACTAATCTCTGCTAGATTCTCCCTTCTGCTGTTTGCCTTCGGCAACGCTCTCTCGCTgg < 1:1111492/148‑1 (MQ=14) accgaccccGCATGGGCAGAATATCGGAGTGCGGAGACCGTGGAGAGTTCTTTTTTTTTTGAAAGTGTAGGTGCTCGGGGATCGATTATCGTGAGTTGAGTGCTTCGGGCTTCTGTTCGTTTCTTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCta < 8:210872/146‑2 (MQ=255) ttCCCCGCATGGGCAGAATATTTTATTGCGGATTCGCTTGCCAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAtt < 6:361428/84‑1 (MQ=255) tCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAg < 8:628401/150‑1 (MQ=38) ccccGCCCGCGCAGAATATTTGATTTCTGATTAGGTTGAGTCTACACGGTCTTTTGAAAGTCTTGGTGCCCGGGTAACGATAACTGAGGGGCGTGCGATTTGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTc < 7:1371882/151‑1 (MQ=2) agcggcttGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGATTTCCGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTc < 8:1176323/144‑1 (MQ=255) cccGCTTGGGCAGAATATTTGATTTCGGATTAGGTTCAGAGTTCAGGGAATTTTGAAAGTGATTGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGATGATAGCTTCGACCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCACCGCTCTCTCGCTGGCGCTGGAGGCg > 4:1015770/1‑151 (MQ=11) gCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCATCGCTTCGCGCATCACCCTTCGGGACGTTGCCTGAGGCAACGATCTCTCGCTATCGCTCGAATAGaa > 1:170213/1‑150 (MQ=14) aTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCTCTGCGCGCATCGCCCATCTGGTCGTTGCCTGAGGCAACGATCTCTCGCTTGCGCTCGAATCGAACCt > 3:119494/1‑151 (MQ=14) aTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGTGGCAACGGTCTCTCGCTTGCGCTCGAATCGTACCt > 8:186614/1‑151 (MQ=255) ggcgtgAATAGTTGATTGCTGCCTCGCTTGAGATTTCCGGGCCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCt < 6:1153504/144‑1 (MQ=11) gttctaaTATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGATTTCCGGGTCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTgg < 7:817165/146‑1 (MQ=11) 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gtggtggGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCT‑CATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTgg < 3:1448442/151‑1 (MQ=37) ggggggggggAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACTCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCT‑CATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTgg < 8:815151/146‑1 (MQ=255) ggtggGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCT‑CATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTgggc > 6:328018/1‑150 (MQ=38) ggtggGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCT‑CATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTggg < 5:598417/150‑1 (MQ=38) tggGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCGCGAGTGGCCCCGTGGTCGGAGCTTCT‑CATCCGTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGTTTCGTTGGGa > 5:376604/1‑149 (MQ=14) tggGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTAGTTGCCTGCGGCAACGCTCACTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAATCATAT‑CATCCTTACCCGCAAGGGCAGCATATTTTATTGCGGATTCGTTGGGa > 5:1425387/1‑149 (MQ=11) gggcggAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGGTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGTCGAACCTTCGTCGAAGCTTCT‑CATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAg < 2:467271/147‑1 (MQ=255) gggggAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCT‑CATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTgg < 2:781904/146‑1 (MQ=38) gggggAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCGGCCGCAACCCACTCACGCGGGCGCTCCAGGGGCACCGTGGTCGCAGCATAT‑CATACATGCCCCCAAGGGCAGCATATTTAATTTCGGGTTGGTTGGGAAGt > 1:578542/1‑151 (MQ=9) ggggAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTTGCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGCTTCT‑CAACCTTCCCAGCAAGGAAACAATAATTAAATGGAAATTCGTTAGGAAAtt > 1:1471901/1‑151 (MQ=11) ggggAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGGCGAACCTTCGTCGAAGCTTCT‑CATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGtt < 5:407226/151‑1 (MQ=255) gggAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCAGGCGCTCGAGTGGAACCTTGGTCGAAGCATCT‑GATCCTTACCCGCATGGGCAGAATATTTTATTTGGGATTCCTTGGGTAGtt > 3:1214364/1‑150 (MQ=11) gAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCT‑CATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAg < 8:415739/151‑1 (MQ=255) aaGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCT‑CATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAgg < 5:1216033/151‑1 (MQ=255) aGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGAGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTAT‑CATCCTTACCCGAATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAggg > 4:985635/1‑151 (MQ=255) gATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCT‑CATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGAc < 2:807926/151‑1 (MQ=255) gATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTAT‑AATACTTACCCCCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTAGTTTGGAAGTTAAGGGa > 3:732635/1‑150 (MQ=14) aTTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCT‑CATCCtt < 3:1019885/99‑1 (MQ=32) aTTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCT‑CATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACt > 6:1276132/1‑151 (MQ=255) ttACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGGGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCT‑CATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGTAGTTCAGGGACtt > 5:878064/1‑151 (MQ=255) ttACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCT‑CATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACtt > 2:449286/1‑151 (MQ=255) ttACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCT‑CATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTAGTTGGGAAGTTCAGGGACtt > 7:586104/1‑151 (MQ=255) | GGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCT‑CATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTT > NC_000913/1286934‑1287234 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |