New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 696863 = | 114 (0.310) | 74 (0.220) +GAAGAAACAATC |
35/274 | 24.1 | 24.5% | intergenic (‑33/+2) | glnW/glnU | tRNA‑Gln/tRNA‑Gln |
? | NC_000913 | = 697134 | 381 (1.020) | intergenic (‑1/+379) | metT/asnB | tRNA‑Met/asparagine synthetase B | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
AACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTGCGGCGCCAGAACCT > NC_000913/696720‑697012 | acccAACTGAGCTTGTTATCAAGATTCTTTCTTCGATGGATTGGTTAACTTTATTCTAACCTGTGACTGTCGTCCTCTATCTTCGGTGCTTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTg < 1:1132547/149‑1 (MQ=255) aaCCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCt < 1:771555/150‑1 (MQ=255) aCCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTgg < 2:1261107/151‑1 (MQ=255) aGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTg < 6:455056/151‑1 (MQ=255) aGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTg < 6:126780/151‑1 (MQ=255) tACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATGAGGCCGGCGGTGAAGCGAGTAGGGGGAGGAGGTGGCGGGGGGACCTggc > 4:104742/1‑149 (MQ=17) tACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAAAACTCGCCCGGTGACGCGCGAACTGGAAGCAGATCGCTGGGGTACCtcgct > 4:8752/1‑147 (MQ=17) tACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTCCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATGAAGAGGGCGGTGACCGGGTAAGTCGAAGATGCTCGCTCCGGTAACTGGAt > 1:172993/1‑151 (MQ=17) aCGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATGCTGCGCGCGCTGACGCGCTTAGTCTCAGAAGATGGCTGGTGTACCTCGaac > 2:125487/1‑149 (MQ=17) aCGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCT‑GGGTACCTGGAt < 6:1440526/149‑1 (MQ=255) ccAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAAGAACCCGCCGCTGAACCGCGAACGCTAAGAACCTGGCGCGGGTAccgcgcaaacacac > 5:181389/1‑139 (MQ=17) ttgtttttttATTCTATGTCTGGTGTACGAGTATTCGATCTTCGGAATGCCGGTATCATAATCCGGTGGCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAAcc < 3:979148/143‑1 (MQ=21) gaatGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCTGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAgg < 2:88024/148‑1 (MQ=255) atcgtttattatgtGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGTATCAAAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGGGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAggg < 2:326873/138‑1 (MQ=21) tcttgaattatttGGCTGGGGTACCAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAAAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCGTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAgg < 5:288445/137‑1 (MQ=18) tGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATACCCGGCCGGTGAACGGGTTAGTCGCAGATCATGGCTGGGGTACCTGGATGCGACACAgggtc > 5:65593/1‑149 (MQ=18) cgtgactaccatcgCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGTATCATAATCCGGTGCCTTTCCGCTTGGCGATACCCAAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGaa < 2:942284/138‑1 (MQ=21) cGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAAGAACCGGGCGGTGAAGCGCTTAGTCGGAGCAGATGGCTGGGGTACCTCGATTCGATCCAGGGAAGGCCggg > 2:541819/1‑149 (MQ=21) gATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTAAATCTAAGAAGATCGATCGGGTACCTCGATAACAAACAGGGAAAGcaccaa > 3:1217620/1‑145 (MQ=17) cagcggggACCAGGACGCGAACCACGGAATGCCGGCATCATAATCCGGCCCCCTAACGCTTGCAGATCCCCCAATAACCGGTCTGTGAACCGCTTACTCGACGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCaaa < 5:1259915/147‑1 (MQ=19) tGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATACCCGGGCGGTGACGGGGGTAGTCTCAGCTGCTGGCTGGGGTACCTGGCTGCGCAGCAGGGCAGGCCGGTATCataac > 2:811197/1‑150 (MQ=9) cggcccccctgATTCGAACCACGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGCGCTGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCaaaa < 2:410462/139‑1 (MQ=37) gaggATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAAACTGGAGGTGAAAATCTTACTCGAAGAAGATGGCTGCGGTAGCTGGa > 1:1467606/3‑114 (MQ=11) gaggATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAAACGGGCGGTGAACCGCGGGCTCGAAGAAGATGGCTTGGGTACCTGGATTc > 6:1078347/3‑117 (MQ=17) aTTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTAACTCGAAGAAGATGGCTggg > 1:705710/1‑101 (MQ=18) aTTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCACAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTggg < 5:704734/101‑1 (MQ=18) cGAACCTCGGAATGCCGGAATCATAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTAc < 7:1281516/102‑1 (MQ=21) caggtattgagggTATCAATATACGGTTCCTTTACGCTTGGCGATACCCAAATAACGGGGCTTTGAACCGATTACTCTAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGc < 4:292040/140‑1 (MQ=18) ggAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATACCCGGGCGGTGACCCGCTTACTCTAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGCACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACAGGGGCCTGCCCGCTTGGCGAt > 8:1211317/1‑151 (MQ=37) ccGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGACCCGCGTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGATACAGGGGATGCCGGTATCAAAACCCGGTGCCTGACCGCTTGGCGATAgcccc > 4:102493/1‑150 (MQ=25) ggTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATACACGGGCGCTGACACGGGTACTCGCAGAAGATGGCGGGGGTACCTGGCAGCGATGCCGGCAATGCCGGTATAATCAGCCGGGGCGTTAACTCTAGGCGCTCCCCCAt > 2:141156/1‑150 (MQ=12) tCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATGAGCCCGGCGGTGACCCGCTTAGTCTAAGAAGATCGCTCGGGGACCTGGCTCAGAACCAGGCACTGCCCCGTTCAAAAACCGCGGCCTTCACGGTAGCCGCTACCCCATccct > 4:244913/1‑148 (MQ=12) cAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAGCCGGGCGCTGACGCGGGTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTCGATACGCACCAGGGAATGCCGGGATCAAAACCCGGTGCCTTAAAGCTAGGCGCTCCCCCATACCTAc > 4:819842/1‑151 (MQ=255) aaaaCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATTAAGAGGGCGGTGACGCGCGTAGTGGCAGCACATGGCTCCGGGACCTCGCTGAGCAGCAGGGAAGGCCGGGATAAAAAGCAGGTGCCTTAAAGCTTCGCGATAGCCCAGGCGTACac > 5:65333/1‑150 (MQ=255) atccGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAAGAACCTGGCTGTGAAGCTCGGACTCGAATAAGATGGCTGCGGTAACTGGATTc > 5:296283/3‑85 (MQ=16) aCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAAGAGGAGGCCGCTGACGGGCTAACTCTAAGAAGATGGCTGGGTGACCTGGAAGCGATGCAGGGACGGCCGGGATCAAATAGCGCTGCGTGCCCGCTAGCCGATACCCCAACAGAACAACgg > 3:1021996/1‑150 (MQ=255) ccGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAAAAATACACCGCTGAAACGGTAAGTCTAAGAAGATCGCTGGGGTACCTGGAATAGATCCAGGGAAAACATCTAACATAAGCCGCTGCCATAAAGATTGGCCATACACCATCAGAACAACGCt > 2:1453451/1‑151 (MQ=255) cGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATTACCAGGGCGCTGACGCGGGAAGTCGCAGCAGATCGATGGGGTACCTCGAAGCCAACCAGGCCAGGCCGGGATCATAACCCGCTGCATTTCCGCTTGGCGATCCGCCCTCCGtcacacccgt > 8:683704/1‑142 (MQ=255) ggTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGAtt < 7:1262159/80‑1 (MQ=255) gTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAAAAGGGCGGTGAACCGGTTAATCTCAGAAGATGGCTGGTGTACCTCGATTAGAAACAGGGAATGCCGCAATCAAAAACAGCTGCCTTAACGATAGCCGATACCCCAAAAGAACAACGCttt > 3:427649/1‑150 (MQ=255) tGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATGAAGCGGGCGGTGACCCGCTTACTCGCAGAAGCTGGCTGGGGGACCTGGCTTCGCACCCGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTCCCGCTTGGCGCTCCCCCATCCGTACAACGcgggct > 3:369447/1‑146 (MQ=21) gCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACAGGTGCCTTACCTCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTg > 5:566091/1‑151 (MQ=255) ccTTACCGCTTGGCGATACCCCAATACGCGGGCGGTGACCCGGTTAGTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAAGCAGGGACGGCCGGGATAAAAACCCGGTGCCTGCCAGCTGGGCGCTACCCCATCCGTACATCGCTTGCTgg > 3:572922/1‑151 (MQ=21) cTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACAGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGt > 1:277625/1‑151 (MQ=255) tACCGCTTGGCGATACCCCAAAACGCGGGCGGTGACACGCTTAATCTAAGAAGATCGATGGGGTACCTGGATTCCAAACAGGGAATCCCACAATCAACAACAGCTGCATACCCTCTAGGCGATACCCCATCCGTACAACgaatacaggtc > 1:1460224/1‑140 (MQ=255) ccGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAAt > 4:752848/1‑151 (MQ=255) ccGCGTGCCGATACCACAATAACCGCGCTAGGAACCGCGTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAAt < 2:1043961/151‑1 (MQ=21) 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gATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAACCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCggg > 7:883306/1‑150 (MQ=255) gATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATCCCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCggg > 5:557346/1‑150 (MQ=255) gATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCgggc > 6:734884/1‑150 (MQ=255) gATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCggg > 4:334378/1‑150 (MQ=255) gATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCg < 6:1407507/148‑1 (MQ=255) gATACCCCAATAACCGGGCCGTGAACCTCTTACGCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTCGATTGGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTAACCGCGTCGCGATACACCATCCGTACACCGCCTTCTGGTGAATCGAGCggg > 4:113117/1‑150 (MQ=21) tACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACTACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAgg > 5:19207/1‑151 (MQ=255) aCCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGc > 3:1276641/1‑151 (MQ=255) aCCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACAGCATGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGc > 4:1361672/1‑151 (MQ=255) ccccAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCg > 4:1405185/1‑151 (MQ=255) cccAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCg > 3:611482/1‑150 (MQ=255) ccAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCg > 6:862434/1‑149 (MQ=255) aTAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACt > 4:1066670/1‑151 (MQ=255) tAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACtt > 1:813669/1‑151 (MQ=255) gggCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACt > 3:1219369/1‑151 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |