| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 781446 | 234 (0.630) | 58 (0.180) | 35/258 | 22.7 | 19.2% | intergenic (+2/‑131) | lysZ/lysQ | tRNA‑Lys/tRNA‑Lys |
| ? | NC_000913 | 2521487 = | 285 (0.880) | intergenic (+159/+106) | lysV/xapR | tRNA‑Lys/transcriptional activator of xapAB | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 253 total aligned reads displayed.
CGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGT > NC_000913/781297‑781596 | cgaGTCATCCTGCACGACCCACCAAACATAAAAATAGCCACCTATTAAAAAACATTCAAGTAAAAACAGTATATCTCGTTAGGGCCGTTATAATAAAAAAAAAATTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAGTCGTGCACGACCCGCCGAtt > 7:830626/1‑151 (MQ=255) gTCATCCTGCACGACCCACCAATCTAAAAGATTGGCCAAAAATAAAAATCTATAAGTTAACACCAATATTGGTCGGTAGATAAGATGTTACAGAAGTTGACTTTTAATAAAATAGAAGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTa > 1:913857/1‑150 (MQ=12) cccagCACGACCCACCAATCTTAAAGAATGGCTCTTTTTAAAAATCTTTCTGGTAACACCCTTATGTTTCGTTATCTCAGTTGTTATTGCATTTTAGTTTTTATTAATTTGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAggt < 7:478746/147‑1 (MQ=16) gCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGAAGTAGAATTTTAATAAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTaaaaaaggtg > 3:694846/1‑144 (MQ=21) ccACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGTGTCGTTATCTCAGTTCGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGtt < 1:25151/150‑1 (MQ=255) cGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGCCCCACCAATGTaaaaaagcgccct > 3:382194/1‑141 (MQ=255) cccccccAATCTTATATTTTGGCCCCGAGTACACATCTTTAAGGTACAAGGCGTTTGTGTAGTTAGGTCTTTTGGTCTTCCTCTGTACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTgg < 2:1271872/150‑1 (MQ=12) aCCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTgg > 4:1166414/1‑151 (MQ=255) cccACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAgatcgtaagagg > 2:1253694/1‑139 (MQ=255) caccaATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAgatcgtaacagcttc > 1:787130/1‑137 (MQ=255) accaATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGAATTTTAATCAATTGGTCTCAGGTTCGAATCATGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGTTTACtttt > 8:1283857/1‑145 (MQ=25) caATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTaaaaaa > 7:857505/1‑133 (MQ=255) aaaGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAATAAGGTCACTGGTAGAGATCGttat > 8:146577/1‑148 (MQ=18) aGATTGGGCCCGAGTAAAAATCTTTCATGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAgg < 4:43583/151‑1 (MQ=255) tGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCATGTAACAGCCGTATGGTTCGTTAGCTGAGTTGGTTGAGCAGTTGACTTTTAATCTATTGGGCGCAGGTTGGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATa < 3:1110114/150‑1 (MQ=25) ccGAGGAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTGGTTAGCTCAGTTGGTAGCGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTg < 2:177887/151‑1 (MQ=255) cGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGc < 5:529490/151‑1 (MQ=255) cGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTATAATCAATTGGTCGCAGGTTGGAATCCTGCACGACCACCCAAGTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGATGGATCACGTTgg > 2:682348/1‑150 (MQ=25) gAGTAAAAATCTTTCAGGTAACAGCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCg < 2:1233705/151‑1 (MQ=255) acaaTCTTTCATGTACCAACCTTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGc < 3:1226992/149‑1 (MQ=255) aaaaTCTTTCAGGCACCACCCTGTGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGc < 2:810218/151‑1 (MQ=21) aaaTCTTTCATTTTACAGCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTAGGTAGCGCAGTTGACTTTTATTCTATTGGGCTCAGGTTCTAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCa < 2:493654/151‑1 (MQ=255) aTCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTa > 6:936599/1‑119 (MQ=255) cTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAGGTGCTTACTGCAAGAGAACGTGAAGGATAACCTTGCGTTAGCTACgg > 8:1417957/1‑151 (MQ=21) ttcccgTAACACCAGTTTTTTTCGTTATCGGAGTTGGTAGAGCATTTTACTTTTACTCTATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGACCCACAAATTTAAATGTCGTTACTGTTAGATAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAAc < 7:558199/142‑1 (MQ=16) cAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAATGAGGTGCCTGTAAGAGAGCGTGATGGATCACCTTGCCTGAGCAACGGCACg > 6:1094156/1‑151 (MQ=17) ggTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGa > 2:1383387/1‑150 (MQ=255) gTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCACTTCACTTTTAATCAATTGCTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAg < 7:278884/151‑1 (MQ=255) tAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAgg > 8:912836/1‑151 (MQ=255) aaCACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTaaaaaag > 3:844933/1‑94 (MQ=255) aaCACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTaaaaaag < 8:841283/98‑5 (MQ=255) acacCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGc < 8:118975/151‑1 (MQ=255) ccaccactcgggTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTCCTAAATGGAAGAGAACCTGAAGGAAAAAGTTTCCTAAGCaaa > 8:1344637/10‑137 (MQ=11) acCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTGTTAATCAATTGGGCGCAGGTTCGAAGCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCga < 5:1438064/151‑1 (MQ=255) ccctcgggTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTg < 2:1165145/119‑1 (MQ=255) gTATGGGGCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAACCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGCGGTTACTGGTAGAGACCGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACg < 5:379563/151‑1 (MQ=255) ttggggTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGAc < 3:654336/146‑1 (MQ=255) ggggTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAgg < 1:130102/139‑1 (MQ=255) gggTCGTTAGCGCAGTTGTTAGAGCAGTTTACTTTTATTCACTTGGTCGCTGCTTCGATTCCTGCAGGACCCACCTATTTAAAGGTGGTTACTGTTAGAGATCGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAg < 3:1052036/150‑1 (MQ=18) ggTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTa > 2:1137485/1‑90 (MQ=255) tCGTTAGCTCAGTTGGTAGCGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCCCAGGGTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGTTGGTTACTGGTAGACAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCg < 5:53454/150‑1 (MQ=255) gcGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGa < 8:104937/150‑1 (MQ=255) aGCTCAGTTGGTATAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGCTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCa < 7:1257868/150‑1 (MQ=255) aGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCa > 5:1209087/1‑119 (MQ=255) gCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATc < 8:418709/151‑1 (MQ=255) ggctgTTCGTAGCTCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATcc < 2:703047/147‑1 (MQ=255) gcAGTGGGAAGAGCCGTTCACTTTAAATCAATGGGGCCCCGGTGCCAACCCTCCACGACCCACAAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATACCGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCt < 2:1306629/150‑1 (MQ=18) aGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTa < 5:1292724/111‑1 (MQ=255) ttGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGAt > 5:960088/1‑97 (MQ=255) ggtagatcttccgatttttAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAATGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACg < 7:1114112/135‑1 (MQ=18) gTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAATATGGTTACTGCTAGAGCTAGTGAAGGATAACCTTGCGTTAGCAACGCCCCGAAGGGCGAGAGGATCTAGACTCAACCGGcaccac > 8:524035/1‑151 (MQ=18) tAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAgg < 7:772686/120‑1 (MQ=255) cgagttttttaCTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGAcc < 4:882905/140‑1 (MQ=255) taatttcacgtttAATCAATTTGTCTCAGTTTAGAATCCTGCATGACCCACCAATTTAATCTTGGGTTCTGTTATTTAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACccac < 3:599839/140‑1 (MQ=17) gCACTTCACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCTAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAATTTGTTTACTGGTAGAGAACGTTAAGGATAACTTTGCGTTAGAAACGGCCCGAAGTGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACccacc < 4:1067151/151‑1 (MQ=18) cAGTTCACTTTTACTCAATTGCTCGCAGGTTGTAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTATAGAACGTGAAGCATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACccacca < 4:547911/151‑1 (MQ=18) cgTTGCCTTTTCCTCAATTGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCTTTTTATATGTTTTTACTGTTATAGAACGTGAAGTATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAATGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAt < 7:1418121/150‑1 (MQ=17) ttaCTTTTAATCAATTGGTTTCAGTTTCTAATCCTTCACTACCCACAAATTTATATTTTTTTACTGTTTTATAACGTGAATTATAACGTTGCGTTAGCAACTGCCCGAATGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATcc < 4:1423947/148‑1 (MQ=12) tGACTTTTAATCAATTTTTTTTAGTTTTTAATCCTGCACGACCGAGCAATTTAATGGTGGTTACTGGTATAGAACGTGAAGGTTAATGTTGCGTTAGCAACGGCGCGAAGTGCGAGAGGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATcc < 3:226288/150‑1 (MQ=18) tGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAAGTGCTTACTGCTAGAGAACGTGAAGCATAACGTTGAGTTAGCAACGGCCCGAAGGCCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGAcaaacaaacct > 4:1299613/1‑141 (MQ=18) tccTTTTTATTAATTGGGCGCAGGTTGGAATCCTGAACTACGCACCTATTTTAATGTGCTAACTGTTAGTTATCGTGTATGATAACGTTTCGTTAGCAAAGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCt < 3:915576/148‑1 (MQ=12) taattttAATCAATTGGTGGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTTGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCt < 3:1033845/147‑1 (MQ=255) taCTTTTAATAATTTGGTGGAAGTTTCTAATCCTGAACTACCCACCAATTTAAATGTGGTTACTGTTATATATCGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCt < 4:756123/149‑1 (MQ=18) atttttAATCAATTGGTCGCAGGTTCTAATCCTGAACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTATTTAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTg < 4:1349238/148‑1 (MQ=18) aCTTTTTATTTATTGGTGGCTGGTTCGAATGCTGCACTACCCAACATTTTAAAGGTGGTTACTGTTATAGATCGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTg < 3:471754/150‑1 (MQ=18) attttAATAAATTGGTGGCAGGTTGGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTTGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGaa < 1:1133601/150‑1 (MQ=255) ttttAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGAAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGAGTTAGCAACGGCACGAAGGGCGAGCCGAACTAGAGGCCTACTGCACGAcccccccccctcc > 6:734299/1‑142 (MQ=18) tttAATCAATTGGTCGCAGGTTGTAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAATGTTGTTTCTGGTATATAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAAt < 4:411677/150‑1 (MQ=18) ttAATCAATTGTTCGCATTTTTTATTACTTCACGAGCCAACAATTTATATCTTGTTTCTTGTATAGAAGGTTAAGGATAACGTTGCGTTAGCTATGTCGCGATTGGCGAGAGGTACTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATg < 3:294384/150‑1 (MQ=12) ttAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATg < 6:841375/150‑1 (MQ=255) aTCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTATAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTa < 2:220366/151‑1 (MQ=255) ttaTTGGTGGCTTGTTCTAATCTTGCACGACCCACCATTTTAAATGTGGTTACTGGTTTAGATCGTGATGGATATCGTTGGGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTaa < 4:561971/148‑1 (MQ=21) cAATTGGGCGCAGGTCCGCCTCCTCCACGACCCTTCTATTTATATGTGGTTTCTGTTAGAGAACTTGAAGTTTTAATTTTCTTTTTCAACGGCCGGAAGGGTGAGTATAATTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAg < 3:1136937/151‑1 (MQ=255) gggcGCACGCTCGAATCCTTCACCAAGCACCAATTTATATGCTGTTACTGGTTGTGATCCTCTAGGATAACCTTGCGTTAGCAACTGCCCGAAGGGCGAGACGAATTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGgcag < 7:757403/147‑1 (MQ=16) cGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATa < 8:648074/151‑1 (MQ=255) ttttttctattCCTGGACTACCCACATATTTAAACTTTTTTACTGTTTGTTTCCGTTAAGGATAATGTTGCGATATCTACTGCGCGATTTGCGAGAGGTACTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATaa < 3:926420/140‑1 (MQ=255) aGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAATGTGCTTACTGGTAGAGAAGGTGAAGGATAACGTTGCCGTAGCACCGGCCAGAAGGGCGAGCCGAAGTCGAGTCCTCCTGCACGACCACCCATACTCAATGATTAAGGCAGCGTAATc > 5:200033/1‑151 (MQ=21) ggTTCGAGTCCTGAACTACCCACCATTTTAAAGGGCGTTACTGCTATATAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATcc < 5:1032117/151‑1 (MQ=21) ggTTCGAATCCTGCAGGACCCACCATTTTAAATGTGGTTACTGGTATTTAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATcc < 2:368836/151‑1 (MQ=25) gtaaTCCTGCACGACCCAACAATTTTAATGTTGTTACTGCTAGATAACGTGAATTATAACTTTGCGTTAGCAACTGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCa < 1:492236/149‑1 (MQ=25) gAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAATGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCa > 6:1334345/1‑150 (MQ=255) ccTGCACGACCCACCAATTTAAATGTTCAAACTGATATTTAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCGAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAggg < 6:866446/150‑1 (MQ=21) ccTGCACCCCCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGATAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAgggg < 6:1263969/151‑1 (MQ=255) cgccACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGGGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGt < 2:319309/148‑1 (MQ=255) tcactatccaccaATTTAAAGCTTTTTAGTTCTATTTAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCGCGAAGGGCGAGAGGTATTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTc < 1:632372/143‑1 (MQ=21) gCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCg > 1:1207006/1‑151 (MQ=255) gCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCg > 4:340905/1‑151 (MQ=255) cACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGt > 3:1323686/1‑151 (MQ=255) cACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAACCTGAATGATTAAGGCAGCAGAATCACGCAAGGGGTCGt > 2:908527/1‑151 (MQ=255) gACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGCCCCACCATGCTGAATGAGTCCGGCAGCATAATCCCGCAAGGCGTCgct > 5:855109/1‑147 (MQ=25) gACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGCCCCACCATACTGAATGAGGACGGCAGCCTAATACCGCAAGGGGTCGtt > 6:128232/1‑149 (MQ=25) aCCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCTGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAAACATCAAGCCAGCATAATCCCGCAAGGCGTCGGTAGc > 5:628626/1‑151 (MQ=25) aCCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATGCTGAAAGATAAAGGCAGCATAATCACTCAAGGGGTCGTTAGc > 1:436468/1‑151 (MQ=255) ccaccaATTTAAATGTGGTTACTGTTAGTGAACGTGAAGGATAACGTTTCGTTAGCAACTGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTc < 3:890761/151‑1 (MQ=255) caccaATTTAAAGGTTGTTACTGTTAGTGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCa < 2:451434/151‑1 (MQ=255) ccaATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATGCTCAATGAGCACGCCAGCGATATCCCGCAAGCCCTCGTGAGCTCacg > 5:1368899/1‑149 (MQ=18) ccaATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGt > 4:1265836/1‑151 (MQ=255) caATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGtt > 5:1129753/1‑151 (MQ=255) caATTTAAAGGTGGCTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATACTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGtt > 1:39500/1‑151 (MQ=255) aTTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTgg > 5:728499/1‑151 (MQ=255) | CGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGT > NC_000913/781297‑781596 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |