| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 1,674,769 | Δ12 bp | coding (857‑868/1035 nt) | tqsA → | pheromone AI‑2 transporter |
| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | 1674781 = | 20 (0.060) | coding (869/1035 nt) | tqsA | pheromone AI‑2 transporter | |||||
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AGTCCTCGCGGCAATCCCCCCTATCGCTCAGGTACTGGTGTTTAATGGCTTCTACGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTGACAATTATTGTCAAAATTGCGCTTGAACAAACAGCGGGAGGTCAAAGCATCGCCGTTCTGTTAAGCG > NC_000913/1674635‑1674930 | gaatattggttcagtcctcgcggcaatcccccctatcgctcaggtactggtgtttaatggcttctacgaagcgttgctggtgctggcgggatatctgctgattaatctggtcttcggcaatattctggagccgcgtatcatggggcTTTcc > 1:1129405‑M2/147‑151 (MQ=255) tattggttcagtcctcgcggcaatcccccctatcgctcaggtactggtgtttaatggcttctacgaagcgttgctggtgctggcgggatatctgctgattaatctggtcttcggcaatattctggagccgcgtatcatggggcTTTCcac > 6:201074‑M2/144‑150 (MQ=255) tattggttcagtcctcgcggcaatcccccctatcgctcaggtactggtgtttaatggcttctacgaagcgttgctggtgctggcgggatatctgctgattaatctggtcttcggcaatattctggagccgcgtatcatggggcTTTCcac > 3:739091‑M2/144‑150 (MQ=255) ttggttcagtcctcgcggcaatcccccctatcgctcaggtactggtgtttaatggcttctacgaagcgttgctggtgctggcgggatatctgctgattaatctggtcttcggcaatattctggagccgcgtatcatggggcTTTCCACAtt > 6:884689‑M2/142‑151 (MQ=255) gcagtcctcgcggcaatcccccctatcgctcaggtactggtgtttaatggcttctacgaagcgttgctggtgctggcgggatatctgctgattaatctggtcttcggcaatattctggagccgcgtatcatggggcTTTCCACATtggtg < 4:195935‑M2/14‑1 (MQ=255) cagtcctcgcggcaatcccccctatcgctcaggtactggtgtttaatggcttctacgaagcgttgctggtgctggcgggatatctgctgattaatctggtcttcggcaatattctggagccgcgtatcatggggcTTTCCACATTggtggt > 7:497344‑M2/136‑151 (MQ=255) agtcctcgcggcaatcccccctatcgctcaggtactggtgtttaatggcttctacgaagcgttgctggtgctggcgggatatctgctgattaatctggtcttcggcaatattctggagccgcgtatcatggggcTTTCCACATtggtggtt > 3:389064‑M2/135‑150 (MQ=255) gtcctcgcggcaatcccccctatcgctcaggtactggtgtttaatggcttctacgaagcgttgctggtgctggcgggatatctgctgattaatctggtcttcggcaatattctggagccgcgtatcatggggcTTTCCACATTGGTGGTAt < 6:1309583‑M2/18‑1 (MQ=255) 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ttaatggcttctacgaagcgttgctggtgctggcgggatatctgctgattaatctggtcttcggcaatattctggagccgcgtatcatggggcTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGt > 8:1342291‑M2/94‑151 (MQ=255) taatggcttctacgaagcgttgctggtgctggcgggatatctgctgattaatctggtcttcggcaatattctggagccgcgtatcatggggcTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTg > 4:921506‑M2/93‑151 (MQ=255) gAAGCGTTGCTGGAGCTGGCCGCATATCTGCTCATTAATCTGGTCTTCGCCAATATTCTCCAGCCGCCTATCA‑‑‑‑‑‑‑TGGGC‑‑‑‑‑CTTTCCACATTGGTGGTAATATTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGCTTGTTAGGACCGGTGAGTATGCTGCttt > 4:295805/1‑151 (MQ=255) atggcttctacgaagcgttgctggtgctggcgggatatctgctgattaatctggtcttcggcaatattctggagccgcgtatcatggggcTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTggg > 4:1274978‑M2/91‑151 (MQ=255) atggcttctacgaagcgttgctggtgctggcgggatatctgctgattaatctggtcttcggcaatattctggagccgcgtatcatggggcTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTggg < 5:190059‑M2/61‑1 (MQ=255) 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attctggagccgccgatcctggggcTTGCCACATTGGTGGTATTTTTGGCGGTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTGACAATTATTGTCAAAATTGCGCTTGAACAAACAGCGGGAGGt < 7:11471‑M2/125‑1 (MQ=255) ggagccgcgtatcatggggcTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCCTTGACAATTATTTTAAAAATTTCGCTTGAACAAACAGCGGGAGGTCAAAGc > 2:601433‑M2/21‑151 (MQ=255) gagccgcgtatcatggggcTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTGACAATTATTGTCAAAATTGCGCTTGAACAAACAGCGGGAGGTCAAAGCa < 2:361522‑M2/132‑1 (MQ=255) agccgcgtatcatggggcTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTGACAATTATTGTCAAAATTGCGCTTGAACAAACAGCGGGAGGTCAAAGCAt < 2:771579‑M2/133‑1 (MQ=255) gccgcgtatcatggggcTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTGACAATTATTGTCAAAATTGCGCTTGaacaa < 5:129414‑M2/113‑1 (MQ=255) gtatcatggggcTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTGACAATTATTGTCAAAATTGCGCTTGAACAAACAGCGGGAGGTCAAAGCATCGCCGt > 4:1363437‑M2/13‑151 (MQ=255) atcatggggcTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTGACAATTATTGTCAAAATTGCGCTTGAACAAACAGCGGGAGGTCAAAGCATCGCCGTTc > 3:1005015‑M2/11‑151 (MQ=255) atcatggggcTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTGACAATTATTGTCAAAATTGCGCTTGAACAAACAGCGGGAGGTCAAAGCATCGCCGTTc > 5:649320‑M2/11‑151 (MQ=255) atcatggggcTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTGACAATTATTGTCAAAATTGCGCTTGAACAAACAGCGGGAGGTCAAAGCATCGCCGTTc < 8:729976‑M2/141‑1 (MQ=255) catggggcTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTGACAATTATTGTCAAAATTGCGCTTGAACAAACAGCGGGAGGTCAAAGCATCGCCGTTCt < 4:1015008‑M2/142‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |