New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 696863 = | 170 (0.360) | 120 (0.270) +GAAGAAACAATC |
49/276 | 27.6 | 29.4% | intergenic (‑33/+2) | glnW/glnU | tRNA‑Gln/tRNA‑Gln |
? | NC_000913 | = 697134 | 457 (0.960) | intergenic (‑1/+379) | metT/asnB | tRNA‑Met/asparagine synthetase B | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
Only 100 of 197 total aligned reads displayed.
GTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAAT‑GCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTGCGGCGCCAGAACCTA > NC_000913/696713‑697013 | gCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGAt < 2:467019/151‑1 (MQ=255) ctAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATg < 6:1867300/149‑1 (MQ=255) aCCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTgg < 5:232755/151‑1 (MQ=255) aCCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTgg < 2:1688877/151‑1 (MQ=255) ccAACTCAGCTACGAAGCAAGATTCTATCTTCGCTGGCAGGCGTAACTGCAATCGAAACAGGCAATGCCTCTATCAAAAACAGGATCATTACCTCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTggg < 2:1446418/151‑1 (MQ=255) aCTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTa < 8:552276/151‑1 (MQ=255) aCTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTa < 3:837711/151‑1 (MQ=255) aGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCt < 4:211197/150‑1 (MQ=255) aGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAAAACGAGGGCGCTGACCCGCTTACGCTCAGAAGCTGGATCGGTGACCTg > 7:1030418/1‑151 (MQ=17) aGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGATGGGTTACGTGGATTCGAACCAGGGAATGCCTGGATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTg < 7:1267396/151‑1 (MQ=255) acttatgcAGATTGGTTCATCGATGGCTGGGGTAACTTTTTTGTATCCAGGTAATTCGGGTATCAAAACCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGAtt < 7:1376527/144‑1 (MQ=25) gtgcgcttccgcgctggctggcGGACCAGGATTCGAACCACGGAATGCCGGTATCATAAACCGGTGCCTTACCTCTTGGCGATACCCAAATAACCGGGCGTTGAACCGCTTACTCTAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAgg < 6:1221908/137‑1 (MQ=255) ccggaataacttGGCTGGTGTCCGAGGATTCGACCCTCGGAATGCCGGTATCATATACCGGTGCCTTACCGCGTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGaa < 1:411869/140‑1 (MQ=255) tcatccaTGGCTTGGTTCACTGTATGCGACCCACGCAATGACGCGATCAACACCCCGGGGCTTACCGCTTGGGGATACCCAAAAAACCGCGCTCCGTACCCAGTAGTCTTAGTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAAT‑Gc < 7:1421791/144‑1 (MQ=2) cagagggCTGCGGTACCGAGATGCGAACCACGCAATGCCGGTATCAAAATCCGGGGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAAT‑GCCgg < 1:70200/145‑1 (MQ=37) ggctagtgtcactctaTTCTACCCAAGTAATGCCGCTATCAACACCCGGGGGCTTAACGATTGCCGATACCCCAATAACCGCGCTCCGAACCGATATCTCTTATAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAAT‑GCCGGTATCa < 4:269376/135‑1 (MQ=12) ccTGTATTCGAACAAGGGAATGCCGGTATCAAAACCCGGTGCCTTACCGCTTGTCGATACCCCAATAACCGCGCGGTGAACCGATTACTCGTAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAAT‑GCCGGTATCAAAAACCGGTGc < 5:612204/151‑1 (MQ=37) gaggATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGAt > 3:512536/3‑98 (MQ=17) cTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAAGCGGGCGGTGACACGATTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGCAT‑GCCGGGATCAAAAACCGGTGcc > 6:607017/1‑151 (MQ=37) ggATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACAGGCCGGTGAACCGCGTACTCGAAGAACATGGCTGGGGTACCTCGAAGCGAACCAGGGAAT‑GCAGGCTTCaaaacgagctgcctt > 7:1676542/1‑140 (MQ=21) gAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATGCGCCGGGCGCTTAAGCGGGAAGTCTAAGCGGGTGGCTGGGGGACCTGGATGCGAACCAGGGGCG‑GCAGCGTTAAAAAGCCGGTGCCTTACAGCt > 4:1413500/1‑151 (MQ=9) cgcAGGGCATGCCGGCATCACAACCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCTCAATAACCGTTCGGTGAACCGCGTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAAGCAGGGAAT‑GCCTGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTg < 2:529803/149‑1 (MQ=25) gCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATCGCTGGGGTACCTCGATTCGAACCAGGGAAT‑GCCGGTATCAAAAACAGCTGCCATACCGCTTGGCGATAcccc > 8:745691/1‑151 (MQ=255) gCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAAGAGGCGCGCGGTGACGGGGGTAAGCGAAGAACATCGCGGGTGTACCTGGATGCCAGACCGGGAAG‑GCCCGGTTCAACAGCGGGTGCGTGCCCGGTGGGCGCTAccgc > 5:1631647/1‑149 (MQ=2) ccGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAAACGATTACTCTAAGAAGATGGATCGGGTACCTCGATTCCATACAGGCAAT‑GCACGCATCAAAAACAGGTGCATAAACGATTGGCGATAcccc > 7:1511990/1‑150 (MQ=21) ccGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGCTGACCCGCTTACTCTAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAAT‑GCCCGGATCAACAACCGGTGCCTTACCGGTTGGCGATAccgc > 7:395629/1‑148 (MQ=25) cGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGCCCCGCGTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGCTTCGAACCAGGGAAT‑GCCGGTATCAAAACCCGGTGCCTTACCGCTGGGCGATACCCCAt > 7:192420/1‑151 (MQ=25) ggaaTCATAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAgg < 4:404749/99‑1 (MQ=255) tATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGATCCAGGGAAT‑GCCGGTATCAAAACCCGGTGCCTTCCCGCTTGGCGATACCCCATCCg > 7:690944/1‑151 (MQ=255) cAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATACCCGGGCGCTGACGCGGTAAGTCGCAGAAGATGGCTGGGGTACCTCGATTCGATCCAGGCAAT‑GCCGGGATAAAAACCCGCTGCCTTCCAGCTTGCCGATACCCCATCCCTAc > 6:1408082/1‑151 (MQ=255) aaaaCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAAACGGGCGCTGAAGCGCTTAAGCGAAGCACATGGCTGGGGTACCTCGCTGAGAAGCAGGGAAT‑GCCTCTTTCAAATACCGGTGCGATCACGCTAGGCGCTACCCCaacactaca > 1:177068/1‑142 (MQ=255) ccccccgcgCCCTACCGCGGGGCGATCCCCCAACAACCGCGCGCGGAACCGATTACTTGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAAT‑GCCGGTATCAAAAACCGGTGCGTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAAc < 1:550705/143‑1 (MQ=18) aaaCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATACCCGGGCGGTGAAGCGAGTAGGCTAAGCAGCTCGCTGGGGTACCTCGATTCGAACCAGGGGAG‑GCCGGGTTCATCACCCGGGGCGTGAACGCTAGGCGCTCCCCCATCCGTACa > 1:1577802/1‑149 (MQ=255) aaaCCGGGTCCTTTACGATTGCCGATACCCCAATAACCGCGCTTTGAACCGATTACTCGACTAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAAT‑GCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAAc < 7:1057837/151‑1 (MQ=18) aCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATTACCCGGGCGGTTAACGGCGTACTCGAAGAATCGGGCGGGTTTACCTCGATTCGCGCCCGGCAAT‑GACTGTATCATAACCAGGTGCGTGACCGCTGGGCTATACCCCCTACGGAGAACgg > 2:375717/1‑150 (MQ=255) ccGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACGAGGGAAT‑GCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATACGTACAACggt > 7:1016132/1‑149 (MQ=255) ccTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGATCCGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAAG‑GCCGGAATCAAAACCCGGTGCCTTACAGCTTGGCGCTCCCCCATCACTACATCGCTTTCTgg > 3:1658941/1‑151 (MQ=25) cattccGATTGTCGTTACCTCAATAACCGTGCGTGGAAGCGCGTACTCGAATTAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAAT‑GCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTgg < 5:1535136/146‑1 (MQ=18) cTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAAT‑GCCGGGATCAAAAACCGGTGCCTTCCCGCTTGGCCATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGt > 6:1772048/1‑151 (MQ=255) ttACCGCTTGGCGATACCCCAATACCCGGGCGCTGTCCCGGGTAGGCGTAGAGGATGGCTGGGGTACCTGGATTAGAACCAGGGTATGGCCGGT‑TCAACAACGGGTGCCTTCCCGTTTGGCTCTACCCCATCCGTACAACGGTTTCTGGTg > 4:1128073/1‑151 (MQ=255) ttACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAAT‑GCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGATTGGCGATACCCCATCCGGACAACGCTGTCTGGTg > 3:1772688/1‑151 (MQ=255) ttACCGCTTGGCGATACCCCAAGAGCCGGGCGGTGAACCGCTTAGTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAAT‑GCCGGTATCAAAAACGGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTg > 3:175196/1‑151 (MQ=255) ttaggagtgccGATACCAAAATAACCGTGCTGCGAAGCGATTACTCGTATAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAAT‑GCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTgg < 5:1544365/138‑1 (MQ=18) tACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAAT‑GCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTg > 6:399065/1‑150 (MQ=255) tACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAAT‑GCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTg > 7:1130731/1‑150 (MQ=255) 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aTACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAAT‑GCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCggg > 6:1364218/1‑149 (MQ=255) tACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAAT‑GCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAgg > 4:1405304/1‑151 (MQ=255) tACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAAT‑GCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAgg > 5:1384397/1‑151 (MQ=255) aCCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAAT‑GCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGc > 8:104244/1‑151 (MQ=255) cccAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAAT‑GCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCg > 6:682151/1‑150 (MQ=255) 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GTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAAT‑GCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTGCGGCGCCAGAACCTA > NC_000913/696713‑697013 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |