| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1287084 | 154 (0.320) | 87 (0.210) | 26/260 | 37.3 | 28.6% | intergenic (+558/+3) | narI/tpr | nitrate reductase 1, gamma (cytochrome b(NR)) subunit/protamine‑like protein |
| ? | NC_000913 | 1287557 = | 302 (0.730) | noncoding (66/85 nt) | tyrT | tRNA‑Tyr | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 165 total aligned reads displayed.
TCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCAT‑GGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACT > NC_000913/1286936‑1287232 | gcGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGTCGCTCGAGCCGAACCTTCGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCCGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTAc < 6:87725/150‑1 (MQ=255) cGTTGCCTGCGGCAACGCGCTCTCGCTGACGCTCTTGTAGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCTGAATATTTGATTGCGGATTCGGTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAATGTGATGGTGGTGGGGGAAGTATTAc < 3:338957/150‑1 (MQ=14) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGGTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAttcgtc > 7:891410/1‑147 (MQ=255) ttGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTc > 2:1099460/1‑150 (MQ=255) gtGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGCCGCTCGAGCCGAACCTTCGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCa < 7:1694559/150‑1 (MQ=255) tGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGCCGCTCTAGCCGAACCTTTGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCa < 2:1559828/150‑1 (MQ=255) ccTGCGGCAAAGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGGGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAttcgtaacct > 4:191907/1‑143 (MQ=11) cTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCAGGGGCAGAATAGTTGATTGGGGAGTCGCGTGAGAGTTCAGGGACTGGTGAGAGGGCTGGTGGTGGGGGAAGGATTACtgcgcgg > 7:1237133/1‑145 (MQ=17) tGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGTCAggtcg > 4:1480078/1‑147 (MQ=255) gCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGGCGAACCTTCGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCt < 4:738944/150‑1 (MQ=255) ggCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTgcg < 7:1566818/151‑1 (MQ=255) ggCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCACGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGATTGAGAGTTAAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGAGGGAAGGATTAcaacgatcta > 2:1809092/1‑140 (MQ=14) gCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTgcgc < 7:321563/151‑1 (MQ=255) cAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCCTccgttctccgtg > 4:1119050/1‑140 (MQ=255) cAACGCTCTCTCGCGGGCGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGGGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTgcgcg < 7:1337539/151‑1 (MQ=255) cGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCtt > 7:741715/1‑151 (MQ=255) tctctcGCTGCCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTgcgcg < 4:449432/145‑1 (MQ=255) gccgagCTGCCGCTCCAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGcc < 7:974697/146‑1 (MQ=11) tcGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACACAGAGCAGCGCAATTCGaccgg > 7:737397/1‑149 (MQ=17) cGCTTACGCTCGAGCCTAACTTTACTCTCAGCTGCTCATCCTTCGCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGATTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTc < 5:623111/151‑1 (MQ=14) gCTGCCGCGCGAGCCGACCCTTACTCTAAGCTTTTTATTTATGCATTCTTGGTCAGAATATTTGTATTCTTATTCGCTTTATATTTCAGTTCCTTTTGCTCTTGAGTTCTGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCg < 8:375685/151‑1 (MQ=2) tctgcGCTCTAGTCGAACCTTTGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCg < 2:747038/146‑1 (MQ=11) gccGCTCCAGCCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCgg < 4:1347585/147‑1 (MQ=255) gcGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑c < 6:1526727/150‑1 (MQ=255) gcGCTCAAGGCTAACCTTCGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑c < 4:1008131/150‑1 (MQ=255) aCGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑c < 8:740248/151‑1 (MQ=255) caagtcGAACCTTCGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGtt < 2:1430036/144‑1 (MQ=255) caaGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGATTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGtt < 7:697152/147‑1 (MQ=255) cGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCCGCTCTGCGCGCTTCCCCCTTCggggagatgc > 7:1005712/1‑144 (MQ=255) ccGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTACGCGCTTAGAGCTTCACCGCACAGGT‑CGTTGctgc > 6:731614/1‑147 (MQ=14) ccGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGATTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTagaaacttcgaag > 2:1695880/1‑112 (MQ=11) cctatctggTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGATTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGTTGCCTGCg < 2:90003/142‑1 (MQ=255) aaCCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGGTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCCGCGCTCCGCGCTTCCCCCGTCGGGT‑CGTTGCCTGGGGc > 4:180821/1‑151 (MQ=14) ccTTTGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCCGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGTTGCCTGCGGCaa < 1:688487/151‑1 (MQ=25) aaGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGATTTCAGGGTCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCtt < 5:1729132/122‑1 (MQ=12) aGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGATTTCAGGGTCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGTTGCCt < 3:1574741/134‑1 (MQ=12) aGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGGTTGAGATTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGTTGCCTGCGGCaa < 7:1297807/141‑1 (MQ=25) tctcATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGACTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCt < 6:1832227/149‑1 (MQ=18) cATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGgc < 1:1101654/149‑1 (MQ=255) cattCCCCGCCGCGGCACAATATTTGATTGCGGAGTCCCTTGAGAGGTCAGGCCCTTTTGACAGTGAGGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTc < 1:352832/148‑1 (MQ=14) ccgcGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGCCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTc < 6:551982/148‑1 (MQ=255) ccccGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGATTTCAGGGTCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTc < 2:1141970/151‑1 (MQ=9) ccccGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGGTTGAGAGTTCCGGGTCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGt < 4:261724/150‑1 (MQ=2) gCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCCGCGCTCCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CCTTGCCTGCGCCAACCCTCTCACGCGTTCGCTCGACTCgca > 7:1206281/1‑148 (MQ=14) 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aaTATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCCGGGCCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGTTGCCTGCGTCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGa < 1:252973/150‑1 (MQ=255) aaTATTTCATTGCGCAATCGCTTGAGAGTTCAGCGACTTTTGAAAGTGACGGTGGTGCGCGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGaa < 8:1342386/151‑1 (MQ=14) gATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTtctc < 6:874707/151‑1 (MQ=255) tCGTTTGAGATTTCCGGGTCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTccc < 2:477163/150‑1 (MQ=9) cggttGAGAGTTCCGGGTCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCg < 4:1370305/148‑1 (MQ=255) cGCTTGAGAGTTCAGGGCCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCCTCGGGT‑CGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTcccc < 6:1123270/150‑1 (MQ=255) gcgtGAGATTTCAGTTACTTTAGACCGTCATGGTCGTGGGCGAATTATTCCTCACCGCTTCGCGCTTAGCAC‑TCGCTTGCGTTGGCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGCCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGc < 8:1235063/148‑1 (MQ=2) ttGAGATTTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCa < 3:1426362/150‑1 (MQ=9) tGAGATTTCAGGGTCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCAt < 8:1433285/150‑1 (MQ=255) tGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGGGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCAt < 6:681267/150‑1 (MQ=255) agacTTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCAT‑ggg < 7:1242042/151‑1 (MQ=9) atttCAGGGTCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGAGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCAT‑GGGc < 5:1200349/148‑1 (MQ=255) agTTCAGGGTCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCAT‑GGGCa < 5:931207/151‑1 (MQ=255) agTTCAGGGCCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGTTGCCTGCGGTAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCAT‑GGGCa < 2:533257/151‑1 (MQ=255) tccgggTCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCAT‑GGGCAGa < 3:274093/147‑1 (MQ=18) cAGGGTCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCAT‑GGGCAGAat < 5:1587596/151‑1 (MQ=37) ggccTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGTTGCCTGCGGCAACGCTCTGTCTCTGTCTCTCGAGTCGAACCTTGTTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCAT‑GGGCAGAATAtt < 5:259053/148‑1 (MQ=11) ggccTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTTTCGCTCGAGTCGAACCTTTGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCAT‑GGGCAGAATAtt < 2:643638/148‑1 (MQ=9) gcTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCAT‑GGGCAGAATATTTa < 5:142642/150‑1 (MQ=25) ccTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCAT‑GGGCAGAat < 7:513781/145‑1 (MQ=25) 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tGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGTTTCCTGGGGCAAAGCTCTCTCGCTGGCGCGCGAATCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCAACCTTCCCCCCATAGTGCCG‑ATATTTAAATGCGGCttt > 8:1590614/1‑150 (MQ=11) tGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCAT‑GGGCAGAATATTTaa < 5:890082/141‑1 (MQ=35) gATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTAAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGTGT‑CGTTTCCTGACGCAAAGCGCTCTCGCGGGCGCAAGAATAGAAACTTGGTAGAAGGATGTAATGCTTGCCCGCAT‑GGGGGGATTATTTTATTTCGGATTCg > 3:888521/1‑151 (MQ=2) tggtggtggGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGCACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCACCGCAT‑GGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGtt > 1:771556/1‑151 (MQ=25) tggtggtggGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGTTGCCTGCGGCAACGCTATCTCGCTGGCGCACGAGGCGAACCATAGTCGAAGCTTATCATACATACCCCCAT‑GGGCAGAATATTTAATTTCGGAttagct > 3:1546372/1‑147 (MQ=11) tggtggtggGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGTAGCGAGCGGCAACGCTCTCTAGCTGGCGCGCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTACCCGCAA‑GGGCAGAATATTTTATTGGGGATTGGtt > 6:407490/1‑151 (MQ=11) gtggtggGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGCCGCTCGAGGCGAACCTTTGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCAT‑GGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGtttg > 4:47955/1‑149 (MQ=12) tggtggGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGGCGAACCTTTGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCAT‑GGGCAGAATATTTTATTGCGGATTCGGTggg > 7:1864266/1‑151 (MQ=255) tggtggGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCGCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATACTTACCCGCAT‑GGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTggg > 3:1202788/1‑151 (MQ=255) gggtggGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCAT‑GGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTggg < 4:362843/150‑1 (MQ=38) ggatctgggAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCAT‑GGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTggg < 4:1332539/145‑1 (MQ=255) ggtggGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCAT‑GGGCAGAata < 2:487623/129‑1 (MQ=34) gtggGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCAT‑GGGCAGAATAttt < 5:1088065/131‑1 (MQ=34) gtggGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCGTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCAT‑GGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGa > 4:477260/1‑150 (MQ=255) tggGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGTTTCCAGCGGCAACCCTATCTAGCTTGCGCTCGACTCCAACCTTTGTAGAACCTTAAAATCAAACCCCGCAA‑GGGCAAAATAATTAATTTCGGAATAGTTGGGaa > 8:515784/1‑150 (MQ=9) gggggAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGTCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCAT‑GGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAg < 5:366273/150‑1 (MQ=255) ggAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCAT‑GGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTc > 5:440607/1‑150 (MQ=255) gAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGCCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCAT‑GGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAg < 3:47744/151‑1 (MQ=255) caGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGTTGCCTGATTAAACGCTCTCTCGCTCGCGCTAGAGACGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCAT‑TGGCATAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAgg < 2:1300672/150‑1 (MQ=14) aaGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGTTGCCAGCGGCAACGCTCTCTAGCTGGCGCTCGAGTCGAACCGTGGTCGAAGCTTATCATACATACCCCCAA‑GGGCAGAATATTTTATTGCGGATTAGGTGGGTAGTTTAgg > 8:1049085/1‑151 (MQ=11) aGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCAT‑GGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAggg < 8:1860770/151‑1 (MQ=255) ggATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCATGGTCGAAGCTTATAATGCTTCCCCGCAT‑GGGGAGAATATTTAATTGGGGGTTGGGTGGGAAGTTGAgggg > 4:1248550/1‑150 (MQ=14) gATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCAT‑GGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTTGGAAGTTGAGGGAc > 5:1610657/1‑151 (MQ=255) aTTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCAT‑GGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGaat < 7:241211/151‑3 (MQ=255) aTTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCAT‑GGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGAcg > 7:1536101/1‑150 (MQ=255) aTTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGTTGCCGGCGGCAACGCTCTCTCGCGGGCGCTCGAGTCGCACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCATCCCCGCAT‑GGGGAGAATATTTAATTTCGGCTTGGGTGGGCAGTTGAGGGGCt > 6:1247889/1‑151 (MQ=14) | TCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGT‑CGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCAT‑GGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACT > NC_000913/1286936‑1287232 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |