| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 1,674,769 | Δ12 bp | coding (857‑868/1035 nt) | tqsA → | pheromone AI‑2 transporter |
| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | 1674781 = | 3 (0.010) | coding (869/1035 nt) | tqsA | pheromone AI‑2 transporter | |||||
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AGTCCTCGCGGCAATCCCCCCTATCGCTCAGGTACTGGTGTTTAATGGCTTCTACGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTGACAATTATTGTCAAAATTGCGCTTGAACAAACAGCGGGAGGTCAAAGCATCGCCGTTCTGTTAAGCG > NC_000913/1674635‑1674930 | gaatattggttcagtcctcgcggcaatcccccctatcgctcaggtactggtgtttaatggcttctacgaagcgttgctggtgctggcgggatatctgctgattaatctggtcttcggcaatattctggagccgcgtatcatggggcTTTcc > 6:1524154‑M2/147‑151 (MQ=255)gaatattggttcagtcctcgcggcaatcccccctatcgctcaggtactggtgtttaatggcttctacgaagcgttgctggtgctggcgggatatctgctgattaatctggtcttcggcaatattctggagccgcgtatcatggggcTTTcc > 6:1773594‑M2/147‑151 (MQ=255) attggttcagtcctcgcggcaatcccccctatcgctcaggtactggtgtttaatggcttctacgaagcgttgctggtgctggcgggatatctgctgattaatctggtcttcggcaatattctggagccgcgtatcatggggcTTTCcaca < 3:1393031‑M2/8‑1 (MQ=255) attggttcagtcctcgcggcaatcccccctatcgctcaggtactggtgtttaatggcttctacgaagcgttgctggtgctggcgggatatctgctgattaatctggtcttcggcaatattctggagccgcgtatcatggggcTTTCCACAt < 6:479613‑M2/9‑1 (MQ=255) ggttcagtcctcgcggcaatcccccctatcgctcaggtactggtgtttaatggcttctacgaagcgttgctggtgctggcgggatatctgctgattaatctggtcttcggcaatattctggagccgcgtatcatggggcTTTCCACATtgg < 1:864305‑M2/12‑1 (MQ=255) gttcaatcctcgcggcaatcccccctatcgctcaggtactggtgtttaatggcttctacgaagcgttgctggtgctggcgggatatctgctgattaatctggtcttcggcaatattctggagccgcgtatcatggggcTTTCCACATtggt < 6:1471763‑M2/13‑1 (MQ=255) tcagtcctcgcggcaatcccccctatcgctcaggtactggtgtataatggcttctacgaagcgttgctggttctgtcgttatatctgctgattaatctggtcttcggcaatattctggagccgcgtatcatgtgtcTTTCCACATtggtg < 2:1280783‑M2/14‑1 (MQ=255) agtcctcgcggcaatcccccctatcgctcaggtactggtgtttaatggcttctacgaagcgttgctggtgctggcgggatatctgctgattaatctggtcttcggcaatattctggagccgcgtatcatggggcTTTCCACATTggtggt > 2:1482588‑M2/135‑150 (MQ=255) 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atcgctcaggtactggtgtttaatggcttctacgaagcgttgctggtgctggcgggatatctgctgattaatctggtcttcggcaatattctggagccgcgtatcatggggcTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTg < 1:349383‑M2/37‑1 (MQ=255) atcgctcaggtactggtgtttaatggcttctacgaagcgttgctggtgctggcgggatatctgctgattaatctggtcttcggcaatattctggagccgcgtatcatggggcTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTg < 4:1590673‑M2/37‑1 (MQ=255) cgctcaggtactggtgtttaatggcttctacgaagcgttgctggtgctggcgggatatctgctgattaatctggtcttcggcaatattctggagccgcgtatcatggggcTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGa < 1:1306120‑M2/41‑1 (MQ=255) cgctcaggtactggtggttaatggcttctacgaagcgttgctggtgctggcgggatatctgctgattaatctggtcttcggcaatattctggagccgcgtatcatggggcTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTgggg < 1:1015862‑M2/40‑1 (MQ=255) gctcaggtactggtgtttaatggcttctacgaagcgttgctggtgctggcgggatatctgctgattaatctggtcttcggcaatattctggagccgcgtatcatggggcTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGAt < 5:190885‑M2/42‑1 (MQ=255) 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aggtactggtgtttaatggcttctacgaagcgttgctggtgctggcgggatatctgctgattaatctggtcttcggcaatattctggagccgcgtatcatggggcTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGgtt < 5:1769674‑M2/46‑1 (MQ=255) ggtactggtgtttaatggcttctacgaagcgttgctggtgctggcgggatatctgctgattaatctggtcttcggcaatattctggagccgcgtatcatggggcTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGgttg < 3:624411‑M2/47‑1 (MQ=255) tactggtgtttaatggcttctacgaagcgttgctggtgctggcgggatatctgctgattaatctggtcttcggcaatattctggagccgcgtatcatggggcTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGTGATGgttgtt > 3:1632010‑M2/103‑151 (MQ=255) tactggtgtttaatggcttctacgaagcgttgctggtgctggcgggatatctgctgattaatctggtcttcggcaatattctggagccgcgtatcatggggcTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGgttgtt > 1:1187821‑M2/103‑151 (MQ=255) tactggtgtttaatggcttctacgaagcgttgctggtgctggcgggatatctgctgattaatctggtcttcggcaatattctggagccgcgtatcatggggcTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGgttgtt > 1:1557645‑M2/103‑151 (MQ=255) 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ggggcTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTGACAATTATTGTCAAAATTGCGCTTGAACAAACAGCGGGAGGTCAAAGCATCGCCGTTCTGTTa < 5:959384‑M2/146‑1 (MQ=255) cTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTGACAATTATTGTCAAAATTGCGCTTGAACAAACAGCGGGAGGTCAAAGCATCGCCGTTCTGTTAAGCg > 5:675149‑M2/2‑151 (MQ=255) | AGTCCTCGCGGCAATCCCCCCTATCGCTCAGGTACTGGTGTTTAATGGCTTCTACGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTGACAATTATTGTCAAAATTGCGCTTGAACAAACAGCGGGAGGTCAAAGCATCGCCGTTCTGTTAAGCG > NC_000913/1674635‑1674930 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |