| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,287,217 | 0 | G | T | 25.6% | 801.9 / 165.0 | 413 | intergenic (‑41/+27) | tpr/tyrV | protamine‑like protein/tRNA‑Tyr |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (167/139); new base T (68/37); total (236/177) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.62e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 420 total aligned reads displayed.
TGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCA‑GGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTG > NC_000913/1287069‑1287367 | tggtggGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGGCGAACCTTTGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTTATTGCGGATTCGGTggg > 7:1864266/1‑151 (MQ=255)tggtggGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCGCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATACTTACCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTggg > 3:1202788/1‑151 (MQ=255) gtggGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGTCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGaa < 2:1380001/151‑1 (MQ=255) ccgcttccgtgcgcgcTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAgg < 3:1810843/139‑1 (MQ=255) aGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAggg < 4:466595/151‑1 (MQ=255) gATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTTGGAAGTTGAGGGAc > 5:1610657/1‑151 (MQ=255) aTTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGAcg > 7:1536101/1‑150 (MQ=255) aCTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACtttt < 4:1546245/151‑1 (MQ=255) aCTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTAGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTACCCGCATGGGCAGAATATTTAATTTCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACtttt > 5:1488793/1‑151 (MQ=255) cggttggagtttCGACCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGt < 7:263906/141‑1 (MQ=255) gcTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGGATGGGCAGCAGAGTTAATTGCGGCTTGGTTGGTAAGTTCAGGGGGTTTTGGAAGTg > 1:29724/1‑151 (MQ=14) gcTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAAAACACACTAGAGTGCGCTAGAATAGAACCATTGTAGAAACATATAATACATACCCCCATGAGCAAAAAAATTAATTTCGGAATAGTTGGGAAATTAAGGGACATTTTAAAGtt > 5:1868302/1‑150 (MQ=9) cTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTAGCTGGAGCTCGAGTCGAACCTTGGTAGAATCTTATAATCCTTACCCCCATTGGCAGAATAATTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACGTTTGAAAGTgg > 8:827229/1‑150 (MQ=17) ccgcgcTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTTTTTATAATTTATCTGGCTTCCTCTCTTCTCTAAACTTTGTCGAAGATTCTTTTCCTTCACGTCTTGGTTAGTATATTTTATTGCGGATTCGTTGGTAATTTCAGGGACTTTTGAAAGTGAtg < 2:429664/150‑1 (MQ=2) ttCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGa > 7:1241827/1‑149 (MQ=255) gggTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGTAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGGGGTGGGGGAAGGAt < 7:592699/151‑1 (MQ=255) ttGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCAACCTTCCCCGCATAGGCAGAAAATTTATATGAAGAGTCGTTTGGAAGTAAAGGGAGTTTTGAAATTTATTGTGGTGGGGGAAGGaatagta > 5:932464/1‑144 (MQ=14) ccctcccgCATCGGTCCCTCGCTGCCGCTCGAGCCGAACCTTCGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTTATTGCGGATTCGGTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCt < 8:735952/144‑1 (MQ=14) cTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATAACATTc > 5:326885/1‑151 (MQ=255) gCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTc < 6:440424/149‑1 (MQ=255) cggatctctctctCGCTGCCGCTCGAGCCGAACCTTTGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGTTAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGaa < 8:679970/143‑1 (MQ=14) cAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACt > 5:179658/1‑106 (MQ=255) actgCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCg < 4:245809/148‑1 (MQ=255) gCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCCACACTGCGAAGTCGATg > 1:135639/1‑151 (MQ=14) tctctcGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCAGCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTTCTGAATCGTTTTGAACATAAGCGACTTTTGAAAGTGAAGGTGGTGGGGGAAGGATTCTATGCATCGAAGTCGATGAc > 3:919024/1‑151 (MQ=17) ctctcGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGa < 4:1373215/149‑1 (MQ=255) ctctcGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCAGGGTCATAATATTTAATTCGGCATTAATTGATAACTTCAGGGACTATTTAAAGTTATCGTGGTTGGGGAATGATTTAAACATAAGAAGTAGATGagg > 5:1147749/1‑149 (MQ=9) cGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCCAACCTTCGAAGACGATGACCGCac > 2:759993/1‑150 (MQ=11) cTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTAGAACATTCTAAGACGATGAccga > 2:1565522/1‑144 (MQ=255) gtgcTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTa < 3:657363/149‑1 (MQ=255) ccgcTCGAGCCGAACCTTTGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGTCAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTa < 5:1175107/150‑1 (MQ=255) gcTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGGTTCTCATCATTCCCCGCATTGGGAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTTTGAAGTTCAGGGAGTTTTTAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACa < 5:407483/151‑1 (MQ=21) gcGAGGCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGt < 6:573255/150‑1 (MQ=255) cGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTc > 7:758765/1‑151 (MQ=255) cGAGTCGAAACTTGGTCGAAGCTTCTCATCATTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGAGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCTAACAATCGAAGTAGATGACGGCAGATTTaaatt > 5:348919/1‑146 (MQ=18) cGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGATGGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACACAGTTCGCAGTGGATGACCGGAGCTGTACAGTc > 1:1446480/1‑151 (MQ=14) tCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGc < 3:1343163/150‑1 (MQ=255) ccGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAg < 1:1698510/123‑1 (MQ=255) gAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTcc < 4:814539/151‑1 (MQ=255) aaCCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCTGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAAACTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTAAAGTCTGCTcgc > 8:841618/1‑149 (MQ=255) aaCCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTTATTGCGGATTCGTTGGCCAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTc < 2:610777/123‑1 (MQ=255) aaCCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGGCCTTCACGGCAGATTTACATTCTGGTccc > 8:454079/1‑151 (MQ=11) aCCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATAACATTCGAAGTCGATGACGGAACATTTACATTCTGCTCCCt > 8:313699/1‑151 (MQ=18) aCCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATAACAATCGAAGTAGATCACGGAACATTTACATTCAGCTCGCt > 2:206363/1‑151 (MQ=17) cTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTAGAACAATCTAAGAACATCACCGCACATTAACATTCAGCTCGCttt > 3:391729/1‑151 (MQ=14) tGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGTCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGTAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCttt < 6:501784/149‑1 (MQ=255) tGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAG‑CGATGACGGCCGATTTACAGTCTGCTCCCGTTggg > 7:1583646/1‑150 (MQ=255) cgTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTgg < 1:770334/149‑1 (MQ=255) agTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGTAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTggggg < 4:1191554/94‑1 (MQ=255) gTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGcc < 6:326151/151‑1 (MQ=255) cGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACATTCGAAGTAGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGc > 3:1754670/1‑151 (MQ=255) ttCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCTAAGGTTCGAAGTGGATGACGGGTGCTTGACAGTCTGGTGCCTTTGTTCGCTCggg > 6:933639/1‑150 (MQ=18) ctcATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAc > 3:1154495/1‑151 (MQ=255) tcATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAcc > 6:744011/1‑151 (MQ=255) aTCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCCTAACTTCGAAGACCATCACCCAAGATTTAGAGTCTGCTCCCATAGGACTCTCGGGaagggg > 2:1693000/1‑147 (MQ=2) tCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACAACCGGCGAAGTCGATCCCGGGAGAGTTACATTCGGGTCGCTTTGGCCGCTCGGGAAcccc > 4:1323957/1‑150 (MQ=11) tCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCTAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGGCGCTCGGGAAccccc > 6:1782722/1‑150 (MQ=255) cgctgtaTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCA‑g < 8:525240/144‑1 (MQ=255) ccccGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCCTACCTTCTCAGTCCATCACCGCTGAGTTACATTCATCACCCATAGCACTCTCGGGAACCCCACAA‑gc > 3:461980/1‑150 (MQ=2) ccGCATGGGCAGAATATTTTATTGCGGATTCGTTTGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCA‑gggg < 5:654270/151‑1 (MQ=255) cGCATGGTCAGAATATTTAATTGCGGATTCGGTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCA‑GGGGt < 3:782286/151‑1 (MQ=255) cGCATGGGCAGAATATTTTATTGCGGATTCGGTGGTTAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCA‑GGGGt < 6:1118517/151‑1 (MQ=255) gCATGGGCAGAATATTTCATTGCGGATTCGGTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCA‑GGGGTa < 1:178684/151‑1 (MQ=255) gtccgcgctaaTATTTTATTGCGGATTCGGTGGCCAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCA‑GGGGTaa < 6:1720087/142‑1 (MQ=18) aTGGGCAGAATATTTTATTGCGGATTCGGTTGCTAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGAtt < 6:1470670/105‑1 (MQ=18) aTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCTAAGGCCATGACCGGACATTTACATTca > 2:1055030/1‑112 (MQ=1) aTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCCACCCTTCTGAGGCCATGCCGGGAGATGTACAGTCAGCGCCCTTTGGGCGCTCGGGAACCCCACCA‑GGGCTAAt > 3:1047616/1‑151 (MQ=14) ggtcttaaTATTTTATTGCGGATTCGGTTGTTAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCA‑GGGGTAAtt < 2:316242/144‑1 (MQ=18) tgcattatatTTATTTGTTGATTTGTTTGTTAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGTGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCA‑GGGGTAATTc < 8:1614511/144‑1 (MQ=17) gCAGAATATTTTATTGCGGATTCGTTTGTTAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCA‑GGGGTAATTCaa < 5:535807/151‑1 (MQ=255) gCAGAATATTTATTTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATAACATTCGAAGACCATGACCGAAGATTAACAGTCTGCTCCCATTGTACTCTCGGGAACCCAACCA‑TGGCTAAttaa > 8:1443999/1‑148 (MQ=18) cAGAATATTTTATTGCGGATTCGTTGGGTAGTTGAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCA‑GGGGTAATTCaaa < 2:795247/151‑1 (MQ=255) cAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCATCGAAGGCGATGACGGAAGATTTACAGTCTGCTCGCTAAGGGCGCTCGGGAACCCCCCCA‑GCGGTACTTCaa > 2:1309095/1‑150 (MQ=17) aGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACACACATCTAAGACGATCACGCAAGATTTACAGTCTGCTCCCAAAGGCCGCTCGGGAACCCCACCA‑GGGGTAATTCAAAt > 8:1386483/1‑151 (MQ=17) gAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAAtgctatt > 2:1487774/1‑145 (MQ=255) aaTATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCCAACCTGCGAAGGCGATCCCCGGTCAGTTCCAGTCAGCGCCCAATGGACGCTCGCGAACCCCACAA‑GGGCTaaagagacga > 5:1719652/1‑142 (MQ=2) atatTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTAGAACGTTCGAAGTGGATGACGGGTGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCCCCA‑GGGGTAATTCAAAtttt > 4:632694/1‑151 (MQ=25) tatTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAGCCGTCGAAGTCGATGCCGGCAGATGTACAGTCTGGTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCGCCA‑GGGGTAATTCAAATTTTg > 4:887540/1‑151 (MQ=25) tatTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCTGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCA‑CGGGTAATTCAATttttc > 7:1675155/1‑150 (MQ=255) atTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGCTTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCA‑GGGGTAATTCAAATTTTg > 1:323739/1‑150 (MQ=255) atTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCA‑GGGGTAATTCAAATTTTg < 8:1533520/150‑1 (MQ=255) atTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCA‑GGGGTAATTCAAATTTTGa < 7:454838/151‑1 (MQ=255) tttAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCA‑GGGGTAATTCAAATTTTg > 4:1747212/1‑149 (MQ=255) gaTTGCGGATTCGCTGGCCAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCA‑GGGGTAATTCAAATTTTGAGGt < 4:1048771/149‑1 (MQ=255) aaTTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAAt > 7:904808/1‑137 (MQ=255) aTTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCA‑GGGGTAATTCAAATTTTGAGGTaa < 7:360856/151‑1 (MQ=255) aTTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGTAACTTCGAAGACGATCCCGGGTGATTTACTGTCTGGTc > 1:1029602/1‑101 (MQ=2) ttGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCTACCAGGCGAAGTAGATGACGGCAGATTGACATTCTGCTCCCTTAGTACTCTCGGGAACCCAACAA‑GGGGAAATTAAAATATTGATGTaa > 2:1781572/1‑150 (MQ=21) gCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCA‑GGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATg < 1:1263838/150‑1 (MQ=255) gCGGATTCGGTGGCAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCA‑GGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATg < 7:1388940/150‑1 (MQ=255) cGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCTAACAGTCGAAGTCCATCACGGCACAGGGACATTCTGCTCCCTATGGGCTCTCGCGAACCCCCCCA‑GCGCTAATTAAAATATTCAGCTAATCCt > 1:466554/1‑151 (MQ=16) cGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCA‑GGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCt < 8:209430/151‑1 (MQ=255) cGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTAGATCGTTCGAAGTCGATGCAGCAAGCGTTACAGTCTGCTCCCTTTGGGCTCTCGGGAACCCCAGCA‑AGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCt > 6:1743335/1‑151 (MQ=25) cGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCA‑GGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCt < 6:1325627/151‑1 (MQ=255) ggATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCTAACAGTCGTAGGGGATGACCGCACCTTTAGATTCTGCTCCCTTTGTGCGCTCGGGAACCCAACCA‑TCGCTAATTAAAATATTGATGTAAAGCtt > 1:894362/1‑151 (MQ=16) gATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATAACAGTCGAAGTCCATCACCCGAGCTTTACATTCTGCTCCCTAAGGACTCTCGGGAACCCAACCA‑TCGGTAATTAAAATTATCAGGGAATCCttc > 6:1185810/1‑150 (MQ=16) ttCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTAGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGACGCTCGGGAACCCCACCA‑GGGGTAATTCAAATTTTGATGTAATGCTTgac > 8:1071415/1‑150 (MQ=255) tcgcttGGG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCA‑GGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTgag < 6:1599263/146‑1 (MQ=255) gTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGGAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAAtgctttt > 3:1533359/1‑125 (MQ=14) gggAAGTTCAGCGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCGCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCA‑GGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGAtggt < 5:135024/150‑1 (MQ=255) | TGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCA‑GGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTG > NC_000913/1287069‑1287367 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |