| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 696863 = | 162 (0.370) | 85 (0.210) +GAAGAAACAATC |
47/276 | 26.0 | 22.1% | intergenic (‑33/+2) | glnW/glnU | tRNA‑Gln/tRNA‑Gln |
| ? | NC_000913 | = 697134 | 490 (1.120) | intergenic (‑1/+379) | metT/asnB | tRNA‑Met/asparagine synthetase B | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 176 total aligned reads displayed.
AACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTGCGGCGCCAGAACCTA > NC_000913/696720‑697013 | ccAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTATTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGTGAATGCCGGTATCAAAAACGGGTGCGTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTggg < 2:973424/151‑1 (MQ=255) aaCTGAGCTACGTAGCCAGATTGGTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAACACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGt < 2:208192/151‑1 (MQ=255) caGCTACGTAGCCATATTTTTTATTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCTAACCAGGGAATGCCGGTATCAAATACCGGTTCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCt < 1:1454249/150‑1 (MQ=25) tAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATGAGGCGGGCGGTTACGCGGTTAATGTAAGGAGATGGCGGGGTTACCTCGAtgagc > 6:572994/1‑147 (MQ=17) ccAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATGACCCGGGCGGTGACACGCGAACGCGAAGCAGCTGGCGGCGGGACCTCGCTTCGCAcc > 3:60339/1‑151 (MQ=17) ttGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAAAACAACGACGCTGAACCGATTAATCTAAGAAGATCGATCGTGTACCTCGATTAGAAACAggc > 7:54314/1‑149 (MQ=14) tcttttataataTGGCTGGGGTACGAGGATTCGCACCATGGAATGCAGGAATCAGAACGCGGTTTCTTACCGCTTTGCTATAACACAATAACCTGGCGGTGATCCGCTTTCTTTTATAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAggg < 2:244942/139‑1 (MQ=255) ggattggttcacTGTATGCGACCCACGCAATGCCTGGATCCTTACCCCGTTCCTTACCGAGTGTGGTTAGCCCAAAAACGGCGCGCCGAACCGAGTTCTCTTATAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCa < 2:1081004/139‑1 (MQ=2) gcgcTGTATTCGCCCCAGGGAAGGCCGGTATCAACACCCGGGGCCTTTCCGCGTGGCGATAGCCCAAGAACCGCGCTGGGAACCGATAACTCTTATAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGt < 3:1513333/148‑1 (MQ=16) ccgcacgcGAACCACGCAATGCCGGTATCATAATCCTGTTTTTTTAATTTTTCCGTTACCCAAATAACTGTTCTGTTAAGCGATTACTCTTAGAATATTGCTGGGTTATCTGTTTTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGcc < 1:361197/144‑1 (MQ=2) ggATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAAACGAGCGCTGACACGATAACTCTAAGAAGATGGATGGTGTACCTCGATACGAAACAGGCAATGCCGCGATCaaaagcagcttcgt > 6:1159927/1‑140 (MQ=12) cGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGAGGTGAACCGCTTACTCGAATAAGATGGCTGGGGTa > 5:1029400/1‑101 (MQ=18) cAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATCACCGGGCGGTGAAAGGCTTACTCGAAGCCGATGGATGGGGTACCTGGATTCGCACCAGGGCCTGCCGGGTTCATAAACCGGTGCCTTACCGCTGGGc > 4:29415/1‑151 (MQ=25) gAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAAAACCCCGGCGGTTACAGGCTTAATCGAAGAGGATGGCTGGTGTACCTGGATACGAAACAGGCAATGCCGCTATAAACTCCAGCTGCGTTACCTCTTGGCgctc > 2:76840/1‑148 (MQ=16) aaTGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAAACGATTACTCGAAGAAGATGGATGCGGTAACTGGATTCCCAGCAGGGAATGGCGGTATCAAAAGCCGGTGCGTGACCGGTGGGCGCTAc > 6:453567/1‑151 (MQ=25) tGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAAACGAGCGGTGACACGCGTATTCTCAGAAGATGGATCGGGTACCTGGCTTAGCTCCCGGGAATTCCGGGATCAAATTCAGGTGCCTTAACTCTTGGCGATAccc > 2:263041/1‑151 (MQ=16) cAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAGCAGGGCGGTGAACCGCTTAGTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGCAGCAGGGCATGCCGCGTTCAAAACGAGCTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTAc > 8:490655/1‑151 (MQ=25) aaaaCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGACCCGCTTACGCGAAGCAGCTGGCTGGGGTACCTGGCTTCGCACCAGGGAAGGCCGGTATCAACAACCGGTGCGTTCCCGCTGGGCGATACCCCATCCGTaga > 4:13698/1‑148 (MQ=255) aaaaCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAGGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAACCAGGTGCGTTAACGCTTGGCGCTACCCCATCCGTACa > 8:1421184/1‑150 (MQ=37) aaaaCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAAGAACCGGGCGGTGACGCGGTTAGGCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGCAACAGGGGAGGCCGGGAACAAAAGCCGGTGCGTTACAGCTAGGCGATCCCCCATccaaaca > 7:460801/1‑145 (MQ=21) aCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAAGCCCCGGGCGGTGACCCGAGTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTCGATGCGCACGAGGGTAGGCCGGGATCAAAAGCCGGTTCCTAACCGCTGGCCGATACCGCATCAGTAGAACgg > 1:124186/1‑150 (MQ=255) aCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAAGAACCGGGCGGTGACACGCTTACTCGCAGAAGCTGGCTGGGGTACCTGGATTCGATCCAGGGAATGCCGGTATCAAAACCCGGTGCCATCCCGCTTGGCGCTCCCCCATCCGAAGAACgg > 3:16043/1‑150 (MQ=21) ggTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATACCCGGGCGGTGACCCGCTTACTCTAAGACGCTGGCTGGGGTAACTGGATTCGCACCAGGGCAGGCCGGTATCAACACCCGGGGCCTTACCGCTTGGCGCTACCCCATACGAACAACGGttg > 4:654614/1‑150 (MQ=255) ggTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAAGAACAGGGCGCTGAACCGATTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTCGCAACGAAACAGGGAAAACCCGTATCAACAACCGGTGCATGCACGCTTGCCGATCCCCCATAACTACAACGCttt > 1:189675/1‑151 (MQ=255) ccTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATCCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGCTACCCCATCCGTACAACGCTGTCTgg > 7:934856/1‑151 (MQ=255) cTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGCTTCGAACCAGGGAATGCCGGGATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTCCAACGCTGTCTGGt > 8:1460950/1‑151 (MQ=255) cTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGCTACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGt > 3:966048/1‑151 (MQ=255) cTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGt > 4:1508218/1‑151 (MQ=255) tACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATCCCCCATCCGTACAACGCTGTCTGGTg > 2:419643/1‑150 (MQ=255) tACCGCTTGCCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATCGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGCGAAACCCGCTATCAAAAACCGCTGCCATACCGCTAGCCGCTACCCCATCACTACAACGCTTTcacg > 1:546804/1‑145 (MQ=25) aCCGCTTGGCGATACCCCAATAGCCGGGCGGTGACGCGGTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGCACCAGGGAAGGCCGGGATCAAAAACAGGTGCCTTCACTGTGGGCGATACCCCATCCGTACATCGCTGTGTGGTGat > 5:1569280/1‑150 (MQ=21) aCCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGa > 8:384033/1‑150 (MQ=255) cGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACACCGCTTTCTGGTGAATg > 8:322340/1‑151 (MQ=255) ttGGCGATACCCCAATACCCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGGTTTCTGGTGAATGGTg > 3:823221/1‑151 (MQ=255) ttGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTg > 4:1037193/1‑151 (MQ=255) ttGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTg > 2:1525500/1‑151 (MQ=255) cGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCggg > 8:738364/1‑151 (MQ=255) cGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACACCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCggg > 6:1482189/1‑151 (MQ=255) gATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCggg > 4:1268087/1‑150 (MQ=255) tACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAgg > 1:1143798/1‑151 (MQ=255) ccccAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCg > 7:695686/1‑151 (MQ=255) ccccAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGAGTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTGTGGTGAATGGTGCGGGAGGCg > 7:226757/1‑151 (MQ=255) ccAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCg > 5:665491/1‑149 (MQ=255) ccAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGAGAGGCg > 8:63996/1‑149 (MQ=255) 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aaCCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTg > 1:722289/1‑151 (MQ=255) aCCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGCGACTTg > 1:950198/1‑150 (MQ=255) aCCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTg > 4:1507829/1‑150 (MQ=255) cGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAAc > 6:1325126/1‑151 (MQ=255) cGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAAc > 5:870312/1‑151 (MQ=255) gggCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACt > 3:1251833/1‑151 (MQ=255) gggCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACt > 7:131540/1‑151 (MQ=255) gggCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCCATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGCGAGGCGAGACTTGAAcg > 7:1010573/1‑150 (MQ=255) tcttttaaCCGATTAGTCGAAGAAGATGCCTTGGTTACCTGGATTCTATCTTTGGAATGCCGTTTTGAAAAAGCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTc < 6:200784/144‑1 (MQ=25) cGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGc > 8:1015023/1‑151 (MQ=255) 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gatgtattcttagaTGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTgcgg < 2:1587185/140‑1 (MQ=255) tACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTgcggc > 7:1181853/1‑151 (MQ=255) ttgtttcttcgaTGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTgcggc < 5:820257/140‑1 (MQ=255) aCTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTgcggcg > 5:268817/1‑151 (MQ=255) tgtttcttcgaTGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATAAGAACAGCGCTTTCAGGGGAAAGGTGAGGGAGTCGAGAGGTGAACTCGCAGCCCTTCAGgcgc > 5:1348858/10‑151 (MQ=11) 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gaTGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTGCGGCGCCAGAACCTa < 6:963655/151‑1 (MQ=255) | AACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTGCGGCGCCAGAACCTA > NC_000913/696720‑697013 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |